<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL772248.5	1	TGGAGTCCCTGGACTTGGGTCACTCTGAGGCACTAGGAAGAGTGGGTAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	178561	TGGAGTCCCTGGACTTGGGTCACTCTGAGGCACTAGGAAGAGTGGGTAGA	178610

AL772248.5	51	GAGAAGGGAGAGACTTAGGTCCAAGGAGAATGGGGAAGCCAAATCCCACA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	178611	GAGAAGGGAGAGACTTAGGTCCAAGGAGAATGGGGAAGCCAAATCCCACA	178660

AL772248.5	101	TAGGAATGCTGTGTGAGGCTGTGCAGGTTGTTCACTGCACAAAAGTGCAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	178661	TAGGAATGCTGTGTGAGGCTGTGCAGGTTGTTCACTGCACAAAAGTGCAT	178710

AL772248.5	151	TTGCTGAGGGAGTACAGAGGGACTGAAATCCAGCCAGCACTCTGCTTGCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	178711	TTGCTGAGGGAGTACAGAGGGACTGAAATCCAGCCAGCACTCTGCTTGCC	178760

AL772248.5	201	GAGCTGTGTGCCCTGGTGAGGAGTGGTGTCCACTTTAAGGAATGGGTGCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	178761	GAGCTGTGTGCCCTGGTGAGGAGTGGTGTCCACTTTAAGGAATGGGTGCC	178810

AL772248.5	251	TTCTTTCAAACGGCATGGAAGCACTGCGTGGACTAGTGTGGCTCTGCCTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	178811	TTCTTTCAAACGGCATGGAAGCACTGCGTGGACTAGTGTGGCTCTGCCTC	178860

AL772248.5	301	CAACCACAAACCAGAGCAGCAGGGAGCTTCAGAAAGAGGGGAGCCCAGCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	178861	CAACCACAAACCAGAGCAGCAGGGAGCTTCAGAAAGAGGGGAGCCCAGCC	178910

AL772248.5	351	AGGCCCTTTCACATCTCCATAGCCAGGGAAATCTTCCCAGTACAACCTCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	178911	AGGCCCTTTCACATCTCCATAGCCAGGGAAATCTTCCCAGTACAACCTCC	178960

AL772248.5	401	ACTGCTTCCAAGCCTAACTACTAGCTGGCTTCTTCTCCAAGAGAGGAGAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	178961	ACTGCTTCCAAGCCTAACTACTAGCTGGCTTCTTCTCCAAGAGAGGAGAG	179010

AL772248.5	451	CACAATCCTTGAAGCGTTTTAACGTGGGACAGCCTCCCTCATCTATGCTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179011	CACAATCCTTGAAGCGTTTTAACGTGGGACAGCCTCCCTCATCTATGCTG	179060

AL772248.5	501	CAGGCCTCTCCTCCTCTTTGGGAACTTTGACCCATGGATGGACTCCCTCG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179061	CAGGCCTCTCCTCCTCTTTGGGAACTTTGACCCATGGATGGACTCCCTCG	179110

AL772248.5	551	CCTGCAGCACTGACCCTTCACTCCCCAGCAGCTGTGCCATCAGCATTTCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179111	CCTGCAGCACTGACCCTTCACTCCCCAGCAGCTGTGCCATCAGCATTTCA	179160

AL772248.5	601	ACAAGCTACTGTCACACCCCTCCTCACCCCCACTCTGTGTGCATCTCTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179161	ACAAGCTACTGTCACACCCCTCCTCACCCCCACTCTGTGTGCATCTCTCT	179210

AL772248.5	651	CTAGCCTCCATCTTCCCTCTTTGCTCTCATTCCCAGCCCAGATTCCAGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179211	CTAGCCTCCATCTTCCCTCTTTGCTCTCATTCCCAGCCCAGATTCCAGAA	179260

AL772248.5	701	AGTGATGTCTACACTGATTGCAGCCATGTCCTCACCTCCACCACCCTCCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179261	AGTGATGTCTACACTGATTGCAGCCATGTCCTCACCTCCACCACCCTCCC	179310

AL772248.5	751	GATCCAGCTCCACCCCTCCACCAGGCAGCAGCTCTCATGCAGGCCAGGGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179311	GATCCAGCTCCACCCCTCCACCAGGCAGCAGCTCTCATGCAGGCCAGGGG	179360

AL772248.5	801	TGGCCTTGCCATTGCTAAATTCTGTGGACGCTCCGTAGCCCTTGAATCAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179361	TGGCCTTGCCATTGCTAAATTCTGTGGACGCTCCGTAGCCCTTGAATCAC	179410

AL772248.5	851	TGTTCCGGAATCTGACAAGTCCAACCGCACCCTCCTTCCTGGAGTCCAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179411	TGTTCCGGAATCTGACAAGTCCAACCGCACCCTCCTTCCTGGAGTCCAGA	179460

AL772248.5	901	CAGCACCCTCCCTGGTTCTGCCCCTCCCTGCAAGTCACTCCGCAAGCTAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179461	CAGCACCCTCCCTGGTTCTGCCCCTCCCTGCAAGTCACTCCGCAAGCTAC	179510

