<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645727.16	1	GAATTCCAACAGCTTCAACCCAGTGTAGGCAGTCTCAGGAGAAAAAAAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	144583	GAATTCCAACAGCTTCAACCCAGTGTAGGCAGTCTCAGGAGAAAAAAAAA	144632

AL645727.16	51	AAAAGACATTACCAATGAAAACCCACTTTTATTTTCTATATTTAAAAAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	144633	AAAAGACATTACCAATGAAAACCCACTTTTATTTTCTATATTTAAAAAAT	144682

AL645727.16	101	AATAGCATGAAAAACTCACTAAAAAATACCTATTAACTGGACAAAACCAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	144683	AATAGCATGAAAAACTCACTAAAAAATACCTATTAACTGGACAAAACCAC	144732

AL645727.16	151	ATTCGAAGCAGTGTTTTGTATTGCCCATTCATGTGCCATGTGACATGAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	144733	ATTCGAAGCAGTGTTTTGTATTGCCCATTCATGTGCCATGTGACATGAAA	144782

AL645727.16	201	CTATTTTGATTGGGACTGTCACAGATAATTTCTACACATAAAAATGCACC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	144783	CTATTTTGATTGGGACTGTCACAGATAATTTCTACACATAAAAATGCACC	144832

AL645727.16	251	TAGGGACAGCTTTCAAATGGAGTTGTCACTTTCTGTTTAGCAGGCAGGAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	144833	TAGGGACAGCTTTCAAATGGAGTTGTCACTTTCTGTTTAGCAGGCAGGAG	144882

AL645727.16	301	ATATTCTATTGTTGTCAACCCCTCTTTACAAAAGCATCGCTAATACAGTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	144883	ATATTCTATTGTTGTCAACCCCTCTTTACAAAAGCATCGCTAATACAGTG	144932

AL645727.16	351	ATGCACTGTCCTGGAGAAGGGGGCTCGCCATTCTGCCTGATGGGAACAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	144933	ATGCACTGTCCTGGAGAAGGGGGCTCGCCATTCTGCCTGATGGGAACAGA	144982

AL645727.16	401	AGGAGCAACGCTGCTTGATGTCAGGGCTCCCAGAGCTCGAGGGCTCCTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	144983	AGGAGCAACGCTGCTTGATGTCAGGGCTCCCAGAGCTCGAGGGCTCCTTT	145032

AL645727.16	451	GTCCAACTCAGACACCTCTGCACCCAACAATCCTTTCACAGTCTTGGAAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145033	GTCCAACTCAGACACCTCTGCACCCAACAATCCTTTCACAGTCTTGGAAT	145082

AL645727.16	501	TGGATTTCTTTTTCCTGTGCTGGTTTTAGAAAACTGTAAAAAGATTAATG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145083	TGGATTTCTTTTTCCTGTGCTGGTTTTAGAAAACTGTAAAAAGATTAATG	145132

AL645727.16	551	TAGATTGTTATTCTCTGAAACACAGATTAGTAAAGCCACATGAATTTGTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145133	TAGATTGTTATTCTCTGAAACACAGATTAGTAAAGCCACATGAATTTGTT	145182

AL645727.16	601	ATCTACTCAACACATGAAGTCATGGAAAGTTAAGAAAGCAACCCTGGACT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145183	ATCTACTCAACACATGAAGTCATGGAAAGTTAAGAAAGCAACCCTGGACT	145232

AL645727.16	651	GTCTCTAGATTTACACCCACACCCACACACACTCATCCAGCCCCACCTAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145233	GTCTCTAGATTTACACCCACACCCACACACACTCATCCAGCCCCACCTAC	145282

AL645727.16	701	CCCCCCACATACACATATGCACACACAAATGTACACATATGCTCACACAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145283	CCCCCCACATACACATATGCACACACAAATGTACACATATGCTCACACAC	145332

AL645727.16	751	ATACATGCATGCACGTGCACATATACAAATGCACACACACATGCACTTCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145333	ATACATGCATGCACGTGCACATATACAAATGCACACACACATGCACTTCC	145382

AL645727.16	801	ATACACACAGGTGCACACATATGTACACTTTCTCTTTACTGACTTTCAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145383	ATACACACAGGTGCACACATATGTACACTTTCTCTTTACTGACTTTCAAA	145432

AL645727.16	851	GATGGCCAAGTGATACAAGGTAGGAGCTAAGGAGTCCTCTTGGCTTCTGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145433	GATGGCCAAGTGATACAAGGTAGGAGCTAAGGAGTCCTCTTGGCTTCTGT	145482

AL645727.16	901	ATATTTTCTCTCTTAAGATATCTCATTCCCAAGAAAGAATGTTTTCTTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145483	ATATTTTCTCTCTTAAGATATCTCATTCCCAAGAAAGAATGTTTTCTTTT	145532

AL645727.16	951	TAATTTTATTTGGTGTTTAACTCCCAGAAACAGAAACCAATTAGGACAAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145533	TAATTTTATTTGGTGTTTAACTCCCAGAAACAGAAACCAATTAGGACAAA	145582

