<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662850.4	1	CAAAATAAACTTCTAAACTGATTGATACCTGTCTCAGATGTTTTTTGGTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	202299	CAAAATAAACTTCTAAACTGATTGATACCTGTCTCAGATGTTTTTTGGTT	202348

AL662850.4	51	TACATGGCTATAGGAACTTCCTGAGTTCTTTGAGTTAGTTTAAGAATTCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	202349	TACATGGCTATAGGAACTTCCTGAGTTCTTTGAGTTAGTTTAAGAATTCC	202398

AL662850.4	101	CAAACCTTGGGAGGTGAGAAACCCCTGACTTTGCAGCCATGATAGACAGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	202399	CAAACCTTGGGAGGTGAGAAACCCCTGACTTTGCAGCCATGATAGACAGA	202448

AL662850.4	151	AGTGCAGGTAACCTGGAACCCAATAACTTGTGACTTGCATCTGAAGTGAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	202449	AGTGCAGGTAACCTGGAACCCAATAACTTGTGACTTGCATCTGAAGTGAG	202498

AL662850.4	201	GACAGACTTGTGGGACTGAGTCCTTAAACCTGTGGAGTCTGAGGCTAACT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	202499	GACAGACTTGTGGGACTGAGTCCTTAAACCTGTGGAGTCTGAGGCTAACT	202548

AL662850.4	251	CCAGGTAGTTAGTGTCAGAATTGAGTCAAATTCTAGGACTCCCAGTTGCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	202549	CCAGGTAGTTAGTGTCAGAATTGAGTCAAATTCTAGGACTCCCAGTTGCT	202598

AL662850.4	301	GTTGGAGAATCAGAAAATTATTTGGCTGGAGGAAAACCCCATCACCATCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	202599	GTTGGAGAATCAGAAAATTATTTGGCTGGAGGAAAACCCCATCACCATCC	202648

AL662850.4	351	CACAGAGAGAAACTTACAGTATATTGGGGGAACCCACCCCCAATATTTCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	202649	CACAGAGAGAAACTTACAGTATATTGGGGGAACCCACCCCCAATATTTCA	202698

AL662850.4	401	ACGTAGGTTCTTTCTATTTTCCATAAGTGTCAGCCAGCTGAGAAATAAAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	202699	ACGTAGGTTCTTTCTATTTTCCATAAGTGTCAGCCAGCTGAGAAATAAAG	202748

AL662850.4	451	AAAGACAGTACAAAGAGAGGAATTTTACAGTTGGGCCACCAGGGGTGACA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	202749	AAAGACAGTACAAAGAGAGGAATTTTACAGTTGGGCCACCAGGGGTGACA	202798

AL662850.4	501	TCACATATCAGTAGGACTGTGATGTCCGCTTGAGTCTCAGACAAACAAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	202799	TCACATATCAGTAGGACTGTGATGTCCGCTTGAGTCTCAGACAAACAAGT	202848

AL662850.4	551	TTTTGTTAAGGGTTTCAAAAGGGGAGGGGGTGTAAGAACAAGGAGTAGGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	202849	TTTTGTTAAGGGTTTCAAAAGGGGAGGGGGTGTAAGAACAAGGAGTAGGT	202898

AL662850.4	601	AAAAAATCACACGCTTCTGAGTGCAAAAAGCAGAACTACTAATAGGGGTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	202899	AAAAAATCACACGCTTCTGAGTGCAAAAAGCAGAACTACTAATAGGGGTC	202948

AL662850.4	651	TAACAAAGATCACATGCTTCTGAGGGAACAAGACAAAGGGCAAAAGCAGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	202949	TAACAAAGATCACATGCTTCTGAGGGAACAAGACAAAGGGCAAAAGCAGA	202998

AL662850.4	701	ACCACTGATAAGGGTCTATGTTTAGCAGTGCACGTATTGTCTTGGTAAAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	202999	ACCACTGATAAGGGTCTATGTTTAGCAGTGCACGTATTGTCTTGGTAAAC	203048

AL662850.4	751	ATCTTAAACAACAGAAAACAGGGTTTGAGAGCAGAGAAGTGGTCTGACCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203049	ATCTTAAACAACAGAAAACAGGGTTTGAGAGCAGAGAAGTGGTCTGACCA	203098

AL662850.4	801	CAAGTTTACCAGGGCAGAGTTTTTCCCCACCCTAGTAAGCCTGAGGGTTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203099	CAAGTTTACCAGGGCAGAGTTTTTCCCCACCCTAGTAAGCCTGAGGGTTC	203148

AL662850.4	851	TGCAAGAGACCAGGGCATATCTCAGTCCTTATCTCAACTGCATAAGACAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203149	TGCAAGAGACCAGGGCATATCTCAGTCCTTATCTCAACTGCATAAGACAG	203198

AL662850.4	901	ACATTCCCAGAGCAGCCGTTTATAGACCTCCCCCAGGAATGAATTCTTTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203199	ACATTCCCAGAGCAGCCGTTTATAGACCTCCCCCAGGAATGAATTCTTTC	203248

AL662850.4	951	CCCAGTGTATTAATATTAATATTCCTTGCTAGGAAAAAAATTTAGTGATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203249	CCCAGTGTATTAATATTAATATTCCTTGCTAGGAAAAAAATTTAGTGATA	203298

