<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
AL662828.5 1 GAATTCTCTCTCCTCACCTGCAGCATCATCTGTTACCTCACCTTCGGAGA 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 86460 GAATTCTCTCTCCTCACCTGCAGCATCATCTGTTACCTCACCTTCGGAGA 86509 AL662828.5 51 CAAGATCAAGGTGCCTCACAGCCCCTCAGGCCCACCCCCAGCCCCTCCCT 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 86510 CAAGATCAAGGTGCCTCACAGCCCCTCAGGCCCACCCCCAGCCCCTCCCT 86559 AL662828.5 101 GAGCCTCTCCTTGTCCTGAACTGAAAGTACTCCCTCCTTTTCTGGCAGGA 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 86560 GAGCCTCTCCTTGTCCTGAACTGAAAGTACTCCCTCCTTTTCTGGCAGGA 86609 AL662828.5 151 CGACAACTTAATGCCTGCCTATTACAAATGTATCCAGGAGGTGTTAAAAA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 86610 CGACAACTTAATGCCTGCCTATTACAAATGTATCCAGGAGGTGTTAAAAA 86659 AL662828.5 201 CCTGGAGCCACTGGTCCATCCAAATTGTGGACGTGATTCCCTTTCTCAGG 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 86660 CCTGGAGCCACTGGTCCATCCAAATTGTGGACGTGATTCCCTTTCTCAGG 86709 AL662828.5 251 GTGAGGACCTGGAGCCTAGACACCCCTGGGTTGTAGGGGAGAGGCTGGGG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 86710 GTGAGGACCTGGAGCCTAGACACCCCTGGGTTGTAGGGGAGAGGCTGGGG 86759 AL662828.5 301 TGGAGGGAGAGGCTCCTTCCCACAGCTGCATTCTCATGCTTCCTGCCGCA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 86760 TGGAGGGAGAGGCTCCTTCCCACAGCTGCATTCTCATGCTTCCTGCCGCA 86809 AL662828.5 351 GTTCTTCCCCAATCCAGGTCTCCGGAGGCTGAAGCAGGCCATAGAGAAGA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 86810 GTTCTTCCCCAATCCAGGTCTCCGGAGGCTGAAGCAGGCCATAGAGAAGA 86859 AL662828.5 401 GGGATCACATCGTGGAGATGCAGCTGAGGCAGCACAAGGTGGGGACTGTA 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 86860 GGGATCACATCGTGGAGATGCAGCTGAGGCAGCACAAGGTGGGGACTGTA 86909 AL662828.5 451 CGTGGACGGCCTCCCCTCGGCCCACAGCCAGTGATGCTACCGGCCTCAGC 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 86910 CGTGGACGGCCTCCCCTCGGCCCACAGCCAGTGATGCTACCGGCCTCAGC 86959 AL662828.5 501 ATTGCTATGAGGCGGGTTCTTTTGCATACCCCAGTTATGGGCCTGTTGCC 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 86960 ATTGCTATGAGGCGGGTTCTTTTGCATACCCCAGTTATGGGCCTGTTGCC 87009 AL662828.5 551 ACTCTGTACTCCTCTCCCCAGGCCAGCCGCTCAGCCCGCTCCTTTCACCC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87010 ACTCTGTACTCCTCTCCCCAGGCCAGCCGCTCAGCCCGCTCCTTTCACCC 87059 AL662828.5 601 TCTGCAGGAGAGCCTCGTGGCAGGCCAGTGGAGGGACATGATGGACTACA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87060 TCTGCAGGAGAGCCTCGTGGCAGGCCAGTGGAGGGACATGATGGACTACA 87109 AL662828.5 651 TGCTCCAAGGGGTGGCGCAGCCGAGCATGGAAGAGGGCTCTGGACAGCTC 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87110 TGCTCCAAGGGGTGGCGCAGCCGAGCATGGAAGAGGGCTCTGGACAGCTC 87159 AL662828.5 701 CTGGAAGGGCACGTGCACATGGCTGCAGTGGACCTCCTGATCGGTGGCAC 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87160 CTGGAAGGGCACGTGCACATGGCTGCAGTGGACCTCCTGATCGGTGGCAC 87209 AL662828.5 751 TGAGACCACAGCAAACACCCTCTCCTGGGCCGTGGTTTTTTTGCTTCACC 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87210 TGAGACCACAGCAAACACCCTCTCCTGGGCCGTGGTTTTTTTGCTTCACC 87259 AL662828.5 801 ACCCTGAGGTGCGTCCTGGGGACAAGCAAAAGGCTCCTTCCCAGCAACCT 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87260 ACCCTGAGGTGCGTCCTGGGGACAAGCAAAAGGCTCCTTCCCAGCAACCT 87309 AL662828.5 851 GGCCAGGGCGGTGGGCACCCTCACTCAGCTCTGAGCACTGTGCGGCTGGG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87310 GGCCAGGGCGGTGGGCACCCTCACTCAGCTCTGAGCACTGTGCGGCTGGG 87359 AL662828.5 901 GCTGTGCTTGCCTCACCGGCACTCAGGCTCACTGGGTTGCTGAGGGAGCG 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87360 GCTGTGCTTGCCTCACCGGCACTCAGGCTCACTGGGTTGCTGAGGGAGCG 87409 AL662828.5 951 GCTGGAGGCTGGGCAGCTGTGGGCTGCTGGGGCAGGACTCCACCCGATCA 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87410 GCTGGAGGCTGGGCAGCTGTGGGCTGCTGGGGCAGGACTCCACCCGATCA 