<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662833.4	1	GAATTCCTGTCCCCAACCCCATGCGTCCAGTTCACCTCCGCCATCTTGAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	68289	GAATTCCTGTCCCCAACCCCATGCGTCCAGTTCACCTCCGCCATCTTGAG	68338

AL662833.4	51	TATCCCTCATCACCCCAAACTGCAGTCCCTGCCTCTGTTCCCACCTCACC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	68339	TATCCCTCATCACCCCAAACTGCAGTCCCTGCCTCTGTTCCCACCTCACC	68388

AL662833.4	101	TCTGGTGTGCAGGCAAAGGACCAGGATCCCCAGGAGCTTCCAGTTGAGGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	68389	TCTGGTGTGCAGGCAAAGGACCAGGATCCCCAGGAGCTTCCAGTTGAGGA	68438

AL662833.4	151	TCATGGCTATGTACTGGCCCCCAAAGCTGGGGTGGGCTGAGTCTGGGTGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	68439	TCATGGCTATGTACTGGCCCCCAAAGCTGGGGTGGGCTGAGTCTGGGTGC	68488

AL662833.4	201	CTGGGAACCCCAAGAGGCTTTATAGGGGAGGAGTGGAGGAGGGGCCAGCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	68489	CTGGGAACCCCAAGAGGCTTTATAGGGGAGGAGTGGAGGAGGGGCCAGCC	68538

AL662833.4	251	CAGTGGCACAGGAATACCATCAGAACAGAACTGGTCAAACCCGTTGGGAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	68539	CAGTGGCACAGGAATACCATCAGAACAGAACTGGTCAAACCCGTTGGGAA	68588

AL662833.4	301	GGCCTGGGCTGATGTGTCACCCCTGAAGGTGGCGTCCCTTATTTTAGTCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	68589	GGCCTGGGCTGATGTGTCACCCCTGAAGGTGGCGTCCCTTATTTTAGTCC	68638

AL662833.4	351	TCCAGCCCAGGACCCAGCTGCCTGCTCTCCCTATCATGACCCAGAGCCTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	68639	TCCAGCCCAGGACCCAGCTGCCTGCTCTCCCTATCATGACCCAGAGCCTG	68688

AL662833.4	401	CGTCACCCCACCCTGGTTTTCACACCCTCCATCCACACCCTGGAGCAGTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	68689	CGTCACCCCACCCTGGTTTTCACACCCTCCATCCACACCCTGGAGCAGTC	68738

AL662833.4	451	AATACCCACTTGGCATCTCCGTAATCACAGAGATGTCCACCTTCATCCCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	68739	AATACCCACTTGGCATCTCCGTAATCACAGAGATGTCCACCTTCATCCCT	68788

AL662833.4	501	TGCAACTATTGGAAGCCAAAGAATGGGAGCAAACCACGCGATGGGCGTTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	68789	TGCAACTATTGGAAGCCAAAGAATGGGAGCAAACCACGCGATGGGCGTTG	68838

AL662833.4	551	GGAAGCACCGTAATTACAGGGTTGGGAGGCAGGATGCCTGCGCTGGGGGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	68839	GGAAGCACCGTAATTACAGGGTTGGGAGGCAGGATGCCTGCGCTGGGGGA	68888

AL662833.4	601	GGAGGTGCCTTTCAAACCTGGGATGCAGCTGGGACAGTGTCAGCTACTAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	68889	GGAGGTGCCTTTCAAACCTGGGATGCAGCTGGGACAGTGTCAGCTACTAC	68938

AL662833.4	651	CCCAGCCTCCCCACTCATCCCCGCACTGAAAGCTCCCCCTGGGGCTTCGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	68939	CCCAGCCTCCCCACTCATCCCCGCACTGAAAGCTCCCCCTGGGGCTTCGT	68988

AL662833.4	701	GCTTTCCTGGGCACTTCCCTTCCCCCATGGGATCCAGGCATCCTGCTCTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	68989	GCTTTCCTGGGCACTTCCCTTCCCCCATGGGATCCAGGCATCCTGCTCTC	69038

AL662833.4	751	CACCATGTCCTTCTTCAGGCATGCAGGGGACCTCCAAGCAATGATATCCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69039	CACCATGTCCTTCTTCAGGCATGCAGGGGACCTCCAAGCAATGATATCCA	69088

AL662833.4	801	AGGAATTCCATCTGGCAGCCACCCAGGATGACTGCAGAAAAGGAAGGACA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69089	AGGAATTCCATCTGGCAGCCACCCAGGATGACTGCAGAAAAGGAAGGACA	69138

AL662833.4	851	CAGGAGGATATCCTGGTTCCCTCTTCCCACCCAGAGCTGTTTGCATCAGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69139	CAGGAGGATATCCTGGTTCCCTCTTCCCACCCAGAGCTGTTTGCATCAGT	69188

AL662833.4	901	CCTGCCAATGGCTCCGGAAGAAGCTGCCAGGCTCCAGCAACCTCAGCCCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69189	CCTGCCAATGGCTCCGGAAGAAGCTGCCAGGCTCCAGCAACCTCAGCCCC	69238

