<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
AL671755.4 1 GACTTACGATGCTTTTTCCAAGCCTGCCCGTGGCTGCCCAAGGACCAATC 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 140563 GACTTACGATGCTTTTTCCAAGCCTGCCCGTGGCTGCCCAAGGACCAATC 140612 AL671755.4 51 AGCAAGCACTTCCTTTCCTCTGAAGTCCATAAAAATTCCCAGACTCAGCC 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 140613 AGCAAGCACTTCCTTTCCTCTGAAGTCCATAAAAATTCCCAGACTCAGCC 140662 AL671755.4 101 AGACACAAAAAGATGTCAGGACAACCAGCTGCAGAGAGGAATTACCTACC 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 140663 AGACACAAAAAGATGTCAGGACAACCAGCTGCAGAGAGGAATTACCTACC 140712 AL671755.4 151 CTAGGGTCTCTTTTCTGCTGAGACCTGAACACTCTGTGGGATGACCTGTC 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 140713 CTAGGGTCTCTTTTCTGCTGAGACCTGAACACTCTGTGGGATGACCTGTC 140762 AL671755.4 201 TGAGGAGAGGAGCTACCCACTCCAGGGTCTCCTCTCTGCGGAGAGCTGAA 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 140763 TGAGGAGAGGAGCTACCCACTCCAGGGTCTCCTCTCTGCGGAGAGCTGAA 140812 AL671755.4 251 CACTCGTTAGGACACCCTGGCTATGGAGAGGAGCGGGTTTCCTCTCAGCT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 140813 CACTCGTTAGGACACCCTGGCTATGGAGAGGAGCGGGTTTCCTCTCAGCT 140862 AL671755.4 301 GTTCTATTGTTCAATAAAGCTCCTCTTCACCTTACTCACCCTCCACTTAT 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 140863 GTTCTATTGTTCAATAAAGCTCCTCTTCACCTTACTCACCCTCCACTTAT 140912 AL671755.4 351 CCACATACCTCGTGAGTGTGGGACAAGAACTTGGGACCCACTGAATGGCA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 140913 CCACATACCTCGTGAGTGTGGGACAAGAACTTGGGACCCACTGAATGGCA 140962 AL671755.4 401 TGGCTGAAAGAGCTGTCACACAAACAGGGCTGAAACATGCCCTTTCCTCA 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 140963 TGGCTGAAAGAGCTGTCACACAAACAGGGCTGAAACATGCCCTTTCCTCA 141012 AL671755.4 451 CCTCATTGTGGTTGACATAAAGGAGATAAGAGATGCAACTCTTTGGGGAG 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141013 CCTCATTGTGGTTGACATAAAGGAGATAAGAGATGCAACTCTTTGGGGAG 141062 AL671755.4 501 CCCAGACCTAGGAGCTCCCTGAGCCAGGGCTGTGACACCCTTTTGGGTGG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141063 CCCAGACCTAGGAGCTCCCTGAGCCAGGGCTGTGACACCCTTTTGGGTGG 141112 AL671755.4 551 TTCTGTGGTTCCTGGTGCGGAAGCTGCTTGCAGTACACCTGGTCCAGCCG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141113 TTCTGTGGTTCCTGGTGCGGAAGCTGCTTGCAGTACACCTGGTCCAGCCG 141162 AL671755.4 601 CAGACTTGCAGGGAGATGGCACCCCTGTCAGTGCCTGGAACTGCCTGCCC 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141163 CAGACTTGCAGGGAGATGGCACCCCTGTCAGTGCCTGGAACTGCCTGCCC 141212 AL671755.4 651 TGCTGCAGCAAGCATGCCTGGCTGTGTGCAGTAGCTGGACCCCACACTTG 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141213 TGCTGCAGCAAGCATGCCTGGCTGTGTGCAGTAGCTGGACCCCACACTTG 141262 AL671755.4 701 CTCCCTCATACACACCTGCCACAGTAAACATACTGCAGTATGTTGGGAGA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141263 CTCCCTCATACACACCTGCCACAGTAAACATACTGCAGTATGTTGGGAGA 141312 AL671755.4 751 TATTGGATTTTACCAAAAGCTTTTTCAGCATCTATTGAGATGATCATATG 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141313 TATTGGATTTTACCAAAAGCTTTTTCAGCATCTATTGAGATGATCATATG 141362 AL671755.4 801 GCTTTTCCTTTTAATTCTGTTTATGTGGTGAATCACATTTGTAGATTTGC 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141363 GCTTTTCCTTTTAATTCTGTTTATGTGGTGAATCACATTTGTAGATTTGC 141412 AL671755.4 851 AGATGTTCAACCAATCTTGTATGCCAGAAATAGAGCCTTCTTGATTGTGG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141413 AGATGTTCAACCAATCTTGTATGCCAGAAATAGAGCCTTCTTGATTGTGG 141462 AL671755.4 901 TGTATTAACTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGTTTGATTAGTATTTTCTC 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141463 TGTATTAACTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGTTTGATTAGTATTTTCTC 141512 AL671755.4 951 AAGGATTTTTCCTTCTATGTTCATCAGGGATATTGGATGGAATTTTTTTC 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141513 AAGGATTTTTCCTTCTATGTTCATCAGGGATATTGGATGGAATTTTTTTC 