<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662800.4	1	GAATTCTGAATGAATTGAATTGGATAATACATGTAAATCCTTGTGGTGGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	105796	GAATTCTGAATGAATTGAATTGGATAATACATGTAAATCCTTGTGGTGGG	105845

AL662800.4	51	AATTTGGGTGCCATTTTCTTTGCATTATGAAAATCCAGGTCAACTCTTCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	105846	AATTTGGGTGCCATTTTCTTTGCATTATGAAAATCCAGGTCAACTCTTCT	105895

AL662800.4	101	TTCTTCTCCCAATTGTTTTTATTGCACATCTATAAAAACAAGAAAAGAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	105896	TTCTTCTCCCAATTGTTTTTATTGCACATCTATAAAAACAAGAAAAGAAT	105945

AL662800.4	151	TTTCTTGCTTTTCTTTTTTTTGAGACACAGTCTCGCACTGTCGCCCAGGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	105946	TTTCTTGCTTTTCTTTTTTTTGAGACACAGTCTCGCACTGTCGCCCAGGC	105995

AL662800.4	201	TGGAGTGCAATGGCACAACCTCTGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	105996	TGGAGTGCAATGGCACAACCTCTGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGT	106045

AL662800.4	251	TCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106046	TCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGC	106095

AL662800.4	301	ATGCCACCACGCCCAGAAAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106096	ATGCCACCACGCCCAGAAAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTT	106145

AL662800.4	351	CACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGTCCTCATGATCTGCCCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106146	CACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGTCCTCATGATCTGCCCA	106195

AL662800.4	401	CCTCCGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCATGAGCCACCGCGCCTGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106196	CCTCCGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCATGAGCCACCGCGCCTGG	106245

AL662800.4	451	CCAAGAATTTTCTAATAAACAAGAAAAACCTCACCTGTAATCCCACTACT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106246	CCAAGAATTTTCTAATAAACAAGAAAAACCTCACCTGTAATCCCACTACT	106295

AL662800.4	501	TGGTACAATAATCATACTTATTTTTCTTTATTTCCTTCCAGTGTGAGCAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106296	TGGTACAATAATCATACTTATTTTTCTTTATTTCCTTCCAGTGTGAGCAA	106345

AL662800.4	551	GGACAATTTAGCTTTGGGAACCCACAAAGAAACCATTTCAATTAAAAGCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106346	GGACAATTTAGCTTTGGGAACCCACAAAGAAACCATTTCAATTAAAAGCA	106395

AL662800.4	601	CAGGAAGCCCCACCAGTCCCATGAGGTTTTTGCCACCCCTAAGTAGTTCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106396	CAGGAAGCCCCACCAGTCCCATGAGGTTTTTGCCACCCCTAAGTAGTTCC	106445

AL662800.4	651	ATATGAGAAATTAAGAGTAGCGATGCTTGCTTTGAGGAATTGGAGGGAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106446	ATATGAGAAATTAAGAGTAGCGATGCTTGCTTTGAGGAATTGGAGGGAAA	106495

AL662800.4	701	ACTAAAATGAAAGTTGAATTTGGATAAGAGAAAAATCAAGGGCACTCACT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106496	ACTAAAATGAAAGTTGAATTTGGATAAGAGAAAAATCAAGGGCACTCACT	106545

AL662800.4	751	CTTCCCAACCCCAGCCTGTCTGACTCTCTCCCCATCATCCTCCTCACTAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106546	CTTCCCAACCCCAGCCTGTCTGACTCTCTCCCCATCATCCTCCTCACTAC	106595

AL662800.4	801	TTTCAGGCAGGGTGGAGATAGCACCAGGGGGAGATTCTGGGAGACAGGGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106596	TTTCAGGCAGGGTGGAGATAGCACCAGGGGGAGATTCTGGGAGACAGGGC	106645

AL662800.4	851	ACTACTGCAAGAACAGCAGGACAGCCCCACTGGTGGCTGTGGGATGCTCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106646	ACTACTGCAAGAACAGCAGGACAGCCCCACTGGTGGCTGTGGGATGCTCC	106695

AL662800.4	901	GTGGCCCTGCCTACTGCTGTTCTGGAGGATGCACCGCCTCGCTTTCCTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106696	GTGGCCCTGCCTACTGCTGTTCTGGAGGATGCACCGCCTCGCTTTCCTTT	106745

AL662800.4	951	CTGGTGTTAGAGCCAGGTGACTCTGTCCAAAGAGTAGGTTCTTTTTCCCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106746	CTGGTGTTAGAGCCAGGTGACTCTGTCCAAAGAGTAGGTTCTTTTTCCCC	106795

AL662800.4	1001	ACAGAGGCAAACAGGAAACGTTTCCTTTCCTAACTAGCTCTGCCTAGTGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106796	ACAGAGGCAAACAGGAAACGTTTCCTTTCCTAACTAGCTCTGCCTAGTGC	106845

