<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662867.5	1	CCTGCATAAAGCTTCCCCCTCCCCAGTGGACAGACTGCAATGGGCTGGCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	115328	CCTGCATAAAGCTTCCCCCTCCCCAGTGGACAGACTGCAATGGGCTGGCA	115377

AL662867.5	51	TCTGACATTTGTCTGCAGACCTCATGGTAGGAGACAGGCTGGTTTTCTGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	115378	TCTGACATTTGTCTGCAGACCTCATGGTAGGAGACAGGCTGGTTTTCTGC	115427

AL662867.5	101	CCTGGGAGTGGGAGTGTAGGAAAGGAGGAGGCACTGGGGACCTGTATCCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	115428	CCTGGGAGTGGGAGTGTAGGAAAGGAGGAGGCACTGGGGACCTGTATCCC	115477

AL662867.5	151	AGGTTTTCAGGGCAAGGCTGTGTAAGTATTTCCAGCAGACTAGTGTGAGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	115478	AGGTTTTCAGGGCAAGGCTGTGTAAGTATTTCCAGCAGACTAGTGTGAGG	115527

AL662867.5	201	CATGCTAGGAAGCGAGCTGATGTGGAGCCGAGCTAATCCTGTCTGATGTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	115528	CATGCTAGGAAGCGAGCTGATGTGGAGCCGAGCTAATCCTGTCTGATGTG	115577

AL662867.5	251	GCCACCTACAGGCATCAACAGGCCTCAGCAGAGAGAAGCTGAAGTGATTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	115578	GCCACCTACAGGCATCAACAGGCCTCAGCAGAGAGAAGCTGAAGTGATTA	115627

AL662867.5	301	CTGCATTCCTATGAGCTGTGGGAGGAATAAATCGTGGAAAGAAATCCTCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	115628	CTGCATTCCTATGAGCTGTGGGAGGAATAAATCGTGGAAAGAAATCCTCA	115677

AL662867.5	351	TTTGCAACTGTATGGCATTAGGGGTGAGGGGTCTCGGAAGAAGCACCCAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	115678	TTTGCAACTGTATGGCATTAGGGGTGAGGGGTCTCGGAAGAAGCACCCAA	115727

AL662867.5	401	GGAGGAGGAATCCCCTGTAAGCCCCTACCAGTCCCAGAGAATGCAAAGCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	115728	GGAGGAGGAATCCCCTGTAAGCCCCTACCAGTCCCAGAGAATGCAAAGCC	115777

AL662867.5	451	CTCTTGCAAACCGTGCCTGCTCCACGCCCCAGACCACTCCTTCCCCCAAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	115778	CTCTTGCAAACCGTGCCTGCTCCACGCCCCAGACCACTCCTTCCCCCAAC	115827

AL662867.5	501	CCTTCCCCATTCTACTCAACCTTGGAGGGTTAGAAACCACCATTAGCAAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	115828	CCTTCCCCATTCTACTCAACCTTGGAGGGTTAGAAACCACCATTAGCAAG	115877

AL662867.5	551	ACAGGAGAAGAAGGATAGATGCATAATGTTGAGGACCTGTTTCCCCATTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	115878	ACAGGAGAAGAAGGATAGATGCATAATGTTGAGGACCTGTTTCCCCATTT	115927

AL662867.5	601	CTCATCTTCCCATCCTTGCAAAGCCCTTGCTGGAGGAAAGGAGACTTACC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	115928	CTCATCTTCCCATCCTTGCAAAGCCCTTGCTGGAGGAAAGGAGACTTACC	115977

AL662867.5	651	TTTGGAACTAAACGTTGAGTTTCTGAATTGGCATTGTGTTTGGTAATATA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	115978	TTTGGAACTAAACGTTGAGTTTCTGAATTGGCATTGTGTTTGGTAATATA	116027

AL662867.5	701	AAATAACTACAGGACCTAAGAGAGATCAGAACAGTCTTAGTACTGTCCAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116028	AAATAACTACAGGACCTAAGAGAGATCAGAACAGTCTTAGTACTGTCCAT	116077

AL662867.5	751	ATTTTCATCTTGGAATGGGGAAAACTGGCTCCACTGAGCAAGTTAAGGAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116078	ATTTTCATCTTGGAATGGGGAAAACTGGCTCCACTGAGCAAGTTAAGGAC	116127

AL662867.5	801	GTCATAGACTGATCTGTAGATGTTCAATGAAATCTGTAATTCAAGACTAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116128	GTCATAGACTGATCTGTAGATGTTCAATGAAATCTGTAATTCAAGACTAA	116177

AL662867.5	851	ATAACGTATTCTTGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116178	ATAACGTATTCTTGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAC	116227

AL662867.5	901	TTTGGGAGGCCGAGGAGGCGGGCGGAGGGCAGATCACCCGAGGGCAGGAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116228	TTTGGGAGGCCGAGGAGGCGGGCGGAGGGCAGATCACCCGAGGGCAGGAG	116277

AL662867.5	951	TTTGAGATCAGCCTGGCCAAAGTGGTGAAACCCCATCTCTATTAAAAATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116278	TTTGAGATCAGCCTGGCCAAAGTGGTGAAACCCCATCTCTATTAAAAATA	116327

