<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662866.7	1	GAATTCCCTGCCTGGATCTCACAAGCACTTTCCCTCTTGGTGCCTCAGTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	66381	GAATTCCCTGCCTGGATCTCACAAGCACTTTCCCTCTTGGTGCCTCAGTT	66430

AL662866.7	51	TCCTGACCTATGAAACAGAGAAAATAAAAGCACTTATTTATTGTTGTTGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	66431	TCCTGACCTATGAAACAGAGAAAATAAAAGCACTTATTTATTGTTGTTGG	66480

AL662866.7	101	AGGCTGCAAAATGTTAGTAGATATGAGGCATTTGCAGCTGTGCCATATTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	66481	AGGCTGCAAAATGTTAGTAGATATGAGGCATTTGCAGCTGTGCCATATTA	66530

AL662866.7	151	ATTGGTGTCATTGTTTTTGTTGTTTTCGTATTATTATTTTTTTTTTTTAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	66531	ATTGGTGTCATTGTTTTTGTTGTTTTCGTATTATTATTTTTTTTTTTTAA	66580

AL662866.7	201	GACAGAGTCTCAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACACT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	66581	GACAGAGTCTCAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACACT	66630

AL662866.7	251	TTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAAGAGATCGAGACCATCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	66631	TTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAAGAGATCGAGACCATCC	66680

AL662866.7	301	TGATCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	66681	TGATCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCT	66730

AL662866.7	351	GGGCCTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGCTGAGGCAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	66731	GGGCCTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGCTGAGGCAG	66780

AL662866.7	401	GAAAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	66781	GAAAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACA	66830

AL662866.7	451	CCACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	66831	CCACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAA	66880

AL662866.7	501	AAAAAAAAAAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGCAGTTCAGTGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	66881	AAAAAAAAAAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGCAGTTCAGTGA	66930

AL662866.7	551	CATGATCTCAGCTCGTTGCAGCCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCACTTCTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	66931	CATGATCTCAGCTCGTTGCAGCCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCACTTCTC	66980

AL662866.7	601	TTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGGTTACAGACATGCACCACCATACC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	66981	TTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGGTTACAGACATGCACCACCATACC	67030

AL662866.7	651	CGGCTAATTTTTGCATTTTTCATAGAGACAGGATTTTGCCATGTTGGCCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67031	CGGCTAATTTTTGCATTTTTCATAGAGACAGGATTTTGCCATGTTGGCCA	67080

AL662866.7	701	GGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67081	GGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCC	67130

AL662866.7	751	AAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGCCACCATACCCGGCCTATTTTATTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67131	AAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGCCACCATACCCGGCCTATTTTATTA	67180

AL662866.7	801	CATTTTAATTTATTTTATTTTATTATATCATCCACCATGTCTGGCCTATT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67181	CATTTTAATTTATTTTATTTTATTATATCATCCACCATGTCTGGCCTATT	67230

AL662866.7	851	TTATTATATTTTAAGATATTTTAATATATTACGTGTGTTGTAATTGGATT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67231	TTATTATATTTTAAGATATTTTAATATATTACGTGTGTTGTAATTGGATT	67280

AL662866.7	901	ATCATCGGTGAGCTTTGTGAGTGAGTGTCTTGGAGATGACTCCTCCTGAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67281	ATCATCGGTGAGCTTTGTGAGTGAGTGTCTTGGAGATGACTCCTCCTGAC	67330

AL662866.7	951	CAGCCCAGGACCAGCTTTCTTGTCACCTTGAGGTCCCCTCGCCCCATCAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67331	CAGCCCAGGACCAGCTTTCTTGTCACCTTGAGGTCCCCTCGCCCCATCAC	67380

AL662866.7	1001	ACTCTTACGCATTACTCTATGTCTACTGTTATGGGTGTGTAATTTTATAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67381	ACTCTTACGCATTACTCTATGTCTACTGTTATGGGTGTGTAATTTTATAC	67430

AL662866.7	1051	CATAGATGTTTACTCTTTAAACAGACACTTCTAGTCTGTTTTATTTCATG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67431	CATAGATGTTTACTCTTTAAACAGACACTTCTAGTCTGTTTTATTTCATG	67480

AL662866.7	1101	TGTCTGGGAGCGGATAAAGTGTGAGGTTCAGGGAGAAAGAGAGGTCTGTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67481	TGTCTGGGAGCGGATAAAGTGTGAGGTTCAGGGAGAAAGAGAGGTCTGTC	67530

