<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL663093.10	1	TACTGCAACAGGCAACTTCCAAACTCATATTAAGTCTACCTTGGCTCTGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	82475	TACTGCAACAGGCAACTTCCAAACTCATATTAAGTCTACCTTGGCTCTGA	82524

AL663093.10	51	AATCCAGTCCTTTATTTTCAATTTTTTTTCAATAATATCTTCACTTGGAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	82525	AATCCAGTCCTTTATTTTCAATTTTTTTTCAATAATATCTTCACTTGGAT	82574

AL663093.10	101	GTCACATCATATCAAACGTGACATTCACGTGTTCATCTGGCAAACATTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	82575	GTCACATCATATCAAACGTGACATTCACGTGTTCATCTGGCAAACATTTT	82624

AL663093.10	151	TTGAGCATCTACTCTGTGCTAGTTCTGAAGATAAATCAGTGAACAAAACA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	82625	TTGAGCATCTACTCTGTGCTAGTTCTGAAGATAAATCAGTGAACAAAACA	82674

AL663093.10	201	GCAACAGGCCCTGCCTTCAGGGAGCTCACAGTTCACTAGGAAAGGCAGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	82675	GCAACAGGCCCTGCCTTCAGGGAGCTCACAGTTCACTAGGAAAGGCAGAG	82724

AL663093.10	251	ATCACACAAAGAAGGCATATAATAAAAGAGAGGCACAAGTGTGCAAAATA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	82725	ATCACACAAAGAAGGCATATAATAAAAGAGAGGCACAAGTGTGCAAAATA	82774

AL663093.10	301	CTGTCAGGACCCACCTCGTCTTCCCACCATCAAGTCTAAAAAGCCGCCTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	82775	CTGTCAGGACCCACCTCGTCTTCCCACCATCAAGTCTAAAAAGCCGCCTT	82824

AL663093.10	351	CATCAGCATCCATTCTCCCCTGCTAACATTGGAGTGTTCGTGCATCTTGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	82825	CATCAGCATCCATTCTCCCCTGCTAACATTGGAGTGTTCGTGCATCTTGG	82874

AL663093.10	401	CTCTGGCTCCCCCATCCCACACCTCCTGCCTTCTTCATGGGCTTCTTCCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	82875	CTCTGGCTCCCCCATCCCACACCTCCTGCCTTCTTCATGGGCTTCTTCCC	82924

AL663093.10	451	CTTCCAGTTTTTCCTTCTCCTTCTACAGGGTCCTTCCCAACACCAGCCAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	82925	CTTCCAGTTTTTCCTTCTCCTTCTACAGGGTCCTTCCCAACACCAGCCAA	82974

AL663093.10	501	ATAAGCCCTAAGCAGTGTGCACAGGAAGCACCCAGAGGAGAGTATTTTTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	82975	ATAAGCCCTAAGCAGTGTGCACAGGAAGCACCCAGAGGAGAGTATTTTTA	83024

AL663093.10	551	AAAAGTAGATTTCTAAAGACCCGGCACGGTGGCTCATGCGTATAATCCCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83025	AAAAGTAGATTTCTAAAGACCCGGCACGGTGGCTCATGCGTATAATCCCA	83074

AL663093.10	601	GCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCACGCCAGGAGTTTGAGACCAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83075	GCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCACGCCAGGAGTTTGAGACCAG	83124

AL663093.10	651	CCTGGACAACATAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAACTTAGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83125	CCTGGACAACATAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAACTTAGC	83174

AL663093.10	701	CAGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83175	CAGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGC	83224

AL663093.10	751	AGGGGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83225	AGGGGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCA	83274

AL663093.10	801	CACCAGTGCACCCCAGCCTGGGTGACAGAATGAGATGCTGTCTCAAAAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83275	CACCAGTGCACCCCAGCCTGGGTGACAGAATGAGATGCTGTCTCAAAAAA	83324

AL663093.10	851	ATAAAAAATAAATAAATAAAATGGAGATGGCCACTGGATGCAGTGGTTCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83325	ATAAAAAATAAATAAATAAAATGGAGATGGCCACTGGATGCAGTGGTTCA	83374

AL663093.10	901	GGCCTGTAATCCCAGCACTTTTGGAAGACAAGGTGGGAGGATTGCCCAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83375	GGCCTGTAATCCCAGCACTTTTGGAAGACAAGGTGGGAGGATTGCCCAAA	83424

AL663093.10	951	GCTAGGAGTCAGAGACCTGCCTGGGCGACATTGCGAGACACTGTCTCTAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83425	GCTAGGAGTCAGAGACCTGCCTGGGCGACATTGCGAGACACTGTCTCTAT	83474

AL663093.10	1001	TAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAACAAGTTCCCCAGGCACTCCTGATGTGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83475	TAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAACAAGTTCCCCAGGCACTCCTGATGTGG	83524

