<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL671855.4	1	GGGAGAATGGGGGAAGGCCTGGTTTTATCCACAGATGTGTGCATGGGTGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157179	GGGAGAATGGGGGAAGGCCTGGTTTTATCCACAGATGTGTGCATGGGTGA	157228

AL671855.4	51	AGGACCGTGGCTGCAGATCTTGGTCTTGGCATGAGGTGTGGGAGGAGCGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157229	AGGACCGTGGCTGCAGATCTTGGTCTTGGCATGAGGTGTGGGAGGAGCGT	157278

AL671855.4	101	AGGGCTTTAAGCCAGGAGACTGGGATCGTCCTTAACGTGATACTTTCTAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157279	AGGGCTTTAAGCCAGGAGACTGGGATCGTCCTTAACGTGATACTTTCTAG	157328

AL671855.4	151	CTTTGTGACCTTTGGAAAGTCACTTTACATTTGGAAAGTCAGTTTACATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157329	CTTTGTGACCTTTGGAAAGTCACTTTACATTTGGAAAGTCAGTTTACATT	157378

AL671855.4	201	TCTTTCTCTGTAAAATGAAGGTAATAATGTTTGCCTAGAGGGTTATTAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157379	TCTTTCTCTGTAAAATGAAGGTAATAATGTTTGCCTAGAGGGTTATTAAA	157428

AL671855.4	251	ATTGAATGTAGTAATATAAAAATACTAAACCCTAGATAAATGTGGTTGAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157429	ATTGAATGTAGTAATATAAAAATACTAAACCCTAGATAAATGTGGTTGAA	157478

AL671855.4	301	ACTGATTATCTGACTAATCGTTTTCTAATGTGTATCAACATAAATCATTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157479	ACTGATTATCTGACTAATCGTTTTCTAATGTGTATCAACATAAATCATTT	157528

AL671855.4	351	GCATTATGGTTTCTTGCCTTCTCCCCGCTACAGTAAAAATAAATAAATAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157529	GCATTATGGTTTCTTGCCTTCTCCCCGCTACAGTAAAAATAAATAAATAA	157578

AL671855.4	401	ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATAGTCCAGTGTTACCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157579	ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATAGTCCAGTGTTACCC	157628

AL671855.4	451	GAACCCCAAAGGGGACTGTTGTGCCAGGTGGTGGGGGATTTGGGACCGTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157629	GAACCCCAAAGGGGACTGTTGTGCCAGGTGGTGGGGGATTTGGGACCGTA	157678

AL671855.4	501	GGAGGGGCCACCATGGGCAGATGTGGTGAGGGAGGAAAGGAGAGCAGAAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157679	GGAGGGGCCACCATGGGCAGATGTGGTGAGGGAGGAAAGGAGAGCAGAAG	157728

AL671855.4	551	AGGGGACCCGATGAGCAATCCTTACACCCTACCTGCAGTGTCGAAACAGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157729	AGGGGACCCGATGAGCAATCCTTACACCCTACCTGCAGTGTCGAAACAGC	157778

AL671855.4	601	GTCCCGCCCACACACTTCCGGCAGAATCTCCCGAAGTCCACACCTCTCAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157779	GTCCCGCCCACACACTTCCGGCAGAATCTCCCGAAGTCCACACCTCTCAC	157828

AL671855.4	651	TCCAGCCTGGACTTTGATGCTGTGGGCACGCCTCAGAGCCAGAAGTTTAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157829	TCCAGCCTGGACTTTGATGCTGTGGGCACGCCTCAGAGCCAGAAGTTTAT	157878

AL671855.4	701	GGCTCCCACCTGCTCAATCTGACAGGAAGCTTCTGCTCCCCAGTTCTCCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157879	GGCTCCCACCTGCTCAATCTGACAGGAAGCTTCTGCTCCCCAGTTCTCCC	157928

AL671855.4	751	CAGCCACTGTGGTCTACAGATTCCAGGAAACCCATCCCCCTGTGACCTCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157929	CAGCCACTGTGGTCTACAGATTCCAGGAAACCCATCCCCCTGTGACCTCA	157978

AL671855.4	801	TGGTGTGCTCTGTTCTCCACCCTAGGGACCAGAAGGAGCCAGGAGTAAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	157979	TGGTGTGCTCTGTTCTCCACCCTAGGGACCAGAAGGAGCCAGGAGTAAAG	158028

AL671855.4	851	AACTGGCTTACTTGGCCGCCACTGGGAAATTCTGGGTAATTCGAGACGCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158029	AACTGGCTTACTTGGCCGCCACTGGGAAATTCTGGGTAATTCGAGACGCC	158078

AL671855.4	901	CTGGAATTTGGACCCACTCCGCTGATAGGTGGTGGCCAGGGTTCTAGGGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158079	CTGGAATTTGGACCCACTCCGCTGATAGGTGGTGGCCAGGGTTCTAGGGA	158128

AL671855.4	951	ACACAAGAGGCGGAGCCAGGTGGCTTCCCTGTGCTGGCATTCTTGCCTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158129	ACACAAGAGGCGGAGCCAGGTGGCTTCCCTGTGCTGGCATTCTTGCCTCT	158178

AL671855.4	1001	CTCTCTCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTTAGCCTTGCAGCCGTTTCCCTCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158179	CTCTCTCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTTAGCCTTGCAGCCGTTTCCCTCTG	158228

