<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL714025.12	1	TCCCGGAAAAACAAACTACTGGGAGGTGGAGGCTGATGCGCTGCATTGGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	171770	TCCCGGAAAAACAAACTACTGGGAGGTGGAGGCTGATGCGCTGCATTGGT	171819

AL714025.12	51	CTGCTTGGAGACTGCGGGCGACTTCGGAGTCACAGATATTCGTTGTCACC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	171820	CTGCTTGGAGACTGCGGGCGACTTCGGAGTCACAGATATTCGTTGTCACC	171869

AL714025.12	101	AAGGTATGTATTTTCTGGGCGACCCGAAAATACTCATTTCAGAATCCCAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	171870	AAGGTATGTATTTTCTGGGCGACCCGAAAATACTCATTTCAGAATCCCAA	171919

AL714025.12	151	GTTCTCAACTCCTTCGCGACTTCATTAAAGAAAGACCGAATGACACCGAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	171920	GTTCTCAACTCCTTCGCGACTTCATTAAAGAAAGACCGAATGACACCGAG	171969

AL714025.12	201	GGCATCCCTGTCGCCTCTTCCGGTTCCCACTGAGGCAGATAAAAAAAAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	171970	GGCATCCCTGTCGCCTCTTCCGGTTCCCACTGAGGCAGATAAAAAAAAAA	172019

AL714025.12	251	AAAACGCCAGGAAGCGCCGGGGTCCACAAAACGTCTGGAACAACTACAGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172020	AAAACGCCAGGAAGCGCCGGGGTCCACAAAACGTCTGGAACAACTACAGG	172069

AL714025.12	301	TCTAGTGACAATGGCAAATCCTAGTTCAAGCTGAGCGGAGCTTGGCCTCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172070	TCTAGTGACAATGGCAAATCCTAGTTCAAGCTGAGCGGAGCTTGGCCTCA	172119

AL714025.12	351	CTGCGACCCAGGACAGGCGTGGATGAGCCGAGAGGACTCGTTCTTGAGAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172120	CTGCGACCCAGGACAGGCGTGGATGAGCCGAGAGGACTCGTTCTTGAGAC	172169

AL714025.12	401	GTACTCGGGCGCGCGGGTCCTGCACTCTTCTCAACACGCAGCGACTTCAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172170	GTACTCGGGCGCGCGGGTCCTGCACTCTTCTCAACACGCAGCGACTTCAC	172219

AL714025.12	451	GGACCTCGACAGTGTCCAGAGAGACCACGTCCCGCCGGCCCGGAGCAACG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172220	GGACCTCGACAGTGTCCAGAGAGACCACGTCCCGCCGGCCCGGAGCAACG	172269

AL714025.12	501	CAGATCTTCTGGGAACAAATACATGTGGCCTCTCCTGAGCCACTGGTCCG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172270	CAGATCTTCTGGGAACAAATACATGTGGCCTCTCCTGAGCCACTGGTCCG	172319

AL714025.12	551	GAATCCCGGACAGAAGTCTAGATAGCTTCCAGTAGAGAGGCGGGATCTGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172320	GAATCCCGGACAGAAGTCTAGATAGCTTCCAGTAGAGAGGCGGGATCTGG	172369

AL714025.12	601	TGGAGGCCTGCCACCCTCTGCGTTATCTAAATGGTTTTGACGAATGTATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172370	TGGAGGCCTGCCACCCTCTGCGTTATCTAAATGGTTTTGACGAATGTATT	172419

AL714025.12	651	CTGAAATTGATTAAAATTGGCAAGACTTCAAATAGTCACTTGTGGGTAAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172420	CTGAAATTGATTAAAATTGGCAAGACTTCAAATAGTCACTTGTGGGTAAG	172469

AL714025.12	701	AGGGAGAAGTGGGTGGCAGAACTCCGTCGCGGCCAGAGGACTGCTAGCAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172470	AGGGAGAAGTGGGTGGCAGAACTCCGTCGCGGCCAGAGGACTGCTAGCAG	172519

AL714025.12	751	TTTGTGCGTCGACCCAGACCGAGTTGAGGAATGAGTGAGTGCAAGGAGAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172520	TTTGTGCGTCGACCCAGACCGAGTTGAGGAATGAGTGAGTGCAAGGAGAC	172569

AL714025.12	801	ATTTGTTGCTCTCGTACGGAATTTTTTTTTCTGCTGCTAAAAACTTTCTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172570	ATTTGTTGCTCTCGTACGGAATTTTTTTTTCTGCTGCTAAAAACTTTCTA	172619

AL714025.12	851	CTTCGAATAAGGTGGTTTGTAAGTTTTTACATCTTTTTAAAAAATCTTAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172620	CTTCGAATAAGGTGGTTTGTAAGTTTTTACATCTTTTTAAAAAATCTTAA	172669

AL714025.12	901	AATTTCGAAAAACAAGACGAAACTCTTAGTTGTCAACTTTGTCATCAAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172670	AATTTCGAAAAACAAGACGAAACTCTTAGTTGTCAACTTTGTCATCAAAT	172719

AL714025.12	951	ATCTGTAGAGGTCGTAGAAGCAGCTCTTATGTCTGGCCGGTTAGCTCAGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172720	ATCTGTAGAGGTCGTAGAAGCAGCTCTTATGTCTGGCCGGTTAGCTCAGT	172769

