<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL669813.6	1	TGAGATGGAGTGCAATGGCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	143432	TGAGATGGAGTGCAATGGCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCC	143481

AL669813.6	51	TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTTGCTGGAACTACA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	143482	TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTTGCTGGAACTACA	143531

AL669813.6	101	GGCGCATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	143532	GGCGCATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGG	143581

AL669813.6	151	GTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACCCCTGACCTCAGGTGATC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	143582	GTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACCCCTGACCTCAGGTGATC	143631

AL669813.6	201	TGCCTGCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	143632	TGCCTGCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCAG	143681

AL669813.6	251	GCCCAGCCCAATAACCTTTAATTTCAACATACTAATAAACATAAACAGTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	143682	GCCCAGCCCAATAACCTTTAATTTCAACATACTAATAAACATAAACAGTA	143731

AL669813.6	301	TTTCAAGATTTCTGCAATAACTCTAATGGGAATGAAAACATCTGTGGCTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	143732	TTTCAAGATTTCTGCAATAACTCTAATGGGAATGAAAACATCTGTGGCTT	143781

AL669813.6	351	CCATTGGTAATTAAGTCACAGGTACTGCTCATATTGTGGTTAGTTGTAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	143782	CCATTGGTAATTAAGTCACAGGTACTGCTCATATTGTGGTTAGTTGTAAA	143831

AL669813.6	401	ATGTTTTGGTTTGTTTTGTTTTTTCCAAGACTTGGGGGAATGGGTGTTGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	143832	ATGTTTTGGTTTGTTTTGTTTTTTCCAAGACTTGGGGGAATGGGTGTTGG	143881

AL669813.6	451	TGGGATCAACAAGAGTCTTGCTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGGGGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	143882	TGGGATCAACAAGAGTCTTGCTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGGGGCA	143931

AL669813.6	501	GGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	143932	GGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCT	143981

AL669813.6	551	GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGCATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	143982	GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGCATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCA	144031

AL669813.6	601	GCTAATTTTTACATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCTGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144032	GCTAATTTTTACATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCTGG	144081

AL669813.6	651	CTGGTCTTGAACTCTTGGCCTCATGATCCACCCGTCTCGGACTCCCAGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144082	CTGGTCTTGAACTCTTGGCCTCATGATCCACCCGTCTCGGACTCCCAGAG	144131

AL669813.6	701	TGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCAGTTGTTACATTTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144132	TGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCAGTTGTTACATTTTT	144181

AL669813.6	751	AATGAAAGAAAATGTTAAATCCAGTTATTGAAAATAAGGAGGCAGTACTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144182	AATGAAAGAAAATGTTAAATCCAGTTATTGAAAATAAGGAGGCAGTACTT	144231

AL669813.6	801	TTCTCATCCAAGTTCATGGACTTTCTGAATTTTGTCCCCAGAGTCCTTTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144232	TTCTCATCCAAGTTCATGGACTTTCTGAATTTTGTCCCCAGAGTCCTTTG	144281

AL669813.6	851	GTGTTCTAGGACCCCAGGTTAAGGAACCAAAAAAGACAGGTGGGTGGGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144282	GTGTTCTAGGACCCCAGGTTAAGGAACCAAAAAAGACAGGTGGGTGGGGC	144331

AL669813.6	901	ATGAGGGGGAACACATGTTAACCCTGTTTGTTCTGGTGAACAATTCAGAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144332	ATGAGGGGGAACACATGTTAACCCTGTTTGTTCTGGTGAACAATTCAGAT	144381

AL669813.6	951	CCCCACTTTCTGAGGGTGCCCTGCTGGAAGATAACCCTGTTTGTAATTGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144382	CCCCACTTTCTGAGGGTGCCCTGCTGGAAGATAACCCTGTTTGTAATTGT	144431

AL669813.6	1001	GCCGGTTCTTGGACCCTTGGTTGCCTTGATCATCTGCTACAACTGGCTAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144432	GCCGGTTCTTGGACCCTTGGTTGCCTTGATCATCTGCTACAACTGGCTAC	144481

AL669813.6	1051	ATCGAAGACTAGCAGGTGCAGTGGCTGGGCAGCAGGCAAGACCACCAAAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144482	ATCGAAGACTAGCAGGTGCAGTGGCTGGGCAGCAGGCAAGACCACCAAAT	144531

AL669813.6	1101	AGTGGGGGACCAAGTCAGCTCTGAATGGGAAGCCAAAAGAGAATAGAACC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144532	AGTGGGGGACCAAGTCAGCTCTGAATGGGAAGCCAAAAGAGAATAGAACC	144581

