<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL845554.2	1	GACTTGTGGAACTTTGAACTTGAGAGAGATGATTTAGGGTATCTGGCAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128103	GACTTGTGGAACTTTGAACTTGAGAGAGATGATTTAGGGTATCTGGCAGA	128152

AL845554.2	51	AGATATTTCTAAGCAGCAAAGCATTCAAGAGGTTACTTGCGTGCTGTTAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128153	AGATATTTCTAAGCAGCAAAGCATTCAAGAGGTTACTTGCGTGCTGTTAA	128202

AL845554.2	101	AGCCATTCAGTTTTATAAGGGAAGCAGAGCATAAATGTTTGGAAAATTTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128203	AGCCATTCAGTTTTATAAGGGAAGCAGAGCATAAATGTTTGGAAAATTTG	128252

AL845554.2	151	CAGCCTGACAATGCAATAGAAAAGAAAATCCAATTTTCTGAGGATAAATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128253	CAGCCTGACAATGCAATAGAAAAGAAAATCCAATTTTCTGAGGATAAATT	128302

AL845554.2	201	CAAGCTGGCTGCAGAAATTTCATGGGTAACGAGGAGCTGAATGTTAATTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128303	CAAGCTGGCTGCAGAAATTTCATGGGTAACGAGGAGCTGAATGTTAATTA	128352

AL845554.2	251	TTAAGACAATGGGGAAAATGTCTCCAAGGCATGTCAGAGGTTTTTTTTTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128353	TTAAGACAATGGGGAAAATGTCTCCAAGGCATGTCAGAGGTTTTTTTTTT	128402

AL845554.2	301	TTTTTTCCAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128403	TTTTTTCCAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGA	128452

AL845554.2	351	TCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTGCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128453	TCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTGCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCC	128502

AL845554.2	401	TCAGCCTTCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATCCGCCACCACACCTGGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128503	TCAGCCTTCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATCCGCCACCACACCTGGCT	128552

AL845554.2	451	AATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128553	AATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGAT	128602

AL845554.2	501	AGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128603	AGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTG	128652

AL845554.2	551	CTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCATGTCAGAGGTCTTGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128653	CTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCATGTCAGAGGTCTTGA	128702

AL845554.2	601	TGGCAGCCCTGCCCATCACAGGCCTGGAGGCCTAGGAGGAAAGAATGGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128703	TGGCAGCCCTGCCCATCACAGGCCTGGAGGCCTAGGAGGAAAGAATGGTT	128752

AL845554.2	651	TCTTGGGCTGGGCCCAGTGTCCCCGTGCTGTATGCGGTCTTTGGACTTGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128753	TCTTGGGCTGGGCCCAGTGTCCCCGTGCTGTATGCGGTCTTTGGACTTGG	128802

AL845554.2	701	TGCCCTGTGTCTCAGCCACTCCAGCTGTGACTAAAAGGGGCCAACATAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128803	TGCCCTGTGTCTCAGCCACTCCAGCTGTGACTAAAAGGGGCCAACATAGA	128852

AL845554.2	751	GCTCAGGCCACGGCTTCAGAGGATGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128853	GCTCAGGCCACGGCTTCAGAGGATGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCC	128902

AL845554.2	801	ATGTGGTGTTGAGCCTACGTGTACACAGAAGTCAAGAGTTGAGGTTTGGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128903	ATGTGGTGTTGAGCCTACGTGTACACAGAAGTCAAGAGTTGAGGTTTGGG	128952

AL845554.2	851	AACCTCCACCTAGATTTCAGAGGATGTATGGAAATGCCTGGATGTCCAGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	128953	AACCTCCACCTAGATTTCAGAGGATGTATGGAAATGCCTGGATGTCCAGG	129002

AL845554.2	901	CAGAAGTTTGCTGCCTGGGCAGGGCACTCATGTGGAACCTCTGCTAGGGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129003	CAGAAGTTTGCTGCCTGGGCAGGGCACTCATGTGGAACCTCTGCTAGGGC	129052

AL845554.2	951	AGTGCAGAAGGGAAATGTGGAGTGGGCACCCTCACACAGAGTTCTCAATG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129053	AGTGCAGAAGGGAAATGTGGAGTGGGCACCCTCACACAGAGTTCTCAATG	129102

AL845554.2	1001	GGGCAGTGCCTAGTGGAGTTTTGAAAAGAGGAACACCATCCTCCAGACTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129103	GGGCAGTGCCTAGTGGAGTTTTGAAAAGAGGAACACCATCCTCCAGACTC	129152

AL845554.2	1051	CAGAGTGATGGATCCACTGACAGCTTGCATCATGCACTGGAAAAGCTGCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129153	CAGAGTGATGGATCCACTGACAGCTTGCATCATGCACTGGAAAAGCTGCA	129202

