<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 50 bps

Full alignment

AL645931.7	1	GAATTCATTTATCAAATCTAAGAGTCTTTTGGAGGAGTCTTTAGCGTTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	69502	GAATTCATTTATCAAATCTAAGAGTCTTTTGGAGGAGTCTTTAGCGTTTT	69551

AL645931.7	51	CTAGGTATAAGATTATGTTATTGGCAAACAGAGATAATTTGACTTCCTCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	69552	CTAGGTATAAGATTATGTTATTGGCAAACAGAGATAATTTGACTTCCTCT	69601

AL645931.7	101	TTTCCAATTTGGGTGTGCTTTCCCTTGTCTGTTTTCTCTGGCTAGGACTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	69602	TTTCCAATTTGGGTGTGCTTTCCCTTGTCTGTTTTCTCTGGCTAGGACTT	69651

AL645931.7	151	CCAGTACTATGATGAATAGGAGTGGTGAAGGTGGACATCTTTGTCTTGTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	69652	CCAGTACTATGATGAATAGGAGTGGTGAAGGTGGACATCTTTGTCTTGTC	69701

AL645931.7	201	CAGTTCTTAGGGGGACTGGACAAGTTCCCCTGGACAGTTTTTGTTTTTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	69702	CAGTTCTTAGGGGGACTGGACAAGTTCCCCTGGACAGTTTTTGTTTTTTT	69751

AL645931.7	251	GTGTGTGTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGACTGGAGTGCAGTGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	69752	GTGTGTGTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGACTGGAGTGCAGTGG	69801

AL645931.7	301	TGCGACCTCAGCTCCCTGCAACCCCTGCCTCCGAGGTTCAAGCAATTCTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	69802	TGCGACCTCAGCTCCCTGCAACCCCTGCCTCCGAGGTTCAAGCAATTCTC	69851

AL645931.7	351	CTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCAGTCCCACCAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	69852	CTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCAGTCCCACCAT	69901

AL645931.7	401	GCCTAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTAGAGATGAGGTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	69902	GCCTAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTAGAGATGAGGTT	69951

AL645931.7	451	TCACTATTGTTGACCAGACTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAGGTGAATTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	69952	TCACTATTGTTGACCAGACTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAGGTGAATTG	70001

AL645931.7	501	CCCACCTTGGCCTCCCAAACTGCTGGCATTATAGGCGTGAGCCACTGTGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70002	CCCACCTTGGCCTCCCAAACTGCTGGCATTATAGGCGTGAGCCACTGTGC	70051

AL645931.7	551	CCGGCCGGCTTTCAACTTTCATCCATTCAGTATGATATTGGCTGTGTGTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70052	CCGGCCGGCTTTCAACTTTCATCCATTCAGTATGATATTGGCTGTGTGTT	70101

AL645931.7	601	TATCATATCTGACTTTTATAATTTTGAGGTTTGTTCCTTCTATGCCTAGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70102	TATCATATCTGACTTTTATAATTTTGAGGTTTGTTCCTTCTATGCCTAGT	70151

AL645931.7	651	TTGTTGAAATTTTTTATTATAAAGGGATACTGGATTTTACCAAATGCTTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70152	TTGTTGAAATTTTTTATTATAAAGGGATACTGGATTTTACCAAATGCTTT	70201

AL645931.7	701	TTATGCATTGATTGAAATGATCATATGACTTCGTTTTAAATTCTGTTTAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70202	TTATGCATTGATTGAAATGATCATATGACTTCGTTTTAAATTCTGTTTAT	70251

AL645931.7	751	GTGGTGAATCACATTTATTGACTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCCTCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70252	GTGGTGAATCACATTTATTGACTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCCTCC	70301

AL645931.7	801	CTATGATGAAACCCACTTGATCATGGTGATTTATCATTTTGATGTGCTGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70302	CTATGATGAAACCCACTTGATCATGGTGATTTATCATTTTGATGTGCTGA	70351

AL645931.7	851	TGGATTTGGTTTGTTAATATTCTGTTGAAGATTTTTGCATCTATGTTCAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70352	TGGATTTGGTTTGTTAATATTCTGTTGAAGATTTTTGCATCTATGTTCAT	70401

AL645931.7	901	CAGGAATATTGTTCTGTAGTTTTCCTTTTTGTTGTGTTCTTTCCTGGCTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70402	CAGGAATATTGTTCTGTAGTTTTCCTTTTTGTTGTGTTCTTTCCTGGCTT	70451

AL645931.7	951	TGGCATCAGGTAACACTGGCTTCACAGAATGAGTTGGGGAGGATTCTCTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70452	TGGCATCAGGTAACACTGGCTTCACAGAATGAGTTGGGGAGGATTCTCTC	70501

AL645931.7	1001	TTTCTTAATCTTTTGGAATAGTTTCAATAGGATTGGTACCAGTTCTTCTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70502	TTTCTTAATCTTTTGGAATAGTTTCAATAGGATTGGTACCAGTTCTTCTT	70551

AL645931.7	1051	TGAACATCTGGTAGAATTCAGCTGTGAATCTGGTCCTGGGCCTTTTTTTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70552	TGAACATCTGGTAGAATTCAGCTGTGAATCTGGTCCTGGGCCTTTTTTTT	70601

