<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662798.4	1	GTATTTATGTCACATAAAACAGTTTGCTCGGCTGGGCGCGGTGGCCCACG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149229	GTATTTATGTCACATAAAACAGTTTGCTCGGCTGGGCGCGGTGGCCCACG	149278

AL662798.4	51	CCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCAGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149279	CCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCAGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCA	149328

AL662798.4	101	AGAGATGAAAACCATCCTGGCTAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149329	AGAGATGAAAACCATCCTGGCTAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAA	149378

AL662798.4	151	AATACAAAAACTAGCTGGGCATGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149379	AATACAAAAACTAGCTGGGCATGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTAC	149428

AL662798.4	201	TCAGGAGGCTGAGGCAGGAAAATCACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149429	TCAGGAGGCTGAGGCAGGAAAATCACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGC	149478

AL662798.4	251	AGTGAGCTGAGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGCGAGAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149479	AGTGAGCTGAGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGCGAGAC	149528

AL662798.4	301	TCCATCTCAAAATAAATAATAAAATAAAATGGTTTCCTCCTGTTTTCAGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149529	TCCATCTCAAAATAAATAATAAAATAAAATGGTTTCCTCCTGTTTTCAGT	149578

AL662798.4	351	AGAGATGGAGATGAATCCATCCCTTTTTTCCTATAGTAATTCCATCCATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149579	AGAGATGGAGATGAATCCATCCCTTTTTTCCTATAGTAATTCCATCCATT	149628

AL662798.4	401	CTGTCAGGAGGAATAGGTATTGGAAGCCTGTTGAGCATCCAGGGGATCAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149629	CTGTCAGGAGGAATAGGTATTGGAAGCCTGTTGAGCATCCAGGGGATCAA	149678

AL662798.4	451	GGGGTGTTAGACAAGTGGATTCTTATCTTTCTCCCTTCTGTTCTTTCTCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149679	GGGGTGTTAGACAAGTGGATTCTTATCTTTCTCCCTTCTGTTCTTTCTCC	149728

AL662798.4	501	TTAGGACCAGCTTTATCCAGGGACTCTACCATTCCCACCCCTTTGGCCCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149729	TTAGGACCAGCTTTATCCAGGGACTCTACCATTCCCACCCCTTTGGCCCC	149778

AL662798.4	551	ACTCCACGACAACCACTTCCCCATCTTCTCCTCTATTCTGGTCTCCCCTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149779	ACTCCACGACAACCACTTCCCCATCTTCTCCTCTATTCTGGTCTCCCCTG	149828

AL662798.4	601	CCCCCACGCCTTCCCACCCAGCGTCTTCCCCAGGTTCCCCCACTACCTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149829	CCCCCACGCCTTCCCACCCAGCGTCTTCCCCAGGTTCCCCCACTACCTCT	149878

AL662798.4	651	CCCTCAGATCCAGGCCCTCAGCTCAGCATGGGTGGTTCTCCCTCCAGGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149879	CCCTCAGATCCAGGCCCTCAGCTCAGCATGGGTGGTTCTCCCTCCAGGAA	149928

AL662798.4	701	AGGGGGAGGAGGGACCAGGACCTGAGTTGCATAGCGGCTGCCTGGATGGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149929	AGGGGGAGGAGGGACCAGGACCTGAGTTGCATAGCGGCTGCCTGGATGGG	149978

AL662798.4	751	CTTAGAAGCCTTTTTGAGGGACCTCCCTGCCCCTATCCTGGGGCTTGGAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	149979	CTTAGAAGCCTTTTTGAGGGACCTCCCTGCCCCTATCCTGGGGCTTGGAT	150028

AL662798.4	801	ACCTTTCCAAGTCCCTGGAACTGCCCACCCTTCCCCTGCCACCCCGTCAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150029	ACCTTTCCAAGTCCCTGGAACTGCCCACCCTTCCCCTGCCACCCCGTCAG	150078

AL662798.4	851	GAGATCCTAGTATGGAGGAACATCTGTCTGTCATGTATGAGAGACTGAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150079	GAGATCCTAGTATGGAGGAACATCTGTCTGTCATGTATGAGAGACTGAGA	150128

