<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645986.6	1	TATTCCCTTCATAATGAATGGGAACTATACTTATCCATGGGTATAAGGAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	138937	TATTCCCTTCATAATGAATGGGAACTATACTTATCCATGGGTATAAGGAT	138986

AL645986.6	51	AAGTGTTTAGAATGTATTTGGGGATTATGCTGGTTTAGTAAAGTGGCAGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	138987	AAGTGTTTAGAATGTATTTGGGGATTATGCTGGTTTAGTAAAGTGGCAGT	139036

AL645986.6	101	TGTAGGTTCTTTGCCATATTCCATGACTTAACTAAGCTTGCATAGTTGGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139037	TGTAGGTTCTTTGCCATATTCCATGACTTAACTAAGCTTGCATAGTTGGC	139086

AL645986.6	151	TAGTTTTCCAGTCCCTGGCATGGTTTGCTCTTATTGATCAGGTCATAAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139087	TAGTTTTCCAGTCCCTGGCATGGTTTGCTCTTATTGATCAGGTCATAAGT	139136

AL645986.6	201	TCAATTGTGGAACTGTTAGTTACCAAGGTATGTGTGTCAATATTGCAGCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139137	TCAATTGTGGAACTGTTAGTTACCAAGGTATGTGTGTCAATATTGCAGCC	139186

AL645986.6	251	CTAGGTTTATCATGCCATGCTGGCCATTGTTGTCATTCATAGGCATCATA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139187	CTAGGTTTATCATGCCATGCTGGCCATTGTTGTCATTCATAGGCATCATA	139236

AL645986.6	301	TCTAGATAGGACTATTGGTTTTTTCCCCTCCCTTGGAAGCTTGCATGGAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139237	TCTAGATAGGACTATTGGTTTTTTCCCCTCCCTTGGAAGCTTGCATGGAA	139286

AL645986.6	351	CCTTCTGGTACTATGAACACTAGCATGCCACCATGGAGGAGACTTTAGGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139287	CCTTCTGGTACTATGAACACTAGCATGCCACCATGGAGGAGACTTTAGGT	139336

AL645986.6	401	CAGTTCCAACTCAAGTCCTCTGGATCCTCTGTCTGAATTGCTTGGTGCCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139337	CAGTTCCAACTCAAGTCCTCTGGATCCTCTGTCTGAATTGCTTGGTGCCT	139386

AL645986.6	451	TTAGGAATAAGAACTTACTTTCTACCTCAAGGGGATAAACAAGTGTAATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139387	TTAGGAATAAGAACTTACTTTCTACCTCAAGGGGATAAACAAGTGTAATT	139436

AL645986.6	501	GCAATAACCTGTAATATTTGGGGAGACATTTGAACAACCTGATAAGTAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139437	GCAATAACCTGTAATATTTGGGGAGACATTTGAACAACCTGATAAGTAAA	139486

AL645986.6	551	TAAAATTAGGACTTATTATTCCTGGTATTGGGGTTTTTGCTAGGTGCCTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139487	TAAAATTAGGACTTATTATTCCTGGTATTGGGGTTTTTGCTAGGTGCCTT	139536

AL645986.6	601	CTAGAGGAGCTAGGAATTTTTTTTAAAAAAAATTATATCCATGTAGTGAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139537	CTAGAGGAGCTAGGAATTTTTTTTAAAAAAAATTATATCCATGTAGTGAG	139586

AL645986.6	651	TAACATATATTTATTATAGGTAATTTTAGTGAGATAATTAATAATATGAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139587	TAACATATATTTATTATAGGTAATTTTAGTGAGATAATTAATAATATGAC	139636

AL645986.6	701	TCCTCATGGCTTTAAAAGATATCCTTACTGTTATTTTTTTCTACCCTCCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139637	TCCTCATGGCTTTAAAAGATATCCTTACTGTTATTTTTTTCTACCCTCCT	139686

AL645986.6	751	TCATCTGTATCTATCTTCCTTATCTCCCTAATTGAAGGCCCCTCCCTATT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139687	TCATCTGTATCTATCTTCCTTATCTCCCTAATTGAAGGCCCCTCCCTATT	139736

AL645986.6	801	TTTATCATTTCCCATCCAAATAACAATTGTTTAATAAATAAATTCAGATA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139737	TTTATCATTTCCCATCCAAATAACAATTGTTTAATAAATAAATTCAGATA	139786

AL645986.6	851	TAAAAAATGACACCTTTAACAGTACTGGTGTGTTATTATGGTTATCAGGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139787	TAAAAAATGACACCTTTAACAGTACTGGTGTGTTATTATGGTTATCAGGG	139836

AL645986.6	901	GTATTTGATAACTTAGCTAGCATTTTCCTCTACCTCTTACTTAAACACAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139837	GTATTTGATAACTTAGCTAGCATTTTCCTCTACCTCTTACTTAAACACAG	139886

AL645986.6	951	TATACAAGAGAAGCATGACTCTCTTTCCTTCCTCTCAGGTTGCAATAGAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139887	TATACAAGAGAAGCATGACTCTCTTTCCTTCCTCTCAGGTTGCAATAGAC	139936

