<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL732442.7	1	CCAGGTGTGGTGGCAGGCGCCTGTAACCCCAGCTACTCGGGAGGCTAAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	79769	CCAGGTGTGGTGGCAGGCGCCTGTAACCCCAGCTACTCGGGAGGCTAAGG	79818

AL732442.7	51	CAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCTGAGATCG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	79819	CAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCTGAGATCG	79868

AL732442.7	101	CGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAGGGAGACTCTGTCTCAAAAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	79869	CGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAGGGAGACTCTGTCTCAAAAAA	79918

AL732442.7	151	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACTTAACCTCTGCATAAGAGATTTCTAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	79919	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACTTAACCTCTGCATAAGAGATTTCTAT	79968

AL732442.7	201	GGGAGCACAGTGACAGAATATGGGATGTGCAAGGATGGATTCAGTGAATT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	79969	GGGAGCACAGTGACAGAATATGGGATGTGCAAGGATGGATTCAGTGAATT	80018

AL732442.7	251	GATGAAGCCAAACTGGGACATGAAGGAGGATGGCATCTGGAGAGCTGTAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80019	GATGAAGCCAAACTGGGACATGAAGGAGGATGGCATCTGGAGAGCTGTAG	80068

AL732442.7	301	AGGGGTGAAGGTGGTCCATGTGGGTGTGTAGGGATTGTGTACTTTCGATG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80069	AGGGGTGAAGGTGGTCCATGTGGGTGTGTAGGGATTGTGTACTTTCGATG	80118

AL732442.7	351	TCCAAAGATCCTGCTGCTCTCCCTGCCTCTTTTCCTCACGTTTCTCTACC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80119	TCCAAAGATCCTGCTGCTCTCCCTGCCTCTTTTCCTCACGTTTCTCTACC	80168

AL732442.7	401	ACTTTCCCCCACAGAACGTGAAGCTCTTGGAGCAATTTGTCTGCGCCCAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80169	ACTTTCCCCCACAGAACGTGAAGCTCTTGGAGCAATTTGTCTGCGCCCAC	80218

AL732442.7	451	ACGGGTATCATCTTCTATGCTCCATACACAGGTTAGCCCATCATCCCTGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80219	ACGGGTATCATCTTCTATGCTCCATACACAGGTTAGCCCATCATCCCTGC	80268

AL732442.7	501	ACCACCAGAGAGCTTTTCCTTGTGGCATGCCTTGTTTATGTAGTTGGCCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80269	ACCACCAGAGAGCTTTTCCTTGTGGCATGCCTTGTTTATGTAGTTGGCCA	80318

AL732442.7	551	ATAGGTATTTGTTCAGTGGCTCCTGCTTATAGCCTAAAAGGTCTGGCTGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80319	ATAGGTATTTGTTCAGTGGCTCCTGCTTATAGCCTAAAAGGTCTGGCTGA	80368

AL732442.7	601	ACCTTTTGGAAATCTTGGCTTGCTGGGGGCTAAAGTAATTAAATGTGGAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80369	ACCTTTTGGAAATCTTGGCTTGCTGGGGGCTAAAGTAATTAAATGTGGAC	80418

AL732442.7	651	AAAAGAAAACAACAAATACAGCCAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80419	AAAAGAAAACAACAAATACAGCCAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCC	80468

AL732442.7	701	CAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGCTGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80469	CAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGCTGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCG	80518

AL732442.7	751	AGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCTGTGGTGATGCATGCCTGTAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80519	AGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCTGTGGTGATGCATGCCTGTAA	80568

AL732442.7	801	TCCCAGCTACTCAGGAGGCGGAGGCAGGAGAGTCGCTTGAACCCAGGAGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80569	TCCCAGCTACTCAGGAGGCGGAGGCAGGAGAGTCGCTTGAACCCAGGAGG	80618

AL732442.7	851	CACAGGTTGTGGTGAGCCAACATTGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80619	CACAGGTTGTGGTGAGCCAACATTGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAT	80668

AL732442.7	901	CAAGTGAAGCTCCATCTCAAAAAAAAAAAAGGAAAAAGAAAAAAACAAGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80669	CAAGTGAAGCTCCATCTCAAAAAAAAAAAAGGAAAAAGAAAAAAACAAGT	80718

AL732442.7	951	ACTTCTGTAAGCAAACTATCTAAATGTAGTTTTTAATTGATAAACAGTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80719	ACTTCTGTAAGCAAACTATCTAAATGTAGTTTTTAATTGATAAACAGTGA	80768

