<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL928759.1	1	TCAAGACACCTGCTGTTTCTATCTTGCACAGGAGAGCTTTCCAGCACCTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	128820	TCAAGACACCTGCTGTTTCTATCTTGCACAGGAGAGCTTTCCAGCACCTG	128869

AL928759.1	51	TGATAAGCCTCAGCCCCCCTGCTGGATAATGAGTCCACATGAATGGAGAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	128870	TGATAAGCCTCAGCCCCCCTGCTGGATAATGAGTCCACATGAATGGAGAC	128919

AL928759.1	101	AGGCCCCCTATATCTGCCAAACCTATTGATGCTACAGAGATGTGAGGGGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	128920	AGGCCCCCTATATCTGCCAAACCTATTGATGCTACAGAGATGTGAGGGGG	128969

AL928759.1	151	CCCACCTGAGAAAAGCTGAACCTGCCCAGTACATAAAGACCACTCAGGTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	128970	CCCACCTGAGAAAAGCTGAACCTGCCCAGTACATAAAGACCACTCAGGTG	129019

AL928759.1	201	GGTTAAGCACAATTTGCTGTCTTACAGAATCATAAGGAGATACTAAACCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129020	GGTTAAGCACAATTTGCTGTCTTACAGAATCATAAGGAGATACTAAACCA	129069

AL928759.1	251	TTATTTGAAGTCATTAAATTTTGGAATACTTTGTTACATAGAAAATCTGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129070	TTATTTGAAGTCATTAAATTTTGGAATACTTTGTTACATAGAAAATCTGA	129119

AL928759.1	301	CAGATAAAACAGCCTTCAAAAAAATTGTGTTTTTCAGCAATGTCTTAGTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129120	CAGATAAAACAGCCTTCAAAAAAATTGTGTTTTTCAGCAATGTCTTAGTG	129169

AL928759.1	351	CTTCTGTGGCTCACAGGCTCCCACATGCCTGGAGTGCTACGGGGAGAAGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129170	CTTCTGTGGCTCACAGGCTCCCACATGCCTGGAGTGCTACGGGGAGAAGG	129219

AL928759.1	401	TTAAATGAATGAGGAAAAATTGACAGGCTTTCCCAGCCCAAAGCATGATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129220	TTAAATGAATGAGGAAAAATTGACAGGCTTTCCCAGCCCAAAGCATGATG	129269

AL928759.1	451	TTATTATCATTATCATTATTAATATTTGTCTTTATGTAGCAGCTACCACT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129270	TTATTATCATTATCATTATTAATATTTGTCTTTATGTAGCAGCTACCACT	129319

AL928759.1	501	TGGGAATAGATGCTGTATGTCAGACACCAGATTGTATTTAACTTTATAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129320	TGGGAATAGATGCTGTATGTCAGACACCAGATTGTATTTAACTTTATAAT	129369

AL928759.1	551	TGCACTTATCTATCATTTCATTTTACCATATTAACTATCACCTAATAATT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129370	TGCACTTATCTATCATTTCATTTTACCATATTAACTATCACCTAATAATT	129419

AL928759.1	601	TTCCTTCTGTTTTATAGAAAATAACCTTAAGACTCAGGTATTTTGAGTGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129420	TTCCTTCTGTTTTATAGAAAATAACCTTAAGACTCAGGTATTTTGAGTGA	129469

AL928759.1	651	CTTGCTCAAGGTGCTGCAGCTGATAAAATCAAAAGCAGCATGGAATACAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129470	CTTGCTCAAGGTGCTGCAGCTGATAAAATCAAAAGCAGCATGGAATACAT	129519

AL928759.1	701	ATTTATCTTATTACAAAACCTATATTCTTTTCACTGTGCTACTCTAGACT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129520	ATTTATCTTATTACAAAACCTATATTCTTTTCACTGTGCTACTCTAGACT	129569

AL928759.1	751	CTGTTATTGTTGTGAAGCACCTTTAACCACTGCAAGACAGAAGTCTTGGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129570	CTGTTATTGTTGTGAAGCACCTTTAACCACTGCAAGACAGAAGTCTTGGC	129619

AL928759.1	801	CTTCAGAGTAAAACTTTACCAGTGCATAAAGTCAGACTAAAATAATTTGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129620	CTTCAGAGTAAAACTTTACCAGTGCATAAAGTCAGACTAAAATAATTTGA	129669

AL928759.1	851	AAATATACAGAGTCTTAGAGAACGTTATAACTGTTTATTAGAACTAACAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129670	AAATATACAGAGTCTTAGAGAACGTTATAACTGTTTATTAGAACTAACAT	129719

AL928759.1	901	AAATTCTACCTAATTTCTTAGAGGGCTCTTAATGATGTGAATTATAATGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129720	AAATTCTACCTAATTTCTTAGAGGGCTCTTAATGATGTGAATTATAATGG	129769

