<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL845557.1	1	GACAGACTTAAAAATACATAAAAACAAGGTTAACAGAAATAGAGACTAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	101328	GACAGACTTAAAAATACATAAAAACAAGGTTAACAGAAATAGAGACTAGA	101377

AL845557.1	51	ATGAGAAGATCCAAAATACATTTGAATTCCAGAAAGAGAATATAGAAAGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	101378	ATGAGAAGATCCAAAATACATTTGAATTCCAGAAAGAGAATATAGAAAGC	101427

AL845557.1	101	ATGGAGGAAAAGCAAAGTTCAAAGAAAGAATGCTTAAGAATTTTTCAAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	101428	ATGGAGGAAAAGCAAAGTTCAAAGAAAGAATGCTTAAGAATTTTTCAAAA	101477

AL845557.1	151	TTGATGAAAGACATTACTGTAAAGTTTTAAGATGCACCCTCCTAAAGCAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	101478	TTGATGAAAGACATTACTGTAAAGTTTTAAGATGCACCCTCCTAAAGCAG	101527

AL845557.1	201	GAATAATGAAAATGGACTGGACACATAGTAGTGAAACTGTGTAACACCAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	101528	GAATAATGAAAATGGACTGGACACATAGTAGTGAAACTGTGTAACACCAA	101577

AL845557.1	251	GACAAAGACAAAATTCTAAATATTACCAGACAGAAAAAGACAAAATAACC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	101578	GACAAAGACAAAATTCTAAATATTACCAGACAGAAAAAGACAAAATAACC	101627

AL845557.1	301	TGCAAACTAACTAGGTATTAAGCAGACTTCTTAAGAGCAAAAACAAAGGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	101628	TGCAAACTAACTAGGTATTAAGCAGACTTCTTAAGAGCAAAAACAAAGGC	101677

AL845557.1	351	CAAAAGGCAATGGATAACATCTTCAATTAGCTGAGAAAATACATTGAGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	101678	CAAAAGGCAATGGATAACATCTTCAATTAGCTGAGAAAATACATTGAGTT	101727

AL845557.1	401	CCTTATTCAGCAAAACTGTTATTTTATAATGAAGGCGAAGTTAATTTTTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	101728	CCTTATTCAGCAAAACTGTTATTTTATAATGAAGGCGAAGTTAATTTTTC	101777

AL845557.1	451	TGGCAAAAGTCCAAGAATTTATTATTCACAGATCCTCATTTAAAAATGAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	101778	TGGCAAAAGTCCAAGAATTTATTATTCACAGATCCTCATTTAAAAATGAA	101827

AL845557.1	501	ACCACAGGCGGGGTGCGATGGCTCACACTGGTAATCTCAACACTTTGGGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	101828	ACCACAGGCGGGGTGCGATGGCTCACACTGGTAATCTCAACACTTTGGGA	101877

AL845557.1	551	GGCCAAGGCAGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	101878	GGCCAAGGCAGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGC	101927

AL845557.1	601	CAACATGGTGAAACCCTGTTTCTATTAAAAATAGAAAAATTAGCTGGGTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	101928	CAACATGGTGAAACCCTGTTTCTATTAAAAATAGAAAAATTAGCTGGGTA	101977

AL845557.1	651	TGGTGGCACATATCTGTAGTCCCAGATACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	101978	TGGTGGCACATATCTGTAGTCCCAGATACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGA	102027

AL845557.1	701	ATCGCTTGAACTCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACTAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102028	ATCGCTTGAACTCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACTAC	102077

AL845557.1	751	TGCGCTCTATCTTGGGTGACAGAATGAGAGAGCCTGTCTCACACAAAAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102078	TGCGCTCTATCTTGGGTGACAGAATGAGAGAGCCTGTCTCACACAAAAAA	102127

AL845557.1	801	ACTAAAAACCAAAAAACAAAAAAATCAAACCACAAAGCAAGGATTAAGAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102128	ACTAAAAACCAAAAAACAAAAAAATCAAACCACAAAGCAAGGATTAAGAT	102177

AL845557.1	851	ACAAAGAGAAATAGTGAGCAATATTGGTAAATATATGAATATATCTGAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102178	ACAAAGAGAAATAGTGAGCAATATTGGTAAATATATGAATATATCTGAAA	102227

AL845557.1	901	AACACAGACTATAAAAATAATTTTATCATGACTAATTTTGGGGTGCATAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102228	AACACAGACTATAAAAATAATTTTATCATGACTAATTTTGGGGTGCATAA	102277

AL845557.1	951	ATGTAGCAGAATGAAAATATCAGACAACAATAGCAAAGACAGTGGAATAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102278	ATGTAGCAGAATGAAAATATCAGACAACAATAGCAAAGACAGTGGAATAG	102327

AL845557.1	1001	TACTGTAAAATTATGCAATATGGAAAGCACTTGGTAAGGTGTCATAAACA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102328	TACTGTAAAATTATGCAATATGGAAAGCACTTGGTAAGGTGTCATAAACA	102377