AL669813.6	1151	AGGACTCAAGATTAGGGGAGCTGGGATTTCCTTATTCCTCTGTCCCCATG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144582	AGGACTCAAGATTAGGGGAGCTGGGATTTCCTTATTCCTCTGTCCCCATG	144631

AL669813.6	1201	CCCAACCCCAGGCTCTTCTGAGAAACTGTGAAGAGAACCACTTACTGGAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144632	CCCAACCCCAGGCTCTTCTGAGAAACTGTGAAGAGAACCACTTACTGGAT	144681

AL669813.6	1251	CTGTGGGATCCCCCAGTGGAAAGGGCAGTGTGGGTCACTCCAAATGTCCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144682	CTGTGGGATCCCCCAGTGGAAAGGGCAGTGTGGGTCACTCCAAATGTCCA	144731

AL669813.6	1301	TAGGGAGGATGTGGGGAAGGTGCTATTCATCTTCCACTAATCACATATTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144732	TAGGGAGGATGTGGGGAAGGTGCTATTCATCTTCCACTAATCACATATTT	144781

AL669813.6	1351	GTTTCTTTTTGTTTTCAGGGCAATTCCTTGAAGAGCTACGTAAGTTCTCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144782	GTTTCTTTTTGTTTTCAGGGCAATTCCTTGAAGAGCTACGTAAGTTCTCT	144831

AL669813.6	1401	TCTCTCTGTTATAAGCAGAGAATAAAAAGCCAGGAAAGGGAGACAGAAGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144832	TCTCTCTGTTATAAGCAGAGAATAAAAAGCCAGGAAAGGGAGACAGAAGC	144881

AL669813.6	1451	AACAAGAGGAAGAGGCGGGCTATTGAGGGATCACATTCCCAGAGGAAAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144882	AACAAGAGGAAGAGGCGGGCTATTGAGGGATCACATTCCCAGAGGAAAGG	144931

AL669813.6	1501	AGGAGCTGGAGAGCCTGGGTGGAGGGAAGACTCCTCCTGGGAGGTAGAGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144932	AGGAGCTGGAGAGCCTGGGTGGAGGGAAGACTCCTCCTGGGAGGTAGAGG	144981

AL669813.6	1551	GCAAAGAAGCCAGCTGTTAGAGACACATTTACAGGTGGCAGAGAAGCTGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	144982	GCAAAGAAGCCAGCTGTTAGAGACACATTTACAGGTGGCAGAGAAGCTGG	145031

AL669813.6	1601	AGGCACTCCTATCTGCCACCTGATCCATTCCTCCTTCACTGCCCCTAAGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	145032	AGGCACTCCTATCTGCCACCTGATCCATTCCTCCTTCACTGCCCCTAAGC	145081

AL669813.6	1651	AGGAATCCAACCCTAGCTGGTCTCATTGCCCATTCCACAGCAACTGCCCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	145082	AGGAATCCAACCCTAGCTGGTCTCATTGCCCATTCCACAGCAACTGCCCA	145131

AL669813.6	1701	GTGCCTCACCTCTCAGATCAACCATTGAGGCAGGAATGGAGACAAGATGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	145132	GTGCCTCACCTCTCAGATCAACCATTGAGGCAGGAATGGAGACAAGATGA	145181

AL669813.6	1751	CCCCAAGGGCTTTTCTTCTCCCTAGTTCAATGGTTTTATGATACAAACTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	145182	CCCCAAGGGCTTTTCTTCTCCCTAGTTCAATGGTTTTATGATACAAACTA	145231

AL669813.6	1801	CTGACATACGTTTTTCAAGTTATTTTCTCCTTCTTCTAGGAAATCCCTTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	145232	CTGACATACGTTTTTCAAGTTATTTTCTCCTTCTTCTAGGAAATCCCTTC	145281

AL669813.6	1851	TGAGTGATGTCACATCTTGGCAGGGGTGGAGGAGAGCCTGGTTGCCCAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	145282	TGAGTGATGTCACATCTTGGCAGGGGTGGAGGAGAGCCTGGTTGCCCAGG	145331

AL669813.6	1901	GATTTGTCCTTGGGGACATCTCATCCATCAAGTTGCACACTCACTGGCAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	145332	GATTTGTCCTTGGGGACATCTCATCCATCAAGTTGCACACTCACTGGCAT	145381

AL669813.6	1951	CTTTGCTATGGGGACATTCCAATTTGCACTTTCAGGAACACTCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662826.11	145382	CTTTGCTATGGGGACATTCCAATTTGCACTTTCAGGAACACTCTGAATTC	145431

Overview

Query
AL669813.6 - 115133 bps
Hit
AL662826.11 - 145431 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link