<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662847.6	1	GAAATAAATGCCCATGACTCAGATATAAAAAGGAGAATCTACAAGAGCAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	95316	GAAATAAATGCCCATGACTCAGATATAAAAAGGAGAATCTACAAGAGCAG	95365

AL662847.6	51	TAGGCTTGGGAGCTGACACCAGAACAGCTTTGGAAAGGGCTGTCGAGCCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	95366	TAGGCTTGGGAGCTGACACCAGAACAGCTTTGGAAAGGGCTGTCGAGCCA	95415

AL662847.6	101	GGAACTAGGAATCAAAACCCAAACAAGACCACAGGAGGTAGAGGGTAGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	95416	GGAACTAGGAATCAAAACCCAAACAAGACCACAGGAGGTAGAGGGTAGAA	95465

AL662847.6	151	ATTATGCCCCAGTAGTGCATGAATGAATGAATCAAGGGCAGTGACTCATG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	95466	ATTATGCCCCAGTAGTGCATGAATGAATGAATCAAGGGCAGTGACTCATG	95515

AL662847.6	201	GGTTGCCTGGCCAGTCTGGAACTTGGGGAAAATAAAGTTGTAAAATTGGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	95516	GGTTGCCTGGCCAGTCTGGAACTTGGGGAAAATAAAGTTGTAAAATTGGG	95565

AL662847.6	251	GGATGGAAGAGAGAAGTGTGCACTGACCACTTTCCATGGGAAGAGCATGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	95566	GGATGGAAGAGAGAAGTGTGCACTGACCACTTTCCATGGGAAGAGCATGT	95615

AL662847.6	301	GAAGATAGAGGTTGCATATGGATGCCTGCCAGAGGGTCTCCAAGGGGCTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	95616	GAAGATAGAGGTTGCATATGGATGCCTGCCAGAGGGTCTCCAAGGGGCTG	95665

AL662847.6	351	GGGCTCCCTGTAACCAGGTGAGCGAGATGGCTTGATGGATGATGCCACTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	95666	GGGCTCCCTGTAACCAGGTGAGCGAGATGGCTTGATGGATGATGCCACTC	95715

AL662847.6	401	AGCCGCACAAGGCTTGCTCATGAGTCCCTGCACAAAGTGGCCGTGGTGGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	95716	AGCCGCACAAGGCTTGCTCATGAGTCCCTGCACAAAGTGGCCGTGGTGGC	95765

AL662847.6	451	TGGGATGGACACTGCATGGACAGAGCAATTGAGTCACCACTCACCAAGGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	95766	TGGGATGGACACTGCATGGACAGAGCAATTGAGTCACCACTCACCAAGGC	95815

AL662847.6	501	TGACCTGGCAGCTGCCACTGCTGAGGACCCAGCCTGCCAAAAGCAGCTGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	95816	TGACCTGGCAGCTGCCACTGCTGAGGACCCAGCCTGCCAAAAGCAGCTGT	95865

AL662847.6	551	TTCTTTGAACAGAGAAAAAAAACAGACAATGTTAATTAAGAGCAAGACAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	95866	TTCTTTGAACAGAGAAAAAAAACAGACAATGTTAATTAAGAGCAAGACAG	95915

AL662847.6	601	TGTTATGACAGATAAATATGCCACTGCAGCTATAGTAGAGATGTAAACAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	95916	TGTTATGACAGATAAATATGCCACTGCAGCTATAGTAGAGATGTAAACAA	95965

AL662847.6	651	TCTTGAAATTATAAAAAAAAAATGTCGATGGAAAAGACTTACTGCAAGTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	95966	TCTTGAAATTATAAAAAAAAAATGTCGATGGAAAAGACTTACTGCAAGTA	96015

AL662847.6	701	AGAAGTTAAAACAGTTGTAAAAATTCTATCTCTGCCCAACTATATACAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96016	AGAAGTTAAAACAGTTGTAAAAATTCTATCTCTGCCCAACTATATACAGA	96065

AL662847.6	751	TTGTTTCACAGGGAAGTCCTACTAAACCTTCAAAGAAGGTTATTGGACTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96066	TTGTTTCACAGGGAAGTCCTACTAAACCTTCAAAGAAGGTTATTGGACTT	96115

AL662847.6	801	ATTTAAAATATGCAAGAGAATGGAGCAAAATACAGAAAGCTAGGCAACTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96116	ATTTAAAATATGCAAGAGAATGGAGCAAAATACAGAAAGCTAGGCAACTC	96165

AL662847.6	851	ACTTTATCAGCTATGAATAGTGTTAATTCTAAAGCCAGTTAGGGAACAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96166	ACTTTATCAGCTATGAATAGTGTTAATTCTAAAGCCAGTTAGGGAACAAA	96215

