<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645927.3	1	GAATTCTTGAGCCCTTTGGCAGTGGATGTGGTGTGGGTGATGGCAGTAGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	104643	GAATTCTTGAGCCCTTTGGCAGTGGATGTGGTGTGGGTGATGGCAGTAGC	104692

AL645927.3	51	AGTGGTGGGACAGCCCTCTGGGACCCGTGTAGTCCATGCTGATATTGGCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	104693	AGTGGTGGGACAGCCCTCTGGGACCCGTGTAGTCCATGCTGATATTGGCA	104742

AL645927.3	101	ATGGCTGTGACAGGTTGGGCAGGTCAGTTCCCAGATCCACAGGAGGCACA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	104743	ATGGCTGTGACAGGTTGGGCAGGTCAGTTCCCAGATCCACAGGAGGCACA	104792

AL645927.3	151	TGAGTGTGGATGTCAGCTGTGGTGCCAGGGGAAGGTTGAGTGGGGCTGAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	104793	TGAGTGTGGATGTCAGCTGTGGTGCCAGGGGAAGGTTGAGTGGGGCTGAC	104842

AL645927.3	201	CTCAGATCCCAGGAGGGGTGCTGAGGAGCTACCAGTGATGGACTGGGCTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	104843	CTCAGATCCCAGGAGGGGTGCTGAGGAGCTACCAGTGATGGACTGGGCTA	104892

AL645927.3	251	AGTGACCCTCGGGCCCCTGTACGGTGTGCTCAGATTCTGTGGGTGGGTGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	104893	AGTGACCCTCGGGCCCCTGTACGGTGTGCTCAGATTCTGTGGGTGGGTGA	104942

AL645927.3	301	AGCCAGGCTGAGTAGACCTTCCCATGGGCTCCTTGGTGGTGTATGAGGCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	104943	AGCCAGGCTGAGTAGACCTTCCCATGGGCTCCTTGGTGGTGTATGAGGCA	104992

AL645927.3	351	CTGGCTATGGTAGGCAGGGGCAGGGGGATCCCCAGGCCACAGATGGAATG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	104993	CTGGCTATGGTAGGCAGGGGCAGGGGGATCCCCAGGCCACAGATGGAATG	105042

AL645927.3	401	CTCAGATAGGAGTGGTAGTGGCTGTTTTGTGGTCATGGACTGGGGAGGAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105043	CTCAGATAGGAGTGGTAGTGGCTGTTTTGTGGTCATGGACTGGGGAGGAC	105092

AL645927.3	451	TGGGTTGCTTTTCCTGGGAACAACCATAGGCAAGAAACTGGGGAGGCATG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105093	TGGGTTGCTTTTCCTGGGAACAACCATAGGCAAGAAACTGGGGAGGCATG	105142

AL645927.3	501	GGCTTTGCTCATGCCTCTGCCCCACAGTAGTTCATCATGGCAGCAGTTGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105143	GGCTTTGCTCATGCCTCTGCCCCACAGTAGTTCATCATGGCAGCAGTTGC	105192

AL645927.3	551	AGGCAGTGAAATTTGTCCTCAGGGCAAGTAAAAATGTGTCGTTGTCCCTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105193	AGGCAGTGAAATTTGTCCTCAGGGCAAGTAAAAATGTGTCGTTGTCCCTC	105242

AL645927.3	601	TGGTCGGGGTAACGGGAGGTGGGATTACTCCCTAGGGCTCTTGCCTCGGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105243	TGGTCGGGGTAACGGGAGGTGGGATTACTCCCTAGGGCTCTTGCCTCGGT	105292

AL645927.3	651	CTCAGAAGCAGAGTAAGATGCAGTGCGTTGGGATCTGTGCTGTCAAAATG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105293	CTCAGAAGCAGAGTAAGATGCAGTGCGTTGGGATCTGTGCTGTCAAAATG	105342

AL645927.3	701	GTGCCGTGCTGCAGTTAGTTAGGACTTAGGGTTCGTGGGACCCAGTGTGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105343	GTGCCGTGCTGCAGTTAGTTAGGACTTAGGGTTCGTGGGACCCAGTGTGA	105392

AL645927.3	751	GGTTCTTTCTTGGGTAGCGCCTTCACGTGGTCTCCAGGCAGCTCCCTATG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105393	GGTTCTTTCTTGGGTAGCGCCTTCACGTGGTCTCCAGGCAGCTCCCTATG	105442

AL645927.3	801	TTAGTCTCAGGGGCTACGATGGTTGAGGGGATCTCCTGTGGCTAGAATTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105443	TTAGTCTCAGGGGCTACGATGGTTGAGGGGATCTCCTGTGGCTAGAATTG	105492

AL645927.3	851	TAGGTATCTGTGGTGAAATGTGGGCTGCTGGGAGTCTCCCCCTTTCCCTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105493	TAGGTATCTGTGGTGAAATGTGGGCTGCTGGGAGTCTCCCCCTTTCCCTT	105542