AL662800.4	1051	CTGGAATCTTACTGAGTCAGTCCCGCAGTAAGTCAGCAGCTCAGGAAATC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106846	CTGGAATCTTACTGAGTCAGTCCCGCAGTAAGTCAGCAGCTCAGGAAATC	106895

AL662800.4	1101	TACCCTCTCTGAGCCTCCCTGCAGTTCAAGCTGCTTAGGGAACTTGATAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106896	TACCCTCTCTGAGCCTCCCTGCAGTTCAAGCTGCTTAGGGAACTTGATAT	106945

AL662800.4	1151	TTTCAAGACATCTGTCTACACATGGGCAGCCCAGCCGCCGAGTTAGTGGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106946	TTTCAAGACATCTGTCTACACATGGGCAGCCCAGCCGCCGAGTTAGTGGT	106995

AL662800.4	1201	GGCAACCAAAGCGAACAGAGGACTTGGCTTCCTGAAAACAGAGGCAAAGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	106996	GGCAACCAAAGCGAACAGAGGACTTGGCTTCCTGAAAACAGAGGCAAAGA	107045

AL662800.4	1251	AGTATAGCTATCCAACCTTCTGAGTCTTGTCTCTATATGGAGATGCCCAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	107046	AGTATAGCTATCCAACCTTCTGAGTCTTGTCTCTATATGGAGATGCCCAT	107095

AL662800.4	1301	ATGGACAAATAGGGTCTGGACAAGGGGAAGGGTTAACATGAGAAAGTCAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	107096	ATGGACAAATAGGGTCTGGACAAGGGGAAGGGTTAACATGAGAAAGTCAC	107145

AL662800.4	1351	ATGATTTCTGCTATGCTATTCCTCTGTGCGCTTACCCTTTCTGTTTCTAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	107146	ATGATTTCTGCTATGCTATTCCTCTGTGCGCTTACCCTTTCTGTTTCTAA	107195

AL662800.4	1401	ATATTTCAGCTAAAAGACAATAAATACTGCAACCCTTACATTCCTTCAGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	107196	ATATTTCAGCTAAAAGACAATAAATACTGCAACCCTTACATTCCTTCAGC	107245

AL662800.4	1451	CCTGCTTTCACTTGTCCTGGGTGTCCTGACTGTCATCTTCATTCATTTAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	107246	CCTGCTTTCACTTGTCCTGGGTGTCCTGACTGTCATCTTCATTCATTTAT	107295

AL662800.4	1501	ATCAAACACCATTCAATCAATACTTACTACAAGCAAACTATATGTGAGAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	107296	ATCAAACACCATTCAATCAATACTTACTACAAGCAAACTATATGTGAGAT	107345

AL662800.4	1551	CAAGAGTACTATTCAAAATAGTTGACAGCTGGTATGGCAATGGAAATTAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	107346	CAAGAGTACTATTCAAAATAGTTGACAGCTGGTATGGCAATGGAAATTAA	107395

AL662800.4	1601	TATATAAATAAAATTTTCCCAATTATGCTATTTTTCTGTCCTAACTAAAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	107396	TATATAAATAAAATTTTCCCAATTATGCTATTTTTCTGTCCTAACTAAAT	107445

AL662800.4	1651	GATTATAAAACTACTTACCAAGTGACACAGTTGAAATATAAATAATTTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	107446	GATTATAAAACTACTTACCAAGTGACACAGTTGAAATATAAATAATTTCT	107495

AL662800.4	1701	TAAATAGTTATAACAATTTCCAAATTATTTATTGATTTTTAAACATTTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	107496	TAAATAGTTATAACAATTTCCAAATTATTTATTGATTTTTAAACATTTTT	107545

AL662800.4	1751	TGCATTTCTTAGGTGGTAATTATTGGTTAAGTGATATATGCCTATGTTAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	107546	TGCATTTCTTAGGTGGTAATTATTGGTTAAGTGATATATGCCTATGTTAG	107595

AL662800.4	1801	CCATGATTTGACAAAAGAGCCTTGTATAAGCTTCTGATAATTTCCCCATT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	107596	CCATGATTTGACAAAAGAGCCTTGTATAAGCTTCTGATAATTTCCCCATT	107645

AL662800.4	1851	AAATTGTTTGTATATTATGACGTATGTAATCAACTATATTGTTCATGGTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	107646	AAATTGTTTGTATATTATGACGTATGTAATCAACTATATTGTTCATGGTG	107695

AL662800.4	1901	CCAAATCCTCTCTCACTTTAGCAGCTATGTTAAAGATTTTTTAGCCCTTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	107696	CCAAATCCTCTCTCACTTTAGCAGCTATGTTAAAGATTTTTTAGCCCTTG	107745

AL662800.4	1951	AACTGCTGTCTGAAATTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662873.3	107746	AACTGCTGTCTGAAATTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGA	107795

Overview

Query
AL662800.4 - 151228 bps
Hit
AL662873.3 - 107795 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link