<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL669922.5	1	AGAGAGATCCATGACCCGTGGGAGCAGGGCTACTGACAGGAACTCAATGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175136	AGAGAGATCCATGACCCGTGGGAGCAGGGCTACTGACAGGAACTCAATGA	175185

AL669922.5	51	AGGGCAAAGGGAAGGGCCACCTGTATCAGTGACTCTCGTTGTGATAGAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175186	AGGGCAAAGGGAAGGGCCACCTGTATCAGTGACTCTCGTTGTGATAGAAT	175235

AL669922.5	101	AGCTTACAAATGCAAGCGAAGAAAGGAAGCTTGGTTCTTGCTCAGTGGGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175236	AGCTTACAAATGCAAGCGAAGAAAGGAAGCTTGGTTCTTGCTCAGTGGGC	175285

AL669922.5	151	GGGTGCAGTCCATCATGGCTGGCAAGTCCAGGCCACAGGAGCTTGACAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175286	GGGTGCAGTCCATCATGGCTGGCAAGTCCAGGCCACAGGAGCTTGACAAA	175335

AL669922.5	201	GCCGGTCACATTGTATCCATGCATAGGAAGCAGAAAGCGATGGATGATGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175336	GCCGGTCACATTGTATCCATGCATAGGAAGCAGAAAGCGATGGATGATGT	175385

AL669922.5	251	CTGTCCTCATTTTCCATGTTTACTTTGTCTGGGCCACCATCCCTTGTGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175386	CTGTCCTCATTTTCCATGTTTACTTTGTCTGGGCCACCATCCCTTGTGGA	175435

AL669922.5	301	ATGTCCCTGCCCACATTTAGGGTTGGTCTTCAGACCCCTATTAACCAAAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175436	ATGTCCCTGCCCACATTTAGGGTTGGTCTTCAGACCCCTATTAACCAAAT	175485

AL669922.5	351	CTAAGTAATCCCTCACGTGCCCTTAAAAGGAATGGCTACGCCTATAGAAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175486	CTAAGTAATCCCTCACGTGCCCTTAAAAGGAATGGCTACGCCTATAGAAC	175535

AL669922.5	401	TAACAGGAAATGGGAGGCCATTTCCACACCAGGCCTTAAGGGATAAAGCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175536	TAACAGGAAATGGGAGGCCATTTCCACACCAGGCCTTAAGGGATAAAGCA	175585

AL669922.5	451	AGGTACCAGAACCTGGGGACAGTTGCTATGGCTACAAGAGGGCTATATGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175586	AGGTACCAGAACCTGGGGACAGTTGCTATGGCTACAAGAGGGCTATATGA	175635

AL669922.5	501	CAAGATTTAGGTTAAGGAGTTCTGTGTCAGCCCAATAAGCCCACCTACCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175636	CAAGATTTAGGTTAAGGAGTTCTGTGTCAGCCCAATAAGCCCACCTACCC	175685

AL669922.5	551	TACCTTCTGCAAACATGGGGATCTCTGCCTGTCCCTCCTATGAGCTGCCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175686	TACCTTCTGCAAACATGGGGATCTCTGCCTGTCCCTCCTATGAGCTGCCC	175735

AL669922.5	601	AGCTACCAGTAGATTGGTGCTACCACCACAGACTCAGCAGGATGTAAAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175736	AGCTACCAGTAGATTGGTGCTACCACCACAGACTCAGCAGGATGTAAAAG	175785

AL669922.5	651	TGGGAGGGAGAAGGTCTGCATGGCACTCTATTGCTATGAAGAAACATGAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175786	TGGGAGGGAGAAGGTCTGCATGGCACTCTATTGCTATGAAGAAACATGAT	175835

AL669922.5	701	GACCATGACAACTCTTATACAGAAAAAACATTTAATTAGTTAAAGAAAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175836	GACCATGACAACTCTTATACAGAAAAAACATTTAATTAGTTAAAGAAAAA	175885

AL669922.5	751	ACATTAATTCCAGTTCAGAGATTTAGTCCATTATTGTCATGGCAGGAAGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175886	ACATTAATTCCAGTTCAGAGATTTAGTCCATTATTGTCATGGCAGGAAGC	175935

AL669922.5	801	ATGGTGGCACACAGATACGGTACTAGAGAGGCAGCTGAGAATTTTATATC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175936	ATGGTGGCACACAGATACGGTACTAGAGAGGCAGCTGAGAATTTTATATC	175985

AL669922.5	851	CATGCCAGCAGGCAGCAGGAAACAAGAGGGACGCTGGGCCTGGCTTGACC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	175986	CATGCCAGCAGGCAGCAGGAAACAAGAGGGACGCTGGGCCTGGCTTGACC	176035

AL669922.5	901	ATTTGAAACCTCAGAGCCCATCCCCCAGTGACATACTTCCTCGAACAAAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176036	ATTTGAAACCTCAGAGCCCATCCCCCAGTGACATACTTCCTCGAACAAAG	176085

AL669922.5	951	CCACCCTCCAGTAATGCCACTCCCTATGAGCCTATGGTGGCTATTTTTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176086	CCACCCTCCAGTAATGCCACTCCCTATGAGCCTATGGTGGCTATTTTTCT	176135

