<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL663047.15	1	AGAATCAACTCCCCATGCATTTCTGTTTCTCGATAGAAAGCAATGACCCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	200306	AGAATCAACTCCCCATGCATTTCTGTTTCTCGATAGAAAGCAATGACCCA	200355

AL663047.15	51	CCTTCAGGAGCATGGTTGCCCTTAGGCTTCTTCCTCTGCAGGTAGAGGGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	200356	CCTTCAGGAGCATGGTTGCCCTTAGGCTTCTTCCTCTGCAGGTAGAGGGA	200405

AL663047.15	101	TGGAAGGCTTCCCTCTGGAGCGTCTTCCACACATGCCACACTATGTGACA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	200406	TGGAAGGCTTCCCTCTGGAGCGTCTTCCACACATGCCACACTATGTGACA	200455

AL663047.15	151	CTAATAAAGCGTTGGATGCTTGCTGTGTGTGACCAGAGTTGGAAGAGTGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	200456	CTAATAAAGCGTTGGATGCTTGCTGTGTGTGACCAGAGTTGGAAGAGTGT	200505

AL663047.15	201	TTGTGGGAGTTACAAGTTCATTTCAGGATTGTGCTCACCTAGCAAATGGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	200506	TTGTGGGAGTTACAAGTTCATTTCAGGATTGTGCTCACCTAGCAAATGGG	200555

AL663047.15	251	GTTGAGGCACAAATCCTAAGGATCCCACTCTACTGTTGTTTAATCCCCTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	200556	GTTGAGGCACAAATCCTAAGGATCCCACTCTACTGTTGTTTAATCCCCTT	200605

AL663047.15	301	CTCAGTCTGAAACAACTCTAAGTCTCTTTCTGTAGACACAGGGAAGCTCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	200606	CTCAGTCTGAAACAACTCTAAGTCTCTTTCTGTAGACACAGGGAAGCTCT	200655

AL663047.15	351	TCAGGATTTCCTCTGAAAGATGAAGGCTCAGCAAGTACTTATGCCCCATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	200656	TCAGGATTTCCTCTGAAAGATGAAGGCTCAGCAAGTACTTATGCCCCATT	200705

AL663047.15	401	TTTTTTTTTTTTTGGCATTCGTTATTCAGAAGAACAGGTCTATTTCTTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	200706	TTTTTTTTTTTTTGGCATTCGTTATTCAGAAGAACAGGTCTATTTCTTTT	200755

AL663047.15	451	TCTTTTTCTTTTTTTTGGTCTTTGAACATATAGGTATAGTATTTTGGATG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	200756	TCTTTTTCTTTTTTTTGGTCTTTGAACATATAGGTATAGTATTTTGGATG	200805

AL663047.15	501	AGTTTTACCACCAACCAGCATGTGAAAACACACAATCCTGGCTCCTAGAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	200806	AGTTTTACCACCAACCAGCATGTGAAAACACACAATCCTGGCTCCTAGAT	200855

AL663047.15	551	GGGTATACAATTGCCTCTGGTGTAAGGCCATTAAAAACTCAGCTGCTTAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	200856	GGGTATACAATTGCCTCTGGTGTAAGGCCATTAAAAACTCAGCTGCTTAA	200905

AL663047.15	601	CAATTGTGGCCTCAGAAAAGCATCAGGGTTAAGAGGAGTGCAGAGTATGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	200906	CAATTGTGGCCTCAGAAAAGCATCAGGGTTAAGAGGAGTGCAGAGTATGA	200955

AL663047.15	651	TTATCCAAGTTATTGAAAACTGTGAGTTGATTAATTGACACAGAGATAGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	200956	TTATCCAAGTTATTGAAAACTGTGAGTTGATTAATTGACACAGAGATAGT	201005

AL663047.15	701	GGAGTTGCCTGAATATTCCTTAGTTGCCCTGAAGGTGAGGATTGAAAATA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201006	GGAGTTGCCTGAATATTCCTTAGTTGCCCTGAAGGTGAGGATTGAAAATA	201055

AL663047.15	751	GACTGAAGATAGAAAAACACACTGTCTTAGACAGGGTTACTATGGCTGTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201056	GACTGAAGATAGAAAAACACACTGTCTTAGACAGGGTTACTATGGCTGTG	201105

AL663047.15	801	ATGAAACATCATGACAGTATTAAATTGGGGAGGAAAGGGTTCATTTGACT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201106	ATGAAACATCATGACAGTATTAAATTGGGGAGGAAAGGGTTCATTTGACT	201155

AL663047.15	851	TATACTTTCACATCCCTGTTAACCACTGAAGGAAGTCAGGACAGGAACTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201156	TATACTTTCACATCCCTGTTAACCACTGAAGGAAGTCAGGACAGGAACTC	201205

AL663047.15	901	AAACAGGTTAGGAACCTGGAGGCAGAAGCTGATTCAGGAGGGGTCCTGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201206	AAACAGGTTAGGAACCTGGAGGCAGAAGCTGATTCAGGAGGGGTCCTGCT	201255

AL663047.15	951	TACTGGCTTGTTCCTCATTGCTTGCTTAGCCTGCTTTCTTGTAGAATTCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201256	TACTGGCTTGTTCCTCATTGCTTGCTTAGCCTGCTTTCTTGTAGAATTCA	201305