AL645727.16	1001	GCAGTCTGCCCAGAGGACCAGAATGGTGCTCACAGTTGCCAGCTTCTGCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145583	GCAGTCTGCCCAGAGGACCAGAATGGTGCTCACAGTTGCCAGCTTCTGCA	145632

AL645727.16	1051	GAATGCCACATGGTTATCAGCCCTGGGTGTGGATAACAGGGGGTTGGGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145633	GAATGCCACATGGTTATCAGCCCTGGGTGTGGATAACAGGGGGTTGGGGG	145682

AL645727.16	1101	GAGCAGGTACTATTTCTCCACCCCAGCCTAAGATTGCAAAAGTGGTGCCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145683	GAGCAGGTACTATTTCTCCACCCCAGCCTAAGATTGCAAAAGTGGTGCCT	145732

AL645727.16	1151	ATGGAACAAAGGGGACAGAAATGACTAGAAAAACCAGTAGCTACTTGGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145733	ATGGAACAAAGGGGACAGAAATGACTAGAAAAACCAGTAGCTACTTGGAT	145782

AL645727.16	1201	GGCAGAGGTATTGATAACTGATATCCTAGGTCAGGGGAGAAAAGTAAGAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145783	GGCAGAGGTATTGATAACTGATATCCTAGGTCAGGGGAGAAAAGTAAGAA	145832

AL645727.16	1251	AGAAAAAAATTAAAATAATGACCAAAACCAAAGGGAGACATGGTCTATTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145833	AGAAAAAAATTAAAATAATGACCAAAACCAAAGGGAGACATGGTCTATTG	145882

AL645727.16	1301	CTGGTAAGAGCTTGGGATGATCAGCTTTATTATTATATTGTAATCATATA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145883	CTGGTAAGAGCTTGGGATGATCAGCTTTATTATTATATTGTAATCATATA	145932

AL645727.16	1351	TTATTATTATATTGTAATCATATATTATTATTATATTGTAATCATATATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145933	TTATTATTATATTGTAATCATATATTATTATTATATTGTAATCATATATT	145982

AL645727.16	1401	ATTTTATAACTACATATCAGAAACTCCTTTGAAGCTCAGAGGCTTGAGCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	145983	ATTTTATAACTACATATCAGAAACTCCTTTGAAGCTCAGAGGCTTGAGCT	146032

AL645727.16	1451	CTGGGATAGGAATTCTCTCATGTAGCCCATGCAATTTCCCTACCATCTTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	146033	CTGGGATAGGAATTCTCTCATGTAGCCCATGCAATTTCCCTACCATCTTA	146082

AL645727.16	1501	TTTCCGTGCTGTCCCCCACTGTAGCCGTCAACCATCATCACTGTCAACCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	146083	TTTCCGTGCTGTCCCCCACTGTAGCCGTCAACCATCATCACTGTCAACCA	146132

AL645727.16	1551	TTAAGCCTCTTTTCCCATTGATGAAGAGGGGTCACTTCCACAAATTTAGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	146133	TTAAGCCTCTTTTCCCATTGATGAAGAGGGGTCACTTCCACAAATTTAGC	146182

AL645727.16	1601	ACATTACCCCATGCAGTCTTCTGCTTTTCAAAGTGCAACTTAATTCTTAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	146183	ACATTACCCCATGCAGTCTTCTGCTTTTCAAAGTGCAACTTAATTCTTAG	146232

AL645727.16	1651	TGTATCAGTTATAAGAAACACAAGCAAACTTAAAATTCTATTTATGACTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	146233	TGTATCAGTTATAAGAAACACAAGCAAACTTAAAATTCTATTTATGACTC	146282

AL645727.16	1701	AGACAACGCACAAAGTAATGAGATTCTGTGTTATGGAAGCTGTCACATCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	146283	AGACAACGCACAAAGTAATGAGATTCTGTGTTATGGAAGCTGTCACATCT	146332

AL645727.16	1751	TGTCTCAGCCCTGTTGTGTCTAAATGTTCACTCCCTTATTAAGCTCCATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	146333	TGTCTCAGCCCTGTTGTGTCTAAATGTTCACTCCCTTATTAAGCTCCATT	146382

AL645727.16	1801	AGGGAATTTTACAATAGCAAATTGTTTATCTGCTCCTGGTTTTCTGCTGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	146383	AGGGAATTTTACAATAGCAAATTGTTTATCTGCTCCTGGTTTTCTGCTGC	146432

AL645727.16	1851	CTGACAGTCGGGCACGTTTCACTCATTAATGTGGGTGATATTGTACACTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	146433	CTGACAGTCGGGCACGTTTCACTCATTAATGTGGGTGATATTGTACACTG	146482

AL645727.16	1901	TTGGGAATAAAAATCAGGAGGAAAGTAGTGGGCACTGATTCCTTTCCTGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	146483	TTGGGAATAAAAATCAGGAGGAAAGTAGTGGGCACTGATTCCTTTCCTGT	146532

AL645727.16	1951	GTGTGTCATAATATTCACTTCTACGTTGATCTTGTTTACAAGTTGTGGTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662920.14	146533	GTGTGTCATAATATTCACTTCTACGTTGATCTTGTTTACAAGTTGTGGTC	146582

Overview

Query
AL645727.16 - 218427 bps
Hit
AL662920.14 - 146582 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link