<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2302 bps / non-identical: 50 bps

Full alignment

CR753905.3	1	GGCCAATATGGTGAAACCCCTTCTCTACCAACAATACAAAAATCAGCCAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13290	GGCCAATATGGTGAAACCCCTTCTCTACCAACAATACAAAAATCAGCCAG	13339

CR753905.3	51	GCATGGTGGCGGGCACCTGTAATCCTAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13340	GCATGGTGGCGGGCACCTGTAATCCTAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGG	13389

CR753905.3	101	AGAATAGCTTGAACCCTGGAGGTGGAGATTGCAATGAGCAGAGATTGTGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13390	AGAATAGCTTGAACCCTGGAGGTGGAGATTGCAATGAGCAGAGATTGTGC	13439

CR753905.3	151	CACTGCACTCCAGCCAGGGCGACAAAGTGAGACTCAAAAATAAATAAATA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13440	CACTGCACTCCAGCCAGGGCGACAAAGTGAGACTCAAAAATAAATAAATA	13489

CR753905.3	201	AATAAATAAAATGCCGGGCACGGTGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13490	AATAAATAAAATGCCGGGCACGGTGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT	13539

CR753905.3	251	TGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13540	TGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAAC	13589

CR753905.3	301	CTGGCCAACATGATGAAACCTCGTCTCTACTAAAAAAACACAAAAATTAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13590	CTGGCCAACATGATGAAACCTCGTCTCTACTAAAAAAACACAAAAATTAG	13639

CR753905.3	351	CCGGGCGTGATGGCGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13640	CCGGGCGTGATGGCGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG	13689

CR753905.3	401	CAGGAGAATCGCTTTACCCGGAGAGGCGGAGTTTTCAGTGAGCCGAGATC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13690	CAGGAGAATCGCTTTACCCGGAGAGGCGGAGTTTTCAGTGAGCCGAGATC	13739

CR753905.3	451	GTGCCACTGCACTCCTGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13740	GTGCCACTGCACTCCTGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAA	13789

CR753905.3	501	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-AAAAGAAAAGGGTGATTTTGTG	549
			||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13790	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGGGTGATTTTGTG	13839

CR753905.3	550	TTGTGTTTGTTAAATTCATGAAACAAGTAGGACAAGACCATAAATTGAAA	599
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13840	TTGTGTTTGTTAAATTCATGAAACAAGTAGGACAAGACCATAAATTGAAA	13889

CR753905.3	600	AACCAAGCCCATTCCAAATTACGAATGCCTCCGGTAGTACCTATGCCAGG	649
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13890	AACCAAGCCCATTCCAAATTACGAATGCCTCCGGTAGTACCTATGCCAGG	13939

CR753905.3	650	GACAAAGTGCACTTTAATAGTCAATACACAGGTTGCTTACCGGGTTCTTG	699
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13940	GACAAAGTGCACTTTAATAGTCAATACACAGGTTGCTTACCGGGTTCTTG	13989

CR753905.3	700	TTTTTTTTGTCAATAGTCTTCTTTCATTTCAAGTTCCCAAAGTCTTGGGA	749
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13990	TTTTTTTTGTCAATAGTCTTCTTTCATTTCAAGTTCCCAAAGTCTTGGGA	14039

CR753905.3	750	ACAAGCCGGTTTTTTTTTTTTTAACTGGCTTGCAGAAAGCTCAAGGAGAT	799
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14040	ACAAGCCGGTTTTTTTTTTTTTAACTGGCTTGCAGAAAGCTCAAGGAGAT	14089

CR753905.3	800	GTGCAGAAAGTAAAGATATTTCCTGACAATAGTAAGAACACGACCACGAA	849
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14090	GTGCAGAAAGTAAAGATATTTCCTGACAATAGTAAGAACACGACCACGAA	14139

CR753905.3	850	GGGACTCGAACCCTCAATCTTCTGATCCGGAATCAGACGCCTTATCCATT	899
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14140	GGGACTCGAACCCTCAATCTTCTGATCCGGAATCAGACGCCTTATCCATT	14189