AL732442.7	1001	TTAATTCCTTTCTATAGGGTCTTTTAACTTTTACAAAAGACTTCTCACAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80769	TTAATTCCTTTCTATAGGGTCTTTTAACTTTTACAAAAGACTTCTCACAA	80818

AL732442.7	1051	ATTGTCACATAAGTTATTTTATATCATTGTCAATTGGATTAGATTTTCCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80819	ATTGTCACATAAGTTATTTTATATCATTGTCAATTGGATTAGATTTTCCA	80868

AL732442.7	1101	AACTTGGAATCGTAAATTTAACAATTCAGAATTATATTTATTCCCTAACT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80869	AACTTGGAATCGTAAATTTAACAATTCAGAATTATATTTATTCCCTAACT	80918

AL732442.7	1151	ACAGTCACAGGGCAAATCTGGCCCACTGTCACGTCCATTTGTTTTCATAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80919	ACAGTCACAGGGCAAATCTGGCCCACTGTCACGTCCATTTGTTTTCATAT	80968

AL732442.7	1201	TTTCTGCAATTGCTTCCATGCTACAATGGCAGAGTTGAGTAGCTGAGACA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	80969	TTTCTGCAATTGCTTCCATGCTACAATGGCAGAGTTGAGTAGCTGAGACA	81018

AL732442.7	1251	GAGACCACAGGACCTGCAGAGTTTAAAATATTTACTATATGACTCTAGAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	81019	GAGACCACAGGACCTGCAGAGTTTAAAATATTTACTATATGACTCTAGAC	81068

AL732442.7	1301	AGAAAAATTTTGCTAACCCCTGCTCTGAAGCAAGACAAATTTGCAGAGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	81069	AGAAAAATTTTGCTAACCCCTGCTCTGAAGCAAGACAAATTTGCAGAGAA	81118

AL732442.7	1351	TAATTTTTTGTTGTTTTTTTTTTTTGAGACGAAGTTTCACTCTTGTTGCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	81119	TAATTTTTTGTTGTTTTTTTTTTTTGAGACGAAGTTTCACTCTTGTTGCC	81168

AL732442.7	1401	CAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTTGCCTCACCACAACCTCTGCCTCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	81169	CAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTTGCCTCACCACAACCTCTGCCTCC	81218

AL732442.7	1451	CAAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCCCCTGAGTAGCTGGGATTGCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	81219	CAAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCCCCTGAGTAGCTGGGATTGCA	81268

AL732442.7	1501	GGCACATGCCACCATGTCCGGCAAATAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	81269	GGCACATGCCACCATGTCCGGCAAATAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGG	81318

AL732442.7	1551	TCAGGCTGGTCTCGAACTCCGGATCTCAGGTGATCCAGCTGCCTTGGCCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	81319	TCAGGCTGGTCTCGAACTCCGGATCTCAGGTGATCCAGCTGCCTTGGCCT	81368

AL732442.7	1601	TCCAAAGTGCTGGGATGACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCAGAGACTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	81369	TCCAAAGTGCTGGGATGACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCAGAGACTA	81418

AL732442.7	1651	ATCTTTGTTTTTGTTTTTTTTGGGGGGGTGTGGGTGGGGGGATGAAATCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	81419	ATCTTTGTTTTTGTTTTTTTTGGGGGGGTGTGGGTGGGGGGATGAAATCT	81468

AL732442.7	1701	CATTTACTCTGTCACCCAAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	81469	CATTTACTCTGTCACCCAAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCA	81518

AL732442.7	1751	CTGCCGTCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	81519	CTGCCGTCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCC	81568

AL732442.7	1801	AAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGCCACTGTGCCTGGCTAATTTTTTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	81569	AAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGCCACTGTGCCTGGCTAATTTTTTTT	81618

AL732442.7	1851	GTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATTTTGGCCAGTCTGGTCTTGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	81619	GTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATTTTGGCCAGTCTGGTCTTGA	81668

AL732442.7	1901	ACTCCTGACCTCAAGTGATCCTCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	81669	ACTCCTGACCTCAAGTGATCCTCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGA	81718

AL732442.7	1951	TTATAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTGCAGAGAATAATCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662825.5	81719	TTATAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTGCAGAGAATAATCTGAATTC	81768

Overview

Query
AL732442.7 - 71418 bps
Hit
AL662825.5 - 81768 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link