<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL671762.10	1	AGCAAGATAGGGTGAAAACTTAGAAGGGGCTGCTGAGGGGTGAGCCCCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	134494	AGCAAGATAGGGTGAAAACTTAGAAGGGGCTGCTGAGGGGTGAGCCCCTT	134543

AL671762.10	51	CCCACTCCTAGTACCTTTCTTTTCCCCGGGTGGGGTTGGGAGGTCATAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	134544	CCCACTCCTAGTACCTTTCTTTTCCCCGGGTGGGGTTGGGAGGTCATAGG	134593

AL671762.10	101	TAATGACCCCAGGATCCCGTTTCTCCCTCTTCTCTGGTTTTGGTTTCTTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	134594	TAATGACCCCAGGATCCCGTTTCTCCCTCTTCTCTGGTTTTGGTTTCTTC	134643

AL671762.10	151	TGCTTGGGAGGGAGAAGACATAGGCCCAGGCATCAGCCAACCCATCACCG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	134644	TGCTTGGGAGGGAGAAGACATAGGCCCAGGCATCAGCCAACCCATCACCG	134693

AL671762.10	201	CACACATCAACTTTCCTTCCAGCTCCACCCTCGCCTCACCTCCCCTGGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	134694	CACACATCAACTTTCCTTCCAGCTCCACCCTCGCCTCACCTCCCCTGGAG	134743

AL671762.10	251	GTGGCTGCTGCTGTTGGATCTTCTGCTTCTGTTGGAATTTCTCTAGCTTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	134744	GTGGCTGCTGCTGTTGGATCTTCTGCTTCTGTTGGAATTTCTCTAGCTTC	134793

AL671762.10	301	TCCCGTTTCTTTGCCTCTTTCTTGAGCTGAGCAGCTGTCTTTGGGAGGGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	134794	TCCCGTTTCTTTGCCTCTTTCTTGAGCTGAGCAGCTGTCTTTGGGAGGGC	134843

AL671762.10	351	AGGAGCCTCGGGGCCTAGAGAGAGGTGCAGAAATTCAGACTCAGCCAGCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	134844	AGGAGCCTCGGGGCCTAGAGAGAGGTGCAGAAATTCAGACTCAGCCAGCT	134893

AL671762.10	401	GGGGACCCTCTTGGACGGCCATACTAGGTTTCAGATGGGGTATTTTAGAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	134894	GGGGACCCTCTTGGACGGCCATACTAGGTTTCAGATGGGGTATTTTAGAT	134943

AL671762.10	451	GCCCGAGGTCTTGCCCATGCTGACCTCCCCCCTCTCCCTCCTCTCCCGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	134944	GCCCGAGGTCTTGCCCATGCTGACCTCCCCCCTCTCCCTCCTCTCCCGCA	134993

AL671762.10	501	GGACCCTGCCCCAGTGATTCTGCCATTTCTAGGAAAAAAAGAAAGTGAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	134994	GGACCCTGCCCCAGTGATTCTGCCATTTCTAGGAAAAAAAGAAAGTGAGT	135043

AL671762.10	551	TGCATGGAAGGCCCCAGGGAAGCCCCTATCCTCCAACTCCTCGCCCTTCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135044	TGCATGGAAGGCCCCAGGGAAGCCCCTATCCTCCAACTCCTCGCCCTTCC	135093

AL671762.10	601	TCACCTGGCTGATGAGAGAGAGGCCTGGCTCCTGAGTATAGAACCACTTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135094	TCACCTGGCTGATGAGAGAGAGGCCTGGCTCCTGAGTATAGAACCACTTC	135143

AL671762.10	651	TCCTAGCACGGCTCGGAATTCTGGCTGCCGGACACACGTGACAAACCAGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135144	TCCTAGCACGGCTCGGAATTCTGGCTGCCGGACACACGTGACAAACCAGC	135193

AL671762.10	701	GAGTCACATTATTCCAGATCCGGCGGGCAGGTGGGTCTAGGACCTGGAAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135194	GAGTCACATTATTCCAGATCCGGCGGGCAGGTGGGTCTAGGACCTGGAAC	135243

AL671762.10	751	AGGAAATAAATGACTCTTCTCAGTCACCCTACAGTGAGGTCTGAGGAGAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135244	AGGAAATAAATGACTCTTCTCAGTCACCCTACAGTGAGGTCTGAGGAGAG	135293

AL671762.10	801	CAGTCTTGTTCTTCCCCAGGCCTGGTGACTCACGTATCGGAAAGGCAGCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135294	CAGTCTTGTTCTTCCCCAGGCCTGGTGACTCACGTATCGGAAAGGCAGCA	135343

