<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662795.5	1	GAATTCAGTTGCTGGAGGTAGAGGGGTGAGGGATGGAAAAAGAATGACAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	60457	GAATTCAGTTGCTGGAGGTAGAGGGGTGAGGGATGGAAAAAGAATGACAA	60506

AL662795.5	51	ATTTCAATTCCTAGAATCATGTTCTGAGACTAGAACTTTATCTAGTACAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	60507	ATTTCAATTCCTAGAATCATGTTCTGAGACTAGAACTTTATCTAGTACAT	60556

AL662795.5	101	TGCAGGCACCTGGGTTTGGTTGAGTGTATAATAAATGACATAGTTCAACT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	60557	TGCAGGCACCTGGGTTTGGTTGAGTGTATAATAAATGACATAGTTCAACT	60606

AL662795.5	151	TATTCCCTTGACAGTTTGTTTTGGGGTCCAGCTTTTGTCTACCCCAGTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	60607	TATTCCCTTGACAGTTTGTTTTGGGGTCCAGCTTTTGTCTACCCCAGTTT	60656

AL662795.5	201	TCACACACAGATACGTGGAGAAGCATTGTGTGATGGTAAAATGTTTACTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	60657	TCACACACAGATACGTGGAGAAGCATTGTGTGATGGTAAAATGTTTACTT	60706

AL662795.5	251	GAAAGCCTTTTTCCCTATCTTTGTCTCTTGCTAGGATTAAAAACCCGTAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	60707	GAAAGCCTTTTTCCCTATCTTTGTCTCTTGCTAGGATTAAAAACCCGTAT	60756

AL662795.5	301	CTGTAAGACATCAGAGGATCCATGTATACACTGACATTTTATATAAATTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	60757	CTGTAAGACATCAGAGGATCCATGTATACACTGACATTTTATATAAATTT	60806

AL662795.5	351	TTAATATTTTGTTCTATCTGCACATGCTCCTAGGGAGAGTTATCTATACA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	60807	TTAATATTTTGTTCTATCTGCACATGCTCCTAGGGAGAGTTATCTATACA	60856

AL662795.5	401	TTCACCAGTTTTAATGTGACTGCTCACAGAAGCCTAAAAAACCATCCTAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	60857	TTCACCAGTTTTAATGTGACTGCTCACAGAAGCCTAAAAAACCATCCTAA	60906

AL662795.5	451	TTTAGATGCCATTTTACTCAAACTATTGTATGAACAGCTGATAACCATAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	60907	TTTAGATGCCATTTTACTCAAACTATTGTATGAACAGCTGATAACCATAC	60956

AL662795.5	501	TGTTTTTAGAAGACCCAGTGACATGGTATAAATGCTCATCTTTTGCTTGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	60957	TGTTTTTAGAAGACCCAGTGACATGGTATAAATGCTCATCTTTTGCTTGA	61006

AL662795.5	551	CTGTTACTAGTCTGGGATGAGATAAAGTAGAGGTTTACTTGCATAGTTCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61007	CTGTTACTAGTCTGGGATGAGATAAAGTAGAGGTTTACTTGCATAGTTCA	61056

AL662795.5	601	CTCACAATTTCTATATGTATAGTATTGTGGGCTGCTAACAAACAGTCCAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61057	CTCACAATTTCTATATGTATAGTATTGTGGGCTGCTAACAAACAGTCCAC	61106

AL662795.5	651	AGACCAGTGCTAGCCCACAGACTGCACTTTGAGAGTAGCATTGGTCTAGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61107	AGACCAGTGCTAGCCCACAGACTGCACTTTGAGAGTAGCATTGGTCTAGA	61156

AL662795.5	701	TGTACTTGTATTCCAGCATCTACCTCGGTGTCAGATTAATGGCAGGAATT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61157	TGTACTTGTATTCCAGCATCTACCTCGGTGTCAGATTAATGGCAGGAATT	61206

AL662795.5	751	AATCAGTAGCGAATGGGGATTCCATTTCCGGTAATAGGGTGAACTAGGTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61207	AATCAGTAGCGAATGGGGATTCCATTTCCGGTAATAGGGTGAACTAGGTT	61256

AL662795.5	801	TTAAAGCTGCCTCTTCTACCAAAAACAACTAAAAAAGAGATGAAATGTGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61257	TTAAAGCTGCCTCTTCTACCAAAAACAACTAAAAAAGAGATGAAATGTGA	61306

AL662795.5	851	AAATCACCCAAAAGTATAGAAATATAAAAAAGGGAATAATCTTTTTGGTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61307	AAATCACCCAAAAGTATAGAAATATAAAAAAGGGAATAATCTTTTTGGTC	61356

AL662795.5	901	AAAATATAAATGTGGGCAGGATTTAGAAAAAGGGAAGTTGCTTTTATCTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61357	AAAATATAAATGTGGGCAGGATTTAGAAAAAGGGAAGTTGCTTTTATCTT	61406

