<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL671755.4	1	GACTTACGATGCTTTTTCCAAGCCTGCCCGTGGCTGCCCAAGGACCAATC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	140563	GACTTACGATGCTTTTTCCAAGCCTGCCCGTGGCTGCCCAAGGACCAATC	140612

AL671755.4	51	AGCAAGCACTTCCTTTCCTCTGAAGTCCATAAAAATTCCCAGACTCAGCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	140613	AGCAAGCACTTCCTTTCCTCTGAAGTCCATAAAAATTCCCAGACTCAGCC	140662

AL671755.4	101	AGACACAAAAAGATGTCAGGACAACCAGCTGCAGAGAGGAATTACCTACC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	140663	AGACACAAAAAGATGTCAGGACAACCAGCTGCAGAGAGGAATTACCTACC	140712

AL671755.4	151	CTAGGGTCTCTTTTCTGCTGAGACCTGAACACTCTGTGGGATGACCTGTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	140713	CTAGGGTCTCTTTTCTGCTGAGACCTGAACACTCTGTGGGATGACCTGTC	140762

AL671755.4	201	TGAGGAGAGGAGCTACCCACTCCAGGGTCTCCTCTCTGCGGAGAGCTGAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	140763	TGAGGAGAGGAGCTACCCACTCCAGGGTCTCCTCTCTGCGGAGAGCTGAA	140812

AL671755.4	251	CACTCGTTAGGACACCCTGGCTATGGAGAGGAGCGGGTTTCCTCTCAGCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	140813	CACTCGTTAGGACACCCTGGCTATGGAGAGGAGCGGGTTTCCTCTCAGCT	140862

AL671755.4	301	GTTCTATTGTTCAATAAAGCTCCTCTTCACCTTACTCACCCTCCACTTAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	140863	GTTCTATTGTTCAATAAAGCTCCTCTTCACCTTACTCACCCTCCACTTAT	140912

AL671755.4	351	CCACATACCTCGTGAGTGTGGGACAAGAACTTGGGACCCACTGAATGGCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	140913	CCACATACCTCGTGAGTGTGGGACAAGAACTTGGGACCCACTGAATGGCA	140962

AL671755.4	401	TGGCTGAAAGAGCTGTCACACAAACAGGGCTGAAACATGCCCTTTCCTCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	140963	TGGCTGAAAGAGCTGTCACACAAACAGGGCTGAAACATGCCCTTTCCTCA	141012

AL671755.4	451	CCTCATTGTGGTTGACATAAAGGAGATAAGAGATGCAACTCTTTGGGGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141013	CCTCATTGTGGTTGACATAAAGGAGATAAGAGATGCAACTCTTTGGGGAG	141062

AL671755.4	501	CCCAGACCTAGGAGCTCCCTGAGCCAGGGCTGTGACACCCTTTTGGGTGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141063	CCCAGACCTAGGAGCTCCCTGAGCCAGGGCTGTGACACCCTTTTGGGTGG	141112

AL671755.4	551	TTCTGTGGTTCCTGGTGCGGAAGCTGCTTGCAGTACACCTGGTCCAGCCG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141113	TTCTGTGGTTCCTGGTGCGGAAGCTGCTTGCAGTACACCTGGTCCAGCCG	141162

AL671755.4	601	CAGACTTGCAGGGAGATGGCACCCCTGTCAGTGCCTGGAACTGCCTGCCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141163	CAGACTTGCAGGGAGATGGCACCCCTGTCAGTGCCTGGAACTGCCTGCCC	141212

AL671755.4	651	TGCTGCAGCAAGCATGCCTGGCTGTGTGCAGTAGCTGGACCCCACACTTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141213	TGCTGCAGCAAGCATGCCTGGCTGTGTGCAGTAGCTGGACCCCACACTTG	141262

AL671755.4	701	CTCCCTCATACACACCTGCCACAGTAAACATACTGCAGTATGTTGGGAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141263	CTCCCTCATACACACCTGCCACAGTAAACATACTGCAGTATGTTGGGAGA	141312

AL671755.4	751	TATTGGATTTTACCAAAAGCTTTTTCAGCATCTATTGAGATGATCATATG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141313	TATTGGATTTTACCAAAAGCTTTTTCAGCATCTATTGAGATGATCATATG	141362

AL671755.4	801	GCTTTTCCTTTTAATTCTGTTTATGTGGTGAATCACATTTGTAGATTTGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141363	GCTTTTCCTTTTAATTCTGTTTATGTGGTGAATCACATTTGTAGATTTGC	141412

AL671755.4	851	AGATGTTCAACCAATCTTGTATGCCAGAAATAGAGCCTTCTTGATTGTGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141413	AGATGTTCAACCAATCTTGTATGCCAGAAATAGAGCCTTCTTGATTGTGG	141462

AL671755.4	901	TGTATTAACTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGTTTGATTAGTATTTTCTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141463	TGTATTAACTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGTTTGATTAGTATTTTCTC	141512

AL671755.4	951	AAGGATTTTTCCTTCTATGTTCATCAGGGATATTGGATGGAATTTTTTTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141513	AAGGATTTTTCCTTCTATGTTCATCAGGGATATTGGATGGAATTTTTTTC	141562

AL671755.4	1001	TTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTATTAAGCTAACTCACCTAACTTAGTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141563	TTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTATTAAGCTAACTCACCTAACTTAGTG	141612

