<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL592151.13	1	GAATTCTTATTGTCATGAAGAACATGAACATGGGGGGTGGGGGGCAGTAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125037	GAATTCTTATTGTCATGAAGAACATGAACATGGGGGGTGGGGGGCAGTAC	125086

AL592151.13	51	AGGAAAGGAACAACTGCAAGCTGCCATGCTGAGTTTAACAACAATCATCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125087	AGGAAAGGAACAACTGCAAGCTGCCATGCTGAGTTTAACAACAATCATCA	125136

AL592151.13	101	AAAGGGGCTTTGGGAGCTCACCAGCTGCAAAGTTTTTGTATTAGGCTGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125137	AAAGGGGCTTTGGGAGCTCACCAGCTGCAAAGTTTTTGTATTAGGCTGTG	125186

AL592151.13	151	ATTCCATTGGGAGGATGGGAGCCCCTAAATAATGATGTCAAAGGGGTTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125187	ATTCCATTGGGAGGATGGGAGCCCCTAAATAATGATGTCAAAGGGGTTTT	125236

AL592151.13	201	TACATGCCCAGGAAGCTATTTCAAGCAAACAAAAATCTACATTTATTCCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125237	TACATGCCCAGGAAGCTATTTCAAGCAAACAAAAATCTACATTTATTCCT	125286

AL592151.13	251	AATGGAGGTTAAGGCCTTTGGGGATTAGAGATAGAGAGTGTAGATGGCTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125287	AATGGAGGTTAAGGCCTTTGGGGATTAGAGATAGAGAGTGTAGATGGCTA	125336

AL592151.13	301	TTATCTAAATAAACTTACTGTTCCTAGCACAACAAAGGAATATATTCCTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125337	TTATCTAAATAAACTTACTGTTCCTAGCACAACAAAGGAATATATTCCTA	125386

AL592151.13	351	AAAAGAAATATAGGATATTATTTTCACCGTAAAACTGCAAAGAAATGAAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125387	AAAAGAAATATAGGATATTATTTTCACCGTAAAACTGCAAAGAAATGAAC	125436

AL592151.13	401	ACTTTTTCCAAGAACAAACAAAAATGTCAGAAGTTTCATTTTGAAAGTTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125437	ACTTTTTCCAAGAACAAACAAAAATGTCAGAAGTTTCATTTTGAAAGTTA	125486

AL592151.13	451	TACGGCAAAGTGAATTTGAGAATTAAAAGGGAATTAGAGGATAATTTCAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125487	TACGGCAAAGTGAATTTGAGAATTAAAAGGGAATTAGAGGATAATTTCAA	125536

AL592151.13	501	GAGGAATTTCATTAACGGAGATTTCTGCATCATATTTTCATGCTTTTTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125537	GAGGAATTTCATTAACGGAGATTTCTGCATCATATTTTCATGCTTTTTTT	125586

AL592151.13	551	ATTATAGAGTGTAATTCTTAATGACTGCTTCAACAAAATTTGGGGAAAGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125587	ATTATAGAGTGTAATTCTTAATGACTGCTTCAACAAAATTTGGGGAAAGT	125636

AL592151.13	601	AAAATTACATTGCCATTGCTGCTAAGTTGTAACTGACCTTCTCTCTTGTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125637	AAAATTACATTGCCATTGCTGCTAAGTTGTAACTGACCTTCTCTCTTGTA	125686

AL592151.13	651	CTTGTATTCTACCCAGTACAGCCCAGTAAATGCAGCATGTTCACGTTCAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125687	CTTGTATTCTACCCAGTACAGCCCAGTAAATGCAGCATGTTCACGTTCAC	125736

AL592151.13	701	TTGTCCAAAGCAAAATGACTTCTTTCCCAAGACACAATGAAGAGATTAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125737	TTGTCCAAAGCAAAATGACTTCTTTCCCAAGACACAATGAAGAGATTAAA	125786

AL592151.13	751	GGGAGATATCTTCAATGAACAGACCAAAATGTCACCTAACAACATGCTTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125787	GGGAGATATCTTCAATGAACAGACCAAAATGTCACCTAACAACATGCTTA	125836

AL592151.13	801	GTAAATAGGTACCTTTGCAAATGAAACTCTTAGTATCACATTGGGAATTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125837	GTAAATAGGTACCTTTGCAAATGAAACTCTTAGTATCACATTGGGAATTA	125886

AL592151.13	851	CCATAGAAAACCACATTAAACTTATTGTAAACTGACTTTATCCATAAACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125887	CCATAGAAAACCACATTAAACTTATTGTAAACTGACTTTATCCATAAACA	125936

AL592151.13	901	CAAAAAAAATCAAAAGGGATAAATGTAAGACAGTTCACTTAAGACATAGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125937	CAAAAAAAATCAAAAGGGATAAATGTAAGACAGTTCACTTAAGACATAGT	125986

AL592151.13	951	ATAGGTTTCTTGCAAACATGGCTAAAAATTACTTAACACCATAATGAATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	125987	ATAGGTTTCTTGCAAACATGGCTAAAAATTACTTAACACCATAATGAATA	126036

