<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662865.4	1	GAATTCCAGTACACTGTGAGAATGTAAATTGGGAGAACACCATTGAAAGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59234	GAATTCCAGTACACTGTGAGAATGTAAATTGGGAGAACACCATTGAAAGC	59283

AL662865.4	51	AATTTGACAATTGGGCTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59284	AATTTGACAATTGGGCTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACAC	59333

AL662865.4	101	TTTTGGGAGCTGAGGCGGGTGGCTCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGGCCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59334	TTTTGGGAGCTGAGGCGGGTGGCTCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGGCCA	59383

AL662865.4	151	GCCTGACCAACACGGAGAAACTCTGTCTCTATTAAAAATACAAAATTAGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59384	GCCTGACCAACACGGAGAAACTCTGTCTCTATTAAAAATACAAAATTAGC	59433

AL662865.4	201	TGGGCGTGTTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59434	TGGGCGTGTTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGC	59483

AL662865.4	251	AGGAGAATAGCTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCGGTGAGCCGAGGTCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59484	AGGAGAATAGCTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCGGTGAGCCGAGGTCA	59533

AL662865.4	301	CGCCATTGCACTCCATCCTGGGTGACAAGAGCAAAACTCCATCTCGATTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59534	CGCCATTGCACTCCATCCTGGGTGACAAGAGCAAAACTCCATCTCGATTA	59583

AL662865.4	351	AAAAAAAAAAAAAGTAAAAGAAAACAATTTGACAATCACTAAAAAAATTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59584	AAAAAAAAAAAAAGTAAAAGAAAACAATTTGACAATCACTAAAAAAATTT	59633

AL662865.4	401	AAATGCACTCACTCTTAGAACCTTCTACTCTGCTTCTCTCCCATCTGGAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59634	AAATGCACTCACTCTTAGAACCTTCTACTCTGCTTCTCTCCCATCTGGAC	59683

AL662865.4	451	AGAGATGTTTGATTATACAAGGATTGCCATTACAGCATTGTTTGGATTTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59684	AGAGATGTTTGATTATACAAGGATTGCCATTACAGCATTGTTTGGATTTG	59733

AL662865.4	501	TAAAATACTGGGACCAACGTCAATATGCTCCAACAGGGGATAAGTTAATG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59734	TAAAATACTGGGACCAACGTCAATATGCTCCAACAGGGGATAAGTTAATG	59783

AL662865.4	551	AAAATATTATGCAGGTGTACAATGAAATGCTATGCAGTTTCCAAAAACAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59784	AAAATATTATGCAGGTGTACAATGAAATGCTATGCAGTTTCCAAAAACAA	59833

AL662865.4	601	AAACAAAGAAGAAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59834	AAACAAAGAAGAAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAG	59883

AL662865.4	651	GAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59884	GAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAG	59933

AL662865.4	701	AAGAAGGAGAAGAAGAAAAAGAAGAAATAATCTAATAGGGAAAGGTGTCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59934	AAGAAGGAGAAGAAGAAAAAGAAGAAATAATCTAATAGGGAAAGGTGTCT	59983

AL662865.4	751	GAGATTTACTTACTCATTAATTTATTCAACAAATGTTTGTTGAGTGTCAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	59984	GAGATTTACTTACTCATTAATTTATTCAACAAATGTTTGTTGAGTGTCAA	60033

AL662865.4	801	CTATGTGCCAGTCTTCTAGATTCCAGGACACTGTGTGGAACAAAACAGAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60034	CTATGTGCCAGTCTTCTAGATTCCAGGACACTGTGTGGAACAAAACAGAC	60083

AL662865.4	851	AAGGTTGCTGGGGTCATGGAATTACTTTCTAGAGGGAAAGTTGGATGATA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60084	AAGGTTGCTGGGGTCATGGAATTACTTTCTAGAGGGAAAGTTGGATGATA	60133

AL662865.4	901	AGCAAACCAAGCAATAAACACATGGTATGAAACATGCCATAAAGTGGAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60134	AGCAAACCAAGCAATAAACACATGGTATGAAACATGCCATAAAGTGGAAT	60183

AL662865.4	951	GAATCAGAATATGGAAGATGAAGAGTGATGGTTATTACTTTATATTGGGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60184	GAATCAGAATATGGAAGATGAAGAGTGATGGTTATTACTTTATATTGGGT	60233

AL662865.4	1001	CATCAGGGTGGAATCTCTCTGATGAGGTAGCCAAACAGCTGCTGCAGTTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60234	CATCAGGGTGGAATCTCTCTGATGAGGTAGCCAAACAGCTGCTGCAGTTT	60283

