<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662815.13	1	GAATTCCCTTTGGCAATATAAGAATATGTTTTAGAGATTTCTACAGATCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	136852	GAATTCCCTTTGGCAATATAAGAATATGTTTTAGAGATTTCTACAGATCT	136901

AL662815.13	51	GTATGGCTTCTCTTTGCTTTTTCCAAACCCAAACATTTCTTCAAAATGAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	136902	GTATGGCTTCTCTTTGCTTTTTCCAAACCCAAACATTTCTTCAAAATGAA	136951

AL662815.13	101	GGTCAATGGAAGACACCATCTATGAACCCTTACTTTTTGTGTCCTTGGAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	136952	GGTCAATGGAAGACACCATCTATGAACCCTTACTTTTTGTGTCCTTGGAC	137001

AL662815.13	151	AAGAAGCTTATAGGTTCTAGATGCACTGGGTGTTTCAGGATGATGTGCTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137002	AAGAAGCTTATAGGTTCTAGATGCACTGGGTGTTTCAGGATGATGTGCTC	137051

AL662815.13	201	AAACCAGGCACCATGTGTGCTGAGGTATGAGCTGTGTCTTCTAGTTGGGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137052	AAACCAGGCACCATGTGTGCTGAGGTATGAGCTGTGTCTTCTAGTTGGGA	137101

AL662815.13	251	TTCCTATTGCTGTATAGAGACATCATGACCAGGGCAACTCTTAAAGGAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137102	TTCCTATTGCTGTATAGAGACATCATGACCAGGGCAACTCTTAAAGGAAA	137151

AL662815.13	301	ACATTTAACTGGGACTGGCTATTATCATCATGGTGGGAAACATGGCAGCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137152	ACATTTAACTGGGACTGGCTATTATCATCATGGTGGGAAACATGGCAGCA	137201

AL662815.13	351	CACAGGCAGACGAGGCACTGGAGAAGGAGCCAATAGTTTTACACCTGGAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137202	CACAGGCAGACGAGGCACTGGAGAAGGAGCCAATAGTTTTACACCTGGAC	137251

AL662815.13	401	CATCAACGCAGCAGGAAGGGAGAGCCCCTGGGCCTGGCTTAGACATCTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137252	CATCAACGCAGCAGGAAGGGAGAGCCCCTGGGCCTGGCTTAGACATCTGA	137301

AL662815.13	451	AACCCAAAAGCCTGTTCCCAGTGACACACTTCCTCCTACAGAGCCACGCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137302	AACCCAAAAGCCTGTTCCCAGTGACACACTTCCTCCTACAGAGCCACGCC	137351

AL662815.13	501	TATTCTAACAAAGCCATGTCCCGCAATGCCACTCACTCCCTAAGCATTCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137352	TATTCTAACAAAGCCATGTCCCGCAATGCCACTCACTCCCTAAGCATTCA	137401

AL662815.13	551	AATATGAGTCTGTGGTGTCATTCTCATTCAAACTATCACATCCTGGAAGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137402	AATATGAGTCTGTGGTGTCATTCTCATTCAAACTATCACATCCTGGAAGC	137451

AL662815.13	601	AGTACATGGAGTTCTGTGCCTCAGTAGAACGAACCAGGATCACCTATGGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137452	AGTACATGGAGTTCTGTGCCTCAGTAGAACGAACCAGGATCACCTATGGA	137501

AL662815.13	651	AGGGTCCTTGTGTTTGCCAGTTTGGAATTTCATGCATTCTTTTTATTGCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137502	AGGGTCCTTGTGTTTGCCAGTTTGGAATTTCATGCATTCTTTTTATTGCA	137551

AL662815.13	701	CTGCATATTAGTGGAGATGTTTGGGGGCCTTTAAAGAGCATTTAAAAAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137552	CTGCATATTAGTGGAGATGTTTGGGGGCCTTTAAAGAGCATTTAAAAAGG	137601

AL662815.13	751	CTGGTTCTGACACACGCACAAAAATTCTGCAAAGGGGGGAAAGAGCCACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137602	CTGGTTCTGACACACGCACAAAAATTCTGCAAAGGGGGGAAAGAGCCACA	137651

AL662815.13	801	CATTCAATGGCCTAAAACTTAAAGCAAAGAAGTGCTTATGTACCAGCCGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137652	CATTCAATGGCCTAAAACTTAAAGCAAAGAAGTGCTTATGTACCAGCCGG	137701

AL662815.13	851	GGCCTAGCAAACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTAATGGATGGATC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137702	GGCCTAGCAAACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTAATGGATGGATC	137751

AL662815.13	901	ACAGGGCTCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAGGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137752	ACAGGGCTCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAGGG	137801

AL662815.13	951	ATCTTCAACCCTATAGGTGGAACAACATTATGAACTAACCAGTACCCCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137802	ATCTTCAACCCTATAGGTGGAACAACATTATGAACTAACCAGTACCCCTG	137851

AL662815.13	1001	AGCTCTTGACTCTAGCTGCATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137852	AGCTCTTGACTCTAGCTGCATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCAT	137901

