<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645982.26	1	GAATTCCCCTGGAATGTTAGGAAGAGAAGACCAATGTGCCTGGAGTCCAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	159394	GAATTCCCCTGGAATGTTAGGAAGAGAAGACCAATGTGCCTGGAGTCCAT	159443

AL645982.26	51	TGGAAAGTGAAATGGGGTGGAGACACAGAGGGAGACCCAGTAGCCCTAAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	159444	TGGAAAGTGAAATGGGGTGGAGACACAGAGGGAGACCCAGTAGCCCTAAG	159493

AL645982.26	101	TGGCAGGGAAACTTGGGATTTGAGTTGAGGGAGTGACATATTGTGATTTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	159494	TGGCAGGGAAACTTGGGATTTGAGTTGAGGGAGTGACATATTGTGATTTC	159543

AL645982.26	151	TTTTTATATATGCACACACACCACAGTGTATGTGTGGAGGGCCAGGGGAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	159544	TTTTTATATATGCACACACACCACAGTGTATGTGTGGAGGGCCAGGGGAT	159593

AL645982.26	201	AACTTGCAGGAGTCAGTTTGCTCTTCCTACCTTGTGTGGGTCCTAGGGGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	159594	AACTTGCAGGAGTCAGTTTGCTCTTCCTACCTTGTGTGGGTCCTAGGGGT	159643

AL645982.26	251	CAAATTCCAGTCAGCAGGCTTGGCAGCGAGTGTTTTTATCCACGGAGGCG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	159644	CAAATTCCAGTCAGCAGGCTTGGCAGCGAGTGTTTTTATCCACGGAGGCG	159693

AL645982.26	301	TCTCACAGGCCCCAGAGGTTGGGTTTTCAGGGAGTTATTCAAGTTGCTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	159694	TCTCACAGGCCCCAGAGGTTGGGTTTTCAGGGAGTTATTCAAGTTGCTTT	159743

AL645982.26	351	ATTACAAATAGGTTTTAGTGAGGAGCAAGGACAGGCGTAGAGAAATAGCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	159744	ATTACAAATAGGTTTTAGTGAGGAGCAAGGACAGGCGTAGAGAAATAGCT	159793

AL645982.26	401	TAGGAAGGCTCTATAACCATCCAAGGGAGAGGTCCTGGTGGCCTCGTCTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	159794	TAGGAAGGCTCTATAACCATCCAAGGGAGAGGTCCTGGTGGCCTCGTCTT	159843

AL645982.26	451	GGCAGCCCATGGGGTAAAGTCAGAGGAGGGAAATTACTCCAGTAGCTATG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	159844	GGCAGCCCATGGGGTAAAGTCAGAGGAGGGAAATTACTCCAGTAGCTATG	159893

AL645982.26	501	GAGGGTGTTTAAAATGCTCCCCAAGGTGAGCAGCCAGAACCAATGTTCGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	159894	GAGGGTGTTTAAAATGCTCCCCAAGGTGAGCAGCCAGAACCAATGTTCGA	159943

AL645982.26	551	ATATGAAGTAGACCATCAGATAGGTGTGCACTCCACAGACAGGTTCCCGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	159944	ATATGAAGTAGACCATCAGATAGGTGTGCACTCCACAGACAGGTTCCCGA	159993

AL645982.26	601	GCAGGTGGAGGCACTATGTGTTGCTTGACCTGCGGCTCCAGGCTCCAGGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	159994	GCAGGTGGAGGCACTATGTGTTGCTTGACCTGCGGCTCCAGGCTCCAGGG	160043

AL645982.26	651	ACTCAGTGGCCAGGCCTCCAGAGCAGGTGAGTGCCGAGGGGTCTGGAAGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160044	ACTCAGTGGCCAGGCCTCCAGAGCAGGTGAGTGCCGAGGGGTCTGGAAGT	160093

AL645982.26	701	GTGGAGGCCTGGCTTCTGGTACAGAGGCAGTAGGAATATGATGGTCTAGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160094	GTGGAGGCCTGGCTTCTGGTACAGAGGCAGTAGGAATATGATGGTCTAGC	160143

AL645982.26	751	TAGGTGACAGGTTTCCATGCGTGAGAGTCTAGGCTGTGACCATGAGAGTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160144	TAGGTGACAGGTTTCCATGCGTGAGAGTCTAGGCTGTGACCATGAGAGTG	160193

AL645982.26	801	ACAGTGGGTAAAGTACACAGGTGCTCACGTGGAGATGGTCAAGGTTCTGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160194	ACAGTGGGTAAAGTACACAGGTGCTCACGTGGAGATGGTCAAGGTTCTGG	160243

AL645982.26	851	GAGCTTCCCAGTGAGAATCCTCCCCACTGAGGTCACCGGAGAGGGGAGCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160244	GAGCTTCCCAGTGAGAATCCTCCCCACTGAGGTCACCGGAGAGGGGAGCA	160293

AL645982.26	901	GAGATGGGCAAGGAACATACCTAAGTCCTTGATGAGCACAGCCTGGTAAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160294	GAGATGGGCAAGGAACATACCTAAGTCCTTGATGAGCACAGCCTGGTAAC	160343

