<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662899.5	1	GAATTCAAGTCCCTGACTTCCTGCCTGGACTCCAAAGCCTTCTTATTGAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	130331	GAATTCAAGTCCCTGACTTCCTGCCTGGACTCCAAAGCCTTCTTATTGAC	130380

AL662899.5	51	TCCTAGGAATCAAGGTAAGGGGTTAAAATCTCATAAAACAGGATTAGGAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	130381	TCCTAGGAATCAAGGTAAGGGGTTAAAATCTCATAAAACAGGATTAGGAC	130430

AL662899.5	101	TCACCAAGTCTTCTGGTGTTACAGGGTGAAAGAGGCTCGTGTGATGTCAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	130431	TCACCAAGTCTTCTGGTGTTACAGGGTGAAAGAGGCTCGTGTGATGTCAC	130480

AL662899.5	151	CAGAGGGATGTGGCTAAGAGCTGTGATGTCACCTGAGGGAGGCAGGATGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	130481	CAGAGGGATGTGGCTAAGAGCTGTGATGTCACCTGAGGGAGGCAGGATGG	130530

AL662899.5	201	GTTCTGGGCTACTCAAAAGAGAGGTTTCTGAGTTTGCACTGGATAAAGGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	130531	GTTCTGGGCTACTCAAAAGAGAGGTTTCTGAGTTTGCACTGGATAAAGGG	130580

AL662899.5	251	GGCAGAGGGTCATACGTGGAGGGAAAAGAGCCTTAGAGACTCCCCTTTGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	130581	GGCAGAGGGTCATACGTGGAGGGAAAAGAGCCTTAGAGACTCCCCTTTGA	130630

AL662899.5	301	CACAGGGAATGAAAGAACACGTTCTCCCCCACCCCATTACTATCAACTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	130631	CACAGGGAATGAAAGAACACGTTCTCCCCCACCCCATTACTATCAACTTT	130680

AL662899.5	351	GCTTTTCTCCCTGGACTTCCCTTCTGTCCTTCTTTTTCCCTCCCCCCATC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	130681	GCTTTTCTCCCTGGACTTCCCTTCTGTCCTTCTTTTTCCCTCCCCCCATC	130730

AL662899.5	401	ACAGAGGCCTGTGAGCTGTCCAATAACTGACCTGTAACTTCATCTAAGTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	130731	ACAGAGGCCTGTGAGCTGTCCAATAACTGACCTGTAACTTCATCTAAGTC	130780

AL662899.5	451	CCCAGATGGGTACAATGGGAGCTGAGTTGTTGGAGGGAGAAGCTGGAGAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	130781	CCCAGATGGGTACAATGGGAGCTGAGTTGTTGGAGGGAGAAGCTGGAGAC	130830

AL662899.5	501	TTCCAGCTCCAGCTCCCACTCAAGATAATAAAGATAATTTTTCAATCCTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	130831	TTCCAGCTCCAGCTCCCACTCAAGATAATAAAGATAATTTTTCAATCCTC	130880

AL662899.5	551	ATCTCATTCTGGGGTTTGTCTCCAGACGTCATTCCCACTCCTCCCATTTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	130881	ATCTCATTCTGGGGTTTGTCTCCAGACGTCATTCCCACTCCTCCCATTTC	130930

AL662899.5	601	AACATTCCCCCTGGATCCTCTACCACCTAAACTCCCAGCTGGACGGTGTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	130931	AACATTCCCCCTGGATCCTCTACCACCTAAACTCCCAGCTGGACGGTGTC	130980

AL662899.5	651	AGTAAGAACAGAGTGGCAGTAACTCTCACTTTGTAGTGGTATATTTAGGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	130981	AGTAAGAACAGAGTGGCAGTAACTCTCACTTTGTAGTGGTATATTTAGGA	131030

AL662899.5	701	TTTGATGTGACACAGTTATTTATTGCTGAGTGAGCAAACCCCTAGCCCCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131031	TTTGATGTGACACAGTTATTTATTGCTGAGTGAGCAAACCCCTAGCCCCC	131080

AL662899.5	751	AAGTGGGGACTACAGGCTTCAGTGCTTCCCCCACACTGCCTGAGCTACCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131081	AAGTGGGGACTACAGGCTTCAGTGCTTCCCCCACACTGCCTGAGCTACCA	131130

AL662899.5	801	GCCCTTCTGCACTGGCCCTCCTGCCAATACTGCCTGCACTGTCCCCACTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131131	GCCCTTCTGCACTGGCCCTCCTGCCAATACTGCCTGCACTGTCCCCACTC	131180

AL662899.5	851	CCTCTGGCTCCCATGATCACCAGATCCGCCCTGCAGGCTCCCTGTCACCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131181	CCTCTGGCTCCCATGATCACCAGATCCGCCCTGCAGGCTCCCTGTCACCT	131230

AL662899.5	901	GTGGGGCCCTATCCAGACCCCCTAATCCACTTGCCTAGCAGCCCCACTCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131231	GTGGGGCCCTATCCAGACCCCCTAATCCACTTGCCTAGCAGCCCCACTCT	131280

AL662899.5	951	TCCCTCGATGGCTCAGATCCTGAGATCCAAGGAACACCCTGGGTTTCCCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131281	TCCCTCGATGGCTCAGATCCTGAGATCCAAGGAACACCCTGGGTTTCCCA	131330

AL662899.5	1001	ACCACTCTCTTACTGCAGAGGTCTGTCTATCCTGCCCTGGTCTCCTCCAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131331	ACCACTCTCTTACTGCAGAGGTCTGTCTATCCTGCCCTGGTCTCCTCCAC	131380

