<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL663061.8	1	GAACAGGGTCCCCTGTGTCCCCACTCATTTGCGTTTTCCTTTTTATTACA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	109329	GAACAGGGTCCCCTGTGTCCCCACTCATTTGCGTTTTCCTTTTTATTACA	109378

AL663061.8	51	GCCAACCCCTTTTGTAAATATTGTTACACATCTCTCTATTCCACTGAAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	109379	GCCAACCCCTTTTGTAAATATTGTTACACATCTCTCTATTCCACTGAAAA	109428

AL663061.8	101	CATCTCTTTCAAAGGCACTTTAAGAAAGATTCAATGACATGAAAATATGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	109429	CATCTCTTTCAAAGGCACTTTAAGAAAGATTCAATGACATGAAAATATGA	109478

AL663061.8	151	AGGATCCTCTTGAAAGAGTTTCTGGTGGTGGGTTTTAAAGAACATTTTGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	109479	AGGATCCTCTTGAAAGAGTTTCTGGTGGTGGGTTTTAAAGAACATTTTGG	109528

AL663061.8	201	TTTTTAAAACTCTGTAACCATTTTGGTGTGGGGCTTAGCTTCGTATTTTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	109529	TTTTTAAAACTCTGTAACCATTTTGGTGTGGGGCTTAGCTTCGTATTTTC	109578

AL663061.8	251	AAATTGAAATATTCTCTTCCTTAACGTCCGCATAAATCCAAGTTCACAAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	109579	AAATTGAAATATTCTCTTCCTTAACGTCCGCATAAATCCAAGTTCACAAT	109628

AL663061.8	301	TTTTATTATTTTAAAATTTTATTTATTTTTGTTTTGGGGACAGGTTCTCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	109629	TTTTATTATTTTAAAATTTTATTTATTTTTGTTTTGGGGACAGGTTCTCC	109678

AL663061.8	351	TCCTGTCACCCAGGCTGGATTGCAATGGCACAATCATAGCTCACTGCAGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	109679	TCCTGTCACCCAGGCTGGATTGCAATGGCACAATCATAGCTCACTGCAGC	109728

AL663061.8	401	CTGGAACTCCCCGGCTCAAGCGATCCTCCTGCCTCCAATTCCCAAAGAGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	109729	CTGGAACTCCCCGGCTCAAGCGATCCTCCTGCCTCCAATTCCCAAAGAGC	109778

AL663061.8	451	TGAGATTATAGGCATGAACCACTGCAACTCACCCAAATCCAAGTTTATAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	109779	TGAGATTATAGGCATGAACCACTGCAACTCACCCAAATCCAAGTTTATAC	109828

AL663061.8	501	TAAAAGATAAAATTCCAACATTTCAGAGAAAATGAAAGTCACAAAGTTAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	109829	TAAAAGATAAAATTCCAACATTTCAGAGAAAATGAAAGTCACAAAGTTAT	109878

AL663061.8	551	CCCAGTCTCTGAAGTCACTGTCAAAACTTTGGTGAGGAATCTTCCAGGTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	109879	CCCAGTCTCTGAAGTCACTGTCAAAACTTTGGTGAGGAATCTTCCAGGTT	109928

AL663061.8	601	TTCCCCTACTTAAAATATATATTAATATTATGTAAGTAATATTAGCGGCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	109929	TTCCCCTACTTAAAATATATATTAATATTATGTAAGTAATATTAGCGGCA	109978

AL663061.8	651	TTTTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGCAACCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	109979	TTTTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGCAACCT	110028

AL663061.8	701	CCACCTCCCGGGTTCAAGCAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110029	CCACCTCCCGGGTTCAAGCAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTG	110078

AL663061.8	751	GGACTACAGGCGCCGGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTCAGTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110079	GGACTACAGGCGCCGGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTCAGTG	110128

AL663061.8	801	GAGACAGGGTTTCACCATATTGACCAGGCTGATCTCCAACTCCTGACCTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110129	GAGACAGGGTTTCACCATATTGACCAGGCTGATCTCCAACTCCTGACCTC	110178

AL663061.8	851	AGGTGATCTGCCCACCTTGGCCTTCCAAAGTTCTGGGATTACAGGCGTGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110179	AGGTGATCTGCCCACCTTGGCCTTCCAAAGTTCTGGGATTACAGGCGTGA	110228

AL663061.8	901	GCCACTGGGCCCAGCCTCCTTAACCTTTTAAAAAAGGTTAAAAGTATGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110229	GCCACTGGGCCCAGCCTCCTTAACCTTTTAAAAAAGGTTAAAAGTATGCT	110278

AL663061.8	951	GGGCACTTCTTTTCATAGCAATACTTAAAAGCAATCTTACTCTTTTTAAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110279	GGGCACTTCTTTTCATAGCAATACTTAAAAGCAATCTTACTCTTTTTAAT	110328

AL663061.8	1001	GACTGTATAGAATTTTATAATATAACTCTTCTTTGGGAGACAATTGAAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110329	GACTGTATAGAATTTTATAATATAACTCTTCTTTGGGAGACAATTGAAAT	110378

