<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL732432.3	1	ATATTATAAAACTGAACAAAATTAATTTTAAATGCTACAACATAAATATC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	134688	ATATTATAAAACTGAACAAAATTAATTTTAAATGCTACAACATAAATATC	134737

AL732432.3	51	AAGTGGAAAAAAGCTTCCGTTTTACAAGATGAGGCACATTCTTTACAGTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	134738	AAGTGGAAAAAAGCTTCCGTTTTACAAGATGAGGCACATTCTTTACAGTT	134787

AL732432.3	101	GTATGTTACTTGGATTAGTATTTTAATTTGTAATTTAAATAGAACTTTCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	134788	GTATGTTACTTGGATTAGTATTTTAATTTGTAATTTAAATAGAACTTTCA	134837

AL732432.3	151	ATATGGTAGACTACTGTAATGATGATCCAGTATATCAGAATAGTGAATTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	134838	ATATGGTAGACTACTGTAATGATGATCCAGTATATCAGAATAGTGAATTA	134887

AL732432.3	201	AATAAAACAAGAGAATAAGTGAATGGGTGGCTATGTGAATATATACTGTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	134888	AATAAAACAAGAGAATAAGTGAATGGGTGGCTATGTGAATATATACTGTA	134937

AL732432.3	251	CATACATAGTCCCCAGGGTGAATGAGAACTGGAACTTTGCTAATACCAAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	134938	CATACATAGTCCCCAGGGTGAATGAGAACTGGAACTTTGCTAATACCAAC	134987

AL732432.3	301	TCTCTCCCTTGCCTCTCTCTCTGCCCTCTCTCTATGTATATACATTTGTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	134988	TCTCTCCCTTGCCTCTCTCTCTGCCCTCTCTCTATGTATATACATTTGTA	135037

AL732432.3	351	TTAACAAGAACCCAGTTCTCATTCATTCTGGGGTAAGGGGCTTTCAGAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135038	TTAACAAGAACCCAGTTCTCATTCATTCTGGGGTAAGGGGCTTTCAGAGA	135087

AL732432.3	401	AAAGGTAAACACCCTTGAGGCTTTCTGAAATGTCTTCTTTTTTTAATAGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135088	AAAGGTAAACACCCTTGAGGCTTTCTGAAATGTCTTCTTTTTTTAATAGT	135137

AL732432.3	451	AATGACCCTTTCTCCTTTACAGTTGAGTGTGGTGCTTTGCATGAAGTCAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135138	AATGACCCTTTCTCCTTTACAGTTGAGTGTGGTGCTTTGCATGAAGTCAC	135187

AL732432.3	501	CCATCTCTTTCCCTAAGGAGGCCAACTTTGAAGGATAGACTTTGAAGAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135188	CCATCTCTTTCCCTAAGGAGGCCAACTTTGAAGGATAGACTTTGAAGAAA	135237

AL732432.3	551	GTTTATCTCAGTGCTGTTTGTTAAGTGGCTTACCCCAAGAGGCCTCTTGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135238	GTTTATCTCAGTGCTGTTTGTTAAGTGGCTTACCCCAAGAGGCCTCTTGC	135287

AL732432.3	601	AGAAGTAATTGTTAAAACCATGAGGCACACCTGAGAGAAAGGCGCCAGGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135288	AGAAGTAATTGTTAAAACCATGAGGCACACCTGAGAGAAAGGCGCCAGGG	135337

AL732432.3	651	ACTACCTAACAAAGCTGGCACCTCTGGAGACACTTTGGAAGTATTTAATA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135338	ACTACCTAACAAAGCTGGCACCTCTGGAGACACTTTGGAAGTATTTAATA	135387

AL732432.3	701	CATATGCCCTGATGGAGCATCTTACTCTTCAAAGAAAACAGTTTTGAGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135388	CATATGCCCTGATGGAGCATCTTACTCTTCAAAGAAAACAGTTTTGAGGC	135437

AL732432.3	751	ACCTAAGCAATTATGTACTTATTGACTTTGCGAAAACATTTATAACATCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135438	ACCTAAGCAATTATGTACTTATTGACTTTGCGAAAACATTTATAACATCT	135487

AL732432.3	801	TAACAATACAATTATCTGTAAGCTTTCTAATGAGCCCCCAAGTGACCTAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135488	TAACAATACAATTATCTGTAAGCTTTCTAATGAGCCCCCAAGTGACCTAC	135537

AL732432.3	851	TAGTGGAACAAAAACTTTCTTGATAAGAGCCAGTTTCCAAGAGACCATTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135538	TAGTGGAACAAAAACTTTCTTGATAAGAGCCAGTTTCCAAGAGACCATTT	135587

AL732432.3	901	TTAATTGTATGAAAACTGAAAAATGATGGTGTTAAGAAGCTGCTGTTAGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135588	TTAATTGTATGAAAACTGAAAAATGATGGTGTTAAGAAGCTGCTGTTAGC	135637

AL732432.3	951	TCTGTGTAAACTGTGTGGACTCTTTGCCAGTACAGCCCTCAGTGAACACA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135638	TCTGTGTAAACTGTGTGGACTCTTTGCCAGTACAGCCCTCAGTGAACACA	135687