AL671855.4	1051	CGATTCATGTAAGTGTGACTCGATTTCAGGGAAAGGGAACTCGCGTGGGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158229	CGATTCATGTAAGTGTGACTCGATTTCAGGGAAAGGGAACTCGCGTGGGC	158278

AL671855.4	1101	TGAGGAGACCGGAGTGGACGGGCTGGGGAAGGCACCGTGATGCCCGCAAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158279	TGAGGAGACCGGAGTGGACGGGCTGGGGAAGGCACCGTGATGCCCGCAAC	158328

AL671855.4	1151	CCCGTCCCTGAAGGTGGTCCATGAGCTGCCTGCCTGTACCCTCTGTGCGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158329	CCCGTCCCTGAAGGTGGTCCATGAGCTGCCTGCCTGTACCCTCTGTGCGG	158378

AL671855.4	1201	GGCCGCTGGAGGATGCGGTGACCATTCCCTGTGGACACACCTTCTGCCGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158379	GGCCGCTGGAGGATGCGGTGACCATTCCCTGTGGACACACCTTCTGCCGG	158428

AL671855.4	1251	CTCTGCCTCCCCGCGCTCTCCCAGATGGGGGCCCAATCCTCGGGCAAGAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158429	CTCTGCCTCCCCGCGCTCTCCCAGATGGGGGCCCAATCCTCGGGCAAGAT	158478

AL671855.4	1301	CCTGCTCTGCCCGCTCTGCCAAGAGGAGGAGCAGGCAGAGACTCCCATGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158479	CCTGCTCTGCCCGCTCTGCCAAGAGGAGGAGCAGGCAGAGACTCCCATGG	158528

AL671855.4	1351	CCCCTGTGCCCCTGGGCCCGCTGGGAGAAACTTACTGCGAGGAGCACGGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158529	CCCCTGTGCCCCTGGGCCCGCTGGGAGAAACTTACTGCGAGGAGCACGGC	158578

AL671855.4	1401	GAGAAGATCTACTTCTTCTGCGAGAACGATGCCGAGTTCCTCTGTGTGTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158579	GAGAAGATCTACTTCTTCTGCGAGAACGATGCCGAGTTCCTCTGTGTGTT	158628

AL671855.4	1451	CTGCAGGGAGGGTCCCACGCACCAGGCGCACACCGTGGGGTTCCTGGACG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158629	CTGCAGGGAGGGTCCCACGCACCAGGCGCACACCGTGGGGTTCCTGGACG	158678

AL671855.4	1501	AGGCCATTCAGCCCTACCGGGTAAGAAGTGTAGCTTTACCTAGGGCCTGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158679	AGGCCATTCAGCCCTACCGGGTAAGAAGTGTAGCTTTACCTAGGGCCTGT	158728

AL671855.4	1551	TTGGGGCAGGATGATGTCCTGTTATGAGGGGAGGAAATCGGGCGGGGATC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158729	TTGGGGCAGGATGATGTCCTGTTATGAGGGGAGGAAATCGGGCGGGGATC	158778

AL671855.4	1601	TGGATGAAAGGCTTCCACATCAGGGAACCCTAAGGTTACAGGGACTTTCG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158779	TGGATGAAAGGCTTCCACATCAGGGAACCCTAAGGTTACAGGGACTTTCG	158828

AL671855.4	1651	AGGCATTCCCAGACTGAAGGCAGATAGGGCTCCACTTGGATGTGTGGTAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158829	AGGCATTCCCAGACTGAAGGCAGATAGGGCTCCACTTGGATGTGTGGTAG	158878

AL671855.4	1701	TTCCTGGTCTGGGGGGAACTTCAGCTCCAGCTCTCAGAGGACCCCACAGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158879	TTCCTGGTCTGGGGGGAACTTCAGCTCCAGCTCTCAGAGGACCCCACAGA	158928

AL671855.4	1751	GGTGGAGTGCAAAGAACTGTAGCCTTGGCTTCACTCACTATGGAAAGAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158929	GGTGGAGTGCAAAGAACTGTAGCCTTGGCTTCACTCACTATGGAAAGAAA	158978

AL671855.4	1801	GCTCCAATGCCGAGTGGGATCTTCTGCAGATTATGGGCAGGGTAAACTTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	158979	GCTCCAATGCCGAGTGGGATCTTCTGCAGATTATGGGCAGGGTAAACTTG	159028

AL671855.4	1851	TTCTCCCAGGATCCAGACTGGAAATGGGGTTTATAGGGCCCTGACTGCCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	159029	TTCTCCCAGGATCCAGACTGGAAATGGGGTTTATAGGGCCCTGACTGCCA	159078

AL671855.4	1901	GGGCGCAGAGGGGAGGGAGGAGCTGGGAAGGGGAACCTGCTAGCACTGCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	159079	GGGCGCAGAGGGGAGGGAGGAGCTGGGAAGGGGAACCTGCTAGCACTGCT	159128

AL671855.4	1951	CTTCTTCTTGAGAAAGGGAGGGTGGCAGTAGTCCAGAATTGTGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669914.2	159129	CTTCTTCTTGAGAAAGGGAGGGTGGCAGTAGTCCAGAATTGTGAGAATTC	159178

Overview

Query
AL671855.4 - 45646 bps
Hit
AL669914.2 - 159178 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link