<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL731657.18	1	GTTGGGGGGGGGTTGGTGAGCAGAGTAGCAGAGATGGTATAGGGGGTTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	186326	GTTGGGGGGGGGTTGGTGAGCAGAGTAGCAGAGATGGTATAGGGGGTTTT	186375

AL731657.18	51	TGGAGGAGAAACCAGGAAAGGAGATAGTATTTGAAATGTAAATGAAGAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	186376	TGGAGGAGAAACCAGGAAAGGAGATAGTATTTGAAATGTAAATGAAGAAA	186425

AL731657.18	101	ATATCGAATAAAAATGTTATAACATTTGAAACAAAATAAATCCTTCCTAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	186426	ATATCGAATAAAAATGTTATAACATTTGAAACAAAATAAATCCTTCCTAA	186475

AL731657.18	151	TATTCTTCTCTCAGCTGTTTGATGCAGACTAGAAAAGTTACTAATGCAGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	186476	TATTCTTCTCTCAGCTGTTTGATGCAGACTAGAAAAGTTACTAATGCAGG	186525

AL731657.18	201	AAGTTCGGGCAGGTATGTAATGTGTCACTGCTGAAATACAGGGTGTCAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	186526	AAGTTCGGGCAGGTATGTAATGTGTCACTGCTGAAATACAGGGTGTCAAA	186575

AL731657.18	251	AGAAGTAGGAAGGAATGGCAGCCTGTTGGAGGTTACCTCTGACCCCAGAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	186576	AGAAGTAGGAAGGAATGGCAGCCTGTTGGAGGTTACCTCTGACCCCAGAA	186625

AL731657.18	301	TCGCTTCTTTCCTGCTGGTTAGCAGAGCAGTCCATTCACTCTGGTCCTTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	186626	TCGCTTCTTTCCTGCTGGTTAGCAGAGCAGTCCATTCACTCTGGTCCTTC	186675

AL731657.18	351	CTTCATCACTTGTTTAGAACTGACTCAGTGTAAGCCGCACACGGGAAGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	186676	CTTCATCACTTGTTTAGAACTGACTCAGTGTAAGCCGCACACGGGAAGTT	186725

AL731657.18	401	AGCAAATGGGAGGAAAACTTAAGAGTTCTGCAGTGGGAATTTTTTGCTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	186726	AGCAAATGGGAGGAAAACTTAAGAGTTCTGCAGTGGGAATTTTTTGCTGA	186775

AL731657.18	451	CAGCCTGCCTCAGGACAGCTCTTGGCATGGGAGGAAGTGTGCATTCTCTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	186776	CAGCCTGCCTCAGGACAGCTCTTGGCATGGGAGGAAGTGTGCATTCTCTC	186825

AL731657.18	501	TCAGGAGTAGCTGGAATCCTTAGGCAAGGAGTACAGGTCACCCCAGGCCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	186826	TCAGGAGTAGCTGGAATCCTTAGGCAAGGAGTACAGGTCACCCCAGGCCA	186875

AL731657.18	551	TTTTCAGTCTCTTAGTTCCCAAATACTCAATTTCCCACTGCTGATAGCAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	186876	TTTTCAGTCTCTTAGTTCCCAAATACTCAATTTCCCACTGCTGATAGCAA	186925

AL731657.18	601	TGAACAATGGAGGTGTTTTGACTGCTAAGACAGCAATATGCCAATGGCAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	186926	TGAACAATGGAGGTGTTTTGACTGCTAAGACAGCAATATGCCAATGGCAT	186975

AL731657.18	651	TGTGAACCTGCAATAAAATGTTTATGGGGCACATAATGAAATCTAACTAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	186976	TGTGAACCTGCAATAAAATGTTTATGGGGCACATAATGAAATCTAACTAT	187025

AL731657.18	701	GCTTAGGCAAAACAGAACTGTGCACCTAAGATACTAAAATCCTTCTAATA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187026	GCTTAGGCAAAACAGAACTGTGCACCTAAGATACTAAAATCCTTCTAATA	187075

AL731657.18	751	GGCTTAGACCTTGGTCAAAACTTGTAAAATATAATGTTTGGCAAGCCAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187076	GGCTTAGACCTTGGTCAAAACTTGTAAAATATAATGTTTGGCAAGCCAAA	187125

AL731657.18	801	AATGTGATAAATGGTTTTTGTTCTTTTGTTTCAGTTTTGGGTTTTACAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187126	AATGTGATAAATGGTTTTTGTTCTTTTGTTTCAGTTTTGGGTTTTACAAA	187175

AL731657.18	851	AATATGTATAAAACCTATCCTCAAACGTGTAAGAATACAAGAGAATAGAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187176	AATATGTATAAAACCTATCCTCAAACGTGTAAGAATACAAGAGAATAGAT	187225

AL731657.18	901	ATGATATAGATAAATGGGTTTTCCTTGGCATCAACATGTGTTTTTAAAGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187226	ATGATATAGATAAATGGGTTTTCCTTGGCATCAACATGTGTTTTTAAAGC	187275

AL731657.18	951	ACACATGTCCTGAACAGACAGCTTAAGCACCTTCAAATAATTCATTAAGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187276	ACACATGTCCTGAACAGACAGCTTAAGCACCTTCAAATAATTCATTAAGC	187325