AL645927.3	901	TTCCCACATTGGAGAGCCGCTCGAGACTCATATCCGATCTTGGTTGAACA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105543	TTCCCACATTGGAGAGCCGCTCGAGACTCATATCCGATCTTGGTTGAACA	105592

AL645927.3	951	GGCGGTCTCATTTCCTTCTCCTTTGCTTTTGGTGCTTCCTGGTCACTTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105593	GGCGGTCTCATTTCCTTCTCCTTTGCTTTTGGTGCTTCCTGGTCACTTCT	105642

AL645927.3	1001	CTGCTGACTTTCGGTGTTCTCTCTTAGATGATCTATTCAACGTGTGATTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105643	CTGCTGACTTTCGGTGTTCTCTCTTAGATGATCTATTCAACGTGTGATTA	105692

AL645927.3	1051	TTGACTGGTTATTTTGGTTACTTTACATGGAAGGGCCAAGTACCAGATGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105693	TTGACTGGTTATTTTGGTTACTTTACATGGAAGGGCCAAGTACCAGATGT	105742

AL645927.3	1101	ATCAAGTCAGCCATGTTGGAGCCTCTCCAGCTCCATTCAAGGGGCCTGTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105743	ATCAAGTCAGCCATGTTGGAGCCTCTCCAGCTCCATTCAAGGGGCCTGTT	105792

AL645927.3	1151	TTGAGTTGGCCCTAGGCCTTTCCCCGTAAGCAAACTTTCTATAACATTGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105793	TTGAGTTGGCCCTAGGCCTTTCCCCGTAAGCAAACTTTCTATAACATTGA	105842

AL645927.3	1201	AATTACTTGGGAAAAAAAGCTGTCAAAAGACTTTGAGGGTGTTTTGTTTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105843	AATTACTTGGGAAAAAAAGCTGTCAAAAGACTTTGAGGGTGTTTTGTTTT	105892

AL645927.3	1251	GTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTATGGCGTCTCACGCTGTCAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105893	GTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTATGGCGTCTCACGCTGTCAC	105942

AL645927.3	1301	CCAGGCTGGAATACAGTGGCAATCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105943	CCAGGCTGGAATACAGTGGCAATCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCT	105992

AL645927.3	1351	CCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTACACCCCCATGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	105993	CCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTACACCCCCATGC	106042

AL645927.3	1401	CCAGCTAATTTATGTATTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGCTGGCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	106043	CCAGCTAATTTATGTATTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGCTGGCC	106092

AL645927.3	1451	AGGCTGGTCTGGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	106093	AGGCTGGTCTGGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCC	106142

AL645927.3	1501	CAAAGTGCCGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACTCAGCCAACTTGGAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	106143	CAAAGTGCCGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACTCAGCCAACTTGGAG	106192

AL645927.3	1551	GTATTTTGGGGAAAAAAAAGAAGTAATGATTTTTCCTAACTTATGAGATA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	106193	GTATTTTGGGGAAAAAAAAGAAGTAATGATTTTTCCTAACTTATGAGATA	106242

AL645927.3	1601	TTAAGACCTACAATAACATCATATTACTTAAATTACAGCTTATTCAATGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	106243	TTAAGACCTACAATAACATCATATTACTTAAATTACAGCTTATTCAATGG	106292

AL645927.3	1651	AAAAAATAGTAAGTGGAGAAACAAACCATGTATTGAGGGGAACTTGGAAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	106293	AAAAAATAGTAAGTGGAGAAACAAACCATGTATTGAGGGGAACTTGGAAT	106342

AL645927.3	1701	AGTATAAAGATGGCCTCACAAATCGATGAAGAAGGAATGGTTAGTCGGTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	106343	AGTATAAAGATGGCCTCACAAATCGATGAAGAAGGAATGGTTAGTCGGTC	106392

AL645927.3	1751	TACATAGAGACAACCAGAACCAAGACTAGCTGATTATCTCACAGGATATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	106393	TACATAGAGACAACCAGAACCAAGACTAGCTGATTATCTCACAGGATATG	106442

AL645927.3	1801	TAAATATAACCTCTAGAAGACTAGAGTCCTAAATGACAAATATAAAACTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	106443	TAAATATAACCTCTAGAAGACTAGAGTCCTAAATGACAAATATAAAACTC	106492

AL645927.3	1851	TAAATCTAATTAACAGAACCAGTTACATAATCTTTAAGTTTCAATGCAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	106493	TAAATCTAATTAACAGAACCAGTTACATAATCTTTAAGTTTCAATGCAAG	106542

AL645927.3	1901	ATAAAAAATGATAAAATTGAAGTGGGGGACATTTTGAAAAAATGGAAATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	106543	ATAAAAAATGATAAAATTGAAGTGGGGGACATTTTGAAAAAATGGAAATT	106592

AL645927.3	1951	ACATTGCAGTGATCCCTAAAACTAAAGAGCCTTATTTTGAATCCTAGTTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662781.4	106593	ACATTGCAGTGATCCCTAAAACTAAAGAGCCTTATTTTGAATCCTAGTTT	106642

Overview

Query
AL645927.3 - 112578 bps
Hit
AL662781.4 - 106642 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link