AL928759.1	951	CACATCCCATTGCTATTTTAGTTATGGAATCAATGGCATGTCAATAAGTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129770	CACATCCCATTGCTATTTTAGTTATGGAATCAATGGCATGTCAATAAGTG	129819

AL928759.1	1001	CTTTCTGAGAAAATTGTTGGACAAAGTACTATTTTGAACTCCAAATTTTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129820	CTTTCTGAGAAAATTGTTGGACAAAGTACTATTTTGAACTCCAAATTTTA	129869

AL928759.1	1051	TTCCCACTATTAATTTATGAAGAGAACCTTTTCTCTTTCTACTAGACAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129870	TTCCCACTATTAATTTATGAAGAGAACCTTTTCTCTTTCTACTAGACAAA	129919

AL928759.1	1101	GGTAACAAATTAGCTTTTGTTAAAATGGCATACTGTTCTTCTGAGTTTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129920	GGTAACAAATTAGCTTTTGTTAAAATGGCATACTGTTCTTCTGAGTTTCA	129969

AL928759.1	1151	TTTACTTATTACTTTACCTTACATTAAAATTATGACCTGAAGACAGAAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	129970	TTTACTTATTACTTTACCTTACATTAAAATTATGACCTGAAGACAGAAGG	130019

AL928759.1	1201	AACTGGAACAATGTTCACTGTGTTATGGCCGGATGAAGCAGGAAGAGGAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130020	AACTGGAACAATGTTCACTGTGTTATGGCCGGATGAAGCAGGAAGAGGAG	130069

AL928759.1	1251	AAGAGACAAAACTAGGTTAAAGGTAGAAATGTCATCTGTTGGGCCAGGCG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130070	AAGAGACAAAACTAGGTTAAAGGTAGAAATGTCATCTGTTGGGCCAGGCG	130119

AL928759.1	1301	TGGCCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130120	TGGCCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGAT	130169

AL928759.1	1351	CATGTGGTCAGGAGGTCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130170	CATGTGGTCAGGAGGTCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGT	130219

AL928759.1	1401	CTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCTTGTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130220	CTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCTTGTA	130269

AL928759.1	1451	GTCCCAGCTACTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCCCTCCAGCCTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130270	GTCCCAGCTACTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCCCTCCAGCCTG	130319

AL928759.1	1501	GGCGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130320	GGCGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAA	130369

AL928759.1	1551	GTGCATCTATAATCTCTTCAATGACTTTGCCTTGGACTTTCCCTTCACCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130370	GTGCATCTATAATCTCTTCAATGACTTTGCCTTGGACTTTCCCTTCACCC	130419

AL928759.1	1601	CACAGGATGTGAGATCTGAAACTGCACCCTCAACTTCCCATCCAAGATGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130420	CACAGGATGTGAGATCTGAAACTGCACCCTCAACTTCCCATCCAAGATGC	130469

AL928759.1	1651	AATTCTAATCCTACATTTAACACCCTAACTTCTTAACTGGAGTTGAGTTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130470	AATTCTAATCCTACATTTAACACCCTAACTTCTTAACTGGAGTTGAGTTA	130519

AL928759.1	1701	TTTAAACTGTAATTTTAATAGGTGAAATTCTGGACTACCATCCCAAAACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130520	TTTAAACTGTAATTTTAATAGGTGAAATTCTGGACTACCATCCCAAAACA	130569

AL928759.1	1751	TTTTGTTCATTTGCCAAAGTCCTAAGGAATTTCCATTAGATACAAAGCAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130570	TTTTGTTCATTTGCCAAAGTCCTAAGGAATTTCCATTAGATACAAAGCAG	130619

AL928759.1	1801	GTAAGTCTGGATACAGGAAAAAAAATAAAAACATGTTATTTGCTACACAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130620	GTAAGTCTGGATACAGGAAAAAAAATAAAAACATGTTATTTGCTACACAG	130669

AL928759.1	1851	CAAAAAGGATATTGAGTGGTAAAGGGAGCACATCTCAAATGGGACCTCAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130670	CAAAAAGGATATTGAGTGGTAAAGGGAGCACATCTCAAATGGGACCTCAA	130719

AL928759.1	1901	AAACCCTCTTCATTCACAATGGCAGGAGCTAGAAAGAATAAAGCCACCTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130720	AAACCCTCTTCATTCACAATGGCAGGAGCTAGAAAGAATAAAGCCACCTA	130769

AL928759.1	1951	TAGGGTCAAATATCTCTCCTAATCATGTTAAGGCACTGGATTCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662842.3	130770	TAGGGTCAAATATCTCTCCTAATCATGTTAAGGCACTGGATTCTGAATTC	130819

Overview

Query
AL928759.1 - 5908 bps
Hit
AL662842.3 - 130819 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link