87459 AL662828.5 1001 TTCCCCAGATTCAGCAGCGACTGCAGGAGGAGCTAGACCACGAACTGGGC 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87460 TTCCCCAGATTCAGCAGCGACTGCAGGAGGAGCTAGACCACGAACTGGGC 87509 AL662828.5 1051 CCTGGTGCCTCCAGCTCCCGGGTCCCCTACAAGGACCGTGCACGGCTGCC 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87510 CCTGGTGCCTCCAGCTCCCGGGTCCCCTACAAGGACCGTGCACGGCTGCC 87559 AL662828.5 1101 CTTGCTCAATGCCACCATCGCCGAGGTGCTGCGCCTGCGGCCCGTTGTGC 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87560 CTTGCTCAATGCCACCATCGCCGAGGTGCTGCGCCTGCGGCCCGTTGTGC 87609 AL662828.5 1151 CCTTAGCCTTGCCCCACCGCACCACACGGCCCAGCAGGTGACTCCCGAGG 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87610 CCTTAGCCTTGCCCCACCGCACCACACGGCCCAGCAGGTGACTCCCGAGG 87659 AL662828.5 1201 GTTGGGGATGAGTGAGGAAAGCCCGAGCCCAGGGAGGTCCTGGCCAGCCT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87660 GTTGGGGATGAGTGAGGAAAGCCCGAGCCCAGGGAGGTCCTGGCCAGCCT 87709 AL662828.5 1251 CTAACTCCAGCCCCCTTCAGCATCTCCGGCTACGACATCCCTGAGGGCAC 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87710 CTAACTCCAGCCCCCTTCAGCATCTCCGGCTACGACATCCCTGAGGGCAC 87759 AL662828.5 1301 AGTCATCATTCCGAACCTCCAAGGCGCCCACCTGGATGAGACGGTCTGGG 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87760 AGTCATCATTCCGAACCTCCAAGGCGCCCACCTGGATGAGACGGTCTGGG 87809 AL662828.5 1351 AGAGGCCACATGAGTTCTGGCCTGGTATGTGGGGGGCCGGGGGCCTGCCG 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87810 AGAGGCCACATGAGTTCTGGCCTGGTATGTGGGGGGCCGGGGGCCTGCCG 87859 AL662828.5 1401 TGAAAATGTGGTGGAGGCTGGTCCCCGCTGCCGCTGAACGCCTCCCCACC 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87860 TGAAAATGTGGTGGAGGCTGGTCCCCGCTGCCGCTGAACGCCTCCCCACC 87909 AL662828.5 1451 CACCTGTCCACCCGCCCGCAGATCGCTTCCTGGAGCCAGGCAAGAACTCC 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87910 CACCTGTCCACCCGCCCGCAGATCGCTTCCTGGAGCCAGGCAAGAACTCC 87959 AL662828.5 1501 AGAGCTCTGGCCTTCGGCTGCGGTGCCCGCGTGTGCCTGGGCGAGCCGCT 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 87960 AGAGCTCTGGCCTTCGGCTGCGGTGCCCGCGTGTGCCTGGGCGAGCCGCT 88009 AL662828.5 1551 GGCGCGCCTGGAGCTCTTCGTGGTGCTGACCCGACTGCTGCAGGCCTTCA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 88010 GGCGCGCCTGGAGCTCTTCGTGGTGCTGACCCGACTGCTGCAGGCCTTCA 88059 AL662828.5 1601 CGCTGCTGCCCTCCGGGGACGCCCTGCCCTCCCTGCAGCCCCTGCCCCAC 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 88060 CGCTGCTGCCCTCCGGGGACGCCCTGCCCTCCCTGCAGCCCCTGCCCCAC 88109 AL662828.5 1651 TGCAGTGTCATCCTCAAGATGCAGCCTTTCCAAGTGCGGCTGCAGCCCCG 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 88110 TGCAGTGTCATCCTCAAGATGCAGCCTTTCCAAGTGCGGCTGCAGCCCCG 88159 AL662828.5 1701 GGGGATGGGGGCCCACAGCCCGGGCCAGAGCCAGTGATGGGGCAGGACCG 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 88160 GGGGATGGGGGCCCACAGCCCGGGCCAGAGCCAGTGATGGGGCAGGACCG 88209 AL662828.5 1751 ATGCCAGCCGGGTACCTCAGTTTCTCCTTTATTGCTCCTGTACGAACCCC 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 88210 ATGCCAGCCGGGTACCTCAGTTTCTCCTTTATTGCTCCTGTACGAACCCC 88259 AL662828.5 1801 TCCCCTCCCCCCTGTAAACACAGTGCTGCGAGATCGCTGGCAGAGAAGGC 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 88260 TCCCCTCCCCCCTGTAAACACAGTGCTGCGAGATCGCTGGCAGAGAAGGC 88309 AL662828.5 1851 TTCCTCCAGCGGCTGGGTGGTGAAGGACCCTGGCTCTTCTCTCGGGGCGA 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 88310 TTCCTCCAGCGGCTGGGTGGTGAAGGACCCTGGCTCTTCTCTCGGGGCGA 88359 AL662828.5 1901 CCCCTCAGTGCTCGGCAGTCATACTGGGGTGCGAGAGAGGTGGGCAGCAG 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 88360 CCCCTCAGTGCTCGGCAGTCATACTGGGGTGCGAGAGAGGTGGGCAGCAG 88409 AL662828.5 1951 CTCAGCCTCCCCCCGCTGGGGAGCGAAAGTTTCTTGGTCTCAGCTTCATT 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662849.8 88410 CTCAGCCTCCCCCCGCTGGGGAGCGAAAGTTTCTTGGTCTCAGCTTCATT 88459