<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL589737.11	1	GAATTCCTGCCAGTCTACAGGTGAAGGCTTGAGCAGGGACTGATTCCATC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	19892	GAATTCCTGCCAGTCTACAGGTGAAGGCTTGAGCAGGGACTGATTCCATC	19941

AL589737.11	51	TGGAAACCGAAGCAGTTCTTGCCTGCTGTGTTCGTTGTCTCATCCATTTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	19942	TGGAAACCGAAGCAGTTCTTGCCTGCTGTGTTCGTTGTCTCATCCATTTC	19991

AL589737.11	101	TTCACCGCAGCGTGACTCCTTCCAAAACAGGGCCCAGGTTTGTGGCTGCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	19992	TTCACCGCAGCGTGACTCCTTCCAAAACAGGGCCCAGGTTTGTGGCTGCT	20041

AL589737.11	151	TTGGATGGCTGTGACCTGGCAAAGGGTCTGGTACACTGGCTGTTCTTAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20042	TTGGATGGCTGTGACCTGGCAAAGGGTCTGGTACACTGGCTGTTCTTAGT	20091

AL589737.11	201	AAACATTGGCAGACAGTGCCAATAGGGGAAGGCACAGAGGGTTTGCGAAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20092	AAACATTGGCAGACAGTGCCAATAGGGGAAGGCACAGAGGGTTTGCGAAG	20141

AL589737.11	251	TTAGAAAGAGGCAGAGGGGAACAATGTCTGTACTCCAATGGGAACCCCTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20142	TTAGAAAGAGGCAGAGGGGAACAATGTCTGTACTCCAATGGGAACCCCTC	20191

AL589737.11	301	CTCCACACTCCAAAAGCAAATTCCTTAGATCATCAGCTACAAATATCTTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20192	CTCCACACTCCAAAAGCAAATTCCTTAGATCATCAGCTACAAATATCTTA	20241

AL589737.11	351	CTAAGGATACAAATTCTGGGGCAGGCTACTGAATGATCATAGATAATTAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20242	CTAAGGATACAAATTCTGGGGCAGGCTACTGAATGATCATAGATAATTAT	20291

AL589737.11	401	TCTGCAACAATAGTTTGTACACTTTACAAACTTTGGAAAATCATGAATCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20292	TCTGCAACAATAGTTTGTACACTTTACAAACTTTGGAAAATCATGAATCT	20341

AL589737.11	451	CAAACTGCACTTCTGACTCGGGTTTCACACTGATTACTAAATAGCAAGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20342	CAAACTGCACTTCTGACTCGGGTTTCACACTGATTACTAAATAGCAAGCA	20391

AL589737.11	501	TTCTTGAATAATGATTGGATGGGAAACAAATTGGTCACCTTCTCAAGCAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20392	TTCTTGAATAATGATTGGATGGGAAACAAATTGGTCACCTTCTCAAGCAG	20441

AL589737.11	551	TTGTACACAGTAAGGGCATAATTATTTTTTATTGGCTATTTTCTTTATTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20442	TTGTACACAGTAAGGGCATAATTATTTTTTATTGGCTATTTTCTTTATTT	20491

AL589737.11	601	ACATTTCAAATGTTATCCCCTTTCCCTGTTTCCCCCTCCCAGAAACCCCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20492	ACATTTCAAATGTTATCCCCTTTCCCTGTTTCCCCCTCCCAGAAACCCCC	20541

AL589737.11	651	TATCCCATCTACCCTCCCCCTCCTTCTATGAGGGTGTTCCTCCATCCACC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20542	TATCCCATCTACCCTCCCCCTCCTTCTATGAGGGTGTTCCTCCATCCACC	20591

AL589737.11	701	CACCTACCCCTACCTTCCTGCCCTCAATTCCCCTGCACTGGGGCGTCTAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20592	CACCTACCCCTACCTTCCTGCCCTCAATTCCCCTGCACTGGGGCGTCTAT	20641

AL589737.11	751	TGAGCCTTCATAAGACCAAGGACCTCTGCTTCATTGATGCCTGACAAGGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20642	TGAGCCTTCATAAGACCAAGGACCTCTGCTTCATTGATGCCTGACAAGGC	20691

AL589737.11	801	CATCCTCTGCTACCTATGTGGCTAGAGCCATGTGTACTCTTTGGTTGATG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20692	CATCCTCTGCTACCTATGTGGCTAGAGCCATGTGTACTCTTTGGTTGATG	20741

AL589737.11	851	GCTTAGTCCCTAGGAGCTCTGGGAGGAGTCTGGTTGGTTGATATTGTTGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20742	GCTTAGTCCCTAGGAGCTCTGGGAGGAGTCTGGTTGGTTGATATTGTTGT	20791

AL589737.11	901	TCTTCCTATGGGGTTGCAAACCCCTTCAACTCCTTCAGAAGAGGAAGAAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20792	TCTTCCTATGGGGTTGCAAACCCCTTCAACTCCTTCAGAAGAGGAAGAAC	20841

AL589737.11	951	CCATATTAAAACTGAATAAGGGCTGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAGAGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20842	CCATATTAAAACTGAATAAGGGCTGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAGAGC	20891