AL731657.18	1001	TAAACTATACCTTTGAAAAGAACCCATTTTTGTTGGTTTATTCTGATGAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187326	TAAACTATACCTTTGAAAAGAACCCATTTTTGTTGGTTTATTCTGATGAT	187375

AL731657.18	1051	TTTCCATTGCATAGTATTCCCAAGAAGAAAGTATCACACAGTAAGCTCTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187376	TTTCCATTGCATAGTATTCCCAAGAAGAAAGTATCACACAGTAAGCTCTG	187425

AL731657.18	1101	AGGAGGATTGAAAGCCCAGAAGAGTTCTGGGTCTGGCTAAACCTAGAGAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187426	AGGAGGATTGAAAGCCCAGAAGAGTTCTGGGTCTGGCTAAACCTAGAGAC	187475

AL731657.18	1151	AGGTAACATGGCTTAGCCTTAAATCATCCATGGTATCTAATTTTCAAGGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187476	AGGTAACATGGCTTAGCCTTAAATCATCCATGGTATCTAATTTTCAAGGC	187525

AL731657.18	1201	TTTGGGGAAGAATAATATTTTTATCATCCCACTAGGGGCTCCTGCACTCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187526	TTTGGGGAAGAATAATATTTTTATCATCCCACTAGGGGCTCCTGCACTCC	187575

AL731657.18	1251	ACAGATGGTAAGACAAACAACAGATCTGCTGTTATGATCTGTGCTCACAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187576	ACAGATGGTAAGACAAACAACAGATCTGCTGTTATGATCTGTGCTCACAC	187625

AL731657.18	1301	CTGGACTCAAGTTGTTCTTTCCTATGGTCTTTGTTCTGTGCCTCAATGTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187626	CTGGACTCAAGTTGTTCTTTCCTATGGTCTTTGTTCTGTGCCTCAATGTC	187675

AL731657.18	1351	TCAACATGTTAAAAAAAATAATAATGTACCCTATAAAAGGATTCAGATTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187676	TCAACATGTTAAAAAAAATAATAATGTACCCTATAAAAGGATTCAGATTC	187725

AL731657.18	1401	AAAAAACCTACTTCCGACATTGAAACCTTGCTCTGTTTCAACCAGACCAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187726	AAAAAACCTACTTCCGACATTGAAACCTTGCTCTGTTTCAACCAGACCAC	187775

AL731657.18	1451	TTAATGTCAGCCACATTTTACCAGTTTCAGAAGTACCTGAGTTCTGAACT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187776	TTAATGTCAGCCACATTTTACCAGTTTCAGAAGTACCTGAGTTCTGAACT	187825

AL731657.18	1501	CTTGACTTCTGGTTTTGGTTGCTTATCCTCAACCATGTAATTATCCTATC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187826	CTTGACTTCTGGTTTTGGTTGCTTATCCTCAACCATGTAATTATCCTATC	187875

AL731657.18	1551	AGAACAAATCAGGCTCTCTAATAACTGGCTAGTAGACTTCTTTTAGCCAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187876	AGAACAAATCAGGCTCTCTAATAACTGGCTAGTAGACTTCTTTTAGCCAA	187925

AL731657.18	1601	AGGCATCTGTTGTCAATGATAGAAGAGTATACATGTGTCCAGTGCAGTCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187926	AGGCATCTGTTGTCAATGATAGAAGAGTATACATGTGTCCAGTGCAGTCA	187975

AL731657.18	1651	CATAGCTCCATATAAATAAATTGATGTGTAAAGAGAAGCACAAATGTATA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	187976	CATAGCTCCATATAAATAAATTGATGTGTAAAGAGAAGCACAAATGTATA	188025

AL731657.18	1701	AAACATAATGACACACAAGAAGAATGCTTACTGTTACCATTCTGTGATAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	188026	AAACATAATGACACACAAGAAGAATGCTTACTGTTACCATTCTGTGATAA	188075

AL731657.18	1751	GTCCTATATCATGCTACATCACTGGTTTGCTTTCCTATTTCCCTTCCTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	188076	GTCCTATATCATGCTACATCACTGGTTTGCTTTCCTATTTCCCTTCCTTT	188125

AL731657.18	1801	TTTTCTTTCTCTCTTTAGTTAAGTTTTACTGACTTTTATATTACTTTCTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	188126	TTTTCTTTCTCTCTTTAGTTAAGTTTTACTGACTTTTATATTACTTTCTT	188175

AL731657.18	1851	TTTCTAGATATAAATCCTTTTTATATATAACAGAATTTTTAATATACAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	188176	TTTCTAGATATAAATCCTTTTTATATATAACAGAATTTTTAATATACAAG	188225

AL731657.18	1901	TTACTGTTTAATTTTATTTATAAAAGTTCTTATTAAGAAATATTTTTTCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	188226	TTACTGTTTAATTTTATTTATAAAAGTTCTTATTAAGAAATATTTTTTCA	188275

AL731657.18	1951	ATATTCTGTTTTCATTTACATTATATTATATTTGGGGAAATCTAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662807.8	188276	ATATTCTGTTTTCATTTACATTATATTATATTTGGGGAAATCTAGAATTC	188325

Overview

Query
AL731657.18 - 108930 bps
Hit
AL662807.8 - 188325 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link