AL671755.4	1051	TGGGTCACATATCTTGGCTTGATAATCCCAAGCTGTGCTTAGAAACCCAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141613	TGGGTCACATATCTTGGCTTGATAATCCCAAGCTGTGCTTAGAAACCCAG	141662

AL671755.4	1101	GTAGCACCAGGACATCCTGCAGCTCAGGGTTGGGCTCTGGCTGCACTGTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141663	GTAGCACCAGGACATCCTGCAGCTCAGGGTTGGGCTCTGGCTGCACTGTG	141712

AL671755.4	1151	GGATCTGATATGCTTCTGGGTTGCTGGGAAAGTACTCAGGTGAAGCAAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141713	GGATCTGATATGCTTCTGGGTTGCTGGGAAAGTACTCAGGTGAAGCAAGG	141762

AL671755.4	1201	CATTCAGCTGGGCTGTGCAAGCTGCACAATGCACCTGCTTCTCCAGGGCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141763	CATTCAGCTGGGCTGTGCAAGCTGCACAATGCACCTGCTTCTCCAGGGCA	141812

AL671755.4	1251	GCTAGGCATAGGACCTGAGAGGAGCCTGCAGGCAGGAGGGCTTGCAGAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141813	GCTAGGCATAGGACCTGAGAGGAGCCTGCAGGCAGGAGGGCTTGCAGAAC	141862

AL671755.4	1301	AGATGTGTCTTAGTCCCATAGGGAAGCCAGCCCTGCTCTCCTTTGGCTTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141863	AGATGTGTCTTAGTCCCATAGGGAAGCCAGCCCTGCTCTCCTTTGGCTTG	141912

AL671755.4	1351	ACAGTCAGCTGAGTCAAGAGCCTTGCAGAGGGAGATGGGAAGCTCTCAGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141913	ACAGTCAGCTGAGTCAAGAGCCTTGCAGAGGGAGATGGGAAGCTCTCAGG	141962

AL671755.4	1401	GATGTGTGTCTATGGCTACCCTCCACCAAAGCTGCCCAGCACACAAAAGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	141963	GATGTGTGTCTATGGCTACCCTCCACCAAAGCTGCCCAGCACACAAAAGC	142012

AL671755.4	1451	TCCCAGGCTCTGCACTGTCTGAAGTACTGTCTCTGCCTGTTCCCCAGGGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	142013	TCCCAGGCTCTGCACTGTCTGAAGTACTGTCTCTGCCTGTTCCCCAGGGA	142062

AL671755.4	1501	GATACCCCTGCCAGCTAACACATTTATGGGGGATATGGGGTCTCTCATAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	142063	GATACCCCTGCCAGCTAACACATTTATGGGGGATATGGGGTCTCTCATAG	142112

AL671755.4	1551	CTAGGATCCCAGAGGTACATGACAAGAGTGAGCTGTCCCTCAGTTCCCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	142113	CTAGGATCCCAGAGGTACATGACAAGAGTGAGCTGTCCCTCAGTTCCCTG	142162

AL671755.4	1601	GCTCACCAATTTCCCAGGAGCCATCTGGGGCTGGGAACTAGCCCTGGTAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	142163	GCTCACCAATTTCCCAGGAGCCATCTGGGGCTGGGAACTAGCCCTGGTAT	142212

AL671755.4	1651	TCAGGTACCACTTCAGGGTTTCCAGATTTCTGACTCTACAGCCTCAGCTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	142213	TCAGGTACCACTTCAGGGTTTCCAGATTTCTGACTCTACAGCCTCAGCTT	142262

AL671755.4	1701	CAGCTTTGCTTCTCCATACACTCAGTGTTTTCTCTCCTAAGATCACACAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	142263	CAGCTTTGCTTCTCCATACACTCAGTGTTTTCTCTCCTAAGATCACACAT	142312

AL671755.4	1751	TGACTTTGTATCCTGAGACTTTGCTGAATTTGCTTATCAGCTTAAGGAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	142313	TGACTTTGTATCCTGAGACTTTGCTGAATTTGCTTATCAGCTTAAGGAGA	142362

AL671755.4	1801	TTTTGGGCTGAGATGATTAAATCAACCAATTTATGTTGATTAACTCAATA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	142363	TTTTGGGCTGAGATGATTAAATCAACCAATTTATGTTGATTAACTCAATA	142412

AL671755.4	1851	ATTTGGTCTCTCTCGGTGAAAGCAGTGCTTCCTGGCTGCAACTAATTGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	142413	ATTTGGTCTCTCTCGGTGAAAGCAGTGCTTCCTGGCTGCAACTAATTGGA	142462

AL671755.4	1901	CATCTTGTCCCTTCCCATCTGTGTAACACATTTTTTATACATGCTTTATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	142463	CATCTTGTCCCTTCCCATCTGTGTAACACATTTTTTATACATGCTTTATT	142512

AL671755.4	1951	TTGTCATAATTTTAGCTTTACAGAAAAGTTGCAAAGATGGCAAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662852.9	142513	TTGTCATAATTTTAGCTTTACAGAAAAGTTGCAAAGATGGCAAAGAATTC	142562

Overview

Query
AL671755.4 - 8988 bps
Hit
AL662852.9 - 142562 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link