<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL606472.13	1	TCCAGCGCTCTGCTCCTGTCCACCAATTTTAATGATCTTATTTTGGACAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	155362	TCCAGCGCTCTGCTCCTGTCCACCAATTTTAATGATCTTATTTTGGACAG	155411

AL606472.13	51	TTAATAAGTGATGTATATTTTTTTCTGCCTGAAACGAATAATTTCAGAGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	155412	TTAATAAGTGATGTATATTTTTTTCTGCCTGAAACGAATAATTTCAGAGA	155461

AL606472.13	101	AGGAAAACACCCTCCACCTACTTTTCCCTCCCTAGTGATAGGATGTGCCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	155462	AGGAAAACACCCTCCACCTACTTTTCCCTCCCTAGTGATAGGATGTGCCA	155511

AL606472.13	151	CCGTGACAAGCTTAAGTTTTATCTTTGTAGGTCCAAACATTCCTCACTAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	155512	CCGTGACAAGCTTAAGTTTTATCTTTGTAGGTCCAAACATTCCTCACTAC	155561

AL606472.13	201	CACCTTAGAATACAATGATGCTACTGCCTTACAAATTCAGTAGAAATTCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	155562	CACCTTAGAATACAATGATGCTACTGCCTTACAAATTCAGTAGAAATTCC	155611

AL606472.13	251	CGTCAGGATGGAGAGTTTAAGGATGGATTCTCAAGTGAACTACAAATAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	155612	CGTCAGGATGGAGAGTTTAAGGATGGATTCTCAAGTGAACTACAAATAAA	155661

AL606472.13	301	AGAGTACCAAGCCTAAACTAACAGATAAAGTTGCTGGCACTGAAAATGTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	155662	AGAGTACCAAGCCTAAACTAACAGATAAAGTTGCTGGCACTGAAAATGTA	155711

AL606472.13	351	GAAATTTTCCAAATGTGCAATGGGTAGGTTTAAAGTTACAATATTGACAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	155712	GAAATTTTCCAAATGTGCAATGGGTAGGTTTAAAGTTACAATATTGACAT	155761

AL606472.13	401	TTTTATAAGGCAAGTGAACTTTAGAGAAGATAGATATTTTTTACAGAAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	155762	TTTTATAAGGCAAGTGAACTTTAGAGAAGATAGATATTTTTTACAGAAAA	155811

AL606472.13	451	CTGAAAGCTCCTATTTAGTTCTAGTGACTGGAAGAAAAGAGGAAGCATCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	155812	CTGAAAGCTCCTATTTAGTTCTAGTGACTGGAAGAAAAGAGGAAGCATCA	155861

AL606472.13	501	GGCAAAGATTCACCCCAAAACTCTCTTATGATAACAGACCCTAAACGCAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	155862	GGCAAAGATTCACCCCAAAACTCTCTTATGATAACAGACCCTAAACGCAT	155911

AL606472.13	551	GGAATAGTGTACCTGCCCTTTGTGGGATCAGTTCTCCTGGCCCTGGCCCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	155912	GGAATAGTGTACCTGCCCTTTGTGGGATCAGTTCTCCTGGCCCTGGCCCT	155961

AL606472.13	601	AGTTATTCTGTGTTTTAAGCATAGGATGAAGAGTGAAGGTGACCAGACTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	155962	AGTTATTCTGTGTTTTAAGCATAGGATGAAGAGTGAAGGTGACCAGACTC	156011

AL606472.13	651	AGCATCTCTCCTCTACACTTAAGCTTAGTCAAAGACAGGAAGATGTGTGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156012	AGCATCTCTCCTCTACACTTAAGCTTAGTCAAAGACAGGAAGATGTGTGT	156061

AL606472.13	701	CGTTAAGCAAAATGTGCATGTGAGTAAAAGAAACTGAAACATCTACTCAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156062	CGTTAAGCAAAATGTGCATGTGAGTAAAAGAAACTGAAACATCTACTCAC	156111

AL606472.13	751	CACAGTGATCATGGGCAGACAGGCTCTGTGTCTTCTGGCAAGTGAGCCTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156112	CACAGTGATCATGGGCAGACAGGCTCTGTGTCTTCTGGCAAGTGAGCCTT	156161

AL606472.13	801	CCCAGGTCACATTTGTACCTTAGGCGTTTTCAGAGAATTTGTCACCATAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156162	CCCAGGTCACATTTGTACCTTAGGCGTTTTCAGAGAATTTGTCACCATAA	156211

AL606472.13	851	TGTATCTTCAAGATGTTGTTAACTTATCACCATGTCAGGGAGAAGGAAGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156212	TGTATCTTCAAGATGTTGTTAACTTATCACCATGTCAGGGAGAAGGAAGC	156261

AL606472.13	901	CCTCTGCAGAACTGCAGTCCCTAAAGGATGACTTTTCCTCTCCCTCCTTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156262	CCTCTGCAGAACTGCAGTCCCTAAAGGATGACTTTTCCTCTCCCTCCTTA	156311

AL606472.13	951	ATTGTTTGCCTCCAGAGTTACCTCTGGATTAATTACATTTTCATTATATG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156312	ATTGTTTGCCTCCAGAGTTACCTCTGGATTAATTACATTTTCATTATATG	156361