AL662815.13	1051	CACTGGAAAGAGAGGCCCATTGGACACGCAGACTTTGTGTGCCCCGGTAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137902	CACTGGAAAGAGAGGCCCATTGGACACGCAGACTTTGTGTGCCCCGGTAC	137951

AL662815.13	1101	AGGGGAACGCCAGGGCCAAAGGGGGGGAGTGGGTGGGTAGGGGAGTGGGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	137952	AGGGGAACGCCAGGGCCAAAGGGGGGGAGTGGGTGGGTAGGGGAGTGGGG	138001

AL662815.13	1151	GTGGGTGGGTAAGGGGGACTTTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138002	GTGGGTGGGTAAGGGGGACTTTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGC	138051

AL662815.13	1201	TAAATACCTAATAAAAAATGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACAAGAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138052	TAAATACCTAATAAAAAATGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACAAGAA	138101

AL662815.13	1251	GGAAACTAGACAGGGAGACCAGAGAGGCTGTTCTGAGCATAAGAGAGGAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138102	GGAAACTAGACAGGGAGACCAGAGAGGCTGTTCTGAGCATAAGAGAGGAA	138151

AL662815.13	1301	ATGAAAGACACTTCAGAGCACAGTCAAATGGGGCACCAGCTATGACCCCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138152	ATGAAAGACACTTCAGAGCACAGTCAAATGGGGCACCAGCTATGACCCCA	138201

AL662815.13	1351	CATGACTGAAATCCAGCTCTGGATGGAAATGTTGGAGATGGAGAAAGGAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138202	CATGACTGAAATCCAGCTCTGGATGGAAATGTTGGAGATGGAGAAAGGAG	138251

AL662815.13	1401	GATGCTTTTCACTGTGGTGCTCTGCAGGGAAGATGCTCTGCAGGAGAGCG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138252	GATGCTTTTCACTGTGGTGCTCTGCAGGGAAGATGCTCTGCAGGAGAGCG	138301

AL662815.13	1451	CCACGAAGGCAGGGGAGAGTGTTGCAGTAGAGGAGCTGACCACCTCAGAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138302	CCACGAAGGCAGGGGAGAGTGTTGCAGTAGAGGAGCTGACCACCTCAGAG	138351

AL662815.13	1501	GCTTCTTCCAGGATACAGGAGAAGGCAAAGAGAGGCACACTTCAGTAGCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138352	GCTTCTTCCAGGATACAGGAGAAGGCAAAGAGAGGCACACTTCAGTAGCA	138401

AL662815.13	1551	GGCAGTTCATCAGGCTACCAATGGCAGCTTTCCTGGCAGGCTGTTCATGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138402	GGCAGTTCATCAGGCTACCAATGGCAGCTTTCCTGGCAGGCTGTTCATGG	138451

AL662815.13	1601	GACTGTGAACTGAGCCACCCCTCCCACCTCCTTGACTGTTTGAGGAAGTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138452	GACTGTGAACTGAGCCACCCCTCCCACCTCCTTGACTGTTTGAGGAAGTC	138501

AL662815.13	1651	CTTTGGATCTAGTCTGGTGTTTTCACTGAGCAACCAAAGCAACTTCTGGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138502	CTTTGGATCTAGTCTGGTGTTTTCACTGAGCAACCAAAGCAACTTCTGGC	138551

AL662815.13	1701	TGATATTCCACCACCTAATCACCTAATTTTTTTTTGGTTTGTCTTATGCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138552	TGATATTCCACCACCTAATCACCTAATTTTTTTTTGGTTTGTCTTATGCC	138601

AL662815.13	1751	TTGAAAATTTAAGTATTTGTTCTAGTATAAACATTTGACACTCAGCATTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138602	TTGAAAATTTAAGTATTTGTTCTAGTATAAACATTTGACACTCAGCATTT	138651

AL662815.13	1801	TTTTTCTTAACTAAAAATAGCCAAGAGCTTTATGAATGTAAAAAAAAAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138652	TTTTTCTTAACTAAAAATAGCCAAGAGCTTTATGAATGTAAAAAAAAAAA	138701

AL662815.13	1851	AAATAAGCAAGCATTGTTTTGGGAAGTCCACATCTCCCAAGGTAATGTAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138702	AAATAAGCAAGCATTGTTTTGGGAAGTCCACATCTCCCAAGGTAATGTAG	138751

AL662815.13	1901	TATCTATCTGACTTCACCAGTTGCAGCTGCCAACATCCTTCTCTTCCATA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138752	TATCTATCTGACTTCACCAGTTGCAGCTGCCAACATCCTTCTCTTCCATA	138801

AL662815.13	1951	GCCAACCTTCTCCTTTATGTCTCCTACCCCTAATAACAGTCCTTGTGGGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645938.9	138802	GCCAACCTTCTCCTTTATGTCTCCTACCCCTAATAACAGTCCTTGTGGGC	138851

Overview

Query
AL662815.13 - 155204 bps
Hit
AL645938.9 - 138851 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link