AL645931.7	1101	TTTTTAAAAGATTTTTTATTACTGATTCAATATCAGTACTTGTTACTGGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70602	TTTTTAAAAGATTTTTTATTACTGATTCAATATCAGTACTTGTTACTGGT	70651

AL645931.7	1151	TTGTTCAGGATTTCTATTTGTTCCTGATTCAAGCTTAGAGGGTTGTATGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70652	TTGTTCAGGATTTCTATTTGTTCCTGATTCAAGCTTAGAGGGTTGTATGC	70701

AL645931.7	1201	TTCCAGGAGTTCATTCATTTCCTCTAGGTTTGTTCAGGATTTCTATTTCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70702	TTCCAGGAGTTCATTCATTTCCTCTAGGTTTGTTCAGGATTTCTATTTCT	70751

AL645931.7	1251	TCCTGATTCAAGCTTAGAGGAATGCTTCCAGGAATTCATTCATTTCCTCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70752	TCCTGATTCAAGCTTAGAGGAATGCTTCCAGGAATTCATTCATTTCCTCT	70801

AL645931.7	1301	AGATTTTATAGTTTGTGTGCGTAGAGGTGTTTATAGTATTCTTAGATGAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70802	AGATTTTATAGTTTGTGTGCGTAGAGGTGTTTATAGTATTCTTAGATGAT	70851

AL645931.7	1351	CTTTTGTATTTCTATAGTGTCAGTTGTAATGTCTCCATTTTCTTCTATGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70852	CTTTTGTATTTCTATAGTGTCAGTTGTAATGTCTCCATTTTCTTCTATGT	70901

AL645931.7	1401	TCTTAAATGCAGCTTCTACACAAGATTCCTGCATACTGTAGAAAATTTTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70902	TCTTAAATGCAGCTTCTACACAAGATTCCTGCATACTGTAGAAAATTTTA	70951

AL645931.7	1451	TTTTTTTCACCAAGCCCAATTAATTTAGCTTAGCTGGAGAACTATTAAGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	70952	TTTTTTTCACCAAGCCCAATTAATTTAGCTTAGCTGGAGAACTATTAAGA	71001

AL645931.7	1501	AGTGTGAAGACACAAATAAGAAACGAACGACTTCATTCCATAAATATAAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	71002	AGTGTGAAGACACAAATAAGAAACGAACGACTTCATTCCATAAATATAAG	71051

AL645931.7	1551	TAAAGGAAATTCCAGTGATGGCTTTTGCTGCACGAAGAGAAACCAGGCTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	71052	TAAAGGAAATTCCAGTGATGGCTTTTGCTGCACGAAGAGAAACCAGGCTA	71101

AL645931.7	1601	AGTTGAACTATTAATATTCGCTTTAGACTGCGTAATTTCTAAATGGTAAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	71102	AGTTGAACTATTAATATTCGCTTTAGACTGCGTAATTTCTAAATGGTAAC	71151

AL645931.7	1651	TATTCATACCTACCATTCATCCTAACCATACCTTCAGGCTTGGCTTAGAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	71152	TATTCATACCTACCATTCATCCTAACCATACCTTCAGGCTTGGCTTAGAC	71201

AL645931.7	1701	ACTGGGACCTTTGTGAAGGAAGAGAGGCCTGAGGGAACTGGATTGTAGGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	71202	ACTGGGACCTTTGTGAAGGAAGAGAGGCCTGAGGGAACTGGATTGTAGGA	71251

AL645931.7	1751	GATGGATGGTGAGAGGAAAGCTGGGGGTAAGGGTAGGCGTGCGTCTGGGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	71252	GATGGATGGTGAGAGGAAAGCTGGGGGTAAGGGTAGGCGTGCGTCTGGGC	71301

AL645931.7	1801	TTGCGTTGACTACATAAGAAGGAGATTTAAAAACTATAAAGACTTTTTAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	71302	TTGCGTTGACTACATAAGAAGGAGATTTAAAAACTATAAAGACTTTTTAA	71351

AL645931.7	1851	GATTTTGGAAACTTAGTACCTTCTTCATTTTTACTTTTTTTTTTTTTGTT	1900
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
AL645941.11	71352	GATTTTGGAAACTTAGTACCTTCTTCATTTTTACTTTTTTTTTTTTTGGT	71401

AL645931.7	1901	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATGGAGTCTCGCTTTGTCGCCCAGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	71402	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATGGAGTCTCGCTTTGTCGCCCAGG	71451

AL645931.7	1951	CTGGAGTGCAGTGGCGGGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCTCGGG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645941.11	71452	CTGGAGTGCAGTGGCGGGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCTCGGG	71501

Compact alignment

skip 1850 bps 100% identity alignment

AL645931.7	1851	GATTTTGGAAACTTAGTACCTTCTTCATTTTTACTTTTTTTTTTTTTGTT	1900
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
AL645941.11	71352	GATTTTGGAAACTTAGTACCTTCTTCATTTTTACTTTTTTTTTTTTTGGT	71401

skip 100 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AL645931.7 - 124899 bps
Hit
AL645941.11 - 71501 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link