<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL669947.14	1	TGTGTATGTATATTAATTACATTCATATGTATTCACAACACCTGCCTCAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	136565	TGTGTATGTATATTAATTACATTCATATGTATTCACAACACCTGCCTCAA	136614

AL669947.14	51	ATCAGGCAGAATGGTCCAGGATGGAATTAGGGGCAAGCATGAGGTCTTCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	136615	ATCAGGCAGAATGGTCCAGGATGGAATTAGGGGCAAGCATGAGGTCTTCA	136664

AL669947.14	101	GGCTTACTGATTTCTAAGACACAGTAACTTCACTGGTTAGTAAATGGAGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	136665	GGCTTACTGATTTCTAAGACACAGTAACTTCACTGGTTAGTAAATGGAGT	136714

AL669947.14	151	CTATCAAAATACTGCCTTTTGGGCTGGTGAGATGGCTCAGCGGGTAAGAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	136715	CTATCAAAATACTGCCTTTTGGGCTGGTGAGATGGCTCAGCGGGTAAGAG	136764

AL669947.14	201	CACCTGACTGCTCTTCTGAAGGTGCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	136765	CACCTGACTGCTCTTCTGAAGGTGCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACAT	136814

AL669947.14	251	GGTGGCTCACAACCATCCATAATGAGATCTGACTCTCTCTTCTGGAGTGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	136815	GGTGGCTCACAACCATCCATAATGAGATCTGACTCTCTCTTCTGGAGTGT	136864

AL669947.14	301	CTGAAGACACCTTTAAAAAAAAAAAAACAAAAACTGTCTTTTAAAGCCTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	136865	CTGAAGACACCTTTAAAAAAAAAAAAACAAAAACTGTCTTTTAAAGCCTT	136914

AL669947.14	351	GAAGTCCTCAACAGTGTGCTGAGGAGAACCCTCCAGAGAGGGGCTATTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	136915	GAAGTCCTCAACAGTGTGCTGAGGAGAACCCTCCAGAGAGGGGCTATTTT	136964

AL669947.14	401	AGAATCATAATATAGTGTTAGTAGAAGACATCTCTAATCTCAGTTTCCAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	136965	AGAATCATAATATAGTGTTAGTAGAAGACATCTCTAATCTCAGTTTCCAA	137014

AL669947.14	451	ATAAGGTGTGATGTATTTATTAGTTACACCCAGCAGGCAGTTCCAAACAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137015	ATAAGGTGTGATGTATTTATTAGTTACACCCAGCAGGCAGTTCCAAACAA	137064

AL669947.14	501	TGGGGATCCCATGATGAATACCAAGATGAATCTTCAGTGCTGCTCAGTCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137065	TGGGGATCCCATGATGAATACCAAGATGAATCTTCAGTGCTGCTCAGTCA	137114

AL669947.14	551	TGAAGCAGGTTAGTTTTTAGGTTACAGCAAAACTTTACATCTCTCATAGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137115	TGAAGCAGGTTAGTTTTTAGGTTACAGCAAAACTTTACATCTCTCATAGT	137164

AL669947.14	601	ACTGTTCTCAGCAACACAGCCACTATCTTTCCTCTATACATTAAATATAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137165	ACTGTTCTCAGCAACACAGCCACTATCTTTCCTCTATACATTAAATATAT	137214

AL669947.14	651	TTATTTTGGGGGAGGGGGAAACTGGAGAAATAGCTTAGCAGTTAAGAGCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137215	TTATTTTGGGGGAGGGGGAAACTGGAGAAATAGCTTAGCAGTTAAGAGCA	137264

AL669947.14	701	CTGGCTGCTCTTCCAGAGGACCCGAGTTCAATTCCTAGCAACCACATGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137265	CTGGCTGCTCTTCCAGAGGACCCGAGTTCAATTCCTAGCAACCACATGGC	137314

AL669947.14	751	AGCTCACAACTGTCTAACTCCTATTCCAGAGGAGGATCCAGTACCCCCAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137315	AGCTCACAACTGTCTAACTCCTATTCCAGAGGAGGATCCAGTACCCCCAT	137364

AL669947.14	801	ACAGACATACATTCAGTCAAAACACCAGTGTACACTAGAAAAAAAAATAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137365	ACAGACATACATTCAGTCAAAACACCAGTGTACACTAGAAAAAAAAATAT	137414

AL669947.14	851	GTATGTGTGTGTGTGTGTTGCCTTTGTGTATGTCTATGCATCACATGCAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137415	GTATGTGTGTGTGTGTGTTGCCTTTGTGTATGTCTATGCATCACATGCAG	137464

AL669947.14	901	GCAATGCTATAGAGGCCAGAAGAGGGCAGCAGACCCCTTGGGACATGGGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137465	GCAATGCTATAGAGGCCAGAAGAGGGCAGCAGACCCCTTGGGACATGGGT	137514

AL669947.14	951	TAGAGGCAGTTGTGACCCACCATGTGGATGCTGGGAATGGAACCTAGGTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137515	TAGAGGCAGTTGTGACCCACCATGTGGATGCTGGGAATGGAACCTAGGTT	137564

