<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662826.11	1	GAATTCGACTGAGGGGCATACGGCAGAGTGAAAGATTGAGGCAAGTTTTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	131837	GAATTCGACTGAGGGGCATACGGCAGAGTGAAAGATTGAGGCAAGTTTTA	131886

AL662826.11	51	GAGCCAAGAGTGAAAATTTATTAAAAAGCTTTAGAGCAGGAACTGAAGAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	131887	GAGCCAAGAGTGAAAATTTATTAAAAAGCTTTAGAGCAGGAACTGAAGAA	131936

AL662826.11	101	AGTAAAGTCCACTTGAAAGAGGGCCGAGTGGGTGACTTGAGAGATCAAGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	131937	AGTAAAGTCCACTTGAAAGAGGGCCGAGTGGGTGACTTGAGAGATCAAGT	131986

AL662826.11	151	TCATGGTTTGATCTTTGACTTGGGGTTTCATACATTGGCATGCCTCTTGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	131987	TCATGGTTTGATCTTTGACTTGGGGTTTCATACATTGGCATGCCTCTTGG	132036

AL662826.11	201	GGCGGGGGAGTGGTTTGCATCTCTTCTCCCTTGATTTTTCCCTTGGGGTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132037	GGCGGGGGAGTGGTTTGCATCTCTTCTCCCTTGATTTTTCCCTTGGGGTG	132086

AL662826.11	251	GGCTGTCCACGTGCACAGTGGCCTGCCAGCACTTGGAAGGGGCAACATAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132087	GGCTGTCCACGTGCACAGTGGCCTGCCAGCACTTGGAAGGGGCAACATAC	132136

AL662826.11	301	ACATTGTGTTTACCAAAATTGTACACATGCTCACTTAAGGCATTCTTCCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132137	ACATTGTGTTTACCAAAATTGTACACATGCTCACTTAAGGCATTCTTCCC	132186

AL662826.11	351	TTACCAGCCGAGTGTTCCTGGAGAAAGGTTATATACTGGTTCAACTCTGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132187	TTACCAGCCGAGTGTTCCTGGAGAAAGGTTATATACTGGTTCAACTCTGC	132236

AL662826.11	401	CATTTTGCCTGTTAGTGCACATGCTTAAGTCCACTAGCCCACCTCCTGAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132237	CATTTTGCCTGTTAGTGCACATGCTTAAGTCCACTAGCCCACCTCCTGAG	132286

AL662826.11	451	ATCTTATTGGGAAGCTGCTGATTACCAACTTGAGGTGTTTCTATTGGGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132287	ATCTTATTGGGAAGCTGCTGATTACCAACTTGAGGTGTTTCTATTGGGAG	132336

AL662826.11	501	GCTGCCTTTCCCTGGCACCGGCTGCAGCCAATTATTATTTTCAAGAGGCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132337	GCTGCCTTTCCCTGGCACCGGCTGCAGCCAATTATTATTTTCAAGAGGCA	132386

AL662826.11	551	GTTTAACAACTTCCTGACCACCATCTGATGGTTGCCTGACATTCCTGGGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132387	GTTTAACAACTTCCTGACCACCATCTGATGGTTGCCTGACATTCCTGGGC	132436

AL662826.11	601	GAGGGTCCCTCTCCTGACCTATTCATGTCTGACTAATTACCTATTGTAAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132437	GAGGGTCCCTCTCCTGACCTATTCATGTCTGACTAATTACCTATTGTAAC	132486

AL662826.11	651	AGTTTGAACAATAAAGATAGCTCAAGGCCAGACATGGTGGTTCATGCCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132487	AGTTTGAACAATAAAGATAGCTCAAGGCCAGACATGGTGGTTCATGCCTG	132536

AL662826.11	701	TAATCCCCGCTCTTTGGGAGGCCTTGCAAGGCCAGAGGATTTCTTGAGCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132537	TAATCCCCGCTCTTTGGGAGGCCTTGCAAGGCCAGAGGATTTCTTGAGCC	132586

AL662826.11	751	CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGGCAAAACCCTGTCTCTATGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132587	CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGGCAAAACCCTGTCTCTATGA	132636

AL662826.11	801	AAATTACAAAAATTAGCCCGGTGTGGTGGCACAAGCCTGTAGTCCCAGCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132637	AAATTACAAAAATTAGCCCGGTGTGGTGGCACAAGCCTGTAGTCCCAGCT	132686

AL662826.11	851	ACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAGGATCACCTGAGCCCGGGAGGTGGAGGCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132687	ACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAGGATCACCTGAGCCCGGGAGGTGGAGGCT	132736

AL662826.11	901	ACAGTGAGCAGGGATCGTGCCACTGCACTTCAACCTGGGTGACAGAGTGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132737	ACAGTGAGCAGGGATCGTGCCACTGCACTTCAACCTGGGTGACAGAGTGA	132786

AL662826.11	951	AACACTGTCTCAAAATTAAAACAGATAAAATAAAAATATAGCTCATACTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132787	AACACTGTCTCAAAATTAAAACAGATAAAATAAAAATATAGCTCATACTG	132836

AL662826.11	1001	GTACCATGCACAAGTAGATTTGTCAAAGGTCAGGGCCACCTTCACTCAGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132837	GTACCATGCACAAGTAGATTTGTCAAAGGTCAGGGCCACCTTCACTCAGA	132886