AL845554.2	1101	GACACTCAATGCCAGCCCATGAAAGCAGCTTGGAGGGAGGCTATATCCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129203	GACACTCAATGCCAGCCCATGAAAGCAGCTTGGAGGGAGGCTATATCCTG	129252

AL845554.2	1151	CAAAGCCACAGGGGCGGAGCTGCTCAAGACCAGGGGAACCCACCTCTTGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129253	CAAAGCCACAGGGGCGGAGCTGCTCAAGACCAGGGGAACCCACCTCTTGT	129302

AL845554.2	1201	ATCAGTGTGACCTGGATGTGAGATATGGAATCAAAGGAGGTCATTTTTTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129303	ATCAGTGTGACCTGGATGTGAGATATGGAATCAAAGGAGGTCATTTTTTG	129352

AL845554.2	1251	GAGTTTAAGATTTAAGTGCTCTGCTGGATTTCAGAGTTGCATGGAGCCTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129353	GAGTTTAAGATTTAAGTGCTCTGCTGGATTTCAGAGTTGCATGGAGCCTT	129402

AL845554.2	1301	TAAGTCCCTTCATTTTGGCCAGTTTCTTCCATTTGGAATGGGTACATTTA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129403	TAAGTCCCTTCATTTTGGCCAGTTTCTTCCATTTGGAATGGGTACATTTA	129452

AL845554.2	1351	TTCAATGCCTGTACCCTCATTGTGTCTAAGAAGTAACTAGCTTGCTTTTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129453	TTCAATGCCTGTACCCTCATTGTGTCTAAGAAGTAACTAGCTTGCTTTTG	129502

AL845554.2	1401	ATTTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGACTTGCCTTGTCTCAGATGAGAAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129503	ATTTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGACTTGCCTTGTCTCAGATGAGAAT	129552

AL845554.2	1451	TTGGACTGTGGATTTTGAGTTAATGTAGAAATAAGACTTTGGGGTACTCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129553	TTGGACTGTGGATTTTGAGTTAATGTAGAAATAAGACTTTGGGGTACTCT	129602

AL845554.2	1501	TGAGAAGGCATGATTGGTTTGAAATATGAGGGCATGAGATTTGGGAGGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129603	TGAGAAGGCATGATTGGTTTGAAATATGAGGGCATGAGATTTGGGAGGGG	129652

AL845554.2	1551	CCGGTGGTGGAATGATATGGTTTGGCCCTGTCCCCACCCAAATCTCACCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129653	CCGGTGGTGGAATGATATGGTTTGGCCCTGTCCCCACCCAAATCTCACCT	129702

AL845554.2	1601	TGAATTGTAGGTCCCGTAATACCCACATGTTGTGGGAGGGACCTGGTGGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129703	TGAATTGTAGGTCCCGTAATACCCACATGTTGTGGGAGGGACCTGGTGGG	129752

AL845554.2	1651	AGGTAATTTAATCATGGGGTAGGTCTTTCCCGTACTATTCTTGTGATAGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129753	AGGTAATTTAATCATGGGGTAGGTCTTTCCCGTACTATTCTTGTGATAGT	129802

AL845554.2	1701	GAATAAGTCTCATGAGATTTGATGGTTTTATGAAGGGGAGTTTCCCTGCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129803	GAATAAGTCTCATGAGATTTGATGGTTTTATGAAGGGGAGTTTCCCTGCA	129852

AL845554.2	1751	CAAGTCCTCTTCTCTTGTCTGCTGCCATGTGAGATGTGCTTTTCACCTTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129853	CAAGTCCTCTTCTCTTGTCTGCTGCCATGTGAGATGTGCTTTTCACCTTC	129902

AL845554.2	1801	CACCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGCGAGTCCATTAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129903	CACCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGCGAGTCCATTAA	129952

AL845554.2	1851	ACCTCCTTCTTTTGTAAATTGCCCAATCTCAAGTATGCCTTTATTAGCAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	129953	ACCTCCTTCTTTTGTAAATTGCCCAATCTCAAGTATGCCTTTATTAGCAG	130002

AL845554.2	1901	CATGATAATGGACTAATATAAATGAATATATATTTAAGAAATGGATAAAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	130003	CATGATAATGGACTAATATAAATGAATATATATTTAAGAAATGGATAAAT	130052

AL845554.2	1951	TCCTGGACACATACACCCTCTCAAGACTGAACCAGGAAGAAACTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662796.6	130053	TCCTGGACACATACACCCTCTCAAGACTGAACCAGGAAGAAACTGAATTC	130102

Overview

Query
AL845554.2 - 15327 bps
Hit
AL662796.6 - 130102 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link