CR753905.3	900	AGGCCACGCGGCCGCACGCGGGTGCTAATTTGCACACATCAAGACTGAAG	949
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14190	AGGCCACGCGGCCGCACGCGGGTGCTAATTTGCACACATCAAGACTGAAG	14239

CR753905.3	950	TGTAGTGAGGAAACGTTGAGTTTCTGTTTTCAAACCTTTAACTTCGTAAT	999
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14240	TGTAGTGAGGAAACGTTGAGTTTCTGTTTTCAAACCTTTAACTTCGTAAT	14289

CR753905.3	1000	TAGAGATTTAACAACTTGAAGGGGGGCGGGGAGAGGCGGGGGAGGAGGTG	1049
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14290	TAGAGATTTAACAACTTGAAGGGGGGCGGGGAGAGGCGGGGGAGGAGGTG	14339

CR753905.3	1050	GGCAGAAGGAATAAAACTCCATCTAAAATTCCTAATAGCAATTCCTTAGA	1099
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14340	GGCAGAAGGAATAAAACTCCATCTAAAATTCCTAATAGCAATTCCTTAGA	14389

CR753905.3	1100	ATTATAAACTGCGAGATGATCAGAAGTGACATCTTTGCCTTCTTTGAAGG	1149
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14390	ATTATAAACTGCGAGATGATCAGAAGTGACATCTTTGCCTTCTTTGAAGG	14439

CR753905.3	1150	CTCTCTTCTCTAAGTTACTAATAATGATAATGCACGTTCGGGTACAGAAA	1199
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14440	CTCTCTTCTCTAAGTTACTAATAATGATAATGCACGTTCGGGTACAGAAA	14489

CR753905.3	1200	TATGAGCCAAGAACTCAAGTCTGCAATGAAGGAGTGGACATGACAGCGTA	1249
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14490	TATGAGCCAAGAACTCAAGTCTGCAATGAAGGAGTGGACATGACAGCGTA	14539

CR753905.3	1250	AGAGGGAGCATCATTGTTTGATCTATTTTAACCTTTTCCGTCTCAAAGAT	1299
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14540	AGAGGGAGCATCATTGTTTGATCTATTTTAACCTTTTCCGTCTCAAAGAT	14589

CR753905.3	1300	ACGATGGTGCTTCCTCCAGGAAGAAAAGCCTGTAAGCTCAAACAAGAGCT	1349
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14590	ACGATGGTGCTTCCTCCAGGAAGAAAAGCCTGTAAGCTCAAACAAGAGCT	14639

CR753905.3	1350	CCCCTGGAACAGAAGACACTGGAGACCGTAAGAGGTGGGAGGTTGGAAGG	1399
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14640	CCCCTGGAACAGAAGACACTGGAGACCGTAAGAGGTGGGAGGTTGGAAGG	14689

CR753905.3	1400	GGGAAAAGGATAGAAAAACTGCCTGTTGGGTATTATGCTCACCACATGGG	1449
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14690	GGGAAAAGGATAGAAAAACTGCCTGTTGGGTATTATGCTCACCACATGGG	14739

CR753905.3	1450	TGACGGGTTCAATCGTACTCCAGACATCAGCAACACGCAATACACCCTTG	1499
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14740	TGACGGGTTCAATCGTACTCCAGACATCAGCAACACGCAATACACCCTTG	14789

CR753905.3	1500	TCCCAAACCTGCACTGTACTCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATTAA	1549
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14790	TCCCAAACCTGCACTGTACTCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATTAA	14839

CR753905.3	1550	AAAAAAAAAAAAAGCTCCCCCTTGTCAGAAAAGCCCCAAGTATTTTGCCT	1599
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14840	AAAAAAAAAAAAAGCTCCCCCTTGTCAGAAAAGCCCCAAGTATTTTGCCT	14889

CR753905.3	1600	AAAGGTTGATTGCTCTAAGCTCACCTTTGGATTGATCCAGAAAACAGTCT	1649
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14890	AAAGGTTGATTGCTCTAAGCTCACCTTTGGATTGATCCAGAAAACAGTCT	14939