AL662865.4	1051	AGAGTCTCAAATTTGTATGTCACTGGGCATTTATCTCAGAGAAATAAAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60284	AGAGTCTCAAATTTGTATGTCACTGGGCATTTATCTCAGAGAAATAAAAA	60333

AL662865.4	1101	TGTTTGTTCACCCAAGAATCTGCACAAAACATTGTTCGTAATAGCCAAGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60334	TGTTTGTTCACCCAAGAATCTGCACAAAACATTGTTCGTAATAGCCAAGC	60383

AL662865.4	1151	CTAGAAATAATTCAAATGTCCTCGAATGGTGAAGAGTTAAACAGTGGCAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60384	CTAGAAATAATTCAAATGTCCTCGAATGGTGAAGAGTTAAACAGTGGCAC	60433

AL662865.4	1201	ATCCATATTATGAAATACTACCCAGAGATAAAAATGAATGAACTACTGAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60434	ATCCATATTATGAAATACTACCCAGAGATAAAAATGAATGAACTACTGAG	60483

AL662865.4	1251	ATAGGCAGCAACTTGGATAGATCTCAAGGAAATTATGCTGAGTGAGAAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60484	ATAGGCAGCAACTTGGATAGATCTCAAGGAAATTATGCTGAGTGAGAAAA	60533

AL662865.4	1301	GTCAATCTCAGGTTGTGATTTGTATGATTCCATTAATAACATTTATTTAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60534	GTCAATCTCAGGTTGTGATTTGTATGATTCCATTAATAACATTTATTTAT	60583

AL662865.4	1351	TTATTTATTTTTGGGAAAGAGTCCCACTGTGTTACTCAGGCTGGAGTGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60584	TTATTTATTTTTGGGAAAGAGTCCCACTGTGTTACTCAGGCTGGAGTGCA	60633

AL662865.4	1401	GTGGGACAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTTCCGGGTTCAAGTGAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60634	GTGGGACAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTTCCGGGTTCAAGTGAT	60683

AL662865.4	1451	TCTCCTGTGTCAGCCTCCGGAGTAGCTAGGATTAAGGCATGTACCACCAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60684	TCTCCTGTGTCAGCCTCCGGAGTAGCTAGGATTAAGGCATGTACCACCAT	60733

AL662865.4	1501	GCCCAGCTATTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAAACACGGGTTTTCACC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60734	GCCCAGCTATTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAAACACGGGTTTTCACC	60783

AL662865.4	1551	ATATTGGCCAGGCTAGTCTCCAACTCTTGACCTCAAATGATCCACCTACC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60784	ATATTGGCCAGGCTAGTCTCCAACTCTTGACCTCAAATGATCCACCTACC	60833

AL662865.4	1601	TCGACTTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCGCTGTGGCCAGCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60834	TCGACTTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCGCTGTGGCCAGCC	60883

AL662865.4	1651	CACAACATTCTCGAAATGATAAAATTATAGAGATAGAGAGCAGATGAGTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60884	CACAACATTCTCGAAATGATAAAATTATAGAGATAGAGAGCAGATGAGTA	60933

AL662865.4	1701	GTTGCTAGGCATTAGGGAGAGAGAAGGGAAGGAGGTGTCTGTGGCTATAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60934	GTTGCTAGGCATTAGGGAGAGAGAAGGGAAGGAGGTGTCTGTGGCTATAA	60983

AL662865.4	1751	AAGGGTACCCTGAGGGATCCTTGTGATGGAACAGTTTTGTATCTTGACTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	60984	AAGGGTACCCTGAGGGATCCTTGTGATGGAACAGTTTTGTATCTTGACTG	61033

AL662865.4	1801	TAATGTTGTTCCTATGTGATATTTACACATGCAATAAAATTGTATAGAAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	61034	TAATGTTGTTCCTATGTGATATTTACACATGCAATAAAATTGTATAGAAC	61083

AL662865.4	1851	TAAACACACACAAACAGATGAGTGTATGTAAAAATGGTGAAATCTGAGTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	61084	TAAACACACACAAACAGATGAGTGTATGTAAAAATGGTGAAATCTGAGTA	61133

AL662865.4	1901	AGATTGGTGGATTTTATCAAAAATAATTTCCTGGTGTGATATTGTACTAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	61134	AGATTGGTGGATTTTATCAAAAATAATTTCCTGGTGTGATATTGTACTAT	61183

AL662865.4	1951	ATTTATGCAAGATGTTACCATTGGGAGAAACTGAGTGAAGGGTATGCTGG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662859.5	61184	ATTTATGCAAGATGTTACCATTGGGAGAAACTGAGTGAAGGGTATGCTGG	61233

Overview

Query
AL662865.4 - 133757 bps
Hit
AL662859.5 - 61233 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link