AL662826.11	1051	GTCTCTTCCGTTGGTTGCCAACTTGTAAACGAAAAAGTATGTCAGATAGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132887	GTCTCTTCCGTTGGTTGCCAACTTGTAAACGAAAAAGTATGTCAGATAGG	132936

AL662826.11	1101	TCTCAATCAGTTTAGAATTTTCATTTTGCCAAGGTTAAGGACGCACCCAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132937	TCTCAATCAGTTTAGAATTTTCATTTTGCCAAGGTTAAGGACGCACCCAG	132986

AL662826.11	1151	GAAACAGGTATATGTACCTTTCTCAAAGATGATTGTGAGGGCTTCAATAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	132987	GAAACAGGTATATGTACCTTTCTCAAAGATGATTGTGAGGGCTTCAATAT	133036

AL662826.11	1201	TTAAAGGTGAGAAGTGGGCTAGATGGGAAAGAGGGTGTGGTTATCCACAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133037	TTAAAGGTGAGAAGTGGGCTAGATGGGAAAGAGGGTGTGGTTATCCACAT	133086

AL662826.11	1251	GTTGCAAGAGAAAAGGAGTAGGCAGGAAAACAGTCAATTATGGATTCATC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133087	GTTGCAAGAGAAAAGGAGTAGGCAGGAAAACAGTCAATTATGGATTCATC	133136

AL662826.11	1301	TCACACTCAGTAATAGGCCCTTTACATAAGGTGAACATAAGACTAGCTAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133137	TCACACTCAGTAATAGGCCCTTTACATAAGGTGAACATAAGACTAGCTAC	133186

AL662826.11	1351	TTGAGGAGCTATTTAACCTTCTATCTGTAGCTATCTGCTGAGGAACAAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133187	TTGAGGAGCTATTTAACCTTCTATCTGTAGCTATCTGCTGAGGAACAAAA	133236

AL662826.11	1401	GGAAAGACAGTTTTTTGCATGACTCAGCTTTCAGCTTAATTTTTTCCATT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133237	GGAAAGACAGTTTTTTGCATGACTCAGCTTTCAGCTTAATTTTTTCCATT	133286

AL662826.11	1451	TGGCATAGTGAATTGGAGTCCTGAGTTTTATTTTCCTTTCCCACCTCAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133287	TGGCATAGTGAATTGGAGTCCTGAGTTTTATTTTCCTTTCCCACCTCAAA	133336

AL662826.11	1501	CCCCACAAGCTTTGCGTTGTTGCAGATTGTCCCTCTCAGAATATTTTACA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133337	CCCCACAAGCTTTGCGTTGTTGCAGATTGTCCCTCTCAGAATATTTTACA	133386

AL662826.11	1551	AGATGGTGAAGTGCCTAATGAACATTTCTTTTGTCATAAAGTGAGTTTGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133387	AGATGGTGAAGTGCCTAATGAACATTTCTTTTGTCATAAAGTGAGTTTGG	133436

AL662826.11	1601	ATCCTGAAGAAGCCATCATCTTAATCAGGCTTTGGGATCAAAGTTCCCCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133437	ATCCTGAAGAAGCCATCATCTTAATCAGGCTTTGGGATCAAAGTTCCCCT	133486

AL662826.11	1651	TCACCCGAACCCTGAACAGCACAGCAGACAGGGAAGGACTTACTGAGATG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133487	TCACCCGAACCCTGAACAGCACAGCAGACAGGGAAGGACTTACTGAGATG	133536

AL662826.11	1701	GCTGCTCCCACTCTCCAGCCCCCACTTTCCTGACCATTCCTGGCAGGAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133537	GCTGCTCCCACTCTCCAGCCCCCACTTTCCTGACCATTCCTGGCAGGAAG	133586

AL662826.11	1751	AGCTGCTGAGCAGACTCCATGGGCTGCCCACACAGGGTCTGGACCTAGCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133587	AGCTGCTGAGCAGACTCCATGGGCTGCCCACACAGGGTCTGGACCTAGCT	133636

AL662826.11	1801	GTCTTCCTGTGCCCAGCAGCCTGTGAGCCATCCCAGTCCCCTATGTGCAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133637	GTCTTCCTGTGCCCAGCAGCCTGTGAGCCATCCCAGTCCCCTATGTGCAG	133686

AL662826.11	1851	TGGTCAGCACCCACAAGCCAGCCTTCATAGGGATTCAGTTCATGGGTGTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133687	TGGTCAGCACCCACAAGCCAGCCTTCATAGGGATTCAGTTCATGGGTGTT	133736

AL662826.11	1901	GCCCTGAGCCTGGCACAGTGGCCTCCCCAGCTTAGCATCTGCAGTTCGGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133737	GCCCTGAGCCTGGCACAGTGGCCTCCCCAGCTTAGCATCTGCAGTTCGGG	133786

AL662826.11	1951	TCAGGGTGTTCTTAACGGCCCTCACCTATGCCTTTTCTGGCCACACATGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662869.2	133787	TCAGGGTGTTCTTAACGGCCCTCACCTATGCCTTTTCTGGCCACACATGA	133836

Overview

Query
AL662826.11 - 145431 bps
Hit
AL662869.2 - 133836 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link