AL732432.3	1001	CATCTTTAATAGAAATTAGCAATTGCTATAACCTGTAGTCTTAGAAGAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135688	CATCTTTAATAGAAATTAGCAATTGCTATAACCTGTAGTCTTAGAAGAAA	135737

AL732432.3	1051	ATAAATACTGTAGAGGCCTCCAAAGTTATTCTAGTTACCTACTCTCTATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135738	ATAAATACTGTAGAGGCCTCCAAAGTTATTCTAGTTACCTACTCTCTATA	135787

AL732432.3	1101	TTGGGAGACAGAATTCAAACTCCAAAATTTCAAATTCTTCTTTGTTTTAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135788	TTGGGAGACAGAATTCAAACTCCAAAATTTCAAATTCTTCTTTGTTTTAT	135837

AL732432.3	1151	GTCTAAGTGGGTTAGAATAATCTAATAAAATACTCCCAATAAACAAATCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135838	GTCTAAGTGGGTTAGAATAATCTAATAAAATACTCCCAATAAACAAATCA	135887

AL732432.3	1201	ATCCTGCATTCTTTTTAAATGTTCTGTGAAAGCAATAAACCTTGTAGCTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135888	ATCCTGCATTCTTTTTAAATGTTCTGTGAAAGCAATAAACCTTGTAGCTA	135937

AL732432.3	1251	ATTTTCAGTATGGCATATACACCAGTTAACAATACATCTTTTAGAATCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135938	ATTTTCAGTATGGCATATACACCAGTTAACAATACATCTTTTAGAATCAG	135987

AL732432.3	1301	ATGGTGTGAGTTTGAACAATGAACCACCAATTGTTAGGTATGTGACTTAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	135988	ATGGTGTGAGTTTGAACAATGAACCACCAATTGTTAGGTATGTGACTTAA	136037

AL732432.3	1351	AGAAAGCTAGTTAATTTGGTGGCTCAGTTGTAAAAAAGATGGTAATAGTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	136038	AGAAAGCTAGTTAATTTGGTGGCTCAGTTGTAAAAAAGATGGTAATAGTA	136087

AL732432.3	1401	TCTCTCACATGTGGCATGTTAAATGGGTTAATATATATTAACTACATTAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	136088	TCTCTCACATGTGGCATGTTAAATGGGTTAATATATATTAACTACATTAA	136137

AL732432.3	1451	ATAACATCACATATAAGCGTGGAAGAGATGTTAGTGCTCATCATTCAGCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	136138	ATAACATCACATATAAGCGTGGAAGAGATGTTAGTGCTCATCATTCAGCC	136187

AL732432.3	1501	ACCCTAGTAACGATGTATTATTTTCTATAGTTATTTCAAAAAATACTTTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	136188	ACCCTAGTAACGATGTATTATTTTCTATAGTTATTTCAAAAAATACTTTT	136237

AL732432.3	1551	GTATTTTTGTTTTTAAAAATTATTTTTATTTTATAGAAGAGAAAATTCAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	136238	GTATTTTTGTTTTTAAAAATTATTTTTATTTTATAGAAGAGAAAATTCAG	136287

AL732432.3	1601	ATTAAAGAAACCATAACTATCTTGACTAAGATTGCACTGGTATTTATCAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	136288	ATTAAAGAAACCATAACTATCTTGACTAAGATTGCACTGGTATTTATCAG	136337

AL732432.3	1651	TAGTGTTCAACTTCAAATGCACATCTTCTGATTATGAGAATGGTGGTTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	136338	TAGTGTTCAACTTCAAATGCACATCTTCTGATTATGAGAATGGTGGTTCT	136387

AL732432.3	1701	TCCATCACCTTATAGCTATTTCCACATCCATTTACAATTCAAGCTCTTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	136388	TCCATCACCTTATAGCTATTTCCACATCCATTTACAATTCAAGCTCTTCC	136437

AL732432.3	1751	AATACTGGAAGTGTTAAAAATGGGATGGAAAACTGTAACTGGAAGAAATA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	136438	AATACTGGAAGTGTTAAAAATGGGATGGAAAACTGTAACTGGAAGAAATA	136487

AL732432.3	1801	AACACTGACTATTTTGTTTCACTTAAGGTTAATCAAATTTCAAAATGCAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	136488	AACACTGACTATTTTGTTTCACTTAAGGTTAATCAAATTTCAAAATGCAC	136537

AL732432.3	1851	ATTCTTTTTCCCATTACGGTGGTATAAGTAACTCATTCTGTCTCTTCCCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	136538	ATTCTTTTTCCCATTACGGTGGTATAAGTAACTCATTCTGTCTCTTCCCC	136587

AL732432.3	1901	TGAGAAAGTTAAAATTGTCCCTGATTGCATGTGGTATATTATTGTACATA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	136588	TGAGAAAGTTAAAATTGTCCCTGATTGCATGTGGTATATTATTGTACATA	136637

AL732432.3	1951	AAAGCTATAAAGAATTTATCAAAAAACTGTTAGAAATAATAAATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662857.3	136638	AAAGCTATAAAGAATTTATCAAAAAACTGTTAGAAATAATAAATGAATTC	136687

Overview

Query
AL732432.3 - 52664 bps
Hit
AL662857.3 - 136687 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link