AL662866.7	1151	TCAATGCCTTGGCACGGCATGAAGACAATCTCCCCTCCTTGTCCCCTTTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67531	TCAATGCCTTGGCACGGCATGAAGACAATCTCCCCTCCTTGTCCCCTTTC	67580

AL662866.7	1201	CCTGCTAGCTCCTGATGACTGACAGATTCACAGCAGAACAGAAAGGACTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67581	CCTGCTAGCTCCTGATGACTGACAGATTCACAGCAGAACAGAAAGGACTG	67630

AL662866.7	1251	GGAAGGGATGGAGGTGGGACATCTGGCACTGACCTTCAGGGGCTGACCCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67631	GGAAGGGATGGAGGTGGGACATCTGGCACTGACCTTCAGGGGCTGACCCT	67680

AL662866.7	1301	GTGGGGGAACATCTGCCCTGAAGAGTTGGAGCCTTCATGTGATGACACAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67681	GTGGGGGAACATCTGCCCTGAAGAGTTGGAGCCTTCATGTGATGACACAG	67730

AL662866.7	1351	AGCTGAAGTGTGATATTCGGGAGGGGATAGAGAGTGCTTGGAGGTTTTCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67731	AGCTGAAGTGTGATATTCGGGAGGGGATAGAGAGTGCTTGGAGGTTTTCT	67780

AL662866.7	1401	GATTTTGAAGAATCCCAGTCAGTCAGGTTCTGGCGTAAAGTGACTGCTGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67781	GATTTTGAAGAATCCCAGTCAGTCAGGTTCTGGCGTAAAGTGACTGCTGG	67830

AL662866.7	1451	GGAGGTGTGGACTGAATGAATGAAGAATAAATGAACCAGGAAAGTGGACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67831	GGAGGTGTGGACTGAATGAATGAAGAATAAATGAACCAGGAAAGTGGACA	67880

AL662866.7	1501	TGCAAGAGGTGGGTTATTCCTCACCCTATTTCTTGATGCCTCCTGACTGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67881	TGCAAGAGGTGGGTTATTCCTCACCCTATTTCTTGATGCCTCCTGACTGC	67930

AL662866.7	1551	TGGTGTTGGGGCACACAGATGGGTGATGCACTTCTTGGTCAAGGCAACCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67931	TGGTGTTGGGGCACACAGATGGGTGATGCACTTCTTGGTCAAGGCAACCT	67980

AL662866.7	1601	CAGCCCCACCCACGTAAGGTGGTCATGGCAGAGAGTGTAAGGGTGACACC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	67981	CAGCCCCACCCACGTAAGGTGGTCATGGCAGAGAGTGTAAGGGTGACACC	68030

AL662866.7	1651	TGTGAAAAAGACCCAAGGCAGGGATGGGAGCCCTTCTTGCAGCAGGAGTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	68031	TGTGAAAAAGACCCAAGGCAGGGATGGGAGCCCTTCTTGCAGCAGGAGTG	68080

AL662866.7	1701	GATGCAGGACCTGCCTGGAAGCAAGAGAAGGACGAGGGACCCTGGCTGGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	68081	GATGCAGGACCTGCCTGGAAGCAAGAGAAGGACGAGGGACCCTGGCTGGG	68130

AL662866.7	1751	CCCTGTTTCCTCCCACTGCCTGGTTCACAAAGCAACCAGTAAGGGAGCTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	68131	CCCTGTTTCCTCCCACTGCCTGGTTCACAAAGCAACCAGTAAGGGAGCTG	68180

AL662866.7	1801	GAGTAGGGAATTCACTCATGTGCTACTTACTGATCCAGAGATGTGTTCGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	68181	GAGTAGGGAATTCACTCATGTGCTACTTACTGATCCAGAGATGTGTTCGT	68230

AL662866.7	1851	TGACATTTTCTTTTATGTTTTCAGGTTGATGTCATTTACACATTCATGCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	68231	TGACATTTTCTTTTATGTTTTCAGGTTGATGTCATTTACACATTCATGCA	68280

AL662866.7	1901	TTTATGTTGTGTATTTATTAGTCTTGTTTATTTTAGTTAGCAAGTGTCAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	68281	TTTATGTTGTGTATTTATTAGTCTTGTTTATTTTAGTTAGCAAGTGTCAC	68330

AL662866.7	1951	TTGTTGAATTCTGTTCTCATTAGGTATAAATTTTCATATTCATTGAAGTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669854.8	68331	TTGTTGAATTCTGTTCTCATTAGGTATAAATTTTCATATTCATTGAAGTT	68380

Overview

Query
AL662866.7 - 97315 bps
Hit
AL669854.8 - 68380 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link