<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
AL845554.2 1 GACTTGTGGAACTTTGAACTTGAGAGAGATGATTTAGGGTATCTGGCAGA 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128103 GACTTGTGGAACTTTGAACTTGAGAGAGATGATTTAGGGTATCTGGCAGA 128152 AL845554.2 51 AGATATTTCTAAGCAGCAAAGCATTCAAGAGGTTACTTGCGTGCTGTTAA 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128153 AGATATTTCTAAGCAGCAAAGCATTCAAGAGGTTACTTGCGTGCTGTTAA 128202 AL845554.2 101 AGCCATTCAGTTTTATAAGGGAAGCAGAGCATAAATGTTTGGAAAATTTG 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128203 AGCCATTCAGTTTTATAAGGGAAGCAGAGCATAAATGTTTGGAAAATTTG 128252 AL845554.2 151 CAGCCTGACAATGCAATAGAAAAGAAAATCCAATTTTCTGAGGATAAATT 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128253 CAGCCTGACAATGCAATAGAAAAGAAAATCCAATTTTCTGAGGATAAATT 128302 AL845554.2 201 CAAGCTGGCTGCAGAAATTTCATGGGTAACGAGGAGCTGAATGTTAATTA 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128303 CAAGCTGGCTGCAGAAATTTCATGGGTAACGAGGAGCTGAATGTTAATTA 128352 AL845554.2 251 TTAAGACAATGGGGAAAATGTCTCCAAGGCATGTCAGAGGTTTTTTTTTT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128353 TTAAGACAATGGGGAAAATGTCTCCAAGGCATGTCAGAGGTTTTTTTTTT 128402 AL845554.2 301 TTTTTTCCAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128403 TTTTTTCCAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGA 128452 AL845554.2 351 TCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTGCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCC 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128453 TCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTGCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCC 128502 AL845554.2 401 TCAGCCTTCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATCCGCCACCACACCTGGCT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128503 TCAGCCTTCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATCCGCCACCACACCTGGCT 128552 AL845554.2 451 AATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGAT 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128553 AATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGAT 128602 AL845554.2 501 AGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128603 AGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTG 128652 AL845554.2 551 CTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCATGTCAGAGGTCTTGA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128653 CTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCATGTCAGAGGTCTTGA 128702 AL845554.2 601 TGGCAGCCCTGCCCATCACAGGCCTGGAGGCCTAGGAGGAAAGAATGGTT 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128703 TGGCAGCCCTGCCCATCACAGGCCTGGAGGCCTAGGAGGAAAGAATGGTT 128752 AL845554.2 651 TCTTGGGCTGGGCCCAGTGTCCCCGTGCTGTATGCGGTCTTTGGACTTGG 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128753 TCTTGGGCTGGGCCCAGTGTCCCCGTGCTGTATGCGGTCTTTGGACTTGG 128802 AL845554.2 701 TGCCCTGTGTCTCAGCCACTCCAGCTGTGACTAAAAGGGGCCAACATAGA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128803 TGCCCTGTGTCTCAGCCACTCCAGCTGTGACTAAAAGGGGCCAACATAGA 128852 AL845554.2 751 GCTCAGGCCACGGCTTCAGAGGATGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCC 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128853 GCTCAGGCCACGGCTTCAGAGGATGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCC 128902 AL845554.2 801 ATGTGGTGTTGAGCCTACGTGTACACAGAAGTCAAGAGTTGAGGTTTGGG 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128903 ATGTGGTGTTGAGCCTACGTGTACACAGAAGTCAAGAGTTGAGGTTTGGG 128952 AL845554.2 851 AACCTCCACCTAGATTTCAGAGGATGTATGGAAATGCCTGGATGTCCAGG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 128953 AACCTCCACCTAGATTTCAGAGGATGTATGGAAATGCCTGGATGTCCAGG 129002 AL845554.2 901 CAGAAGTTTGCTGCCTGGGCAGGGCACTCATGTGGAACCTCTGCTAGGGC 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129003 CAGAAGTTTGCTGCCTGGGCAGGGCACTCATGTGGAACCTCTGCTAGGGC 129052 AL845554.2 951 AGTGCAGAAGGGAAATGTGGAGTGGGCACCCTCACACAGAGTTCTCAATG 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129053 