<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645930.15	1	GAATTCCCTCTCAGAGCCATGGGATGAATGAAAAGAGAAAAAAAAAAAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	197674	GAATTCCCTCTCAGAGCCATGGGATGAATGAAAAGAGAAAAAAAAAAAAA	197723

AL645930.15	51	GAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAGAAATTACGATTTGTGTTTAATTATTCAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	197724	GAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAGAAATTACGATTTGTGTTTAATTATTCAG	197773

AL645930.15	101	AATCTTCCACCCACACAGAGCAAGAGTGCAAAGTTCTGGAAAATTGTGAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	197774	AATCTTCCACCCACACAGAGCAAGAGTGCAAAGTTCTGGAAAATTGTGAT	197823

AL645930.15	151	TTGCAAGATACCAGCTACCTATAGCTTTTGCAATTACATCAGAGAAAAGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	197824	TTGCAAGATACCAGCTACCTATAGCTTTTGCAATTACATCAGAGAAAAGA	197873

AL645930.15	201	GGTTTACATGAAAGGCACAACTGGCGACCTATTAATTTGCTGAGAAAGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	197874	GGTTTACATGAAAGGCACAACTGGCGACCTATTAATTTGCTGAGAAAGAG	197923

AL645930.15	251	CATTTGGAGGGTTTAATATCTGTATATCACAAATGAGCTTTCAAACAGCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	197924	CATTTGGAGGGTTTAATATCTGTATATCACAAATGAGCTTTCAAACAGCA	197973

AL645930.15	301	CTGCACTATGCAAACTTTTAAGGAGTTTTTGCTTGCCTTTCCCTGGCAGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	197974	CTGCACTATGCAAACTTTTAAGGAGTTTTTGCTTGCCTTTCCCTGGCAGT	198023

AL645930.15	351	CTTTCCTGCCTTTTCCTTCATTTCTACGTTCAAAGGTACCTTTGTGCCTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198024	CTTTCCTGCCTTTTCCTTCATTTCTACGTTCAAAGGTACCTTTGTGCCTC	198073

AL645930.15	401	TGCGCCTCGCAGCTTTGGTACAGCAGCAGTTGCTCTCTTCAGAGCCCGAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198074	TGCGCCTCGCAGCTTTGGTACAGCAGCAGTTGCTCTCTTCAGAGCCCGAC	198123

AL645930.15	451	TTTACATGACGTCTCATGCCTCACATGCTGTACAGAAGCCCTAAAGGAAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198124	TTTACATGACGTCTCATGCCTCACATGCTGTACAGAAGCCCTAAAGGAAC	198173

AL645930.15	501	CAGGGAGCCACTCCCATCATAATGGCTACCCCGTAGTTTACCCCCAGATG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198174	CAGGGAGCCACTCCCATCATAATGGCTACCCCGTAGTTTACCCCCAGATG	198223

AL645930.15	551	CCGGTGAGGTCTGCAGGGTCCCCCATCTTTGGTTATTAGCACTGTCCCTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198224	CCGGTGAGGTCTGCAGGGTCCCCCATCTTTGGTTATTAGCACTGTCCCTT	198273

AL645930.15	601	CATACAGAACAACCTGCTGCCTGCTTCTGGGGCCATGCTTCCAGAGGTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198274	CATACAGAACAACCTGCTGCCTGCTTCTGGGGCCATGCTTCCAGAGGTCT	198323

AL645930.15	651	ACACACAGAAACACATGAGAACTCACAGAATTTGGCTAGCTTTGTGTATG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198324	ACACACAGAAACACATGAGAACTCACAGAATTTGGCTAGCTTTGTGTATG	198373

AL645930.15	701	ACTTTGCTAGGAATGGGGTGGGGTTGGGCAGTGTCAGGGTCACAGTGGGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198374	ACTTTGCTAGGAATGGGGTGGGGTTGGGCAGTGTCAGGGTCACAGTGGGT	198423

AL645930.15	751	GGTGGAAGGGAGAAGGGCAGGCCTCAGCAAGCTAGGCTCTTCACAGAATC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198424	GGTGGAAGGGAGAAGGGCAGGCCTCAGCAAGCTAGGCTCTTCACAGAATC	198473

AL645930.15	801	GTTGGGGAAAGGCAAAGGTGGGTAAAGTCCTGCTCAGCAACAGGGACAAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198474	GTTGGGGAAAGGCAAAGGTGGGTAAAGTCCTGCTCAGCAACAGGGACAAC	198523

AL645930.15	851	ACCCTAAGGCCTTTAAGACCAGAGGAGCCAATAAGAGAGGGATGTCATCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198524	ACCCTAAGGCCTTTAAGACCAGAGGAGCCAATAAGAGAGGGATGTCATCT	198573

AL645930.15	901	TGCTTAAGGCACCAAGCAGAGAATGCATGAGGGATGGGCCCAGGATTCTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198574	TGCTTAAGGCACCAAGCAGAGAATGCATGAGGGATGGGCCCAGGATTCTG	198623

AL645930.15	951	AGGCATCTGTTGGCAAGGCTAATCTTTTCGGTAAAGAGAAGATTCACAGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198624	AGGCATCTGTTGGCAAGGCTAATCTTTTCGGTAAAGAGAAGATTCACAGA	198673