AL671762.10	851	GCAAGGCTGTGACAGCCGCCAGGTCAGCCAGAGTGGGGGCCTCCCCGGCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135344	GCAAGGCTGTGACAGCCGCCAGGTCAGCCAGAGTGGGGGCCTCCCCGGCC	135393

AL671762.10	901	AAGTAGGTGTGCAGCCGAAGCCACTCCTCCAAGGGGCTCAGGGCCCTGCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135394	AAGTAGGTGTGCAGCCGAAGCCACTCCTCCAAGGGGCTCAGGGCCCTGCC	135443

AL671762.10	951	CAGGGCCCCCAGCACAGCCTGGCAGGAAGGGGAAGAAGTGTGAGACAAGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135444	CAGGGCCCCCAGCACAGCCTGGCAGGAAGGGGAAGAAGTGTGAGACAAGG	135493

AL671762.10	1001	TTTGGCCCACCTCCATCTCCCACCACAACCCAATCCATGTGGCCTCCCTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135494	TTTGGCCCACCTCCATCTCCCACCACAACCCAATCCATGTGGCCTCCCTC	135543

AL671762.10	1051	CACCCCACTCTCACAAATCACCACCTCTGAGTCCCATTTCTTCACTCAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135544	CACCCCACTCTCACAAATCACCACCTCTGAGTCCCATTTCTTCACTCAAA	135593

AL671762.10	1101	TAGTCACAATAAAAATACTTCTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135594	TAGTCACAATAAAAATACTTCTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAG	135643

AL671762.10	1151	ACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135644	ACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAA	135693

AL671762.10	1201	AAAAATAGCCAGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135694	AAAAATAGCCAGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGA	135743

AL671762.10	1251	GGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135744	GGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAG	135793

AL671762.10	1301	CCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAGCGAGACTCCGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135794	CCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAGCGAGACTCCGT	135843

AL671762.10	1351	CTCAGAAAAAAAAAAACAAAACACTTCTGACTCATCCAACAAATCCCTAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135844	CTCAGAAAAAAAAAAACAAAACACTTCTGACTCATCCAACAAATCCCTAC	135893

AL671762.10	1401	TCAATACTTATGTGTTAGATGCAATATGTTAAGCATAGAAGTAAAGATTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135894	TCAATACTTATGTGTTAGATGCAATATGTTAAGCATAGAAGTAAAGATTA	135943

AL671762.10	1451	TATGAGGCATCTCAATAACTGCCAGGTTCAGAACATCAATAAATATGTAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135944	TATGAGGCATCTCAATAACTGCCAGGTTCAGAACATCAATAAATATGTAT	135993

AL671762.10	1501	TAAGTACTTCTCCAGGGAATGAGAGGAAAACACGAACAGATGGACAGAAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	135994	TAAGTACTTCTCCAGGGAATGAGAGGAAAACACGAACAGATGGACAGAAC	136043

AL671762.10	1551	CCTGACCTGGTAGAGTTAACATTCTTGTAGGGGAACAACAAATGAGCAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	136044	CCTGACCTGGTAGAGTTAACATTCTTGTAGGGGAACAACAAATGAGCAAA	136093

AL671762.10	1601	TATAAAATGAAGTGCCCTATTTTTCTTAACTCCTATGAAGAAAAATAAAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	136094	TATAAAATGAAGTGCCCTATTTTTCTTAACTCCTATGAAGAAAAATAAAG	136143

AL671762.10	1651	CAGAATGAGGGGAACAGGGGCCAGGCGTGGTGGCTCACACCTATAATCTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	136144	CAGAATGAGGGGAACAGGGGCCAGGCGTGGTGGCTCACACCTATAATCTC	136193

AL671762.10	1701	AGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGAGCAGACCATCTGAGGTTAGGAGTTCGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	136194	AGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGAGCAGACCATCTGAGGTTAGGAGTTCGA	136243

AL671762.10	1751	GACCAGCCTGGTCAACATGACAAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	136244	GACCAGCCTGGTCAACATGACAAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAA	136293

AL671762.10	1801	AATTAGCCGGACAAGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	136294	AATTAGCCGGACAAGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGG	136343

AL671762.10	1851	CTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAGCAGTGAGCTGAGATCGCACCATCGCAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	136344	CTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAGCAGTGAGCTGAGATCGCACCATCGCAC	136393

AL671762.10	1901	CGTGGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAAGGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	136394	CGTGGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAAGGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAA	136443

AL671762.10	1951	AAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAATAAAAGAGGGGAACAAACAGGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662899.5	136444	AAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAATAAAAGAGGGGAACAAACAGGGAATTC	136493

Overview

Query
AL671762.10 - 113582 bps
Hit
AL662899.5 - 136493 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link