AL662847.6	901	TAATAAAGAAACAAGATAGGAAAATCACTATTAGTAATTAGATGTAAAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96216	TAATAAAGAAACAAGATAGGAAAATCACTATTAGTAATTAGATGTAAAAT	96265

AL662847.6	951	AGATGAGAAAAATAGTAGACTGTGTCCATCAGTGTGCTATAAACAAATTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96266	AGATGAGAAAAATAGTAGACTGTGTCCATCAGTGTGCTATAAACAAATTA	96315

AL662847.6	1001	AATATCTTGACCAAGTTATGAATCCCAAGAATAAAAGAATATTTAAACTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96316	AATATCTTGACCAAGTTATGAATCCCAAGAATAAAAGAATATTTAAACTT	96365

AL662847.6	1051	TAAATCTTTTAATGCATTTTAACACTTAATTCAATAATTTAAAAAGAGAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96366	TAAATCTTTTAATGCATTTTAACACTTAATTCAATAATTTAAAAAGAGAC	96415

AL662847.6	1101	AATCATATTTCACTAGATGTAGAAATCACTGTAGATGAAATCTAACACTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96416	AATCATATTTCACTAGATGTAGAAATCACTGTAGATGAAATCTAACACTA	96465

AL662847.6	1151	CACCTGACCTACATTTCTTCAGTTATCTCCACTTTTAAGAATTTGTGATC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96466	CACCTGACCTACATTTCTTCAGTTATCTCCACTTTTAAGAATTTGTGATC	96515

AL662847.6	1201	AGTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGGTAAGGAATCAACCCAGATGCCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96516	AGTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGGTAAGGAATCAACCCAGATGCCC	96565

AL662847.6	1251	ATCAACAGTGGAATGGATAAAGAAAACTGCGGCACAGGGCCAGGCGCGGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96566	ATCAACAGTGGAATGGATAAAGAAAACTGCGGCACAGGGCCAGGCGCGGT	96615

AL662847.6	1301	GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGGTGAGGCGGGCAGATCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96616	GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGGTGAGGCGGGCAGATCA	96665

AL662847.6	1351	CGAAGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96666	CGAAGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCT	96715

AL662847.6	1401	CTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96716	CTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGT	96765

AL662847.6	1451	CCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCAGGAGGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96766	CCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCAGGAGGT	96815

AL662847.6	1501	GGAGTTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96816	GGAGTTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAC	96865

AL662847.6	1551	AGAATGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAACT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96866	AGAATGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAACT	96915

AL662847.6	1601	GCAGCACTTATACACCATGGTACGCTACCCAGCCAAAAAAACAAGAACGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96916	GCAGCACTTATACACCATGGTACGCTACCCAGCCAAAAAAACAAGAACGA	96965

AL662847.6	1651	AATCATGTCCTTCACAGCAACATGGATGGAGGTGGAGACCATTATTCTAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	96966	AATCATGTCCTTCACAGCAACATGGATGGAGGTGGAGACCATTATTCTAA	97015

AL662847.6	1701	GCAAATTAATGTAGGAACAGAAAGCCAAATACCACATATTCTCACCTATA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	97016	GCAAATTAATGTAGGAACAGAAAGCCAAATACCACATATTCTCACCTATA	97065

AL662847.6	1751	AGTGGCAGCTAAACATTGAGTACACATGGACACAAAGAAGGGAACAATAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	97066	AGTGGCAGCTAAACATTGAGTACACATGGACACAAAGAAGGGAACAATAG	97115

AL662847.6	1801	ACACTGGGGCCTCCTTGAGGGTGGAGGGTGGGAGGAGGGGGAGGATTAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	97116	ACACTGGGGCCTCCTTGAGGGTGGAGGGTGGGAGGAGGGGGAGGATTAAA	97165

AL662847.6	1851	AAACTACCTATTGGGTATTGTGCTGATTACCTGAGTAACAAAATTATCTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	97166	AAACTACCTATTGGGTATTGTGCTGATTACCTGAGTAACAAAATTATCTG	97215

AL662847.6	1901	CACACCAAACACCCGTGATACACAATTTACCCATGTAACAAACCTGAATA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	97216	CACACCAAACACCCGTGATACACAATTTACCCATGTAACAAACCTGAATA	97265

AL662847.6	1951	TGTATCCCTTGAACCTAAAAAATCAAAAAGAAAAAAGTAAAAAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662866.7	97266	TGTATCCCTTGAACCTAAAAAATCAAAAAGAAAAAAGTAAAAAAGAATTC	97315

Overview

Query
AL662847.6 - 135784 bps
Hit
AL662866.7 - 97315 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link