AL662795.5	951	GAGGGCGTTTGCCAAATCTGGAAAAATCTTAGCTTTGGTTTTCTCAGCTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61407	GAGGGCGTTTGCCAAATCTGGAAAAATCTTAGCTTTGGTTTTCTCAGCTT	61456

AL662795.5	1001	CATATGGTATAGTGCAAAGGAGGTAATTCTCAGAACTTGTTTGTATAGGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61457	CATATGGTATAGTGCAAAGGAGGTAATTCTCAGAACTTGTTTGTATAGGG	61506

AL662795.5	1051	AGTATAAGAGGAGACACTTTTGTGTACCCCATGAAATATGGGAAACAAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61507	AGTATAAGAGGAGACACTTTTGTGTACCCCATGAAATATGGGAAACAAAA	61556

AL662795.5	1101	GATGTGTTTCCTCAGAGTAAGAAAAGAAAATCTGTTTCATCCCCCAGCAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61557	GATGTGTTTCCTCAGAGTAAGAAAAGAAAATCTGTTTCATCCCCCAGCAC	61606

AL662795.5	1151	AAGAGTATTCTAAAGAAATTTGCCTTTGAGTCAGCAAAACCTGTTTTTGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61607	AAGAGTATTCTAAAGAAATTTGCCTTTGAGTCAGCAAAACCTGTTTTTGA	61656

AL662795.5	1201	GAATTTACAACCACCAGCCAGCACTCCTGCAGATTTGTTGCCCAAACTAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61657	GAATTTACAACCACCAGCCAGCACTCCTGCAGATTTGTTGCCCAAACTAG	61706

AL662795.5	1251	CTTTACCGTTTTGGGCCAAAATAACCTCAAAGCATGATTTTGATTAATAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61707	CTTTACCGTTTTGGGCCAAAATAACCTCAAAGCATGATTTTGATTAATAA	61756

AL662795.5	1301	TTGTCCTGGATTAGCGATGATCCAAAAATTGGAAGAAGGAAACAAAAATC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61757	TTGTCCTGGATTAGCGATGATCCAAAAATTGGAAGAAGGAAACAAAAATC	61806

AL662795.5	1351	TTTATAGGAATGCATATTTAACCCATATGTCAAAGAATTTGCCCAAATAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61807	TTTATAGGAATGCATATTTAACCCATATGTCAAAGAATTTGCCCAAATAA	61856

AL662795.5	1401	TTCTACAAGGAAAAAGCTGCTCAGAGCATGAACTGTATAAAGTACAAGTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61857	TTCTACAAGGAAAAAGCTGCTCAGAGCATGAACTGTATAAAGTACAAGTG	61906

AL662795.5	1451	GAGAAAAGTCAGTCTGATTGAGAACCAGTGGAAACAATAGATAAGAGGCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61907	GAGAAAAGTCAGTCTGATTGAGAACCAGTGGAAACAATAGATAAGAGGCT	61956

AL662795.5	1501	CATAAAGCTTCAATATTTGAATTATGAAACAAAATAACGTAACTAGTATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	61957	CATAAAGCTTCAATATTTGAATTATGAAACAAAATAACGTAACTAGTATT	62006

AL662795.5	1551	ACATTTAAAATAATTATGAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTTATCCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	62007	ACATTTAAAATAATTATGAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTTATCCC	62056

AL662795.5	1601	AGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCACCTGAGGCTGGGAGTTTGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	62057	AGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCACCTGAGGCTGGGAGTTTGA	62106

AL662795.5	1651	GACCAGCCTGACCAACATAGAAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATAGAAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	62107	GACCAGCCTGACCAACATAGAAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATAGAAAA	62156

AL662795.5	1701	TTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCCGCTACATGGGAGGCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	62157	TTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCCGCTACATGGGAGGCT	62206

AL662795.5	1751	GAGGCAGGTGAATCACTTGAAACTGGGAAGTGGGCATTGTGGTAAGCCGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	62207	GAGGCAGGTGAATCACTTGAAACTGGGAAGTGGGCATTGTGGTAAGCCGA	62256

AL662795.5	1801	GATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGATCAAAACTCTGTATC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	62257	GATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGATCAAAACTCTGTATC	62306

AL662795.5	1851	AAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	62307	AAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGAC	62356

AL662795.5	1901	AAGCTTGAAAATGCCTACAGAATGTATTAACCTAAAAATGACCTGTTTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	62357	AAGCTTGAAAATGCCTACAGAATGTATTAACCTAAAAATGACCTGTTTTT	62406

AL662795.5	1951	CAAAAGAACTAAAGTTAGTTTTTAGGAAGTAAAATTAACTTTGATTTTAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662782.3	62407	CAAAAGAACTAAAGTTAGTTTTTAGGAAGTAAAATTAACTTTGATTTTAA	62456

Overview

Query
AL662795.5 - 115104 bps
Hit
AL662782.3 - 62456 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link