CR753905.3	1650	GGGGCGATTTTTTGTTACCCTTTCCCCAGCTATGTCCCCTATGTTGATAG	1699
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14940	GGGGCGATTTTTTGTTACCCTTTCCCCAGCTATGTCCCCTATGTTGATAG	14989

CR753905.3	1700	GGTAGGAAAGATTAAAAAAAAAAACAACAACCAAGTTTGTAAAGTAAACC	1749
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	14990	GGTAGGAAAGATTAAAAAAAAAAACAACAACCAAGTTTGTAAAGTAAACC	15039

CR753905.3	1750	AATCACAGATTCCCTCAGTTTTCGCATCGTCTTGGCTTCATGGAAATGAC	1799
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	15040	AATCACAGATTCCCTCAGTTTTCGCATCGTCTTGGCTTCATGGAAATGAC	15089

CR753905.3	1800	GAGTTACTGGGAAGAAACTATTTCATTTTTCCAGTGCCCAGTCCTATCTC	1849
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	15090	GAGTTACTGGGAAGAAACTATTTCATTTTTCCAGTGCCCAGTCCTATCTC	15139

CR753905.3	1850	CTTTCCCCAGAGAGATGCATCTCTCAGCCCTAAACTTTTCCTGGATCCCT	1899
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	15140	CTTTCCCCAGAGAGATGCATCTCTCAGCCCTAAACTTTTCCTGGATCCCT	15189

CR753905.3	1900	TGTACACCATTTTCTCCAGGTTTCTCCAGTCAAAACTCAAGAATTGTTTT	1949
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	15190	TGTACACCATTTTCTCCAGGTTTCTCCAGTCAAAACTCAAGAATTGTTTT	15239

CR753905.3	1950	AGGCCATATTTTGGATGGTGTATCCTATGTACACTAATTTATTAAGTAAT	1999
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	15240	AGGCCATATTTTGGATGGTGTATCCTATGTACACTAATTTATTAAGTAAT	15289

CR753905.3	2000	GACCCATGTTTGAGACCACGGAACGCTAGTTCTGGGGCCGGACTAGATGA	2049
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	15290	GACCCATGTTTGAGACCACGGAACGCTAGTTCTGGGGCCGGACTAGATGA	15339

CR753905.3	2050	GTCTGGGTAGACAAAAGAAAGGTCTTCTGCTGTTCCCTATGAAACTGATT	2099
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	15340	GTCTGGGTAGACAAAAGAAAGGTCTTCTGCTGTTCCCTATGAAACTGATT	15389

CR753905.3	2100	TAGTTAAGTCCCTTTCTTTCTCAGAAAGCGTCCTATGAGGAGCATTAGAT	2149
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	15390	TAGTTAAGTCCCTTTCTTTCTCAGAAAGCGTCCTATGAGGAGCATTAGAT	15439

CR753905.3	2150	TGAATAAGGGTTTCTGGTGTGATCCAGTTTGGGGAGGCTACTTGCTCTAG	2199
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	15440	TGAATAAGGGTTTCTGGTGTGATCCAGTTTGGGGAGGCTACTTGCTCTAG	15489

CR753905.3	2200	TCAGTGCTGAAGAATCCATCTCCATTTTGGGCAAGATGCACTACCATGAC	2249
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	15490	TCAGTGCTGAAGAATCCATCTCCATTTTGGGCAAGATGCACTACCATGAC	15539

CR753905.3	2250	TTATGTTTCAACAGACTCAAACTTATTCACATGTTTTGAAATTGTTCTCA	2299
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662890.3	15540	TTATGTTTCAACAGACTCAAACTTATTCACATGTTTTGAAATTGTTCTCA	15589

CR753905.3	2300	GTT	2302
			|||
AL662890.3	15590	GTT	15592

Compact alignment

skip 500 bps 100% identity alignment

CR753905.3	501	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-AAAAGAAAAGGGTGATTTTGTG	549
			||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
AL662890.3	13790	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGGGTGATTTTGTG	13839

skip 1753 bps 100% identity alignment

Overview

Query
CR753905.3 - 2302 bps
Hit
AL662890.3 - 137288 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2302 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link