AL645986.6	1001	CTTGCTAATAGGTCTATATATATTTTCAATGCATTTATTTATATACACTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139937	CTTGCTAATAGGTCTATATATATTTTCAATGCATTTATTTATATACACTG	139986

AL645986.6	1051	TCTATGTTTAAATAATAATATGTTTAATGATAATTAAAGATACAACAGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	139987	TCTATGTTTAAATAATAATATGTTTAATGATAATTAAAGATACAACAGAA	140036

AL645986.6	1101	AAATAGAACATATACTGGAAGATATAAGGTGAATTGTTCACGTTCTTTTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140037	AAATAGAACATATACTGGAAGATATAAGGTGAATTGTTCACGTTCTTTTG	140086

AL645986.6	1151	TATTTACTTTTATATTAACTGTATTATTAATTTAACTTGTCAGTTTATTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140087	TATTTACTTTTATATTAACTGTATTATTAATTTAACTTGTCAGTTTATTG	140136

AL645986.6	1201	CATTGAGATCATAGTCACTCTTGCTACCCTCTCCTCTCCCAATCCCACTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140137	CATTGAGATCATAGTCACTCTTGCTACCCTCTCCTCTCCCAATCCCACTA	140186

AL645986.6	1251	ACACCGTTATCTTTAACTATGTTCCCTCCTATAGTCCTTACTTGATGTAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140187	ACACCGTTATCTTTAACTATGTTCCCTCCTATAGTCCTTACTTGATGTAT	140236

AL645986.6	1301	ATCTGTGTAGGCAGCTACTGCTCTAATGTGTTGGTGGTTCAAACAACCAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140237	ATCTGTGTAGGCAGCTACTGCTCTAATGTGTTGGTGGTTCAAACAACCAT	140286

AL645986.6	1351	GTCATATCTATAAGACAGCCTTGCAGTGAAGACATTCTCCTCCTCTCCCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140287	GTCATATCTATAAGACAGCCTTGCAGTGAAGACATTCTCCTCCTCTCCCC	140336

AL645986.6	1401	TCTCCAATCTTTCCAACCCTACTTCCACACTGTCCCTTGAGCCTTGCTGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140337	TCTCCAATCTTTCCAACCCTACTTCCACACTGTCCCTTGAGCCTTGCTGC	140386

AL645986.6	1451	TGGTGGTGATAAAGATGTGTCATTTAGAGCTGGGGTCTGAACAGTAACTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140387	TGGTGGTGATAAAGATGTGTCATTTAGAGCTGGGGTCTGAACAGTAACTT	140436

AL645986.6	1501	ATTCTCAATACTTTAACCAGATATGAGCCTATGATTCTGCAGTAAACCAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140437	ATTCTCAATACTTTAACCAGATATGAGCCTATGATTCTGCAGTAAACCAT	140486

AL645986.6	1551	TGCCCTCTATAAAAAGATACTTCTTTGATTAAGGCTGGAGCTGCACTTAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140487	TGCCCTCTATAAAAAGATACTTCTTTGATTAAGGCTGGAGCTGCACTTAA	140536

AL645986.6	1601	ATGTGTATGTGTGTATGTGTTTATGTATGTGTATTTTTAGGGTCAAAATA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140537	ATGTGTATGTGTGTATGTGTTTATGTATGTGTATTTTTAGGGTCAAAATA	140586

AL645986.6	1651	AGGTAGTCATATATGGCACCATTCTGATGACATGGCACAGAAGTATAGCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140587	AGGTAGTCATATATGGCACCATTCTGATGACATGGCACAGAAGTATAGCT	140636

AL645986.6	1701	CAGAAGCTCAAAAGACAGAAAATTCAACATGCCTATGACTGACTTTTCAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140637	CAGAAGCTCAAAAGACAGAAAATTCAACATGCCTATGACTGACTTTTCAT	140686

AL645986.6	1751	ATTTCCTGCCAATTGTCATTTTAAATAACCATAATATTTCATGAGAACGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140687	ATTTCCTGCCAATTGTCATTTTAAATAACCATAATATTTCATGAGAACGC	140736

AL645986.6	1801	TATTAAATGTTGTATGGACTGCCTTTAAGCAAAGTCAGATCTAAGGTATA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140737	TATTAAATGTTGTATGGACTGCCTTTAAGCAAAGTCAGATCTAAGGTATA	140786

AL645986.6	1851	GATGACTTACCCAACTCTATGCTGGATTTCCTCAAATGAAAGAGAAGATG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140787	GATGACTTACCCAACTCTATGCTGGATTTCCTCAAATGAAAGAGAAGATG	140836

AL645986.6	1901	TGAATTTTATATAAAAAGTAGCACTGAATGCACCTGCTTGAGCTGTTGAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140837	TGAATTTTATATAAAAAGTAGCACTGAATGCACCTGCTTGAGCTGTTGAG	140886

AL645986.6	1951	CTGAGGCTTCATTTCAATCTTGTGGCTGTATTTGGCAAGCAAAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645946.6	140887	CTGAGGCTTCATTTCAATCTTGTGGCTGTATTTGGCAAGCAAAAGAATTC	140936

Overview

Query
AL645986.6 - 48206 bps
Hit
AL645946.6 - 140936 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link