AL662867.5	1001	CAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCTCAGCCACTCGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116328	CAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCTCAGCCACTCGG	116377

AL662867.5	1051	GAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCACGAGACAGAGGTTACAGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116378	GAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCACGAGACAGAGGTTACAGTG	116427

AL662867.5	1101	AGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCTACAAGAGCAAGACTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116428	AGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCTACAAGAGCAAGACTC	116477

AL662867.5	1151	CATCTCAAGGAAAAAAAACTAATTAATAATAATAACTTATTCTTGAGACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116478	CATCTCAAGGAAAAAAAACTAATTAATAATAATAACTTATTCTTGAGACA	116527

AL662867.5	1201	CATGCGATGCAAGACAAGTATTTATTGCTAGGATCTCCTCAGGTAAGCTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116528	CATGCGATGCAAGACAAGTATTTATTGCTAGGATCTCCTCAGGTAAGCTG	116577

AL662867.5	1251	TGCAGTAAGTCTGTGCTGTCCTACATGGTAGCCATTAGCCACATGTAGCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116578	TGCAGTAAGTCTGTGCTGTCCTACATGGTAGCCATTAGCCACATGTAGCA	116627

AL662867.5	1301	ACTGAGCACATGAAGTGTGGCTAGTCCAAATACAAATGTGCTCTTAAGTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116628	ACTGAGCACATGAAGTGTGGCTAGTCCAAATACAAATGTGCTCTTAAGTG	116677

AL662867.5	1351	CAAGACACACATGAGATTTCAAAGACTTAGTACAAAAACAGTAAAATATC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116678	CAAGACACACATGAGATTTCAAAGACTTAGTACAAAAACAGTAAAATATC	116727

AL662867.5	1401	TCACTAATAATTTTTATGTTTATTACTTGTCAAAATCACAATATTTTGGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116728	TCACTAATAATTTTTATGTTTATTACTTGTCAAAATCACAATATTTTGGA	116777

AL662867.5	1451	TATGCTGTGTTAAATAAAATTTACTATTAGAATTAATTTCACCTGTTGTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116778	TATGCTGTGTTAAATAAAATTTACTATTAGAATTAATTTCACCTGTTGTT	116827

AL662867.5	1501	TTTTACCTTTTTGATGTGACTACTAGAACTTTGTAAATTACACGGAGCTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116828	TTTTACCTTTTTGATGTGACTACTAGAACTTTGTAAATTACACGGAGCTC	116877

AL662867.5	1551	GCTTTCTGTGGACATGTAGTCTCTCTCACAGAGAAATACATGTATATTTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116878	GCTTTCTGTGGACATGTAGTCTCTCTCACAGAGAAATACATGTATATTTC	116927

AL662867.5	1601	TGCTGGACATGTAGTCTCTCTCACAGGTCATAAGGCACTGAGGTCACAGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116928	TGCTGGACATGTAGTCTCTCTCACAGGTCATAAGGCACTGAGGTCACAGG	116977

AL662867.5	1651	CCATAGGTTGGGATGTTTCTCCTCCAGAGAGTAGCTCATTCTCACTTTAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	116978	CCATAGGTTGGGATGTTTCTCCTCCAGAGAGTAGCTCATTCTCACTTTAA	117027

AL662867.5	1701	ATCATCCTAAAGAACACAGGTACTGGTAGGTAGGTGGGCCGCAAGCTGGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	117028	ATCATCCTAAAGAACACAGGTACTGGTAGGTAGGTGGGCCGCAAGCTGGA	117077

AL662867.5	1751	TTGAGTGGGGAAACTTCCTGCTGTCTTTGAACCAGAACAAGAACAGAGTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	117078	TTGAGTGGGGAAACTTCCTGCTGTCTTTGAACCAGAACAAGAACAGAGTT	117127

AL662867.5	1801	GGGAGCCTGTATTTTGCATAGTGAAGGCACACTCAAGGGAGCCACCTATC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	117128	GGGAGCCTGTATTTTGCATAGTGAAGGCACACTCAAGGGAGCCACCTATC	117177

AL662867.5	1851	TTGGGGAGTTATGCTGGCCCCCAAAACTCAGAGCGTGCTAAAGGTGAGGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	117178	TTGGGGAGTTATGCTGGCCCCCAAAACTCAGAGCGTGCTAAAGGTGAGGC	117227

AL662867.5	1901	AGAGAAGCCTCCTGTAGCAAGTGCATACAGGGAGGGGCGTGGGCCTCTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	117228	AGAGAAGCCTCCTGTAGCAAGTGCATACAGGGAGGGGCGTGGGCCTCTGA	117277

AL662867.5	1951	AATCTGAAAGCACCATGTCTCATTTCCAGTTTTAAGTGTACCTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663093.10	117278	AATCTGAAAGCACCATGTCTCATTTCCAGTTTTAAGTGTACCTGGAATTC	117327

Overview

Query
AL662867.5 - 70288 bps
Hit
AL663093.10 - 117327 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link