<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662854.7	1	GGCGGCCCCATCATCCCTTCTCTGTCAGCCACAGGTGCAGTAAGGAGCCG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	183618	GGCGGCCCCATCATCCCTTCTCTGTCAGCCACAGGTGCAGTAAGGAGCCG	183667

AL662854.7	51	ACAAAATGGCACCCTCCGAGAGAGTTCATTTGCATAATAAGCTTAGGGTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	183668	ACAAAATGGCACCCTCCGAGAGAGTTCATTTGCATAATAAGCTTAGGGTG	183717

AL662854.7	101	GGGCGGCCAGCCTTCCCAGCTATGTAAACAAACACCTGATCAAACCAATC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	183718	GGGCGGCCAGCCTTCCCAGCTATGTAAACAAACACCTGATCAAACCAATC	183767

AL662854.7	151	TGTGAGTCCTAAGTAAATCAGACGCCGCCTCCTCAAGCTGGACTATAAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	183768	TGTGAGTCCTAAGTAAATCAGACGCCGCCTCCTCAAGCTGGACTATAAAT	183817

AL662854.7	201	TCGGCTCATCTGCCTCCAGCTGCCCCTTTTCTCTCGGAAGTCCCCTCTCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	183818	TCGGCTCATCTGCCTCCAGCTGCCCCTTTTCTCTCGGAAGTCCCCTCTCT	183867

AL662854.7	251	CACTAGAGAGAGAGCTGTTTTCCTTTCTCTTTCTTTTGCCTATTAAACCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	183868	CACTAGAGAGAGAGCTGTTTTCCTTTCTCTTTCTTTTGCCTATTAAACCT	183917

AL662854.7	301	TCCCTCTTAAACTCCTCGCGACTCCTCGCGTGTGTCCGTGTCCTACATTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	183918	TCCCTCTTAAACTCCTCGCGACTCCTCGCGTGTGTCCGTGTCCTACATTT	183967

AL662854.7	351	TCCTGGCATGGGATGGCAAACCCCGGGTATTTACCCCAGACAACTGGCTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	183968	TCCTGGCATGGGATGGCAAACCCCGGGTATTTACCCCAGACAACTGGCTG	184017

AL662854.7	401	CTTCACTTGCACTGGATCTTGAGGGTCGGGGAGATTTTTGACCTTTAACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184018	CTTCACTTGCACTGGATCTTGAGGGTCGGGGAGATTTTTGACCTTTAACA	184067

AL662854.7	451	GGGACTCCATCATTGCAAGTTTTCCTTGGAGACTCTTGATGGCCCAGGTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184068	GGGACTCCATCATTGCAAGTTTTCCTTGGAGACTCTTGATGGCCCAGGTT	184117

AL662854.7	501	TAGTTTATACCTACTGTGAGAGCAAGAACTTGAGTAATGTATGGATGGAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184118	TAGTTTATACCTACTGTGAGAGCAAGAACTTGAGTAATGTATGGATGGAC	184167

AL662854.7	551	CTTTTTGGAAGGAAAACAATTTTCATGGACTTAAATTATTTTTATAATTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184168	CTTTTTGGAAGGAAAACAATTTTCATGGACTTAAATTATTTTTATAATTT	184217

AL662854.7	601	AAATGTGTGGAAACACAACTAACTATGAATTCCTTATGCTTCAGTAGTTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184218	AAATGTGTGGAAACACAACTAACTATGAATTCCTTATGCTTCAGTAGTTA	184267

AL662854.7	651	AGCAGTTATAAAACCAAAGCAAAGTAGCCATAGGTACAAACAAAAGTATA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184268	AGCAGTTATAAAACCAAAGCAAAGTAGCCATAGGTACAAACAAAAGTATA	184317

AL662854.7	701	AAGACAAGTTTAACATTAATGTAATAAATAGTGTTTTTCTGAAATGAAGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184318	AAGACAAGTTTAACATTAATGTAATAAATAGTGTTTTTCTGAAATGAAGT	184367

AL662854.7	751	TGCTGCTGGCAACAGACCATGTACTGCCTGATGAAGGTTCTTCCGCACTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184368	TGCTGCTGGCAACAGACCATGTACTGCCTGATGAAGGTTCTTCCGCACTT	184417

AL662854.7	801	GGCACAATATTCCACTGTGTGCCTGGCGATGACTCAATTCTTCCCCTTCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184418	GGCACAATATTCCACTGTGTGCCTGGCGATGACTCAATTCTTCCCCTTCT	184467

AL662854.7	851	CATGTCTGTTCAAATTACTAAGAAATCTTTGTTAGAACTTGTCTCCTGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184468	CATGTCTGTTCAAATTACTAAGAAATCTTTGTTAGAACTTGTCTCCTGGC	184517