AL663047.15	1001	GGACCAGCCCAGGGTGGCACCATCAATTACTAATCAAGAAAATATCTACG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201306	GGACCAGCCCAGGGTGGCACCATCAATTACTAATCAAGAAAATATCTACG	201355

AL663047.15	1051	CCAGGCAGTGGTGGCCCATGCCTTTAATCCCAGCACTTAGGAGGCAGAGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201356	CCAGGCAGTGGTGGCCCATGCCTTTAATCCCAGCACTTAGGAGGCAGAGG	201405

AL663047.15	1101	CAGGCAGATTTCTGTGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTGCAGAGTGAGTTCCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201406	CAGGCAGATTTCTGTGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTGCAGAGTGAGTTCCA	201455

AL663047.15	1151	GGAAAGCCAGGACTATACAGAGAAACACTGTCTTGAAAAAACAAAAAAGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201456	GGAAAGCCAGGACTATACAGAGAAACACTGTCTTGAAAAAACAAAAAAGA	201505

AL663047.15	1201	AAAAAGAAAATGTCTACAAGAAGATAGATCTTATGGAGGCATTTTCCCAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201506	AAAAAGAAAATGTCTACAAGAAGATAGATCTTATGGAGGCATTTTCCCAA	201555

AL663047.15	1251	CTGATGCTTCCTCCTCTCAAACTCTAACTTGTGTCAAGTTGATAAAAGCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201556	CTGATGCTTCCTCCTCTCAAACTCTAACTTGTGTCAAGTTGATAAAAGCC	201605

AL663047.15	1301	AGACATCATGGACACCTTATTCATATGTGAGTGCTTGAGGGCTTCTATGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201606	AGACATCATGGACACCTTATTCATATGTGAGTGCTTGAGGGCTTCTATGG	201655

AL663047.15	1351	TAATTCTCAAGAGGTAGATGTCTTCTGTCACAGGATATATATAGATGAGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201656	TAATTCTCAAGAGGTAGATGTCTTCTGTCACAGGATATATATAGATGAGG	201705

AL663047.15	1401	GGCAGATTAAAGATCTGGTCAGAACCATAGAGCTATAGAGATTGTTTGAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201706	GGCAGATTAAAGATCTGGTCAGAACCATAGAGCTATAGAGATTGTTTGAT	201755

AL663047.15	1451	TGGCCTGGCACTATAGAGATACCTGAAGAGGCAGATTATTTCACCTTTCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201756	TGGCCTGGCACTATAGAGATACCTGAAGAGGCAGATTATTTCACCTTTCA	201805

AL663047.15	1501	GAGTGTCCTGGGCTTACAGAAGTGGCTCAATGGGCAAAGAAAGAAATATC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201806	GAGTGTCCTGGGCTTACAGAAGTGGCTCAATGGGCAAAGAAAGAAATATC	201855

AL663047.15	1551	AATTCTAAGGTGCTAGAAGATAGGACAGAAATCTCATACTTGATGGGCAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201856	AATTCTAAGGTGCTAGAAGATAGGACAGAAATCTCATACTTGATGGGCAT	201905

AL663047.15	1601	GGTGGTGTACATCTTTAATGATAGCACTCGAGAGGCAGGCAGATCAAGAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201906	GGTGGTGTACATCTTTAATGATAGCACTCGAGAGGCAGGCAGATCAAGAT	201955

AL663047.15	1651	AAGAAGTTGTGGGCCAGCCTAATCTGCATAGAGAGTTTCAGGCCAGAGAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	201956	AAGAAGTTGTGGGCCAGCCTAATCTGCATAGAGAGTTTCAGGCCAGAGAG	202005

AL663047.15	1701	ACCTACATAGTGACACCTTGTCTCAGAAGAAAAGAAAAAAAAAAGTCTCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	202006	ACCTACATAGTGACACCTTGTCTCAGAAGAAAAGAAAAAAAAAAGTCTCA	202055

AL663047.15	1751	TTCTCAGAAGAGAAACCACATTCAAGATGCTCTCCTTACCTCCTCTCCTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	202056	TTCTCAGAAGAGAAACCACATTCAAGATGCTCTCCTTACCTCCTCTCCTG	202105

AL663047.15	1801	CCTTCCAAGCCTGTAGCTTGGATTAACTCTCAGTGCCATGACTGAGGCAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	202106	CCTTCCAAGCCTGTAGCTTGGATTAACTCTCAGTGCCATGACTGAGGCAT	202155

AL663047.15	1851	GTTGGGCCTGGTTAATTAAAAGGGAGGTTGTGTGGTGAAAAATCACAATC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	202156	GTTGGGCCTGGTTAATTAAAAGGGAGGTTGTGTGGTGAAAAATCACAATC	202205

AL663047.15	1901	ATTAGGTTGACAGGAATTGAGCAAACACTCGTGGGATTGGATTTTGAGGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	202206	ATTAGGTTGACAGGAATTGAGCAAACACTCGTGGGATTGGATTTTGAGGG	202255

AL663047.15	1951	GCTTGATCAAAGAGGCTGGCTAGACTGTGAGGTTGGATAACCAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646054.20	202256	GCTTGATCAAAGAGGCTGGCTAGACTGTGAGGTTGGATAACCAAGAATTC	202305

Overview

Query
AL663047.15 - 77653 bps
Hit
AL646054.20 - 202305 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link