<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL671883.3	1	GAATTCCACACTGTCAATGAAAAGAGGCAAACTTCATAAAATATTTGAAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	1995	GAATTCCACACTGTCAATGAAAAGAGGCAAACTTCATAAAATATTTGAAG	2044

AL671883.3	51	AGATTTATTCTGAGCCAAATACGAGTGACCACAGCCCATGACACTTCCCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2045	AGATTTATTCTGAGCCAAATACGAGTGACCACAGCCCATGACACTTCCCT	2094

AL671883.3	101	CAGGAGACCCTGAGAACATGTACTCAATGTGGTTGGGGTACAGGTTGGTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2095	CAGGAGACCCTGAGAACATGTACTCAATGTGGTTGGGGTACAGGTTGGTT	2144

AL671883.3	151	TTATACATTTTAGGAAGATATGAGACACTAATAATATGTATTTAAGATAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2145	TTATACATTTTAGGAAGATATGAGACACTAATAATATGTATTTAAGATAT	2194

AL671883.3	201	ACATTGGATCAGTCCAGAAAAGCAGAACAATTTGAAGCAAGCGGGGGTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2195	ACATTGGATCAGTCCAGAAAAGCAGAACAATTTGAAGCAAGCGGGGGTTG	2244

AL671883.3	251	GGGGTTACTGCTTCTAGGTTATAGGTAGATTTTAAAATGTTCTGATTGGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2245	GGGGTTACTGCTTCTAGGTTATAGGTAGATTTTAAAATGTTCTGATTGGC	2294

AL671883.3	301	AATTGGTTGAGTTATTATCAATAAAAAGGAACGTCTGGGTTATGATAAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2295	AATTGGTTGAGTTATTATCAATAAAAAGGAACGTCTGGGTTATGATAAGA	2344

AL671883.3	351	GGTTGTGGAGTCCAAAATTTTATCATGCAGTTGAAGCCTCCAGGTGCCAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2345	GGTTGTGGAGTCCAAAATTTTATCATGCAGTTGAAGCCTCCAGGTGCCAG	2394

AL671883.3	401	GCTTCAGAGAGAATAGATTATAATGTTTCTGATCAGACTTAAGGTCTGTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2395	GCTTCAGAGAGAATAGATTATAATGTTTCTGATCAGACTTAAGGTCTGTG	2444

AL671883.3	451	TTGATGTTAATTGCTGGTCAGCTTTTCCTGAATTCCAAAAGGGAAGAGGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2445	TTGATGTTAATTGCTGGTCAGCTTTTCCTGAATTCCAAAAGGGAAGAGGC	2494

AL671883.3	501	CATAATGAGGCATGTTCAACACCTGCTTCCCATGGTGGCTTGAGCCAGTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2495	CATAATGAGGCATGTTCAACACCTGCTTCCCATGGTGGCTTGAGCCAGTC	2544

AL671883.3	551	TTTCAAGTTAACTTTTGAGCACCCTGGCTGAGGAGGGTGTCCATTAAGAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2545	TTTCAAGTTAACTTTTGAGCACCCTGGCTGAGGAGGGTGTCCATTAAGAT	2594

AL671883.3	601	GGTTGGGAGAGGGTGGGTTTGAAGTTTATTTTTGGTTTACAACATGTAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2595	GGTTGGGAGAGGGTGGGTTTGAAGTTTATTTTTGGTTTACAACATGTAAA	2644

AL671883.3	651	ATGTTAAGAGGAGATAGAAACCACCCGCATCCCTAGAATAGCACAACACT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2645	ATGTTAAGAGGAGATAGAAACCACCCGCATCCCTAGAATAGCACAACACT	2694

AL671883.3	701	CCAGTCACCCCTGCAGTTGATAATGGACATGAGTCTTAAACTCCATCAGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2695	CCAGTCACCCCTGCAGTTGATAATGGACATGAGTCTTAAACTCCATCAGT	2744

AL671883.3	751	CAGATGACCACCTGCTGAAGCGGCATTGTTGTCTCAGGTAAATACTCAGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2745	CAGATGACCACCTGCTGAAGCGGCATTGTTGTCTCAGGTAAATACTCAGG	2794

AL671883.3	801	GTTCATTGTATCTTGCCAAGAAGATTAAGGACAGTGACACACAAGGAGTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2795	GTTCATTGTATCTTGCCAAGAAGATTAAGGACAGTGACACACAAGGAGTG	2844

AL671883.3	851	AGTTTATTGGCCGGTGCTATGTTGCCTGCTCTTTACTGAACACATGGCTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2845	AGTTTATTGGCCGGTGCTATGTTGCCTGCTCTTTACTGAACACATGGCTG	2894

AL671883.3	901	GCAAAAAGAAGGGAAGATGGAGCCATCATTGTGAACACGTCTAGTCCTAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2895	GCAAAAAGAAGGGAAGATGGAGCCATCATTGTGAACACGTCTAGTCCTAG	2944

AL671883.3	951	GTGTCCTTTTCCTATTGGCACAGCTGCCAGCATTCACTCGTGCAAGCTTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2945	GTGTCCTTTTCCTATTGGCACAGCTGCCAGCATTCACTCGTGCAAGCTTC	2994