AGTGCAGAAGGGAAATGTGGAGTGGGCACCCTCACACAGAGTTCTCAATG 129102 AL845554.2 1001 GGGCAGTGCCTAGTGGAGTTTTGAAAAGAGGAACACCATCCTCCAGACTC 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129103 GGGCAGTGCCTAGTGGAGTTTTGAAAAGAGGAACACCATCCTCCAGACTC 129152 AL845554.2 1051 CAGAGTGATGGATCCACTGACAGCTTGCATCATGCACTGGAAAAGCTGCA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129153 CAGAGTGATGGATCCACTGACAGCTTGCATCATGCACTGGAAAAGCTGCA 129202 AL845554.2 1101 GACACTCAATGCCAGCCCATGAAAGCAGCTTGGAGGGAGGCTATATCCTG 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129203 GACACTCAATGCCAGCCCATGAAAGCAGCTTGGAGGGAGGCTATATCCTG 129252 AL845554.2 1151 CAAAGCCACAGGGGCGGAGCTGCTCAAGACCAGGGGAACCCACCTCTTGT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129253 CAAAGCCACAGGGGCGGAGCTGCTCAAGACCAGGGGAACCCACCTCTTGT 129302 AL845554.2 1201 ATCAGTGTGACCTGGATGTGAGATATGGAATCAAAGGAGGTCATTTTTTG 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129303 ATCAGTGTGACCTGGATGTGAGATATGGAATCAAAGGAGGTCATTTTTTG 129352 AL845554.2 1251 GAGTTTAAGATTTAAGTGCTCTGCTGGATTTCAGAGTTGCATGGAGCCTT 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129353 GAGTTTAAGATTTAAGTGCTCTGCTGGATTTCAGAGTTGCATGGAGCCTT 129402 AL845554.2 1301 TAAGTCCCTTCATTTTGGCCAGTTTCTTCCATTTGGAATGGGTACATTTA 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129403 TAAGTCCCTTCATTTTGGCCAGTTTCTTCCATTTGGAATGGGTACATTTA 129452 AL845554.2 1351 TTCAATGCCTGTACCCTCATTGTGTCTAAGAAGTAACTAGCTTGCTTTTG 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129453 TTCAATGCCTGTACCCTCATTGTGTCTAAGAAGTAACTAGCTTGCTTTTG 129502 AL845554.2 1401 ATTTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGACTTGCCTTGTCTCAGATGAGAAT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129503 ATTTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGACTTGCCTTGTCTCAGATGAGAAT 129552 AL845554.2 1451 TTGGACTGTGGATTTTGAGTTAATGTAGAAATAAGACTTTGGGGTACTCT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129553 TTGGACTGTGGATTTTGAGTTAATGTAGAAATAAGACTTTGGGGTACTCT 129602 AL845554.2 1501 TGAGAAGGCATGATTGGTTTGAAATATGAGGGCATGAGATTTGGGAGGGG 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129603 TGAGAAGGCATGATTGGTTTGAAATATGAGGGCATGAGATTTGGGAGGGG 129652 AL845554.2 1551 CCGGTGGTGGAATGATATGGTTTGGCCCTGTCCCCACCCAAATCTCACCT 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129653 CCGGTGGTGGAATGATATGGTTTGGCCCTGTCCCCACCCAAATCTCACCT 129702 AL845554.2 1601 TGAATTGTAGGTCCCGTAATACCCACATGTTGTGGGAGGGACCTGGTGGG 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129703 TGAATTGTAGGTCCCGTAATACCCACATGTTGTGGGAGGGACCTGGTGGG 129752 AL845554.2 1651 AGGTAATTTAATCATGGGGTAGGTCTTTCCCGTACTATTCTTGTGATAGT 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129753 AGGTAATTTAATCATGGGGTAGGTCTTTCCCGTACTATTCTTGTGATAGT 129802 AL845554.2 1701 GAATAAGTCTCATGAGATTTGATGGTTTTATGAAGGGGAGTTTCCCTGCA 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129803 GAATAAGTCTCATGAGATTTGATGGTTTTATGAAGGGGAGTTTCCCTGCA 129852 AL845554.2 1751 CAAGTCCTCTTCTCTTGTCTGCTGCCATGTGAGATGTGCTTTTCACCTTC 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129853 CAAGTCCTCTTCTCTTGTCTGCTGCCATGTGAGATGTGCTTTTCACCTTC 129902 AL845554.2 1801 CACCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGCGAGTCCATTAA 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129903 CACCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGCGAGTCCATTAA 129952 AL845554.2 1851 ACCTCCTTCTTTTGTAAATTGCCCAATCTCAAGTATGCCTTTATTAGCAG 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 129953 ACCTCCTTCTTTTGTAAATTGCCCAATCTCAAGTATGCCTTTATTAGCAG 130002 AL845554.2 1901 CATGATAATGGACTAATATAAATGAATATATATTTAAGAAATGGATAAAT 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 130003 CATGATAATGGACTAATATAAATGAATATATATTTAAGAAATGGATAAAT 130052 AL845554.2 1951 TCCTGGACACATACACCCTCTCAAGACTGAACCAGGAAGAAACTGAATTC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL662796.6 130053 TCCTGGACACATACACCCTCTCAAGACTGAACCAGGAAGAAACTGAATTC 130102
