<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645746.10	1	GAATTCACTAGGGTTTCGGTATGTGTTCCTCAAGAGTGCATCTGTGGCGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	60465	GAATTCACTAGGGTTTCGGTATGTGTTCCTCAAGAGTGCATCTGTGGCGT	60514

AL645746.10	51	GCACATTTGCATATGTATGTCCTATGTATGAGCACAGCGGCCAGAGGAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	60515	GCACATTTGCATATGTATGTCCTATGTATGAGCACAGCGGCCAGAGGAGG	60564

AL645746.10	101	ACATAAAGTGTCCTGCTCAATCATGCTCTAACTTACAGCTTTGAGACAGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	60565	ACATAAAGTGTCCTGCTCAATCATGCTCTAACTTACAGCTTTGAGACAGT	60614

AL645746.10	151	CTCCCACTGAGCCTGGAGCTAGATGAACAGCCAGCAACAAGCAGGGACCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	60615	CTCCCACTGAGCCTGGAGCTAGATGAACAGCCAGCAACAAGCAGGGACCC	60664

AL645746.10	201	TCCTTGGGCCACTCATGCAGCTTCTCTCAGCATTTTACTTGGGTACCGGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	60665	TCCTTGGGCCACTCATGCAGCTTCTCTCAGCATTTTACTTGGGTACCGGG	60714

AL645746.10	251	GATTAGAACCCGGGGCTTTGGGCTGACACAGCAAGTACCTTTCCCCACCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	60715	GATTAGAACCCGGGGCTTTGGGCTGACACAGCAAGTACCTTTCCCCACCA	60764

AL645746.10	301	AGCCATTTCTCACGCTCCTCAAGGATCTCTTTCACAAGGGCACTAATCCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	60765	AGCCATTTCTCACGCTCCTCAAGGATCTCTTTCACAAGGGCACTAATCCT	60814

AL645746.10	351	GCTTCTGAGAGCTCTCATCCGTGATCTAATTCCCCTCACACTGTACTCTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	60815	GCTTCTGAGAGCTCTCATCCGTGATCTAATTCCCCTCACACTGTACTCTC	60864

AL645746.10	401	GAAGGTCTTTATAGAAATCAGAATTCTAGGAGGACAGAGCCATTCCTATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	60865	GAAGGTCTTTATAGAAATCAGAATTCTAGGAGGACAGAGCCATTCCTATT	60914

AL645746.10	451	TGCTCTGCGGAGATATCCAGATAGGAACCGGTATCATGGAGTCCTCTGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	60915	TGCTCTGCGGAGATATCCAGATAGGAACCGGTATCATGGAGTCCTCTGAG	60964

AL645746.10	501	CAATGGTGGACATCCCTCTCTGAGCTGAATAGAGGTGCAGATACTGACGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	60965	CAATGGTGGACATCCCTCTCTGAGCTGAATAGAGGTGCAGATACTGACGA	61014

AL645746.10	551	TCTGAAAGGGAGATGTTCATGTACATTCTCACTGTCTCCCACTACCAAAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61015	TCTGAAAGGGAGATGTTCATGTACATTCTCACTGTCTCCCACTACCAAAG	61064

AL645746.10	601	GGAGAACAGACAAGGCAGGGGAAAAGCCACCACGTCTGTCTCCTATCATG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61065	GGAGAACAGACAAGGCAGGGGAAAAGCCACCACGTCTGTCTCCTATCATG	61114

AL645746.10	651	TGTTCTTTGCCTGTGTCTCAGCATTTCTAATCTAAGCATCCCCTGGAGCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61115	TGTTCTTTGCCTGTGTCTCAGCATTTCTAATCTAAGCATCCCCTGGAGCC	61164

AL645746.10	701	TGTTTCAACTCATGACTATGCTCACTTGCACTTCCCTTCCCACTCCCAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61165	TGTTTCAACTCATGACTATGCTCACTTGCACTTCCCTTCCCACTCCCAGA	61214

AL645746.10	751	CATCCAAAATGGTTTCATAGCTTATGAGTTACTAGAGAAGACACATGGGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61215	CATCCAAAATGGTTTCATAGCTTATGAGTTACTAGAGAAGACACATGGGT	61264

AL645746.10	801	TGTTTAAATTCACAGTAATACCTACTGTATCTTTTGGTGGCATCTGAGAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61265	TGTTTAAATTCACAGTAATACCTACTGTATCTTTTGGTGGCATCTGAGAT	61314

AL645746.10	851	TACAGAGGAAAGAAAGAAGAATGTAGGAACAGCCAAGGCTACATGGACAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61315	TACAGAGGAAAGAAAGAAGAATGTAGGAACAGCCAAGGCTACATGGACAT	61364

AL645746.10	901	TTTAAATCACTTTCAATTTATTTATTACCTTATTTTCTAGATTGGCAACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61365	TTTAAATCACTTTCAATTTATTTATTACCTTATTTTCTAGATTGGCAACT	61414

AL645746.10	951	ACTTCCAGGAACTGTATCTTAGTTAAGGATTGACTGCTGTGAACAGACAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61415	ACTTCCAGGAACTGTATCTTAGTTAAGGATTGACTGCTGTGAACAGACAC	61464