141562 AL671755.4 1001 TTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTATTAAGCTAACTCACCTAACTTAGTG 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141563 TTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTATTAAGCTAACTCACCTAACTTAGTG 141612 AL671755.4 1051 TGGGTCACATATCTTGGCTTGATAATCCCAAGCTGTGCTTAGAAACCCAG 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141613 TGGGTCACATATCTTGGCTTGATAATCCCAAGCTGTGCTTAGAAACCCAG 141662 AL671755.4 1101 GTAGCACCAGGACATCCTGCAGCTCAGGGTTGGGCTCTGGCTGCACTGTG 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141663 GTAGCACCAGGACATCCTGCAGCTCAGGGTTGGGCTCTGGCTGCACTGTG 141712 AL671755.4 1151 GGATCTGATATGCTTCTGGGTTGCTGGGAAAGTACTCAGGTGAAGCAAGG 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141713 GGATCTGATATGCTTCTGGGTTGCTGGGAAAGTACTCAGGTGAAGCAAGG 141762 AL671755.4 1201 CATTCAGCTGGGCTGTGCAAGCTGCACAATGCACCTGCTTCTCCAGGGCA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141763 CATTCAGCTGGGCTGTGCAAGCTGCACAATGCACCTGCTTCTCCAGGGCA 141812 AL671755.4 1251 GCTAGGCATAGGACCTGAGAGGAGCCTGCAGGCAGGAGGGCTTGCAGAAC 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141813 GCTAGGCATAGGACCTGAGAGGAGCCTGCAGGCAGGAGGGCTTGCAGAAC 141862 AL671755.4 1301 AGATGTGTCTTAGTCCCATAGGGAAGCCAGCCCTGCTCTCCTTTGGCTTG 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141863 AGATGTGTCTTAGTCCCATAGGGAAGCCAGCCCTGCTCTCCTTTGGCTTG 141912 AL671755.4 1351 ACAGTCAGCTGAGTCAAGAGCCTTGCAGAGGGAGATGGGAAGCTCTCAGG 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141913 ACAGTCAGCTGAGTCAAGAGCCTTGCAGAGGGAGATGGGAAGCTCTCAGG 141962 AL671755.4 1401 GATGTGTGTCTATGGCTACCCTCCACCAAAGCTGCCCAGCACACAAAAGC 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 141963 GATGTGTGTCTATGGCTACCCTCCACCAAAGCTGCCCAGCACACAAAAGC 142012 AL671755.4 1451 TCCCAGGCTCTGCACTGTCTGAAGTACTGTCTCTGCCTGTTCCCCAGGGA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 142013 TCCCAGGCTCTGCACTGTCTGAAGTACTGTCTCTGCCTGTTCCCCAGGGA 142062 AL671755.4 1501 GATACCCCTGCCAGCTAACACATTTATGGGGGATATGGGGTCTCTCATAG 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 142063 GATACCCCTGCCAGCTAACACATTTATGGGGGATATGGGGTCTCTCATAG 142112 AL671755.4 1551 CTAGGATCCCAGAGGTACATGACAAGAGTGAGCTGTCCCTCAGTTCCCTG 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 142113 CTAGGATCCCAGAGGTACATGACAAGAGTGAGCTGTCCCTCAGTTCCCTG 142162 AL671755.4 1601 GCTCACCAATTTCCCAGGAGCCATCTGGGGCTGGGAACTAGCCCTGGTAT 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 142163 GCTCACCAATTTCCCAGGAGCCATCTGGGGCTGGGAACTAGCCCTGGTAT 142212 AL671755.4 1651 TCAGGTACCACTTCAGGGTTTCCAGATTTCTGACTCTACAGCCTCAGCTT 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 142213 TCAGGTACCACTTCAGGGTTTCCAGATTTCTGACTCTACAGCCTCAGCTT 142262 AL671755.4 1701 CAGCTTTGCTTCTCCATACACTCAGTGTTTTCTCTCCTAAGATCACACAT 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 142263 CAGCTTTGCTTCTCCATACACTCAGTGTTTTCTCTCCTAAGATCACACAT 142312 AL671755.4 1751 TGACTTTGTATCCTGAGACTTTGCTGAATTTGCTTATCAGCTTAAGGAGA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 142313 TGACTTTGTATCCTGAGACTTTGCTGAATTTGCTTATCAGCTTAAGGAGA 142362 AL671755.4 1801 TTTTGGGCTGAGATGATTAAATCAACCAATTTATGTTGATTAACTCAATA 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 142363 TTTTGGGCTGAGATGATTAAATCAACCAATTTATGTTGATTAACTCAATA 142412 AL671755.4 1851 ATTTGGTCTCTCTCGGTGAAAGCAGTGCTTCCTGGCTGCAACTAATTGGA 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 142413 ATTTGGTCTCTCTCGGTGAAAGCAGTGCTTCCTGGCTGCAACTAATTGGA 142462 AL671755.4 1901 CATCTTGTCCCTTCCCATCTGTGTAACACATTTTTTATACATGCTTTATT 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 142463 CATCTTGTCCCTTCCCATCTGTGTAACACATTTTTTATACATGCTTTATT 142512 AL671755.4 1951 TTGTCATAATTTTAGCTTTACAGAAAAGTTGCAAAGATGGCAAAGAATTC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662852.9 142513 TTGTCATAATTTTAGCTTTACAGAAAAGTTGCAAAGATGGCAAAGAATTC 142562