AL669922.5	1001	TCAGACCAATACAGTTGGTTAAGCTGGTAAAACACAATCTTCCATCTTTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176136	TCAGACCAATACAGTTGGTTAAGCTGGTAAAACACAATCTTCCATCTTTG	176185

AL669922.5	1051	GTGAGTTCCACTGCACTGAATCAGCATAAAGAATGACTGCTTTACAGTGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176186	GTGAGTTCCACTGCACTGAATCAGCATAAAGAATGACTGCTTTACAGTGT	176235

AL669922.5	1101	TTCCCCCACACTGTGAGCCAGGAACCCAGATTGCTAGCTCTAAGTCAACC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176236	TTCCCCCACACTGTGAGCCAGGAACCCAGATTGCTAGCTCTAAGTCAACC	176285

AL669922.5	1151	AATTGTTCAGTGAATGTGGACTCCTCCATAGGTAAAGTGCTGGATAGGAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176286	AATTGTTCAGTGAATGTGGACTCCTCCATAGGTAAAGTGCTGGATAGGAA	176335

AL669922.5	1201	GGGAGAACCAGAGGAGACTTGCAGAGCCTCAGCCTCCAGAAGCTTATAGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176336	GGGAGAACCAGAGGAGACTTGCAGAGCCTCAGCCTCCAGAAGCTTATAGC	176385

AL669922.5	1251	TTCATCAAGGATTTGGGGATGCGCTAAGACATATCAGCCAGACAGAAGGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176386	TTCATCAAGGATTTGGGGATGCGCTAAGACATATCAGCCAGACAGAAGGA	176435

AL669922.5	1301	CAAGCCCTAAGAGAAAGAGGTAAAAGTATGTGTGTCCCCAAATTCATCTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176436	CAAGCCCTAAGAGAAAGAGGTAAAAGTATGTGTGTCCCCAAATTCATCTG	176485

AL669922.5	1351	CTGGAAATTATCTCCACCTCGCGGTCCACAGGTGACAGGTAGCATCTTTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176486	CTGGAAATTATCTCCACCTCGCGGTCCACAGGTGACAGGTAGCATCTTTA	176535

AL669922.5	1401	AGAGGTGACTGAGTTGGGAGGTGTCGCCCTTGTGAGTAGATGACTGATTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176536	AGAGGTGACTGAGTTGGGAGGTGTCGCCCTTGTGAGTAGATGACTGATTT	176585

AL669922.5	1451	TACTTTCTTCACAGCCAGGAGTCCCCTCCCCCACAAACACAGCCCTCAGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176586	TACTTTCTTCACAGCCAGGAGTCCCCTCCCCCACAAACACAGCCCTCAGT	176635

AL669922.5	1501	CTTGAATTGCCCATCTACCAGAACCAAGAGCTAAAAACCTTTGATGGTTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176636	CTTGAATTGCCCATCTACCAGAACCAAGAGCTAAAAACCTTTGATGGTTT	176685

AL669922.5	1551	ATAATTTACTTTGGGTTTATAATTTAATGTTTGTGGTGTTAATTGTAGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176686	ATAATTTACTTTGGGTTTATAATTTAATGTTTGTGGTGTTAATTGTAGCA	176735

AL669922.5	1601	ACAGAAACTGAACTAAGGCCAGCTGTAGTGGTGCATGCCTTTAATCTTAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176736	ACAGAAACTGAACTAAGGCCAGCTGTAGTGGTGCATGCCTTTAATCTTAG	176785

AL669922.5	1651	TACTCAGGAGGTAGAGGCAGGCTGATCTCTGAGGTTTTGGCCAGCCTGGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176786	TACTCAGGAGGTAGAGGCAGGCTGATCTCTGAGGTTTTGGCCAGCCTGGT	176835

AL669922.5	1701	CTACAGAGGGAGTTCCCTGTTAGCCAGGGCGACACAGGGAAATGCTGTCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176836	CTACAGAGGGAGTTCCCTGTTAGCCAGGGCGACACAGGGAAATGCTGTCT	176885

AL669922.5	1751	CAAAAAACAAACAGAAAACTGAACTAAGACAGACAGATACAAATATTTAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176886	CAAAAAACAAACAGAAAACTGAACTAAGACAGACAGATACAAATATTTAC	176935

AL669922.5	1801	ACTAAGGGTAGCTAATATTTTAGGCTCCTCACAGTTGAGTTATTATTAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176936	ACTAAGGGTAGCTAATATTTTAGGCTCCTCACAGTTGAGTTATTATTAAA	176985

AL669922.5	1851	AGACAGCCTCTACTATATATTGGTGTTCTTCTAAGTTATTTGTATATATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	176986	AGACAGCCTCTACTATATATTGGTGTTCTTCTAAGTTATTTGTATATATT	177035

AL669922.5	1901	TACATTATTTAATCTCCCCAGATCCCCATGAGGTAGTCATAGGTTTCCTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	177036	TACATTATTTAATCTCCCCAGATCCCCATGAGGTAGTCATAGGTTTCCTT	177085

AL669922.5	1951	GCCTCTGGCTCTCATAGACTCTCTGATGGCTGCTTGGCCAACTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663099.7	177086	GCCTCTGGCTCTCATAGACTCTCTGATGGCTGCTTGGCCAACTGGAATTC	177135

Overview

Query
AL669922.5 - 8647 bps
Hit
AL663099.7 - 177135 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link