AL645930.15	1001	ACTGGGGACATGGCTTGGGACAGGCCGGGTGTGCACAAGGTTCCCTCTTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198674	ACTGGGGACATGGCTTGGGACAGGCCGGGTGTGCACAAGGTTCCCTCTTC	198723

AL645930.15	1051	AGTAGAATGGGAAAGGCTTTACAAAGATATCCTAAAAGTTATAAATGACA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198724	AGTAGAATGGGAAAGGCTTTACAAAGATATCCTAAAAGTTATAAATGACA	198773

AL645930.15	1101	TCACTTCTGTATTCCGCCTCGGGTGCAAGCTCTCGGGGGTAGATCTTGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198774	TCACTTCTGTATTCCGCCTCGGGTGCAAGCTCTCGGGGGTAGATCTTGAG	198823

AL645930.15	1151	CACGTCCGTAGCTCTATCCCCAACATCTTTAACTGCTCTGTCTGTGTACC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198824	CACGTCCGTAGCTCTATCCCCAACATCTTTAACTGCTCTGTCTGTGTACC	198873

AL645930.15	1201	GAAGGGATGAATGACACGGAGCAGGAAGAGGGATCTGTGAGTGGGTTTCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198874	GAAGGGATGAATGACACGGAGCAGGAAGAGGGATCTGTGAGTGGGTTTCT	198923

AL645930.15	1251	AACCAGGCCACAACAAGCCAGGAAGAGATCTACTGACCGACCGTCCTGAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198924	AACCAGGCCACAACAAGCCAGGAAGAGATCTACTGACCGACCGTCCTGAA	198973

AL645930.15	1301	AAGTGTTTCAAATCTCCCAGCAGATACACAGCCTCACAGAGCCAAGCCAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	198974	AAGTGTTTCAAATCTCCCAGCAGATACACAGCCTCACAGAGCCAAGCCAG	199023

AL645930.15	1351	CAATGAGTCAGGGAAAGTGATGGGCTGGCTAGTCTTTTGTCAGCGGGACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	199024	CAATGAGTCAGGGAAAGTGATGGGCTGGCTAGTCTTTTGTCAGCGGGACA	199073

AL645930.15	1401	CAAGCTACAGTTATCTGAAAGGAGGGCACCTCAGTTGAGAACATGCCTCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	199074	CAAGCTACAGTTATCTGAAAGGAGGGCACCTCAGTTGAGAACATGCCTCC	199123

AL645930.15	1451	AGAAGATCAGGCTGTAAGGCATGTCCTTAAATTAGTGACTGATGGGAGAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	199124	AGAAGATCAGGCTGTAAGGCATGTCCTTAAATTAGTGACTGATGGGAGAG	199173

AL645930.15	1501	GGCCCAGCCCATTGCGGCTGTTGCCATTCCTGTTTATAGAACCCAGGATG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	199174	GGCCCAGCCCATTGCGGCTGTTGCCATTCCTGTTTATAGAACCCAGGATG	199223

AL645930.15	1551	GCTTCTACAAGAAAGCAGGCTGAGCAAGCCATAGGGAACAAGCCAGTAAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	199224	GCTTCTACAAGAAAGCAGGCTGAGCAAGCCATAGGGAACAAGCCAGTAAG	199273

AL645930.15	1601	CAGGGATACTCCATGACCTTTGTCTCAGCTCTGCATCCAGGTTCCTGCCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	199274	CAGGGATACTCCATGACCTTTGTCTCAGCTCTGCATCCAGGTTCCTGCCC	199323

AL645930.15	1651	TGTTTTGAGTTCCTGTCCTGACTTCCTTCAATGATGAGCTACAATGTAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	199324	TGTTTTGAGTTCCTGTCCTGACTTCCTTCAATGATGAGCTACAATGTAGA	199373

AL645930.15	1701	TGTGAAGCCAAATAAACCCTTTCCTAGCCAATTTGCTTTTGGGTCACAGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	199374	TGTGAAGCCAAATAAACCCTTTCCTAGCCAATTTGCTTTTGGGTCACAGT	199423

AL645930.15	1751	ACTCCATTGAAGTAACAGAAACCTTGACTAAGACAAGTGAAGATCAACAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	199424	ACTCCATTGAAGTAACAGAAACCTTGACTAAGACAAGTGAAGATCAACAG	199473

AL645930.15	1801	ACAGTTCAAACTCCAAGTGGCAGTGACAGACGACAGGAGGAACGTTTACA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	199474	ACAGTTCAAACTCCAAGTGGCAGTGACAGACGACAGGAGGAACGTTTACA	199523

AL645930.15	1851	GAAGGCAACGGGGGTGGGGAAGGAGGAAGGATGGAGGGAGGTACCTGGGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	199524	GAAGGCAACGGGGGTGGGGAAGGAGGAAGGATGGAGGGAGGTACCTGGGT	199573

AL645930.15	1901	CCAGCACAGCTCCTTCCACAGTGACGATACAGAACAATTTGATGAGATCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	199574	CCAGCACAGCTCCTTCCACAGTGACGATACAGAACAATTTGATGAGATCT	199623

AL645930.15	1951	CCCCGGGTGACGGATGGTGTGTCTGAATGCACAGAGGCGTTAAATGTGGG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669872.8	199624	CCCCGGGTGACGGATGGTGTGTCTGAATGCACAGAGGCGTTAAATGTGGG	199673

Overview

Query
AL645930.15 - 227993 bps
Hit
AL669872.8 - 199673 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link