<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL691478.5	1	TCTTAGAGCATAAGCCATTGGTGTTCTGTTCAGAAACTTTCCCCCTGTGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213242	TCTTAGAGCATAAGCCATTGGTGTTCTGTTCAGAAACTTTCCCCCTGTGC	213291

AL691478.5	51	CCATGTGCTCCAGGCTCTTCCTCACTTTCTTTTCTATTCGTTTCAGTGTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213292	CCATGTGCTCCAGGCTCTTCCTCACTTTCTTTTCTATTCGTTTCAGTGTA	213341

AL691478.5	101	TCTGGTTTTATGTGGAGGTCCTTGATCCATTTGATCAGGACTTGAGCTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213342	TCTGGTTTTATGTGGAGGTCCTTGATCCATTTGATCAGGACTTGAGCTTT	213391

AL691478.5	151	GTACAGAGAGATAAGAATGGGTCAATTTGCATTCTGCTACATGCTGACCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213392	GTACAGAGAGATAAGAATGGGTCAATTTGCATTCTGCTACATGCTGACCA	213441

AL691478.5	201	CCAGTTGAACCAGCACCATTTGTTGAAAATGCTATCTTTTTTTCCCCTGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213442	CCAGTTGAACCAGCACCATTTGTTGAAAATGCTATCTTTTTTTCCCCTGG	213491

AL691478.5	251	ATGGTTTCAGCTACTTTGTCAAGACCAAGTGATCATAGGTGTGTGGGTTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213492	ATGGTTTCAGCTACTTTGTCAAGACCAAGTGATCATAGGTGTGTGGGTTC	213541

AL691478.5	301	ATTTCTGGGTCTTCAGTTTTATTCCATTGATCTATCTTCTTGTCATTATA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213542	ATTTCTGGGTCTTCAGTTTTATTCCATTGATCTATCTTCTTGTCATTATA	213591

AL691478.5	351	CCAATACCATGTAGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTATCACTATTGCTCTGTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213592	CCAATACCATGTAGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTATCACTATTGCTCTGTA	213641

AL691478.5	401	ATATAGCTTGAGGTCAGGGATGGTGATTCCCACAGAAGTTCTTTTTTTTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213642	ATATAGCTTGAGGTCAGGGATGGTGATTCCCACAGAAGTTCTTTTTTTTA	213691

AL691478.5	451	ATTTATTTTTTTTATTACATATTTTCCTCAATTACATTTCCAATGCTATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213692	ATTTATTTTTTTTATTACATATTTTCCTCAATTACATTTCCAATGCTATC	213741

AL691478.5	501	CCAAAAGTCCCCCATACCCTCCCCCCCCACTTCCCTACCCACTCATTCCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213742	CCAAAAGTCCCCCATACCCTCCCCCCCCACTTCCCTACCCACTCATTCCC	213791

AL691478.5	551	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACTGGGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213792	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACTGGGG	213841

AL691478.5	601	CATATACAGTTTGCCTGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCTGAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213842	CATATACAGTTTGCCTGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCTGAC	213891

AL691478.5	651	TAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCGGGGTAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213892	TAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCGGGGTAC	213941

AL691478.5	701	TGGTTAGTTCATAATGTTGTTCCAACTATAGGGTTGCAAATCCCTTTAGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213942	TGGTTAGTTCATAATGTTGTTCCAACTATAGGGTTGCAAATCCCTTTAGC	213991

AL691478.5	751	TCCTTGGGTACTTTCGCTAGCTTCTCCATTGGGAGCCCTGTGATCCATCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	213992	TCCTTGGGTACTTTCGCTAGCTTCTCCATTGGGAGCCCTGTGATCCATCC	214041

AL691478.5	801	AATAGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGTCCAAGAATAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214042	AATAGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGTCCAAGAATAG	214091

AL691478.5	851	TCTCACAAGAGACAGCTACATCTGGGTCCTTTCGATAAAATCTTGCTAGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214092	TCTCACAAGAGACAGCTACATCTGGGTCCTTTCGATAAAATCTTGCTAGT	214141

AL691478.5	901	GTATGCAATGGTGTCAGCGTTTGGAAGCTGATTATGGGGTGGATCCCTGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214142	GTATGCAATGGTGTCAGCGTTTGGAAGCTGATTATGGGGTGGATCCCTGG	214191

AL691478.5	951	ATATGGCAGTCTCTACATGGTCCATCCTTTTGTCTCAGCTCCAAACTTTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214192	ATATGGCAGTCTCTACATGGTCCATCCTTTTGTCTCAGCTCCAAACTTTG	214241

AL691478.5	1001	TCTCTGTAACTCCTTCCATGGGTGTTTTGTTCCCAATTCTAAGGAGGGGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214242	TCTCTGTAACTCCTTCCATGGGTGTTTTGTTCCCAATTCTAAGGAGGGGC	214291