AL662854.7	901	CTTCACTTGGTACAAATGCGACCAAGACAATTAAAGCTATAAATAGGTAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184518	CTTCACTTGGTACAAATGCGACCAAGACAATTAAAGCTATAAATAGGTAA	184567

AL662854.7	951	ATGCAAATGCAGGTACTCACAAGCAGGGCCAGGATCAGTTACAAATGACC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184568	ATGCAAATGCAGGTACTCACAAGCAGGGCCAGGATCAGTTACAAATGACC	184617

AL662854.7	1001	CAAAACATGCTTATAACACTTTTCAAATGCTACTAAGGAAAGTTAGACAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184618	CAAAACATGCTTATAACACTTTTCAAATGCTACTAAGGAAAGTTAGACAT	184667

AL662854.7	1051	GGAACTTAATAGTTTTCACAGGTATTCACGAGTCCTCAGGAGTCCAGAGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184668	GGAACTTAATAGTTTTCACAGGTATTCACGAGTCCTCAGGAGTCCAGAGA	184717

AL662854.7	1101	CCTCAGTTTGAGAACACTATCCTAGCACTGACCTTGACTTCCAGGGTGAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184718	CCTCAGTTTGAGAACACTATCCTAGCACTGACCTTGACTTCCAGGGTGAC	184767

AL662854.7	1151	CTTGAGGTAAGCATTTACCATTTTTGGATCTCTGTACATTTTTTGTACAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184768	CTTGAGGTAAGCATTTACCATTTTTGGATCTCTGTACATTTTTTGTACAC	184817

AL662854.7	1201	AAGAATAATTTGGGCCACCAGTGTTCTTGGGAGATAAAAGAAGTTAGAGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184818	AAGAATAATTTGGGCCACCAGTGTTCTTGGGAGATAAAAGAAGTTAGAGG	184867

AL662854.7	1251	AGTTAATGACAATGTTCCAAGATGTTCAAGGACTAGAGAGAAAGGATAAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184868	AGTTAATGACAATGTTCCAAGATGTTCAAGGACTAGAGAGAAAGGATAAG	184917

AL662854.7	1301	AATGTATTATAGACCTCTAGAGTTGGAAAAAGAATGGTGGCTGAGATCCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184918	AATGTATTATAGACCTCTAGAGTTGGAAAAAGAATGGTGGCTGAGATCCT	184967

AL662854.7	1351	CCAGCCTAGCTTTGGCTCTGTAATCAAAAAGACTCAGATTTGGGCCAAGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	184968	CCAGCCTAGCTTTGGCTCTGTAATCAAAAAGACTCAGATTTGGGCCAAGC	185017

AL662854.7	1401	ATTGTGGCACACGCCTGTAATCTCATTACACTGGGAGGCTGTGGCAGAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	185018	ATTGTGGCACACGCCTGTAATCTCATTACACTGGGAGGCTGTGGCAGAAG	185067

AL662854.7	1451	GATCGCTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACTAGCCTACGTAACATGGTGAGAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	185068	GATCGCTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACTAGCCTACGTAACATGGTGAGAC	185117

AL662854.7	1501	CCTATCTCTACCAATCTCTACATACAAACAAAAAATGGCTGGGCGTGGTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	185118	CCTATCTCTACCAATCTCTACATACAAACAAAAAATGGCTGGGCGTGGTG	185167

AL662854.7	1551	GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	185168	GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCAC	185217

AL662854.7	1601	GAGGTCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCTGTCTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	185218	GAGGTCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCTGTCTC	185267

AL662854.7	1651	TACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACGTATAATCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	185268	TACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACGTATAATCC	185317

AL662854.7	1701	CAGCTACTCTCAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGCAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	185318	CAGCTACTCTCAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGCAG	185367

AL662854.7	1751	AGGTTGCAGTGAGCCGAGAGCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	185368	AGGTTGCAGTGAGCCGAGAGCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG	185417

AL662854.7	1801	GGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAATAAAAATAAAAAATAACAGGACATGAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	185418	GGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAATAAAAATAAAAAATAACAGGACATGAT	185467

AL662854.7	1851	GGTGCCTGAGCCCCAGCTATTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATGGCTTGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	185468	GGTGCCTGAGCCCCAGCTATTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATGGCTTGA	185517

AL662854.7	1901	GAGGTTGCATTGAGTTATAATTGTACCCCTGCACTCCAGCCTGGGTGACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	185518	GAGGTTGCATTGAGTTATAATTGTACCCCTGCACTCCAGCCTGGGTGACA	185567

AL662854.7	1951	GAGAGCTTGTCTCTATAAAACAAATAAACAAACAACTGAGATCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662848.6	185568	GAGAGCTTGTCTCTATAAAACAAATAAACAAACAACTGAGATCTGAATTC	185617

Overview

Query
AL662854.7 - 84474 bps
Hit
AL662848.6 - 185617 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link