AL645982.26	951	CCACAGACGCAGACAAGAAACATTGAGAATAAGAGACAGATGGCCAGATG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160344	CCACAGACGCAGACAAGAAACATTGAGAATAAGAGACAGATGGCCAGATG	160393

AL645982.26	1001	AGAGCGACATGAACCCAGAACTGCAGTCTACATGGGACACACTTGTGAGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160394	AGAGCGACATGAACCCAGAACTGCAGTCTACATGGGACACACTTGTGAGA	160443

AL645982.26	1051	CAAGCAAGTTTCAACCACTTCAAGCCTGCCAGGCATTCAGAGGGTGGTCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160444	CAAGCAAGTTTCAACCACTTCAAGCCTGCCAGGCATTCAGAGGGTGGTCT	160493

AL645982.26	1101	GCAAAGAGAGTGGGGTCTTTGAGCAAGAACAGGGGATACTTCTATCTTAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160494	GCAAAGAGAGTGGGGTCTTTGAGCAAGAACAGGGGATACTTCTATCTTAG	160543

AL645982.26	1151	TGGCAGTCAATAAGAAGTAAACATCTGTGCTGTAGCCATATAAAACCTAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160544	TGGCAGTCAATAAGAAGTAAACATCTGTGCTGTAGCCATATAAAACCTAT	160593

AL645982.26	1201	GCACCCACCTTTTCTACCAGGCTGGTTGCATTAAGGACATTCAGAGAATC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160594	GCACCCACCTTTTCTACCAGGCTGGTTGCATTAAGGACATTCAGAGAATC	160643

AL645982.26	1251	ACAACAGACAGTTGTTCTGACTGGGTAGCATTTAATATGATCAGGTCTTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160644	ACAACAGACAGTTGTTCTGACTGGGTAGCATTTAATATGATCAGGTCTTA	160693

AL645982.26	1301	AATAAGAAGCCATGAACACAAACATTCAAAACCAAATACATAATAAATAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160694	AATAAGAAGCCATGAACACAAACATTCAAAACCAAATACATAATAAATAA	160743

AL645982.26	1351	TCATTAAGTTATAAAGTACATCATTCATATTAAAGCTAAATTCTCAGGTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160744	TCATTAAGTTATAAAGTACATCATTCATATTAAAGCTAAATTCTCAGGTG	160793

AL645982.26	1401	TGACTGTAAATAAAACAGAGCAATAACATAGATCAATAATGCTATGAATT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160794	TGACTGTAAATAAAACAGAGCAATAACATAGATCAATAATGCTATGAATT	160843

AL645982.26	1451	TATTCACAAAGAAAACACTTTCAGCTACAGTATTAACGGCCATAACTGAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160844	TATTCACAAAGAAAACACTTTCAGCTACAGTATTAACGGCCATAACTGAT	160893

AL645982.26	1501	TTCCTCTGAACTCCTATGACCTAGAGCAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160894	TTCCTCTGAACTCCTATGACCTAGAGCAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT	160943

AL645982.26	1551	CTCTCTCTCTCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160944	CTCTCTCTCTCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATCC	160993

AL645982.26	1601	CTTCCCTTTTTCCTTTTTGAACAACTAAATATCACACTTGGGATAAAATT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	160994	CTTCCCTTTTTCCTTTTTGAACAACTAAATATCACACTTGGGATAAAATT	161043

AL645982.26	1651	TAACTCAAAAGTGTGGTCAGGTGTTCCTGTAAGAGTACTCAAAACATTAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	161044	TAACTCAAAAGTGTGGTCAGGTGTTCCTGTAAGAGTACTCAAAACATTAA	161093

AL645982.26	1701	AACTCAGACATACGAAGTTCAGAATAAAATACAGAATAGACTTAGGAAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	161094	AACTCAGACATACGAAGTTCAGAATAAAATACAGAATAGACTTAGGAAAG	161143

AL645982.26	1751	CCCCACATTCTTGTTCTACAGATAAGAGAATGAAAACCAAAAAAAGCTTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	161144	CCCCACATTCTTGTTCTACAGATAAGAGAATGAAAACCAAAAAAAGCTTA	161193

AL645982.26	1801	CACCAGTGGCAACCTTCATGGACACACAACAGTGTGTCAGGTCCAATGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	161194	CACCAGTGGCAACCTTCATGGACACACAACAGTGTGTCAGGTCCAATGTG	161243

AL645982.26	1851	TTCCCACCCACAGTGAACAATAATGTCAAAGGACTGGCTGAGTCTTGAGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	161244	TTCCCACCCACAGTGAACAATAATGTCAAAGGACTGGCTGAGTCTTGAGC	161293

AL645982.26	1901	ACAGAGAGGTTCAAGACTGCTGTGCAATTTTGTCTAGTTTACTCTAAAGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	161294	ACAGAGAGGTTCAAGACTGCTGTGCAATTTTGTCTAGTTTACTCTAAAGC	161343

AL645982.26	1951	GTAGCTTTCCCATGGCTAGTGGAGAAGCCTTTACTGGCTTTTCCAAACGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645966.30	161344	GTAGCTTTCCCATGGCTAGTGGAGAAGCCTTTACTGGCTTTTCCAAACGA	161393

Overview

Query
AL645982.26 - 133023 bps
Hit
AL645966.30 - 161393 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link