AL662798.4	901	CAAGAGGTAAGTCAGTGCAAAAGTGGCCTTCGTCTACAGTGGGAAGGATG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150129	CAAGAGGTAAGTCAGTGCAAAAGTGGCCTTCGTCTACAGTGGGAAGGATG	150178

AL662798.4	951	TGGGTAATCCTTGGACGTACAGGGATAGTCAACTGGATTCTTTTTTGGAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150179	TGGGTAATCCTTGGACGTACAGGGATAGTCAACTGGATTCTTTTTTGGAA	150228

AL662798.4	1001	CCATGAGGCAGGCATAGAAATATATTATAAACATTTTCCTGAGAAAATGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150229	CCATGAGGCAGGCATAGAAATATATTATAAACATTTTCCTGAGAAAATGA	150278

AL662798.4	1051	TGTTCCAGCCAGGCACGGTGGCTCAAAGTGCTGTAATCCCAGCACTTTGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150279	TGTTCCAGCCAGGCACGGTGGCTCAAAGTGCTGTAATCCCAGCACTTTGG	150328

AL662798.4	1101	GAGGCTTAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150329	GAGGCTTAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTG	150378

AL662798.4	1151	GCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAACACAAAAATCAGCCAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150379	GCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAACACAAAAATCAGCCAGG	150428

AL662798.4	1201	CATGGTGGCAGACGCCTATAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150429	CATGGTGGCAGACGCCTATAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGA	150478

AL662798.4	1251	GAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGCAGTGAAAGGAGATATCTCCATTGTAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150479	GAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGCAGTGAAAGGAGATATCTCCATTGTAC	150528

AL662798.4	1301	TCCAGCCTAGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150529	TCCAGCCTAGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAA	150578

AL662798.4	1351	AGAAAATGATGTTCCTCATTTTGGGTTAAGGGAGGTTAATCATGGGATGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150579	AGAAAATGATGTTCCTCATTTTGGGTTAAGGGAGGTTAATCATGGGATGA	150628

AL662798.4	1401	GATCTTTCACTCCAAGATGGGAGTAAGGAGGCCTTAAAAATAGAAAACTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150629	GATCTTTCACTCCAAGATGGGAGTAAGGAGGCCTTAAAAATAGAAAACTG	150678

AL662798.4	1451	GGCCTGGCACATGGCTCACGCTTATAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150679	GGCCTGGCACATGGCTCACGCTTATAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAG	150728

AL662798.4	1501	GCAGGCGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150729	GCAGGCGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGT	150778

AL662798.4	1551	GAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150779	GAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGG	150828

AL662798.4	1601	GTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150829	GTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGA	150878

AL662798.4	1651	ACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTACCTCTGCACTCCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150879	ACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTACCTCTGCACTCCA	150928

AL662798.4	1701	GCCTGGGCGACAGAGCTAGACTCCATCTCAAGCCTGTAATCCCAGCTACT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150929	GCCTGGGCGACAGAGCTAGACTCCATCTCAAGCCTGTAATCCCAGCTACT	150978

AL662798.4	1751	CGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGCGGAGGTTGCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	150979	CGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGCGGAGGTTGCA	151028

AL662798.4	1801	GTGAGCTGAGATTGTACCTCTGTACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCTAGAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	151029	GTGAGCTGAGATTGTACCTCTGTACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCTAGAC	151078

AL662798.4	1851	TCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATTAGAAAACTGAAAAATAGGATTATCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	151079	TCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATTAGAAAACTGAAAAATAGGATTATCT	151128

AL662798.4	1901	TTTCTTTCCCACTGGGTTGATGCCATCTTCTTCCACCTAGCTTCCCAAGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	151129	TTTCTTTCCCACTGGGTTGATGCCATCTTCTTCCACCTAGCTTCCCAAGC	151178

AL662798.4	1951	TCTTCCTTCAGTCCCACGACTACAGTCTGTATTCCTTGGATGTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662800.4	151179	TCTTCCTTCAGTCCCACGACTACAGTCTGTATTCCTTGGATGTGGAATTC	151228

Overview

Query
AL662798.4 - 29862 bps
Hit
AL662800.4 - 151228 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link