AL606472.13	1001	ATAGAAACACATAAAGAGACAAAATGAACAACAACCAATCTTCTATGTCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156362	ATAGAAACACATAAAGAGACAAAATGAACAACAACCAATCTTCTATGTCT	156411

AL606472.13	1051	AGAGTCCCCATGTTCCTGGACCCCTCTTTACATTGCTAAACTAAATGTAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156412	AGAGTCCCCATGTTCCTGGACCCCTCTTTACATTGCTAAACTAAATGTAT	156461

AL606472.13	1101	GAGTCAGAATAGAGGCCTGCTTCTGATCCAGATAAAGATCTGTTCTCTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156462	GAGTCAGAATAGAGGCCTGCTTCTGATCCAGATAAAGATCTGTTCTCTTT	156511

AL606472.13	1151	CTCAAGTCCTTCTTTCTATGGAGAACATTATGAGTCACATCCAACACTCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156512	CTCAAGTCCTTCTTTCTATGGAGAACATTATGAGTCACATCCAACACTCT	156561

AL606472.13	1201	ACACTCTACTTTCTGAGCATAACCTAAACACACACCTGAGCCCACAAGAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156562	ACACTCTACTTTCTGAGCATAACCTAAACACACACCTGAGCCCACAAGAT	156611

AL606472.13	1251	AGCTTTACTACATCTGGACACAATCTAGGTCATAGTCAGCCATGAGCAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156612	AGCTTTACTACATCTGGACACAATCTAGGTCATAGTCAGCCATGAGCAAC	156661

AL606472.13	1301	ACGATTTTCTTCCTTCTTTGTTAAATAAATGGTATCGTCAAAGCAGATGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156662	ACGATTTTCTTCCTTCTTTGTTAAATAAATGGTATCGTCAAAGCAGATGG	156711

AL606472.13	1351	ACCTCCCTTTTCCAGCTCAAATTCTGGCCTAAGCCACTGTATCCTTCTAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156712	ACCTCCCTTTTCCAGCTCAAATTCTGGCCTAAGCCACTGTATCCTTCTAA	156761

AL606472.13	1401	CCCAAAGGTACTCCCAATACCTAGTGCATGATACATGTTTTGACTGTAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156762	CCCAAAGGTACTCCCAATACCTAGTGCATGATACATGTTTTGACTGTAAA	156811

AL606472.13	1451	TAAAGGAAAGCCTTTTACTGCCTTCACCCTTGCTTTGAAATGGAATATTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156812	TAAAGGAAAGCCTTTTACTGCCTTCACCCTTGCTTTGAAATGGAATATTA	156861

AL606472.13	1501	TTTTCTGAGTTAACAGAGTTGGGACCACACATTTTCAAAGGTAAAAACAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156862	TTTTCTGAGTTAACAGAGTTGGGACCACACATTTTCAAAGGTAAAAACAT	156911

AL606472.13	1551	ATATAAAACTAAAAAATTTTAATTTAGGTTGAAGCAAAAGGGTAGAGTTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156912	ATATAAAACTAAAAAATTTTAATTTAGGTTGAAGCAAAAGGGTAGAGTTC	156961

AL606472.13	1601	ATCTCTATTCTATTAAAACCTTTTCAACATACGTTGTGTGTAGTTTTTTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	156962	ATCTCTATTCTATTAAAACCTTTTCAACATACGTTGTGTGTAGTTTTTTC	157011

AL606472.13	1651	TCTTATTCCTTCAAGAGTTTTGTAAGATTTTGGTTTCATCAGAACAACAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	157012	TCTTATTCCTTCAAGAGTTTTGTAAGATTTTGGTTTCATCAGAACAACAA	157061

AL606472.13	1701	CCCTCTGTTCTATTATTGAACCCGGAGTCAATCCTAGGGAAGATCCTAGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	157062	CCCTCTGTTCTATTATTGAACCCGGAGTCAATCCTAGGGAAGATCCTAGT	157111

AL606472.13	1751	GTTTGTAAGATATGTTATGTATATACTTTGTTACTGATGCTGAGAAGAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	157112	GTTTGTAAGATATGTTATGTATATACTTTGTTACTGATGCTGAGAAGAAA	157161

AL606472.13	1801	ACCAGACTTATCTCTCACTTGACTTTCTGAAACATATTTAGCACAGAGAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	157162	ACCAGACTTATCTCTCACTTGACTTTCTGAAACATATTTAGCACAGAGAG	157211

AL606472.13	1851	ATTGACTTCAGAGGGAAACTGGGTTTTGTATTTTCTATTTTTAAACAGTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	157212	ATTGACTTCAGAGGGAAACTGGGTTTTGTATTTTCTATTTTTAAACAGTG	157261

AL606472.13	1901	GAGGGGGGACATTCATTGGGACTTGGAGATACAAAAAACAACTGCTTCTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	157262	GAGGGGGGACATTCATTGGGACTTGGAGATACAAAAAACAACTGCTTCTG	157311

AL606472.13	1951	GTCTCCATGGTTAGAATATTTGACTGCAAAATCTCCTTTAGAAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645923.14	157312	GTCTCCATGGTTAGAATATTTGACTGCAAAATCTCCTTTAGAAGGAATTC	157361

Overview

Query
AL606472.13 - 130721 bps
Hit
AL645923.14 - 157361 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link