AL662850.4	1001	TCTCTCCTACTTGCACGTCTGTTTATAGGCTCTGGGCAAGAAGAAAAAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203299	TCTCTCCTACTTGCACGTCTGTTTATAGGCTCTGGGCAAGAAGAAAAAAT	203348

AL662850.4	1051	ATGGCTCTTTTTGCCCAACCTCGCAGGCAGTCAGACCTTATGGTTGTCTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203349	ATGGCTCTTTTTGCCCAACCTCGCAGGCAGTCAGACCTTATGGTTGTCTT	203398

AL662850.4	1101	TCCTTGTTCCATAAAAATTGCTGTTATTCTCTTCTTTTTCAAGGTGCACT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203399	TCCTTGTTCCATAAAAATTGCTGTTATTCTCTTCTTTTTCAAGGTGCACT	203448

AL662850.4	1151	GATTTCATATTGTTCAAACACACGTTTTACAATCAAATTGTAACACAATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203449	GATTTCATATTGTTCAAACACACGTTTTACAATCAAATTGTAACACAATT	203498

AL662850.4	1201	ATCACAGTGGTCCTAAGGTGATGTACATCCTCAGCTTATGAAGATAACAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203499	ATCACAGTGGTCCTAAGGTGATGTACATCCTCAGCTTATGAAGATAACAG	203548

AL662850.4	1251	GATTAAGAGATTAAAGTAAAGACAGGCATAAGAAATTATAAAAGTATTAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203549	GATTAAGAGATTAAAGTAAAGACAGGCATAAGAAATTATAAAAGTATTAT	203598

AL662850.4	1301	TTGGGAACTGTTAAATGTCCATATTAAAATGAAATCTTCACAATTTATGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203599	TTGGGAACTGTTAAATGTCCATATTAAAATGAAATCTTCACAATTTATGT	203648

AL662850.4	1351	TCCTCTGCCGCAGCTCCAGCCAGTCCCTCCGTTCAGGGTCCTTGACTTCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203649	TCCTCTGCCGCAGCTCCAGCCAGTCCCTCCGTTCAGGGTCCTTGACTTCC	203698

AL662850.4	1401	CGCAACAACAGTAAGAGTAAGCAAGTAAACCTCTACCTTCTTCGGTCCCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203699	CGCAACAACAGTAAGAGTAAGCAAGTAAACCTCTACCTTCTTCGGTCCCA	203748

AL662850.4	1451	GAGGAAAAGATAAAAAAAAATTAAGCATTTATTTCATGTCCCTAAGTCTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203749	GAGGAAAAGATAAAAAAAAATTAAGCATTTATTTCATGTCCCTAAGTCTG	203798

AL662850.4	1501	CTAAACACAGGTTTCTACCAGCTATTCATTGTCCAGACATGGAGTGGCCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203799	CTAAACACAGGTTTCTACCAGCTATTCATTGTCCAGACATGGAGTGGCCC	203848

AL662850.4	1551	TACCTCTAACCTAGAAGTTAGGATTTTTTAGGCCTTTGAGGGGGTCACAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203849	TACCTCTAACCTAGAAGTTAGGATTTTTTAGGCCTTTGAGGGGGTCACAT	203898

AL662850.4	1601	AAAAACTAATAAGTGTCAGAGATTCTCTCCCCAGAAATATTTCCACACAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203899	AAAAACTAATAAGTGTCAGAGATTCTCTCCCCAGAAATATTTCCACACAC	203948

AL662850.4	1651	AAGAAAATATAAATATTAATATAAAACATCAGTGTGCAACCAGATCCTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203949	AAGAAAATATAAATATTAATATAAAACATCAGTGTGCAACCAGATCCTCT	203998

AL662850.4	1701	GAGATCTTACAAACCTGGGTGTTTTAATCCTAGTAAGAGACAATGCCAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	203999	GAGATCTTACAAACCTGGGTGTTTTAATCCTAGTAAGAGACAATGCCAAG	204048

AL662850.4	1751	CACACAATGCCACTCCAATAATCTGGAGTATGAACTGGGATAGACAAAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	204049	CACACAATGCCACTCCAATAATCTGGAGTATGAACTGGGATAGACAAAAA	204098

AL662850.4	1801	CTTGATGTAATAACTTATTTTCAATGGAATGGGTGGAAAGATGTTATTTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	204099	CTTGATGTAATAACTTATTTTCAATGGAATGGGTGGAAAGATGTTATTTA	204148

AL662850.4	1851	TTAGTCACTGGTTCATTCAGACACTCTGAATCCCTACCAGATACAAGATA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	204149	TTAGTCACTGGTTCATTCAGACACTCTGAATCCCTACCAGATACAAGATA	204198

AL662850.4	1901	AATTTCTTGTCTTGGAGCACTGCTCCAATAATTAAAATTTATCATTCTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	204199	AATTTCTTGTCTTGGAGCACTGCTCCAATAATTAAAATTTATCATTCTTT	204248

AL662850.4	1951	TCCCACCCTTCACACTCCAGCACTTCAACCCTCTTACTACATCAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662844.12	204249	TCCCACCCTTCACACTCCAGCACTTCAACCCTCTTACTACATCAGAATTC	204298

Overview

Query
AL662850.4 - 3994 bps
Hit
AL662844.12 - 204298 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link