<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL713971.7	1	TTTTTTTTGTTTCTATTCCTTTTATATCACTGTGTTTGAATCGAGGGGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	185965	TTTTTTTTGTTTCTATTCCTTTTATATCACTGTGTTTGAATCGAGGGGGA	186014

AL713971.7	51	GGGGTGGTAACCGGAAATAAAGACCTCCGATCTTCCGCCCCACATGCAGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186015	GGGGTGGTAACCGGAAATAAAGACCTCCGATCTTCCGCCCCACATGCAGT	186064

AL713971.7	101	CTTTGTCTTTTTGGGGGGAATGGGGCCCCTTGTCTTCTCCACACCCGGGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186065	CTTTGTCTTTTTGGGGGGAATGGGGCCCCTTGTCTTCTCCACACCCGGGG	186114

AL713971.7	151	CCCCTAAGCAGCAGTGTCGGGCCACGCCCCCTCGGTGGGAGGTCGGCCTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186115	CCCCTAAGCAGCAGTGTCGGGCCACGCCCCCTCGGTGGGAGGTCGGCCTG	186164

AL713971.7	201	CGCTGGTGGCCGCAGATGGCCTAAGGCTGGCGGGCCTTTGATTGGCCCCG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186165	CGCTGGTGGCCGCAGATGGCCTAAGGCTGGCGGGCCTTTGATTGGCCCCG	186214

AL713971.7	251	GCTTTGCCCTTGCCACGCCCCTCTGCGCTGGGATTGGCTTAGTGCTGGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186215	GCTTTGCCCTTGCCACGCCCCTCTGCGCTGGGATTGGCTTAGTGCTGGGA	186264

AL713971.7	301	TTCCCACCCACCCACAGCCCGCCATGGCGTCTCAGCTCCAGAACCGACTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186265	TTCCCACCCACCCACAGCCCGCCATGGCGTCTCAGCTCCAGAACCGACTC	186314

AL713971.7	351	CGCTCCGCACTGGCCTTGGTCACAGGTTGAGGGGGTTCTTTCCCCGGGCG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186315	CGCTCCGCACTGGCCTTGGTCACAGGTTGAGGGGGTTCTTTCCCCGGGCG	186364

AL713971.7	401	GTTTGGGGTATTGGAGTGAGGTCAGGGGCGTGCCCTTGGAGTGCGCGGCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186365	GTTTGGGGTATTGGAGTGAGGTCAGGGGCGTGCCCTTGGAGTGCGCGGCC	186414

AL713971.7	451	GCTGTGACCTCTGGCCCCTTACCCACATTTTACTTTCTGCCCTGTGACCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186415	GCTGTGACCTCTGGCCCCTTACCCACATTTTACTTTCTGCCCTGTGACCT	186464

AL713971.7	501	CTGATCCCTGCCCTCTCCTCCCCGTGCCCGGTCCGGCGTGTTCTGTCCTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186465	CTGATCCCTGCCCTCTCCTCCCCGTGCCCGGTCCGGCGTGTTCTGTCCTA	186514

AL713971.7	551	CCTCAGGTGCGGGGAGCGGCATCGGCCGAGCGGTCAGTGTACGCCTGGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186515	CCTCAGGTGCGGGGAGCGGCATCGGCCGAGCGGTCAGTGTACGCCTGGCC	186564

AL713971.7	601	GGAGAGGGGGCCACCGTAGCTGCCTGCGACCTGGACCGGGCAGCGGCACA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186565	GGAGAGGGGGCCACCGTAGCTGCCTGCGACCTGGACCGGGCAGCGGCACA	186614

AL713971.7	651	GGAGACGGTGCGGCTGCTGGGCGGGCCAGGGAGCAAGGAGGGGCCGCCCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186615	GGAGACGGTGCGGCTGCTGGGCGGGCCAGGGAGCAAGGAGGGGCCGCCCC	186664

AL713971.7	701	GAGGGAACCATGCTGCCTTCCAGGCTGACGTGTCTGAGGCCAGGGCCGCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186665	GAGGGAACCATGCTGCCTTCCAGGCTGACGTGTCTGAGGCCAGGGCCGCC	186714

AL713971.7	751	AGGTGCCTGCTGGAACAAGTGCAGGTGAACGCCAGGCCACTTTCCCCCTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186715	AGGTGCCTGCTGGAACAAGTGCAGGTGAACGCCAGGCCACTTTCCCCCTC	186764

AL713971.7	801	TAAAGCTCTAATATTGCCTCCACTGCCCCGGCTTTTTGTGGGGGGTTTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186765	TAAAGCTCTAATATTGCCTCCACTGCCCCGGCTTTTTGTGGGGGGTTTTT	186814

AL713971.7	851	GATGCGTAACCTCCCCCTCCCATAGGCCTGCTTTTCTCGCCCACCATCTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186815	GATGCGTAACCTCCCCCTCCCATAGGCCTGCTTTTCTCGCCCACCATCTG	186864

AL713971.7	901	TCGTTGTGTCCTGTGCGGGCATCACCCAGGATGAGTTTCTGCTGCACATG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186865	TCGTTGTGTCCTGTGCGGGCATCACCCAGGATGAGTTTCTGCTGCACATG	186914

AL713971.7	951	TCTGAGGATGACTGGGACAAAGTCATAGCTGTCAACCTCAAGGTGGCGAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186915	TCTGAGGATGACTGGGACAAAGTCATAGCTGTCAACCTCAAGGTGGCGAT	186964