AL669947.14	1001	GTCTGGAAGAGCAACCTCTGTTTTTAACCTCTTATCTATCTCCCCAGCCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137565	GTCTGGAAGAGCAACCTCTGTTTTTAACCTCTTATCTATCTCCCCAGCCC	137614

AL669947.14	1051	CTATAAAATGTACAGTTAACTTAAATCAGCAATGGAGATTTTCTAATAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137615	CTATAAAATGTACAGTTAACTTAAATCAGCAATGGAGATTTTCTAATAAA	137664

AL669947.14	1101	TTCTTCAAACTGTGCTTTCAGTGTGTGTCTTCTCTGCAGAGCATACAATT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137665	TTCTTCAAACTGTGCTTTCAGTGTGTGTCTTCTCTGCAGAGCATACAATT	137714

AL669947.14	1151	TATTATTAATTTTATGTTTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTTTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137715	TATTATTAATTTTATGTTTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTTTG	137764

AL669947.14	1201	AATGAATTGGTGTGCATGCCCAAGTCTGCTGTGGCCAGAAGAGTCTTTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137765	AATGAATTGGTGTGCATGCCCAAGTCTGCTGTGGCCAGAAGAGTCTTTGG	137814

AL669947.14	1251	ATTTGGTTGTGAGCCACCAGACAGGTTCTGGGAGCCAAACTTGGGTATTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137815	ATTTGGTTGTGAGCCACCAGACAGGTTCTGGGAGCCAAACTTGGGTATTC	137864

AL669947.14	1301	TGCAACTTGGGTGTTCTGTAACACTTTTTTTTTTTTTTTAAAGATTTGTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137865	TGCAACTTGGGTGTTCTGTAACACTTTTTTTTTTTTTTTAAAGATTTGTT	137914

AL669947.14	1351	TATTTATTTGTTTATTATATGTAAGTACACTGTAGCTGTCCTCAGACACT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137915	TATTTATTTGTTTATTATATGTAAGTACACTGTAGCTGTCCTCAGACACT	137964

AL669947.14	1401	CCAGAAGAGGGAGTCAGATCTCGTTAAGGATGGTTGTGAGCCACCATGTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	137965	CCAGAAGAGGGAGTCAGATCTCGTTAAGGATGGTTGTGAGCCACCATGTG	138014

AL669947.14	1451	GTTGCTGGGATTTGAACTCCTGACCTTCAGAAGAGCAGTCGGGTGCTCTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	138015	GTTGCTGGGATTTGAACTCCTGACCTTCAGAAGAGCAGTCGGGTGCTCTT	138064

AL669947.14	1501	ACCCACTGAGCCATCTCACCAGCCCGTTCTGTTAACAGTTAGCCATTTTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	138065	ACCCACTGAGCCATCTCACCAGCCCGTTCTGTTAACAGTTAGCCATTTTT	138114

AL669947.14	1551	CAAACTCCTGCATTTCAGAATTTAAAGATATACTTCTCTGCCTCCTCTTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	138115	CAAACTCCTGCATTTCAGAATTTAAAGATATACTTCTCTGCCTCCTCTTC	138164

AL669947.14	1601	CTCCTCCTCATTATTATTATTATTAATTTTGGTTTTTCAAGACAGAGTTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	138165	CTCCTCCTCATTATTATTATTATTAATTTTGGTTTTTCAAGACAGAGTTT	138214

AL669947.14	1651	CTCTGTGTAGCCCTAGCAGTCTAGGAACTCTCTCTGTAGATCAGGCTGGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	138215	CTCTGTGTAGCCCTAGCAGTCTAGGAACTCTCTCTGTAGATCAGGCTGGC	138264

AL669947.14	1701	CTCAAACTAAAAAAGATCTACTTGTTTCTGCCTCCCGAGTGTTGGAGTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	138265	CTCAAACTAAAAAAGATCTACTTGTTTCTGCCTCCCGAGTGTTGGAGTTA	138314

AL669947.14	1751	AAGGCAGACACCACCACTGCCTGGCTAGTTGTATTATTTCTGACTATATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	138315	AAGGCAGACACCACCACTGCCTGGCTAGTTGTATTATTTCTGACTATATG	138364

AL669947.14	1801	TGTGTCCCTGTGTGCCTGTGCATGTATTTCCAGCTACATGTGCTAGCCAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	138365	TGTGTCCCTGTGTGCCTGTGCATGTATTTCCAGCTACATGTGCTAGCCAG	138414

AL669947.14	1851	AGGGTCTTCCTGGTGGGTTGGGGTTATAGGCAGCTTTGAGCCACCTGATG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	138415	AGGGTCTTCCTGGTGGGTTGGGGTTATAGGCAGCTTTGAGCCACCTGATG	138464

AL669947.14	1901	CTAATTGCTGGGAACCAAACTTAGGTACTATGAGTATAGATGCTCTTAAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	138465	CTAATTGCTGGGAACCAAACTTAGGTACTATGAGTATAGATGCTCTTAAC	138514

AL669947.14	1951	CAACAAGCTATCTGGCTAACATTTCAGAATTGGATCAGGCGAGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645950.13	138515	CAACAAGCTATCTGGCTAACATTTCAGAATTGGATCAGGCGAGAGAATTC	138564

Overview

Query
AL669947.14 - 102304 bps
Hit
AL645950.13 - 138564 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link