AL845557.1	1051	AAACTGAGTAAATCAGTAATCATCATAAATACAAATGGTTTAAACTTGCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102378	AAACTGAGTAAATCAGTAATCATCATAAATACAAATGGTTTAAACTTGCC	102427

AL845557.1	1101	CCTTAAAAGATCTATACTCTAAGACAGGGAAAAAGGATCCAGTTATTTTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102428	CCTTAAAAGATCTATACTCTAAGACAGGGAAAAAGGATCCAGTTATTTTC	102477

AL845557.1	1151	TATTCACAAGACTTATTGGAATCTGAAAAGTAAAATAATAGAGAAAGACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102478	TATTCACAAGACTTATTGGAATCTGAAAAGTAAAATAATAGAGAAAGACA	102527

AL845557.1	1201	AAGCAGAGGAAAATATTAACCAAAAAGCTATTATTTAAAATAGAATTTAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102528	AAGCAGAGGAAAATATTAACCAAAAAGCTATTATTTAAAATAGAATTTAA	102577

AL845557.1	1251	ATCAGAAATTACTATTTGAAATAAAGAATACTGGAAGTTCCTGGGAAAGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102578	ATCAGAAATTACTATTTGAAATAAAGAATACTGGAAGTTCCTGGGAAAGA	102627

AL845557.1	1301	TGGCTGAATAGGAACAGCTCTGGTCTGCAGCTCCCAGTGAGACCAATGCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102628	TGGCTGAATAGGAACAGCTCTGGTCTGCAGCTCCCAGTGAGACCAATGCA	102677

AL845557.1	1351	GAAGGCGGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCATCTCAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102678	GAAGGCGGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCATCTCAT	102727

AL845557.1	1401	TGGGACTGGTTAGAAAGTAGGTGCAGCTCATGGAGGGTGAGCAGAAGTGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102728	TGGGACTGGTTAGAAAGTAGGTGCAGCTCATGGAGGGTGAGCAGAAGTGG	102777

AL845557.1	1451	GGTGGGTTGTTGGTTCACCTGGGAAGTGCAAGGAGCTGGGGACCTCCCTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102778	GGTGGGTTGTTGGTTCACCTGGGAAGTGCAAGGAGCTGGGGACCTCCCTC	102827

AL845557.1	1501	CTCTAGCCAAGGGGAGCCGTGAGGGACTGTGCTATCCGGACCAGGGACTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102828	CTCTAGCCAAGGGGAGCCGTGAGGGACTGTGCTATCCGGACCAGGGACTG	102877

AL845557.1	1551	TGCTATCTGGACCAGATACTATGCTTTTCCCATGGTTTTTGCAACCCACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102878	TGCTATCTGGACCAGATACTATGCTTTTCCCATGGTTTTTGCAACCCACA	102927

AL845557.1	1601	GACCAGGAGATTCCCTTGTGTGCCTACACCACTAGGGTGCTGGGTTTCAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102928	GACCAGGAGATTCCCTTGTGTGCCTACACCACTAGGGTGCTGGGTTTCAA	102977

AL845557.1	1651	GCACAAAACTGGGCGGCTGTTTGGGCAGACACCGAGCTAGCTGCAATTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	102978	GCACAAAACTGGGCGGCTGTTTGGGCAGACACCGAGCTAGCTGCAATTTT	103027

AL845557.1	1701	TTTTTTCATAGGCCAGTGGCACCTGGAACCCCAGCAAGACAGAACCATTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	103028	TTTTTTCATAGGCCAGTGGCACCTGGAACCCCAGCAAGACAGAACCATTC	103077

AL845557.1	1751	ACTCCCCTGGAAAGGGGGCTGAAGCCAGGGAGCCAAGTGGTCTCGCTCAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	103078	ACTCCCCTGGAAAGGGGGCTGAAGCCAGGGAGCCAAGTGGTCTCGCTCAG	103127

AL845557.1	1801	TGGGTCCCACTCCCCCAGCGCCCAGCAAGCTAATAACCACTGGCTTGAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	103128	TGGGTCCCACTCCCCCAGCGCCCAGCAAGCTAATAACCACTGGCTTGAAA	103177

AL845557.1	1851	TTCTCACTGCCAGCATAGCAGTCTGAAGTCGACCTGGGACAATCCAGGTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	103178	TTCTCACTGCCAGCATAGCAGTCTGAAGTCGACCTGGGACAATCCAGGTT	103227

AL845557.1	1901	GGTGTGGGGAGGGGTGCCCGCCATTACTGAGGCTTGTGTGGGTGGTTTTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	103228	GGTGTGGGGAGGGGTGCCCGCCATTACTGAGGCTTGTGTGGGTGGTTTTC	103277

AL845557.1	1951	CCCTCACAGTGTTAAGGAAGCCACTGGGAAGTTCGGACTTTGCAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662830.14	103278	CCCTCACAGTGTTAAGGAAGCCACTGGGAAGTTCGGACTTTGCAGAATTC	103327

Overview

Query
AL845557.1 - 49278 bps
Hit
AL662830.14 - 103327 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link