AL713971.7	1001	CTCTGAACCTGCGACGTTTGGCCCCCTTAGCCTGGGGAGGGAGTTGGAGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	186965	CTCTGAACCTGCGACGTTTGGCCCCCTTAGCCTGGGGAGGGAGTTGGAGG	187014

AL713971.7	1051	AGGGCTGTCACCCCAGCTGATCTTTTCTCCCTTGTTACCCTTTCCCGCCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187015	AGGGCTGTCACCCCAGCTGATCTTTTCTCCCTTGTTACCCTTTCCCGCCA	187064

AL713971.7	1101	GGGCACCTTCCTAGTCACTCAGGCTGCAGCACAAGCCCTGGTGTCCAATG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187065	GGGCACCTTCCTAGTCACTCAGGCTGCAGCACAAGCCCTGGTGTCCAATG	187114

AL713971.7	1151	GTTGTCGTGGTTCCATCATCAACATCAGTAGCATCGTAGGAAAGGTCAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187115	GTTGTCGTGGTTCCATCATCAACATCAGTAGCATCGTAGGAAAGGTCAGG	187164

AL713971.7	1201	TTGAGTTGGACGAGGTCAGCCAGCCAAGTGGTATAGAGAGGAGAACCCCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187165	TTGAGTTGGACGAGGTCAGCCAGCCAAGTGGTATAGAGAGGAGAACCCCT	187214

AL713971.7	1251	CCTTGAGACTCCTGACTCATTCCACATCTCTGACTCACCTATAGGTGGGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187215	CCTTGAGACTCCTGACTCATTCCACATCTCTGACTCACCTATAGGTGGGG	187264

AL713971.7	1301	AACGTGGGGCAGACAAACTATGCAGCATCCAAGGCTGGAGTGATTGGGCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187265	AACGTGGGGCAGACAAACTATGCAGCATCCAAGGCTGGAGTGATTGGGCT	187314

AL713971.7	1351	GACCCAGACCGCAGCCCGGGAGCTTGGACGGTTGGTCAGATGCTTGAGGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187315	GACCCAGACCGCAGCCCGGGAGCTTGGACGGTTGGTCAGATGCTTGAGGG	187364

AL713971.7	1401	TGCTGGGGAGCACCTGGGGGGTCTGAGGGAGGTACCAGCATTCAGCCCTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187365	TGCTGGGGAGCACCTGGGGGGTCTGAGGGAGGTACCAGCATTCAGCCCTC	187414

AL713971.7	1451	TCCAGAATCGGCAGCCACTCTCCTTCCCACAGACATGGGATCCGCTGTAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187415	TCCAGAATCGGCAGCCACTCTCCTTCCCACAGACATGGGATCCGCTGTAA	187464

AL713971.7	1501	CTCTGTCCTCCCAGGGTTCATTGCAACACCCATGACACAGAAAGTGCCAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187465	CTCTGTCCTCCCAGGGTTCATTGCAACACCCATGACACAGAAAGTGCCAC	187514

AL713971.7	1551	AGAAAGTGGTGGACAAGGTAGGAGGCTGTGGGTGGAGGGCAGAATCATTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187515	AGAAAGTGGTGGACAAGGTAGGAGGCTGTGGGTGGAGGGCAGAATCATTC	187564

AL713971.7	1601	AGAGACTCAATCTCTCTGGGCTTCACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187565	AGAGACTCAATCTCTCTGGGCTTCACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAA	187614

AL713971.7	1651	TACTGGGCACAGTTCCTGGCAAACATTAAATATTCAATGAATGTATGAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187615	TACTGGGCACAGTTCCTGGCAAACATTAAATATTCAATGAATGTATGAGA	187664

AL713971.7	1701	AATGAAGACAAAAAAAGGTCACAGACTCAGTCTTCAAAAAAATCCATAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187665	AATGAAGACAAAAAAAGGTCACAGACTCAGTCTTCAAAAAAATCCATAAA	187714

AL713971.7	1751	AGAAGCTTTCACCCACATGAGTATTTCCTTACAGATTACTGAAATGATCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187715	AGAAGCTTTCACCCACATGAGTATTTCCTTACAGATTACTGAAATGATCC	187764

AL713971.7	1801	CGATGGGACACTTGGGGGACCCTGAGGGTGAGCACTGAATGTAGTGGGGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187765	CGATGGGACACTTGGGGGACCCTGAGGGTGAGCACTGAATGTAGTGGGGT	187814

AL713971.7	1851	CCCTGGGAAGGGGGCCTGAATGAAGAGATCCCCAAAGTTTGGGGATTTTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187815	CCCTGGGAAGGGGGCCTGAATGAAGAGATCCCCAAAGTTTGGGGATTTTC	187864

AL713971.7	1901	TAGGGGACTGGTGGTTGGTGTCTGTGGAGAGGTTTGTGGGGAGGGATGTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187865	TAGGGGACTGGTGGTTGGTGTCTGTGGAGAGGTTTGTGGGGAGGGATGTC	187914

AL713971.7	1951	TTTGGTGGGAGATTATGGCTGTTTTGGGTCTATGGGAGTGAGCAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662824.9	187915	TTTGGTGGGAGATTATGGCTGTTTTGGGTCTATGGGAGTGAGCAGAATTC	187964

Overview

Query
AL713971.7 - 70621 bps
Hit
AL662824.9 - 187964 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link