AL714025.12	1001	TGGTTAGAGTGTGGTGCTAATAACGCCAAGGTCGCGGGTTCGATCCCCGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172770	TGGTTAGAGTGTGGTGCTAATAACGCCAAGGTCGCGGGTTCGATCCCCGT	172819

AL714025.12	1051	ACGGGCCACATATGTTTTAGCTACTATGCTTTGCCTTCAAAATAAAAGAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172820	ACGGGCCACATATGTTTTAGCTACTATGCTTTGCCTTCAAAATAAAAGAT	172869

AL714025.12	1101	GAAGCGAATGTGGCATAGATCTACTCTGTATAGCTGTGTAAGGCATACCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172870	GAAGCGAATGTGGCATAGATCTACTCTGTATAGCTGTGTAAGGCATACCA	172919

AL714025.12	1151	ACCTTGACTGTGTTTCTTTTTGGTTGCTCTGTGCCGTCTAGTTGCGTTCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172920	ACCTTGACTGTGTTTCTTTTTGGTTGCTCTGTGCCGTCTAGTTGCGTTCT	172969

AL714025.12	1201	TATTTTGTGGTTTAGTGTCCTGAAAGCACACTTCATAGTTCGTAGAGAAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	172970	TATTTTGTGGTTTAGTGTCCTGAAAGCACACTTCATAGTTCGTAGAGAAC	173019

AL714025.12	1251	CACAAGGAATCAATCTGGAAGCAGTGGGAAATAGCAGTGAGTACCTGGGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	173020	CACAAGGAATCAATCTGGAAGCAGTGGGAAATAGCAGTGAGTACCTGGGT	173069

AL714025.12	1301	CTTTCTCCATGCCACGTTTCCACAGTGTGCCTCCTCTCCAGTCACACTCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	173070	CTTTCTCCATGCCACGTTTCCACAGTGTGCCTCCTCTCCAGTCACACTCA	173119

AL714025.12	1351	CTTTACACAGACTTCCTGCAAAGCTGTGTGCATTAGAAGGCTGGGTAATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	173120	CTTTACACAGACTTCCTGCAAAGCTGTGTGCATTAGAAGGCTGGGTAATG	173169

AL714025.12	1401	CTACCAGGAAAACCCAGTCCTGGCCTCTGCCTGTGCCTTCATTTCTGTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	173170	CTACCAGGAAAACCCAGTCCTGGCCTCTGCCTGTGCCTTCATTTCTGTTT	173219

AL714025.12	1451	TCTGCCTTCTGTTAATCTAGAGACACTGAACGGGGGAATGTCGGGTTCAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	173220	TCTGCCTTCTGTTAATCTAGAGACACTGAACGGGGGAATGTCGGGTTCAG	173269

AL714025.12	1501	AACCCCAAGTCCTTCATCAATGTCCAGCTGCTTAGTGGGGTCCAAAGGAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	173270	AACCCCAAGTCCTTCATCAATGTCCAGCTGCTTAGTGGGGTCCAAAGGAT	173319

AL714025.12	1551	CTTCCAGCCGAGATCTTTCCGAACAGTTTTCTGAACCTGAGTTTTGTGCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	173320	CTTCCAGCCGAGATCTTTCCGAACAGTTTTCTGAACCTGAGTTTTGTGCC	173369

AL714025.12	1601	TCCCAGCATTCCCAGGGAGCCTAGCAGAGGTCTGTGTTTTGGAGTTTACA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	173370	TCCCAGCATTCCCAGGGAGCCTAGCAGAGGTCTGTGTTTTGGAGTTTACA	173419

AL714025.12	1651	ACGATCCATTTAGTGAGCTTCTCCGTTACATTATAGAAGGCGAAGTAATG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	173420	ACGATCCATTTAGTGAGCTTCTCCGTTACATTATAGAAGGCGAAGTAATG	173469

AL714025.12	1701	TTAAGTCAGATGTTTCAGATAGTTCTCCGAACTTTTGTTAGTTCTTTAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	173470	TTAAGTCAGATGTTTCAGATAGTTCTCCGAACTTTTGTTAGTTCTTTAAA	173519

AL714025.12	1751	GTGCTATGGATTGAATTAGGGCTTTATACATAGGCAAGCACTGTGCCTCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	173520	GTGCTATGGATTGAATTAGGGCTTTATACATAGGCAAGCACTGTGCCTCT	173569

AL714025.12	1801	AAGCCACAGCCTATTACTTGGGTACTTTTAAAAGTCTATACAGTGAATTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	173570	AAGCCACAGCCTATTACTTGGGTACTTTTAAAAGTCTATACAGTGAATTT	173619

AL714025.12	1851	GAGAAGTGTGCAGGCAAAACAGTGTGTATTGTGCTCCCAAAAGGCACACA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	173620	GAGAAGTGTGCAGGCAAAACAGTGTGTATTGTGCTCCCAAAAGGCACACA	173669

AL714025.12	1901	AATCTGCGAGAGGCATGCTTTGTCCTCTCTGAGCAGTGGTTGTGATGCCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	173670	AATCTGCGAGAGGCATGCTTTGTCCTCTCTGAGCAGTGGTTGTGATGCCC	173719

AL714025.12	1951	CAAAATCAGGATGAAGAGTACAGCCAAGAAGTACAAAGGCGGTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669819.13	173720	CAAAATCAGGATGAAGAGTACAGCCAAGAAGTACAAAGGCGGTGGAATTC	173769

Overview

Query
AL714025.12 - 121496 bps
Hit
AL669819.13 - 173769 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link