<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AC101661.7	1	GAATTCCAGCACTGCAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153205	GAATTCCAGCACTGCAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGA	153254

AC101661.7	51	GGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153255	GGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGG	153304

AC101661.7	101	CAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153305	CAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCA	153354

AC101661.7	151	GAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGGCAGAGAGGCAGAGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153355	GAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGAGGCAGAGGCAGAGAGGCAGAGA	153404

AC101661.7	201	GGCAGAGGCAGAGGCAGAGGCAGAGGCAGAGAGGCAAAGGCAGAGAGGCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153405	GGCAGAGGCAGAGGCAGAGGCAGAGGCAGAGAGGCAAAGGCAGAGAGGCA	153454

AC101661.7	251	GAGGCAGAGAGGCAGAGGCAGAGAGGCAGAGGCAGAGGAAGCCGGCAGAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153455	GAGGCAGAGAGGCAGAGGCAGAGAGGCAGAGGCAGAGGAAGCCGGCAGAC	153504

AC101661.7	301	CTCTGTGATTTGGAGGCCAGCTGGGTCTGCAAAGACAGTTCTAGGACATC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153505	CTCTGTGATTTGGAGGCCAGCTGGGTCTGCAAAGACAGTTCTAGGACATC	153554

AC101661.7	351	CAGAGCTACACAGAGAAACTATGTAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153555	CAGAGCTACACAGAGAAACTATGTAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	153604

AC101661.7	401	AAAAAAAAAAAACCAACAAAACAAGCCAAGAAGTCACACAAGGATGTAGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153605	AAAAAAAAAAAACCAACAAAACAAGCCAAGAAGTCACACAAGGATGTAGT	153654

AC101661.7	451	GAATATACATCTAGTTACTTGTGAAATACCTTGAGGTCAAGAAAAGCACC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153655	GAATATACATCTAGTTACTTGTGAAATACCTTGAGGTCAAGAAAAGCACC	153704

AC101661.7	501	TAGAACACATTTACTTAAATGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153705	TAGAACACATTTACTTAAATGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTAT	153754

AC101661.7	551	CTATCTATCTATCTACCCATCCATCCATTCATCCATCCATCCATCCATCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153755	CTATCTATCTATCTACCCATCCATCCATTCATCCATCCATCCATCCATCT	153804

AC101661.7	601	ATGTGTTTGCTCAGCCACTGTTTCTAAGACATGGCTGCATATCTTTGTTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153805	ATGTGTTTGCTCAGCCACTGTTTCTAAGACATGGCTGCATATCTTTGTTA	153854

AC101661.7	651	GTGGCTTTGAAAGGTAGTAGAATCCACACTGGGAGCTCCAGCTTGGTTGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153855	GTGGCTTTGAAAGGTAGTAGAATCCACACTGGGAGCTCCAGCTTGGTTGG	153904

AC101661.7	701	TCAGCATGGTCTAGCTGGGTCAGCATTCCTTTAGTATTCACCATTTTACC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153905	TCAGCATGGTCTAGCTGGGTCAGCATTCCTTTAGTATTCACCATTTTACC	153954

AC101661.7	751	CAAAGAGCCTGGGATGGAGACTCAAGAACCTTGAAACATGGCTTTGCCAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	153955	CAAAGAGCCTGGGATGGAGACTCAAGAACCTTGAAACATGGCTTTGCCAT	154004

AC101661.7	801	AGCATATAAGAGGAGAGAGTCATTCTGCCATTCTGGGTCTGTTTCCTTAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154005	AGCATATAAGAGGAGAGAGTCATTCTGCCATTCTGGGTCTGTTTCCTTAA	154054

AC101661.7	851	GTATAAAGTGACTGGATAAGCTAGCACTGTTCTTCCATAGCTTGATTAAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154055	GTATAAAGTGACTGGATAAGCTAGCACTGTTCTTCCATAGCTTGATTAAC	154104

AC101661.7	901	ATTGTTTTCTGGCAATATCAAATACTTTCAGTAAAGCCTCTCAGGCCTTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154105	ATTGTTTTCTGGCAATATCAAATACTTTCAGTAAAGCCTCTCAGGCCTTG	154154

AC101661.7	951	CCTATACCTGTGTCTCCAACCTTAGGGTAGGGCCCAGAAATACATGTTTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154155	CCTATACCTGTGTCTCCAACCTTAGGGTAGGGCCCAGAAATACATGTTTC	154204

AC101661.7	1001	TTCAAGGCCTTGACTGGTTCTGGTCTGTGGTAAAGTTTACATGTTACAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154205	TTCAAGGCCTTGACTGGTTCTGGTCTGTGGTAAAGTTTACATGTTACAAT	154254

AC101661.7	1051	AGAATAAAGGAGAAAAAATATAACTGAGTTGAGTAATAATCTAGCATTTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154255	AGAATAAAGGAGAAAAAATATAACTGAGTTGAGTAATAATCTAGCATTTA	154304