AL645746.10	1001	CATGACCAAGGCAACTCTTATAAGGACAATGTCTAATTGGGGCTGGCTTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61465	CATGACCAAGGCAACTCTTATAAGGACAATGTCTAATTGGGGCTGGCTTA	61514

AL645746.10	1051	CGGGTTCAGCGGTTCAGTTCCTTATCATCAAGGCAGGAACATGGCAGCAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61515	CGGGTTCAGCGGTTCAGTTCCTTATCATCAAGGCAGGAACATGGCAGCAT	61564

AL645746.10	1101	CCAGGCAGGCACAGTGCAGGAGGAGCTGAGAGTTCTACATCTCCATCTGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61565	CCAGGCAGGCACAGTGCAGGAGGAGCTGAGAGTTCTACATCTCCATCTGA	61614

AL645746.10	1151	AGGCTGCTAGCAGAATACTGGCTTCCAGGCAGCTAGGATGAGGGTCTTAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61615	AGGCTGCTAGCAGAATACTGGCTTCCAGGCAGCTAGGATGAGGGTCTTAA	61664

AL645746.10	1201	ACCCAATCCCACAGTGACACACCTACACCAACAAGACCACACCTCCTAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61665	ACCCAATCCCACAGTGACACACCTACACCAACAAGACCACACCTCCTAAT	61714

AL645746.10	1251	AGTGCCACTCCCTGGGCCAAGCGTATACACACCATCACAGCTCAGCAAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61715	AGTGCCACTCCCTGGGCCAAGCGTATACACACCATCACAGCTCAGCAAGC	61764

AL645746.10	1301	AAAGGTAACTGTCACACCCACAGATGACCTGAATCTGACCCCTTCAAAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61765	AAAGGTAACTGTCACACCCACAGATGACCTGAATCTGACCCCTTCAAAGG	61814

AL645746.10	1351	CCCTCTGAACTTCATACATACATATATAAGCAAATACTTGGAAAAAAAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61815	CCCTCTGAACTTCATACATACATATATAAGCAAATACTTGGAAAAAAAAA	61864

AL645746.10	1401	AACAAAACACCACCAACAACAATAACAAAACCCTAGAAAACTATTTCCAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61865	AACAAAACACCACCAACAACAATAACAAAACCCTAGAAAACTATTTCCAA	61914

AL645746.10	1451	GAAAATCAAGGATTTTTTTCCTTAATGAGAAGCACAATGTGGCATTCTAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61915	GAAAATCAAGGATTTTTTTCCTTAATGAGAAGCACAATGTGGCATTCTAT	61964

AL645746.10	1501	CATTGGGGCTTCATAAAACACATTTTGGCAATTGAGAAAACTAATTAAGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	61965	CATTGGGGCTTCATAAAACACATTTTGGCAATTGAGAAAACTAATTAAGC	62014

AL645746.10	1551	TAATTTTGTATATCAATCTCATTTCAAAACCTGAGTTCTAAAGTCACAGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	62015	TAATTTTGTATATCAATCTCATTTCAAAACCTGAGTTCTAAAGTCACAGA	62064

AL645746.10	1601	AAGTCTCTATTATTCCACTTTCTCCATATAAGAATAGATTTGGACTTCAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	62065	AAGTCTCTATTATTCCACTTTCTCCATATAAGAATAGATTTGGACTTCAA	62114

AL645746.10	1651	AACATTTTGGGAATCTGGTTGTGGTGAGGCAGGAGAATTGCTGTAAGGTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	62115	AACATTTTGGGAATCTGGTTGTGGTGAGGCAGGAGAATTGCTGTAAGGTC	62164

AL645746.10	1701	AAGACCACGCTGAGCAACAGGGAGTTCCAGGCTAGACTTGGCTATGAAGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	62165	AAGACCACGCTGAGCAACAGGGAGTTCCAGGCTAGACTTGGCTATGAAGT	62214

AL645746.10	1751	AGACCCTGTCTCAAATAGAATAAAACTAGCAGAGAGGGGGGCGGGGCTAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	62215	AGACCCTGTCTCAAATAGAATAAAACTAGCAGAGAGGGGGGCGGGGCTAG	62264

AL645746.10	1801	AGCTCAGTGGTGGCAGACAGTTCATCTAGCTTGTGTGAGGCCTTGGTTTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	62265	AGCTCAGTGGTGGCAGACAGTTCATCTAGCTTGTGTGAGGCCTTGGTTTC	62314

AL645746.10	1851	AGAGTGCAGCACCTCACACTGGTAAGGAAAGGGAAGCTGCTTTTCTTGTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	62315	AGAGTGCAGCACCTCACACTGGTAAGGAAAGGGAAGCTGCTTTTCTTGTG	62364

AL645746.10	1901	TGTTTTTAGATGTGGGAGGGAGTATGCTACCAAACTATCAGATTAAAAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	62365	TGTTTTTAGATGTGGGAGGGAGTATGCTACCAAACTATCAGATTAAAAAA	62414

AL645746.10	1951	AAAAAACAAAAAAACAAAAAAACAAAAAACAAAAAAACCCGCCATGGAAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL646015.8	62415	AAAAAACAAAAAAACAAAAAAACAAAAAACAAAAAAACCCGCCATGGAAA	62464

Overview

Query
AL645746.10 - 75405 bps
Hit
AL646015.8 - 62464 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link