AL592151.13	1001	ACAAGGATCGGTAAGAGTCAGTAATGAAACGATGTCTGAAGCAAGCACTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126037	ACAAGGATCGGTAAGAGTCAGTAATGAAACGATGTCTGAAGCAAGCACTG	126086

AL592151.13	1051	AAATATACCTAGGCATAGCACATGCAAAAAATGTGATGCTATGCTTTTTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126087	AAATATACCTAGGCATAGCACATGCAAAAAATGTGATGCTATGCTTTTTC	126136

AL592151.13	1101	AACCATAATGACCTGTAAATTGTTTTATACTAAGGCCCAACGGTTCTAGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126137	AACCATAATGACCTGTAAATTGTTTTATACTAAGGCCCAACGGTTCTAGC	126186

AL592151.13	1151	AATGCTGTATAATCTCACATCTTTCCCCTGTCAAATGAAGAAAAAATTAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126187	AATGCTGTATAATCTCACATCTTTCCCCTGTCAAATGAAGAAAAAATTAA	126236

AL592151.13	1201	AAGATACACAAACATAAATATATCTTTTAAAACATATAGCATGCCTGGGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126237	AAGATACACAAACATAAATATATCTTTTAAAACATATAGCATGCCTGGGT	126286

AL592151.13	1251	ATTGTTTATATGATTCAGTGGAAATCAACATGGTTTGCTGGTGTGTCTGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126287	ATTGTTTATATGATTCAGTGGAAATCAACATGGTTTGCTGGTGTGTCTGG	126336

AL592151.13	1301	TTTTTTGTGTTTTAATATTTATATTGCATAGCTATCCAAAATTGTTCAGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126337	TTTTTTGTGTTTTAATATTTATATTGCATAGCTATCCAAAATTGTTCAGA	126386

AL592151.13	1351	GTTTTGAAAGAACCAAGTTGTAAAAAATTGTGGATAGGCAGGAATTCTGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126387	GTTTTGAAAGAACCAAGTTGTAAAAAATTGTGGATAGGCAGGAATTCTGA	126436

AL592151.13	1401	CAAGCTTTCTAAACATGACCCTTTATTTCAACATGAAGATAAAGAGGCAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126437	CAAGCTTTCTAAACATGACCCTTTATTTCAACATGAAGATAAAGAGGCAA	126486

AL592151.13	1451	AGCTATACTGATTGAACAGAAAACAAGAATGGGACTTAAAAAAAAAAACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126487	AGCTATACTGATTGAACAGAAAACAAGAATGGGACTTAAAAAAAAAAACA	126536

AL592151.13	1501	AGAGTTGGATAGACAGTGTTCTTCCTTCTAGTTGATAGGAAGGCCACACA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126537	AGAGTTGGATAGACAGTGTTCTTCCTTCTAGTTGATAGGAAGGCCACACA	126586

AL592151.13	1551	GTGTAAAACTATACTCACAACTTTGGTGTTCACATGCACAATCTTCACCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126587	GTGTAAAACTATACTCACAACTTTGGTGTTCACATGCACAATCTTCACCA	126636

AL592151.13	1601	CTTAGAAAGAAGCAGCTTTATTAGTGCTTATAAAAATTCATTAGTCCCTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126637	CTTAGAAAGAAGCAGCTTTATTAGTGCTTATAAAAATTCATTAGTCCCTA	126686

AL592151.13	1651	TAAAACCAGAACCAATTCAGCAGATAAGTAAATAAAACAATATAAAGAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126687	TAAAACCAGAACCAATTCAGCAGATAAGTAAATAAAACAATATAAAGAAA	126736

AL592151.13	1701	ATAAATTCACAAACTTTAATGTAGAATTTCAGAAAATGTTAAAGTTCACT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126737	ATAAATTCACAAACTTTAATGTAGAATTTCAGAAAATGTTAAAGTTCACT	126786

AL592151.13	1751	GAGAAATACTATTTAGTGTGATTAAGATAATAAAAATAAATCAATAATGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126787	GAGAAATACTATTTAGTGTGATTAAGATAATAAAAATAAATCAATAATGC	126836

AL592151.13	1801	AAACACAGTATTAATAACTTGAAGTTTTCAAATTTGAGAGGTTTTGTTCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126837	AAACACAGTATTAATAACTTGAAGTTTTCAAATTTGAGAGGTTTTGTTCT	126886

AL592151.13	1851	CATGAGAATATTCTCTCAAAAGTAGTTTAGTTATATGAATAAGATTTCTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126887	CATGAGAATATTCTCTCAAAAGTAGTTTAGTTATATGAATAAGATTTCTG	126936

AL592151.13	1901	GATAATAATTGATCTGCATAGGCTATTAAAAATTGCCTGTTTATACAGGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126937	GATAATAATTGATCTGCATAGGCTATTAAAAATTGCCTGTTTATACAGGT	126986

AL592151.13	1951	CTGACTTTCAAAGCCCCAATCTTGAGTACGTGTCAAGGTTAGCCTTACCA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662889.5	126987	CTGACTTTCAAAGCCCCAATCTTGAGTACGTGTCAAGGTTAGCCTTACCA	127036

Overview

Query
AL592151.13 - 148345 bps
Hit
AL662889.5 - 127036 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link