AL662899.5	1051	CCCAGGAGAGTTTTCAAAGGTAGAGAGGACCCTTTGGTCTTTATTCACCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131381	CCCAGGAGAGTTTTCAAAGGTAGAGAGGACCCTTTGGTCTTTATTCACCA	131430

AL662899.5	1101	CCATCATACTTTTTTTTTTTTTTGCTTTTAAAAAGTGGAGGTGGAAAAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131431	CCATCATACTTTTTTTTTTTTTTGCTTTTAAAAAGTGGAGGTGGAAAAAA	131480

AL662899.5	1151	AAAAAAAACTGAAGGTGGGAGAAAAGTAAAAGCAAAAATAACAGCTGGTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131481	AAAAAAAACTGAAGGTGGGAGAAAAGTAAAAGCAAAAATAACAGCTGGTG	131530

AL662899.5	1201	AATCCAAGAGCAGTGCCCTCACTGTCCATAAACACAAACACCCTAAATAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131531	AATCCAAGAGCAGTGCCCTCACTGTCCATAAACACAAACACCCTAAATAG	131580

AL662899.5	1251	TTCTGTTCTCTCCTGTGTATGAAGGGGGGCCCTGCACCCTCGTACTCGGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131581	TTCTGTTCTCTCCTGTGTATGAAGGGGGGCCCTGCACCCTCGTACTCGGG	131630

AL662899.5	1301	TTTCTTCCCCATCCCTGAGGTCCCTATGCTTACAATTTGGGTCATGCCTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131631	TTTCTTCCCCATCCCTGAGGTCCCTATGCTTACAATTTGGGTCATGCCTC	131680

AL662899.5	1351	ACACTTTTCTCCTAAAGCCCACACTCTCTTCACCCTTTGCCCCCACCCCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131681	ACACTTTTCTCCTAAAGCCCACACTCTCTTCACCCTTTGCCCCCACCCCA	131730

AL662899.5	1401	CGGTCACAGCCCCTTTCCCGGGTCTCCCCTCTGCTCCTCACCTTCCCTCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131731	CGGTCACAGCCCCTTTCCCGGGTCTCCCCTCTGCTCCTCACCTTCCCTCT	131780

AL662899.5	1451	CCAACCCCTCACTCTCCCAGTCAGTGGCCGCCTCATCCCCATTGGGCTCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131781	CCAACCCCTCACTCTCCCAGTCAGTGGCCGCCTCATCCCCATTGGGCTCC	131830

AL662899.5	1501	CGGAGGCTGACAGCCAGCACCAAGGCCTGCAGGAGACCAAAGAGGCAGGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131831	CGGAGGCTGACAGCCAGCACCAAGGCCTGCAGGAGACCAAAGAGGCAGGC	131880

AL662899.5	1551	GAAGTGCAAAGGGTGGGCAGTAAGTAGGCTCAGAACAGCATGGAGCCCAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131881	GAAGTGCAAAGGGTGGGCAGTAAGTAGGCTCAGAACAGCATGGAGCCCAT	131930

AL662899.5	1601	GCAGGGCAGCCAGGAAGGACAGTAGGCCATGTAGCCAGAGGCCCAGCGGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131931	GCAGGGCAGCCAGGAAGGACAGTAGGCCATGTAGCCAGAGGCCCAGCGGT	131980

AL662899.5	1651	CCACGCAGGCCCAGTGTGTCCAAGGCTGCCCGCAGTGGTCGTGAGCACAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	131981	CCACGCAGGCCCAGTGTGTCCAAGGCTGCCCGCAGTGGTCGTGAGCACAG	132030

AL662899.5	1701	GGCCAGCAGGGCAGAGGCCAGCAGCTCCAGAAGATGCAGGGTCAGGTTGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	132031	GGCCAGCAGGGCAGAGGCCAGCAGCTCCAGAAGATGCAGGGTCAGGTTGG	132080

AL662899.5	1751	TGGAGATCTGCAGACACTCTTCTGGGCCCCCCAAGTACCGGGAGGGAGCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	132081	TGGAGATCTGCAGACACTCTTCTGGGCCCCCCAAGTACCGGGAGGGAGCT	132130

AL662899.5	1801	CCTGGTTCCCCCCGCAGCCAGCCCAACAGCTTCTCACGCCTACCAGGTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	132131	CCTGGTTCCCCCCGCAGCCAGCCCAACAGCTTCTCACGCCTACCAGGTTT	132180

AL662899.5	1851	CTCCAATGGGGCTCCTGGCCCAGGGACGCTCAGTCCCCCTTCAGGGGACA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	132181	CTCCAATGGGGCTCCTGGCCCAGGGACGCTCAGTCCCCCTTCAGGGGACA	132230

AL662899.5	1901	CCCCTGGTCTCCTGGTGCCACCTGAATCCACATGATCCCATCTGAGTTTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	132231	CCCCTGGTCTCCTGGTGCCACCTGAATCCACATGATCCCATCTGAGTTTG	132280

AL662899.5	1951	GGACTGGCCCCTCCAGCCTCCAGTCTCCCAGACTCTTGAGTGCTAGAGAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662801.7	132281	GGACTGGCCCCTCCAGCCTCCAGTCTCCCAGACTCTTGAGTGCTAGAGAT	132330

Overview

Query
AL662899.5 - 136493 bps
Hit
AL662801.7 - 132330 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link