AL663061.8	1051	GTTCTTTATCTTCACTGTGGTAGTGGAGATGTGGGTGTGTACAACAGCTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110379	GTTCTTTATCTTCACTGTGGTAGTGGAGATGTGGGTGTGTACAACAGCTA	110428

AL663061.8	1101	AAATTCAACAAGTTGAACACTTTAAATAGATGCAGTTTATTGCATGCAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110429	AAATTCAACAAGTTGAACACTTTAAATAGATGCAGTTTATTGCATGCAAA	110478

AL663061.8	1151	GTATGTCCCAATATGATGATTTAAAAATATTATCGTCTTTGAGATTTGTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110479	GTATGTCCCAATATGATGATTTAAAAATATTATCGTCTTTGAGATTTGTA	110528

AL663061.8	1201	CTTTGCTTATGTGAAACAAAACAAAACAAAAACCCTGTTCTTGTGCCCAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110529	CTTTGCTTATGTGAAACAAAACAAAACAAAAACCCTGTTCTTGTGCCCAG	110578

AL663061.8	1251	GAGACACACCCTGACACATCTGGAGGTAGAGGGTCATGCTGTCTGCAACT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110579	GAGACACACCCTGACACATCTGGAGGTAGAGGGTCATGCTGTCTGCAACT	110628

AL663061.8	1301	TACCCTCACAGGCTCTGAAATAACAATAATAGCAGTATATTTACAGATTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110629	TACCCTCACAGGCTCTGAAATAACAATAATAGCAGTATATTTACAGATTC	110678

AL663061.8	1351	AGAAAGAGAGAAAGCTATAGTAAAAATGTTCATAAGTAAAACTAGATAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110679	AGAAAGAGAGAAAGCTATAGTAAAAATGTTCATAAGTAAAACTAGATAAA	110728

AL663061.8	1401	GGGCAAAAATAAATAATAAAACTACGTCTTTTAAATTTTATCTCTCCTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110729	GGGCAAAAATAAATAATAAAACTACGTCTTTTAAATTTTATCTCTCCTTT	110778

AL663061.8	1451	ATTTTTTCTCTCCCCTTTTCTTCCTATCTCTTCCCTCCTTTCTTAACACG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110779	ATTTTTTCTCTCCCCTTTTCTTCCTATCTCTTCCCTCCTTTCTTAACACG	110828

AL663061.8	1501	TCCCCCTATCCTTCCCTCCTTTCACCACTCTCTGCACTTGATCCCCGGTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110829	TCCCCCTATCCTTCCCTCCTTTCACCACTCTCTGCACTTGATCCCCGGTG	110878

AL663061.8	1551	TATTCCAGCCTCCAGGCCAACACACTTCACCGCGTCCGCCTGGGGCAGGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110879	TATTCCAGCCTCCAGGCCAACACACTTCACCGCGTCCGCCTGGGGCAGGT	110928

AL663061.8	1601	CAGAAAAGGGACGCGAGGCGGCGCTGTCACAGCATTCTATGCGCCCCAGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110929	CAGAAAAGGGACGCGAGGCGGCGCTGTCACAGCATTCTATGCGCCCCAGC	110978

AL663061.8	1651	GCCCTGGGCCGCGCTGGTCTTGTATCATTTCAGTGGTCCCTCCCGTCTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	110979	GCCCTGGGCCGCGCTGGTCTTGTATCATTTCAGTGGTCCCTCCCGTCTTT	111028

AL663061.8	1701	GACGGGGCCAAACTCGGGGTGTAAATTAGGATCCTCACTGAAGCGGCGGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	111029	GACGGGGCCAAACTCGGGGTGTAAATTAGGATCCTCACTGAAGCGGCGGG	111078

AL663061.8	1751	ACCCTGAGAGGCTTTTTCCTGGCCCCTTAGTTGTGGGTTTTCCTGCGGGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	111079	ACCCTGAGAGGCTTTTTCCTGGCCCCTTAGTTGTGGGTTTTCCTGCGGGC	111128

AL663061.8	1801	GGTGGAGCCCGTTTCCATCAGAACCGCCCAGAGGCGGGCGCTGCCTTCCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	111129	GGTGGAGCCCGTTTCCATCAGAACCGCCCAGAGGCGGGCGCTGCCTTCCA	111178

AL663061.8	1851	GGGGTGAAGTGTTTTCGGACCCCGGAATCTGTGGGCGGCCTGCGGGAGGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	111179	GGGGTGAAGTGTTTTCGGACCCCGGAATCTGTGGGCGGCCTGCGGGAGGG	111228

AL663061.8	1901	GCTGAGGCGCAGTTCCCTACTCACCCAGGTCCGAATCCACCGCGGTGCTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	111229	GCTGAGGCGCAGTTCCCTACTCACCCAGGTCCGAATCCACCGCGGTGCTG	111278

AL663061.8	1951	TTTCCAGCGAGTCAGATTCCAGATCGCGCTCCAGCCTGGACTCGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645933.8	111279	TTTCCAGCGAGTCAGATTCCAGATCGCGCTCCAGCCTGGACTCGGAATTC	111328

Overview

Query
AL663061.8 - 37000 bps
Hit
AL645933.8 - 111328 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link