AL663093.10	1051	TCCAGGGACACACTTTGGAAAGCTCTGCTCTGCTGGCAGCCATCTTCACA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83525	TCCAGGGACACACTTTGGAAAGCTCTGCTCTGCTGGCAGCCATCTTCACA	83574

AL663093.10	1101	GACCCCCACCCACATCTTCTCAGCCTTGCCCCCATCAGCTCCCCTTCATC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83575	GACCCCCACCCACATCTTCTCAGCCTTGCCCCCATCAGCTCCCCTTCATC	83624

AL663093.10	1151	ACCAAGCCTCTTGAAACAATCCCCTACAAACACTATCTTCATGTCCTTAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83625	ACCAAGCCTCTTGAAACAATCCCCTACAAACACTATCTTCATGTCCTTAT	83674

AL663093.10	1201	CTCCTACTCTCTGTGTGTATGTATTTTCTCTGCAAGTTTTACCAGAGCAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83675	CTCCTACTCTCTGTGTGTATGTATTTTCTCTGCAAGTTTTACCAGAGCAA	83724

AL663093.10	1251	TCCATGTAAATAGTTTAAAGAGTCCAATAGTTCCATAGATTTATTGCAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83725	TCCATGTAAATAGTTTAAAGAGTCCAATAGTTCCATAGATTTATTGCAAA	83774

AL663093.10	1301	AACTAGCACGGATGCACCCTCCCCCTTTTCATGTCCAATTCCTGTTCTCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83775	AACTAGCACGGATGCACCCTCCCCCTTTTCATGTCCAATTCCTGTTCTCC	83824

AL663093.10	1351	AGAGGAGACGACTTTTAACTTTTAGCTTTTTATCCCAGTATTTGCAAGTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83825	AGAGGAGACGACTTTTAACTTTTAGCTTTTTATCCCAGTATTTGCAAGTG	83874

AL663093.10	1401	CAGATTTAAACATCATGCCCATATTGTATTGCAATTCATAGATTTTTTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83875	CAGATTTAAACATCATGCCCATATTGTATTGCAATTCATAGATTTTTTTT	83924

AL663093.10	1451	AATGAGACCTTAAATTGCGTCTTTTATTGGACTAAAGAATATTGTAAGTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83925	AATGAGACCTTAAATTGCGTCTTTTATTGGACTAAAGAATATTGTAAGTC	83974

AL663093.10	1501	TCAAAATAGCTTCCTGTCCCAATCTCACCTCTGAAAGGACTTACTAATTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	83975	TCAAAATAGCTTCCTGTCCCAATCTCACCTCTGAAAGGACTTACTAATTT	84024

AL663093.10	1551	AAATATATCTACTATGAACTGAACAGTGTCCCCCCTAAATATGTTTAAGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	84025	AAATATATCTACTATGAACTGAACAGTGTCCCCCCTAAATATGTTTAAGT	84074

AL663093.10	1601	CTTTTTTCTATTTTTTTTTTGAGACAGGGGCTTGCTCTGTCATCCAAGCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	84075	CTTTTTTCTATTTTTTTTTTGAGACAGGGGCTTGCTCTGTCATCCAAGCT	84124

AL663093.10	1651	GGAGTGTAGTGGCACAATCATAGCTTGCTGCAGCCTTGACCTCCTGGGCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	84125	GGAGTGTAGTGGCACAATCATAGCTTGCTGCAGCCTTGACCTCCTGGGCT	84174

AL663093.10	1701	CAAGCGAGCCTCCCATCTCAGCACTCACCCCTCCCAGAGGCTGCCACCAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	84175	CAAGCGAGCCTCCCATCTCAGCACTCACCCCTCCCAGAGGCTGCCACCAT	84224

AL663093.10	1751	GCCCAGCTAATTAGTTTTGTTTTAAATTTTAGTAGAGACCATATCTCACT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	84225	GCCCAGCTAATTAGTTTTGTTTTAAATTTTAGTAGAGACCATATCTCACT	84274

AL663093.10	1801	ATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACCCCTGAGCTCAAGTGATCCTCCTGCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	84275	ATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACCCCTGAGCTCAAGTGATCCTCCTGCC	84324

AL663093.10	1851	TTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	84325	TTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCT	84374

AL663093.10	1901	CATATGTTGAAGTCTTAATCATCAATGTGACTATATCTGAAGATAGGGTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	84375	CATATGTTGAAGTCTTAATCATCAATGTGACTATATCTGAAGATAGGGTC	84424

AL663093.10	1951	TTTAGGAAGTAATTAAAGTTAATGGGGTCATAAGAGTGGTGCCCGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662854.7	84425	TTTAGGAAGTAATTAAAGTTAATGGGGTCATAAGAGTGGTGCCCGAATTC	84474

Overview

Query
AL663093.10 - 117327 bps
Hit
AL662854.7 - 84474 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link