AL662833.4	951	TTCCTCCTCCCTCAGGAATCCACCTATCCGCCTCTAGGACCTTGGCTCCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69239	TTCCTCCTCCCTCAGGAATCCACCTATCCGCCTCTAGGACCTTGGCTCCA	69288

AL662833.4	1001	ACTCTATTGTACTCGTCTCCTCCCTCCCATTCTCCTTTTGGTCTCAGCTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69289	ACTCTATTGTACTCGTCTCCTCCCTCCCATTCTCCTTTTGGTCTCAGCTC	69338

AL662833.4	1051	CTTGATCTAAGCCTCCCAGAGAGACCCCTAGAACGTTTCCCTCAAGGACC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69339	CTTGATCTAAGCCTCCCAGAGAGACCCCTAGAACGTTTCCCTCAAGGACC	69388

AL662833.4	1101	TTTCTGCCTGGAAGTCTGTTAGCCTTTCAGAAGTAACATGTCCAAAATAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69389	TTTCTGCCTGGAAGTCTGTTAGCCTTTCAGAAGTAACATGTCCAAAATAA	69438

AL662833.4	1151	AATTTGATTCCTCCCAGGTTGTTCCCTGCCTGGTCCGCTACCCCACAGTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69439	AATTTGATTCCTCCCAGGTTGTTCCCTGCCTGGTCCGCTACCCCACAGTA	69488

AL662833.4	1201	AGGAACACCTTATTATGCAATGGCGTGATCTCATCTGTTCCCTCCAGGGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69489	AGGAACACCTTATTATGCAATGGCGTGATCTCATCTGTTCCCTCCAGGGC	69538

AL662833.4	1251	TCACGCAGAAACCTTCGTTACACTCCTCCACCATCCACCTGCAAGCCCCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69539	TCACGCAGAAACCTTCGTTACACTCCTCCACCATCCACCTGCAAGCCCCT	69588

AL662833.4	1301	CCACACCCTGTCCAAACCCAGCCCATCATCCTGAGCCACCATCTCCCCTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69589	CCACACCCTGTCCAAACCCAGCCCATCATCCTGAGCCACCATCTCCCCTG	69638

AL662833.4	1351	AGCCTCCCCAACACCCTTCTAATTGGCCCCCTTGCTCCCACTGTTTATCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69639	AGCCTCCCCAACACCCTTCTAATTGGCCCCCTTGCTCCCACTGTTTATCC	69688

AL662833.4	1401	CTCCCCCTCACACAAAGCCTGTCCTCCACCAGCAAAAGAGGTCTTAAAAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69689	CTCCCCCTCACACAAAGCCTGTCCTCCACCAGCAAAAGAGGTCTTAAAAT	69738

AL662833.4	1451	ATACATCACGCGGGCCTGGTGTGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCACT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69739	ATACATCACGCGGGCCTGGTGTGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCACT	69788

AL662833.4	1501	TTGGGAGGCCGAAGCGGGCGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCAAGACCAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69789	TTGGGAGGCCGAAGCGGGCGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCAAGACCAG	69838

AL662833.4	1551	CCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATATTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69839	CCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATATTA	69888

AL662833.4	1601	GCCGGACATGGTGGCACATGCCTCTTGGTAATCCCAGCTACTCAAGAGGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69889	GCCGGACATGGTGGCACATGCCTCTTGGTAATCCCAGCTACTCAAGAGGC	69938

AL662833.4	1651	TGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69939	TGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCTG	69988

AL662833.4	1701	AGATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACGAGTGAAATTCCGTCTCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	69989	AGATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACGAGTGAAATTCCGTCTCA	70038

AL662833.4	1751	AAAAAAAAAAAACATATATATATATATCAGGCCAGGCGTAGTGGCTCATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	70039	AAAAAAAAAAAACATATATATATATATCAGGCCAGGCGTAGTGGCTCATG	70088

AL662833.4	1801	CCAGCACTTTGGGAAGCTGACACAGGAGGACCACTTGAGCTCAGGAGTTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	70089	CCAGCACTTTGGGAAGCTGACACAGGAGGACCACTTGAGCTCAGGAGTTG	70138

AL662833.4	1851	TGTGCGCTGCTTCACCTGCAGCAAGACTGTGGGCAACACGTGGGAGGCCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	70139	TGTGCGCTGCTTCACCTGCAGCAAGACTGTGGGCAACACGTGGGAGGCCT	70188

AL662833.4	1901	ACCTGGGGCTGCTGCAGTCCAAGTACGCTGATGGGGACGCCCTGGGCCTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	70189	ACCTGGGGCTGCTGCAGTCCAAGTACGCTGATGGGGACGCCCTGGGCCTG	70238

AL662833.4	1951	AAGCGCCACAGCCGCTGCCTGCCGCATGCTGCTGGCCCACGTGGACCTGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662867.5	70239	AAGCGCCACAGCCGCTGCCTGCCGCATGCTGCTGGCCCACGTGGACCTGA	70288

Overview

Query
AL662833.4 - 168887 bps
Hit
AL662867.5 - 70288 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link