AL772248.5	951	CCTGTGGGCTCTTCTTCCTCTGCCTCCGCTGTGAGTGTAGGCTGTCGACA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179511	CCTGTGGGCTCTTCTTCCTCTGCCTCCGCTGTGAGTGTAGGCTGTCGACA	179560

AL772248.5	1001	GGGTTCCAGTGGCCCTGTCTCTTCCCCAACCCCACACGACTACTCTGGTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179561	GGGTTCCAGTGGCCCTGTCTCTTCCCCAACCCCACACGACTACTCTGGTG	179610

AL772248.5	1051	CCTCAATTCTCCTGACCTATAAAGTAGGCATGCCTCCCAGGTGTGCTTTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179611	CCTCAATTCTCCTGACCTATAAAGTAGGCATGCCTCCCAGGTGTGCTTTA	179660

AL772248.5	1101	TGGGGTGTGATGATCCACTTAGAGAACATCTTGATCACAACTGACTCTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179661	TGGGGTGTGATGATCCACTTAGAGAACATCTTGATCACAACTGACTCTCA	179710

AL772248.5	1151	ATAAATGCACAAAAGGTATTTATGTAAGTGTCTCTTAGATATTGATCTAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179711	ATAAATGCACAAAAGGTATTTATGTAAGTGTCTCTTAGATATTGATCTAA	179760

AL772248.5	1201	GTTTATCTAAGGCGTTGTTCCCCACCTCTGCTGCTCCCTGCCTCAGGGAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179761	GTTTATCTAAGGCGTTGTTCCCCACCTCTGCTGCTCCCTGCCTCAGGGAA	179810

AL772248.5	1251	TGGGACTGTCTCATCCAGAACCCTGGGGGCTGCCTGGTACACCTTGCTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179811	TGGGACTGTCTCATCCAGAACCCTGGGGGCTGCCTGGTACACCTTGCTTT	179860

AL772248.5	1301	CCTTCGCCTCCCCCATCCAGCCCCACTGCCACCATCCCAGCTGACCCATC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179861	CCTTCGCCTCCCCCATCCAGCCCCACTGCCACCATCCCAGCTGACCCATC	179910

AL772248.5	1351	ATCATTTTTCTTTTTTTTGAGACAGGGTGTTGCTCTGTGCAGAGTGTGGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179911	ATCATTTTTCTTTTTTTTGAGACAGGGTGTTGCTCTGTGCAGAGTGTGGA	179960

AL772248.5	1401	TAGCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCATGGCTCTCTGCAGCCTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	179961	TAGCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCATGGCTCTCTGCAGCCTC	180010

AL772248.5	1451	GGTCTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAAGCCTCTCAAGTAGCTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	180011	GGTCTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAAGCCTCTCAAGTAGCTG	180060

AL772248.5	1501	GGACTACAGGCACGCACCACCACGCCTGGCTAATATCTTTTGTTATAGTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	180061	GGACTACAGGCACGCACCACCACGCCTGGCTAATATCTTTTGTTATAGTA	180110

AL772248.5	1551	GAGATGGGGGGTCTCACTATGTTGCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTAGCCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	180111	GAGATGGGGGGTCTCACTATGTTGCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTAGCCT	180160

AL772248.5	1601	CAAGCGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTATAGGCAGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	180161	CAAGCGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTATAGGCAGG	180210

AL772248.5	1651	ATCAACCCTGCTAGCCTTTACCAGCTCTTAACTCACTTCTCCAGCTAGTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	180211	ATCAACCCTGCTAGCCTTTACCAGCTCTTAACTCACTTCTCCAGCTAGTC	180260

AL772248.5	1701	TCAGCAGCCACCCGGTTATTTGCAAGATAAATATCTAGTCTCATCACTCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	180261	TCAGCAGCCACCCGGTTATTTGCAAGATAAATATCTAGTCTCATCACTCT	180310

AL772248.5	1751	CCCACTTTACCCTTCAGAGGCCCTCTAGGGGCCTTCGAATGAGGCCCAAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	180311	CCCACTTTACCCTTCAGAGGCCCTCTAGGGGCCTTCGAATGAGGCCCAAG	180360

AL772248.5	1801	CCCCTCAGCACAGCACAGGAAGCCCTGAGACCAGGCCCTTTGGCACCCCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	180361	CCCCTCAGCACAGCACAGGAAGCCCTGAGACCAGGCCCTTTGGCACCCCC	180410

AL772248.5	1851	CACATGCCCTGTTCTCCAGCCAGAGGAAACTGTAACAGTGATTCTCTTAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	180411	CACATGCCCTGTTCTCCAGCCAGAGGAAACTGTAACAGTGATTCTCTTAC	180460

AL772248.5	1901	TGGCCATGCTCTCCCCACCTTACTCACCGTGACTCCCTCAGGCTGCACTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	180461	TGGCCATGCTCTCCCCACCTTACTCACCGTGACTCCCTCAGGCTGCACTG	180510

AL772248.5	1951	AGCTTCTCAAACTCTTTGCCTGCCCCACCACTACTTTCCCTTCAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645922.12	180511	AGCTTCTCAAACTCTTTGCCTGCCCCACCACTACTTTCCCTTCAGAATTC	180560

Overview

Query
AL772248.5 - 6879 bps
Hit
AL645922.12 - 180560 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link