AL589737.11	1001	ACTGACTGTTCTTCTGAAAGTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20892	ACTGACTGTTCTTCTGAAAGTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGG	20941

AL589737.11	1051	TAGCTCACAACCATCTGTAATGAGATCTGATTCCCTCTTCTGGTGCATCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20942	TAGCTCACAACCATCTGTAATGAGATCTGATTCCCTCTTCTGGTGCATCT	20991

AL589737.11	1101	GAAGACAGCTACAGTATACTTAGATTCAATAATAAATAAATCTTTAGGCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	20992	GAAGACAGCTACAGTATACTTAGATTCAATAATAAATAAATCTTTAGGCT	21041

AL589737.11	1151	GGAACAAGCAACCTTCATTCCAAGCAACCACATGATGGCTCACAACCATC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21042	GGAACAAGCAACCTTCATTCCAAGCAACCACATGATGGCTCACAACCATC	21091

AL589737.11	1201	AGTATAATTACAGTGTACCCATATACATAAAATAAATAAATAAATCTTAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21092	AGTATAATTACAGTGTACCCATATACATAAAATAAATAAATAAATCTTAA	21141

AL589737.11	1251	AAAGTCAAATAAAACTGGGTTCTTACCTCAAATATTGGCTCCATCTAGCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21142	AAAGTCAAATAAAACTGGGTTCTTACCTCAAATATTGGCTCCATCTAGCT	21191

AL589737.11	1301	TGTAAATCAACACAAATATTTAATGTAAATGACAAAAGCAGAAACCAATA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21192	TGTAAATCAACACAAATATTTAATGTAAATGACAAAAGCAGAAACCAATA	21241

AL589737.11	1351	CTGTATGAGAACAGAGAAGAGTTCAAAAATATTATTGGGGGAGGGTAGAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21242	CTGTATGAGAACAGAGAAGAGTTCAAAAATATTATTGGGGGAGGGTAGAG	21291

AL589737.11	1401	AGATGGCTCAGTTGTTAAGAGTACTTGTCCTTGCAGAGGACCAGGGTTCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21292	AGATGGCTCAGTTGTTAAGAGTACTTGTCCTTGCAGAGGACCAGGGTTCA	21341

AL589737.11	1451	AGTCTCAGCGCACATATTGCTGCTCACAACCATCCAAAACTCTAGTTCTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21342	AGTCTCAGCGCACATATTGCTGCTCACAACCATCCAAAACTCTAGTTCTA	21391

AL589737.11	1501	GGGTGTTTGAACTTCTACGCACATGGCACACAGACAGACATTTAAGCAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21392	GGGTGTTTGAACTTCTACGCACATGGCACACAGACAGACATTTAAGCAAA	21441

AL589737.11	1551	ACACACATACATGTACAGTAGGAGAATGTCTTTTTTAAAAATCTTTAAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21442	ACACACATACATGTACAGTAGGAGAATGTCTTTTTTAAAAATCTTTAAAA	21491

AL589737.11	1601	AATTAGAGTAGGAAATGTCTTTCTAGTTATGATAAAATTTATCAAAGTAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21492	AATTAGAGTAGGAAATGTCTTTCTAGTTATGATAAAATTTATCAAAGTAT	21541

AL589737.11	1651	AACATAAAAGTGATTCAGAAAGCTCAAAAGGCAAATGACCAACTAGGGAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21542	AACATAAAAGTGATTCAGAAAGCTCAAAAGGCAAATGACCAACTAGGGAA	21591

AL589737.11	1701	CTACTTAGAAATTCTTTCATAAGCAAACGTCTAATCTCTTTAGCATATAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21592	CTACTTAGAAATTCTTTCATAAGCAAACGTCTAATCTCTTTAGCATATAA	21641

AL589737.11	1751	ACACATTATTTGGAACCAAAAGGAAAGAATCAACAACAAAGTAAAAAATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21642	ACACATTATTTGGAACCAAAAGGAAAGAATCAACAACAAAGTAAAAAATG	21691

AL589737.11	1801	GAGAGAGGCTAACTACACAGGATCCAGCAAGGTAAAATTCAAATAAAAGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21692	GAGAGAGGCTAACTACACAGGATCCAGCAAGGTAAAATTCAAATAAAAGA	21741

AL589737.11	1851	CCAAGCATCTTACCTTAAAAAACTTTAAAGCTATGCTAAAAATAGACTGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21742	CCAAGCATCTTACCTTAAAAAACTTTAAAGCTATGCTAAAAATAGACTGT	21791

AL589737.11	1901	CACAATGAACTTCCTCGTCTGTATCCATCATGCAGCTTCAACAGTTTCCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21792	CACAATGAACTTCCTCGTCTGTATCCATCATGCAGCTTCAACAGTTTCCA	21841

AL589737.11	1951	CTCATGACTGATCTTGTTTTATCCATTCTGCTCCCCTTTATATTTCCCCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645825.6	21842	CTCATGACTGATCTTGTTTTATCCATTCTGCTCCCCTTTATATTTCCCCC	21891

Overview

Query
AL589737.11 - 202855 bps
Hit
AL645825.6 - 21891 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link