AL691478.5	1051	ATAGTGTCCACACTTCAGTCTTCATTCTTCTTGAGTTTCATGTGTTTAGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214292	ATAGTGTCCACACTTCAGTCTTCATTCTTCTTGAGTTTCATGTGTTTAGC	214341

AL691478.5	1101	AAATTGTATCTTATATCTTGGGTATCCTAGGTTTTGGGCTAATATCCACT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214342	AAATTGTATCTTATATCTTGGGTATCCTAGGTTTTGGGCTAATATCCACT	214391

AL691478.5	1151	TATCAGTGAGTACATATTGTGTGAGTTCCTTTGTGAATGTGTTACCTCAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214392	TATCAGTGAGTACATATTGTGTGAGTTCCTTTGTGAATGTGTTACCTCAC	214441

AL691478.5	1201	TCAGGATGATGCCCTCCAGGTCCATCCATTTGGCTAGGAATTTCATAAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214442	TCAGGATGATGCCCTCCAGGTCCATCCATTTGGCTAGGAATTTCATAAAT	214491

AL691478.5	1251	TCATATTGTTGAGAATTTTATTGTTGAGAATAGTTTTCACTATCCTGGAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214492	TCATATTGTTGAGAATTTTATTGTTGAGAATAGTTTTCACTATCCTGGAT	214541

AL691478.5	1301	TTTTTTGTTATTTCAAATGAATTTGAAAATTGTTCTTTCTAATTCTATGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214542	TTTTTTGTTATTTCAAATGAATTTGAAAATTGTTCTTTCTAATTCTATGA	214591

AL691478.5	1351	AGAATTGAGTTGGAATTTTGATGAAGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214592	AGAATTGAGTTGGAATTTTGATGAAGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCT	214641

AL691478.5	1401	TTTGGCAAGATAGCCATTTTTACTATATTGATCCTGCCAATCCATGAGCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214642	TTTGGCAAGATAGCCATTTTTACTATATTGATCCTGCCAATCCATGAGCA	214691

AL691478.5	1451	TGGGAGATCTTCCATCTTCTGAGGTCTTCTTCCATTTCTTTCTTCAGAGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214692	TGGGAGATCTTCCATCTTCTGAGGTCTTCTTCCATTTCTTTCTTCAGAGA	214741

AL691478.5	1501	CTTAAAGTTCTTGTCATACAGATCTTTCACTTGTTTGGTTAGAGTCACAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214742	CTTAAAGTTCTTGTCATACAGATCTTTCACTTGTTTGGTTAGAGTCACAC	214791

AL691478.5	1551	CAAGGTATTTTATATTGTTTGTGACTACTGTGAATGGTGTTGATTCCCTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214792	CAAGGTATTTTATATTGTTTGTGACTACTGTGAATGGTGTTGATTCCCTA	214841

AL691478.5	1601	ATTTCTTTCTCAGACAGTTTATCCTTTGAGTATAGGATGGCTACTGATTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214842	ATTTCTTTCTCAGACAGTTTATCCTTTGAGTATAGGATGGCTACTGATTT	214891

AL691478.5	1651	GTTTAAGTTAATTTTGTATCCTGCCACTTTGCTGAAGTTGTTTATCAGCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214892	GTTTAAGTTAATTTTGTATCCTGCCACTTTGCTGAAGTTGTTTATCAGCT	214941

AL691478.5	1701	GTAGTTCTCTGGTGGAATTTCTGGGGGGTCACTTAAGTATACTATCATAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214942	GTAGTTCTCTGGTGGAATTTCTGGGGGGTCACTTAAGTATACTATCATAG	214991

AL691478.5	1751	CATCTGCAAATAGTGATATTTTGATTTCTTTCTTTCCATTTTGTATCCTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	214992	CATCTGCAAATAGTGATATTTTGATTTCTTTCTTTCCATTTTGTATCCTT	215041

AL691478.5	1801	TTGCCCTCCTTTTGTTGTCTAATTGCTCTGACTAGGACTTTGAATGCTAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	215042	TTGCCCTCCTTTTGTTGTCTAATTGCTCTGACTAGGACTTTGAATGCTAT	215091

AL691478.5	1851	ATTGAATAGGTAGGGAAGAGTAGGCAGCAGACAGTTGTCTAGTTCCTGAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	215092	ATTGAATAGGTAGGGAAGAGTAGGCAGCAGACAGTTGTCTAGTTCCTGAT	215141

AL691478.5	1901	TTTAATGGGATTGCTTCAAGTTTCTCTCCATTTAGTTTGATGTTGGCTAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	215142	TTTAATGGGATTGCTTCAAGTTTCTCTCCATTTAGTTTGATGTTGGCTAT	215191

AL691478.5	1951	TGGTTTGCTGTATATTGCTTTTACTATGTTTAGGTATGGGCCTTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662823.12	215192	TGGTTTGCTGTATATTGCTTTTACTATGTTTAGGTATGGGCCTTGAATTC	215241

Overview

Query
AL691478.5 - 120928 bps
Hit
AL662823.12 - 215241 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link