AL671883.3	1001	CAGCTTGCTTGTCTATGTCTGAAGCTTGATTTTACAGGCTGGTCTTTGTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	2995	CAGCTTGCTTGTCTATGTCTGAAGCTTGATTTTACAGGCTGGTCTTTGTC	3044

AL671883.3	1051	AGAAAAGAAAATGATTTGGGGCCTGCTTTCCATTAAAAAGAAAACCTTAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3045	AGAAAAGAAAATGATTTGGGGCCTGCTTTCCATTAAAAAGAAAACCTTAC	3094

AL671883.3	1101	TGAGACTTCTGTACCCTCACTACCTGCCTAAATAATTTCTTCTTAAATCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3095	TGAGACTTCTGTACCCTCACTACCTGCCTAAATAATTTCTTCTTAAATCC	3144

AL671883.3	1151	TATATCACTGCCAGACTCTGAGCTAGTATGAGGTGACACAGAAAGGCTGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3145	TATATCACTGCCAGACTCTGAGCTAGTATGAGGTGACACAGAAAGGCTGG	3194

AL671883.3	1201	GATTGTGCAGAATGCATTTTAGTAAACATGGCTGAGTGTCAGTAGTGATG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3195	GATTGTGCAGAATGCATTTTAGTAAACATGGCTGAGTGTCAGTAGTGATG	3244

AL671883.3	1251	TCCAGTTGCCAGGTGCAGCAGTGACATCTATCCTAGCCTTGGGGTCCAGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3245	TCCAGTTGCCAGGTGCAGCAGTGACATCTATCCTAGCCTTGGGGTCCAGT	3294

AL671883.3	1301	GTCCAGCACCAGGATGTCAGAGGTGTGAGCAGTGGTGTCTGTGCTCAGCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3295	GTCCAGCACCAGGATGTCAGAGGTGTGAGCAGTGGTGTCTGTGCTCAGCA	3344

AL671883.3	1351	GCAGGGGCAGTTGTTCCTAGGAGGGACCTGATCCAGGGGCGTGGGCTATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3345	GCAGGGGCAGTTGTTCCTAGGAGGGACCTGATCCAGGGGCGTGGGCTATG	3394

AL671883.3	1401	GATTCTGTTCCGGGATGTGTAGTTTTCAGCCTGGTTCTGTGGCCTTCCCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3395	GATTCTGTTCCGGGATGTGTAGTTTTCAGCCTGGTTCTGTGGCCTTCCCC	3444

AL671883.3	1451	ACAATAAAATTAACCCCCAATACCAGATATACTACTTTATGTGTAAATTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3445	ACAATAAAATTAACCCCCAATACCAGATATACTACTTTATGTGTAAATTA	3494

AL671883.3	1501	CAGAAATTTGTTTTCCATAGTTTTCTCCAAGAGGTGAGTGAGAAATGAAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3495	CAGAAATTTGTTTTCCATAGTTTTCTCCAAGAGGTGAGTGAGAAATGAAT	3544

AL671883.3	1551	CTATGGACCAGGGTCAGAGAGCAGCATTCGGAGGTGTTCCTTGTGTGACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3545	CTATGGACCAGGGTCAGAGAGCAGCATTCGGAGGTGTTCCTTGTGTGACA	3594

AL671883.3	1601	GCCACATCCTGAATTGTCTACCTGGCCTCTACCTCATGGTGGAGAGATCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3595	GCCACATCCTGAATTGTCTACCTGGCCTCTACCTCATGGTGGAGAGATCA	3644

AL671883.3	1651	ACAGGGAATATCACATCTCTTAACTGATGATATACATCCTCCCTTTCCTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3645	ACAGGGAATATCACATCTCTTAACTGATGATATACATCCTCCCTTTCCTT	3694

AL671883.3	1701	TCTGCAAGAAAAATCCTCTTTTAAACAGGGTTTGAAAACCCACCCCACCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3695	TCTGCAAGAAAAATCCTCTTTTAAACAGGGTTTGAAAACCCACCCCACCC	3744

AL671883.3	1751	CACCCACTCACCCACCCTGGGCACTCTCTGATCTCTGAGGTTCCTGATCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3745	CACCCACTCACCCACCCTGGGCACTCTCTGATCTCTGAGGTTCCTGATCC	3794

AL671883.3	1801	GGCTGAGCAACAAGATTTCTGGTGGAGGCTTAGAAAATACTCAGGCCACT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3795	GGCTGAGCAACAAGATTTCTGGTGGAGGCTTAGAAAATACTCAGGCCACT	3844

AL671883.3	1851	CCTCAGAACCCCTGTCTCACAATATTATGCACAAGACCAAGGAATCATTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3845	CCTCAGAACCCCTGTCTCACAATATTATGCACAAGACCAAGGAATCATTT	3894

AL671883.3	1901	ACATAACAAGCCTTACAGGCGAGGCTGATGCAGACATGTGGGATCCTGGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3895	ACATAACAAGCCTTACAGGCGAGGCTGATGCAGACATGTGGGATCCTGGT	3944

AL671883.3	1951	GTTCTGGCTGCTCCAAGTGTGATCAGGAGACCAGTAACGTGAGCTCCAGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662850.4	3945	GTTCTGGCTGCTCCAAGTGTGATCAGGAGACCAGTAACGTGAGCTCCAGC	3994

Overview

Query
AL671883.3 - 120197 bps
Hit
AL662850.4 - 3994 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link