AC101661.7	1101	AAAAATGTTTTCATGATGTCTAGATACATGGATATAAAGTAAAATCGTGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154305	AAAAATGTTTTCATGATGTCTAGATACATGGATATAAAGTAAAATCGTGT	154354

AC101661.7	1151	GAGTTCAGGTAGGAAAAGCTTTGCCTGTTGAGTTGCTGAGACTGAAGCAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154355	GAGTTCAGGTAGGAAAAGCTTTGCCTGTTGAGTTGCTGAGACTGAAGCAC	154404

AC101661.7	1201	TTAGAAATGTGCTCATGGGGTCAACAGCCCGGCACTGTCTGCAGCAGGAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154405	TTAGAAATGTGCTCATGGGGTCAACAGCCCGGCACTGTCTGCAGCAGGAA	154454

AC101661.7	1251	GAACATATATTAGATAGAGTTTGTGGAACAATGCCTGACTACTGAAATGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154455	GAACATATATTAGATAGAGTTTGTGGAACAATGCCTGACTACTGAAATGC	154504

AC101661.7	1301	ATGTTAATTCCAAGTGTGTGCATAGCAAATGCAGTTTGTTTTTACTTTAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154505	ATGTTAATTCCAAGTGTGTGCATAGCAAATGCAGTTTGTTTTTACTTTAG	154554

AC101661.7	1351	CAAGATATTTTTGTTCTAAAAAGTAAAAACAAATATTCTGAAATTATGCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154555	CAAGATATTTTTGTTCTAAAAAGTAAAAACAAATATTCTGAAATTATGCC	154604

AC101661.7	1401	CAGAATTTTAATCTGAAAATTTACATTATGTTTATGTATGAGCACCAGGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154605	CAGAATTTTAATCTGAAAATTTACATTATGTTTATGTATGAGCACCAGGC	154654

AC101661.7	1451	ACATAGCCTCCCGTTCAACTCTTTACTGGATAAATGTTGCTCTTACTCTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154655	ACATAGCCTCCCGTTCAACTCTTTACTGGATAAATGTTGCTCTTACTCTC	154704

AC101661.7	1501	ATTCTAAAACTCATGCGTGATTTCAGAAGAAACTTGTGACTGGCTTTTCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154705	ATTCTAAAACTCATGCGTGATTTCAGAAGAAACTTGTGACTGGCTTTTCA	154754

AC101661.7	1551	GAATGCAAATCTTCTTTTTAAATGCACTGGAGGTTTTGAAACATAACTCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154755	GAATGCAAATCTTCTTTTTAAATGCACTGGAGGTTTTGAAACATAACTCA	154804

AC101661.7	1601	GTTGTAGTTCAAGTTTTATGGGCAAATGGTTAAAAATGTGGGAGTGGGGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154805	GTTGTAGTTCAAGTTTTATGGGCAAATGGTTAAAAATGTGGGAGTGGGGG	154854

AC101661.7	1651	GAGGAAGGACAAGACCATGTATCCTCCTCCATCTAAGTGACTGTTGATAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154855	GAGGAAGGACAAGACCATGTATCCTCCTCCATCTAAGTGACTGTTGATAA	154904

AC101661.7	1701	GGAAGCTTGCTATAGCTTTCATCTTAGAAATGAGAAAGCAAACTACAAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154905	GGAAGCTTGCTATAGCTTTCATCTTAGAAATGAGAAAGCAAACTACAAAA	154954

AC101661.7	1751	CTGTTTTGCAGTTACAGCCAACCAGGCGAACACAGTGAGAATTTAGATAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	154955	CTGTTTTGCAGTTACAGCCAACCAGGCGAACACAGTGAGAATTTAGATAG	155004

AC101661.7	1801	CCTTTATTCCGACTTTTTTTTTTCCTCACCAAGAGTGAGATGCCTGTCCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	155005	CCTTTATTCCGACTTTTTTTTTTCCTCACCAAGAGTGAGATGCCTGTCCT	155054

AC101661.7	1851	AGCGGCACTTCATAGTGAATAATGTACTCTCTCCTTCATGGAATCAGGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	155055	AGCGGCACTTCATAGTGAATAATGTACTCTCTCCTTCATGGAATCAGGGA	155104

AC101661.7	1901	CTTGTACAAACTGTGAACCACCGAGCAGTAGCCTGGTGCCTGACACTGTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	155105	CTTGTACAAACTGTGAACCACCGAGCAGTAGCCTGGTGCCTGACACTGTG	155154

AC101661.7	1951	ATGACCCCTGAAGAGAAGCTTGCCCTCCGGGTGCCCGGGCCATCTCTGGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662815.13	155155	ATGACCCCTGAAGAGAAGCTTGCCCTCCGGGTGCCCGGGCCATCTCTGGC	155204

Overview

Query
AC101661.7 - 228933 bps
Hit
AL662815.13 - 155204 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link