<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645693.8	1	CTTCATCTTGTGTTTGGCTGTGAGTCTCAGCATCTATTTTTGGTCAGCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	188674	CTTCATCTTGTGTTTGGCTGTGAGTCTCAGCATCTATTTTTGGTCAGCTT	188723

AL645693.8	51	CTGGGTAGAGCCTCTCAGAGGACAGTTATGCTAGGCTCCTGTCTGCAAGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	188724	CTGGGTAGAGCCTCTCAGAGGACAGTTATGCTAGGCTCCTGTCTGCAAGC	188773

AL645693.8	101	AGAACAGAGTATCATTAATAGTGTCAGATATTGGTAATTGAAAATGGGAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	188774	AGAACAGAGTATCATTAATAGTGTCAGATATTGGTAATTGAAAATGGGAT	188823

AL645693.8	151	TGGCCTCAAGTTGGACCAGTTATTGGTTGGCCATTCCCTCAATCTTTGCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	188824	TGGCCTCAAGTTGGACCAGTTATTGGTTGGCCATTCCCTCAATCTTTGCT	188873

AL645693.8	201	CCACCCCCATCTCTGCATTTCTTGTAGACAGGATAAATTTTGGGTCTAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	188874	CCACCCCCATCTCTGCATTTCTTGTAGACAGGATAAATTTTGGGTCTAAA	188923

AL645693.8	251	GTTTTGTGGTTGTATTGGTGCCCTTTATACTTTTTATATGTTTAAAATAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	188924	GTTTTGTGGTTGTATTGGTGCCCTTTATACTTTTTATATGTTTAAAATAA	188973

AL645693.8	301	ATCTGGGTTCCACATCAAGGAAAAATGCTATGTGAGTGAAGGGACTCTAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	188974	ATCTGGGTTCCACATCAAGGAAAAATGCTATGTGAGTGAAGGGACTCTAG	189023

AL645693.8	351	CTGTCCTGAGAAAGACAAGCATGGCTCTGGCAGGCCTTGCCCTTCTCCAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189024	CTGTCCTGAGAAAGACAAGCATGGCTCTGGCAGGCCTTGCCCTTCTCCAC	189073

AL645693.8	401	AATTCCCTCTCCTTGGGTAAATCCTGTTAGATTATATTCCTAAAGCTGGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189074	AATTCCCTCTCCTTGGGTAAATCCTGTTAGATTATATTCCTAAAGCTGGT	189123

AL645693.8	451	TGCTAAGGTCTATTCCTTTATTTGGCCACTTCCTCCTTCTGGGGCTATCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189124	TGCTAAGGTCTATTCCTTTATTTGGCCACTTCCTCCTTCTGGGGCTATCA	189173

AL645693.8	501	AAGTATTGAAGTTCATCAGTCAAAAACCCCCTTACAGTTAATCTATTTAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189174	AAGTATTGAAGTTCATCAGTCAAAAACCCCCTTACAGTTAATCTATTTAA	189223

AL645693.8	551	CATGCCCAATCAAAATTAAACAGCTCATCCTTACACGGAGTTTCACCTTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189224	CATGCCCAATCAAAATTAAACAGCTCATCCTTACACGGAGTTTCACCTTT	189273

AL645693.8	601	GATTGTATAAACTACCATCTGCCTGTGGGCCATGTCTGCCTCCTCTCTAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189274	GATTGTATAAACTACCATCTGCCTGTGGGCCATGTCTGCCTCCTCTCTAT	189323

AL645693.8	651	CCAGAGGCAGTACTTTGTTCCCTTTCCCCTTGCTCCTTTCCTACTCTTCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189324	CCAGAGGCAGTACTTTGTTCCCTTTCCCCTTGCTCCTTTCCTACTCTTCT	189373

AL645693.8	701	TAGTCTTCTAGCTCCCGTCTTTGTCTCTTATTCTCTGGCCTGTTTTCCCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189374	TAGTCTTCTAGCTCCCGTCTTTGTCTCTTATTCTCTGGCCTGTTTTCCCT	189423

AL645693.8	751	GGCAAATAAATCTCCTTTGTGTAGAGAACTTGGTCTTGAGGTGTCTTCGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189424	GGCAAATAAATCTCCTTTGTGTAGAGAACTTGGTCTTGAGGTGTCTTCGT	189473

AL645693.8	801	CTGATTCCAAGTGTCCCCACAATTTGCCTTCCTGAGCCTGATTTATTTTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189474	CTGATTCCAAGTGTCCCCACAATTTGCCTTCCTGAGCCTGATTTATTTTA	189523

AL645693.8	851	CTTAGCATGATGATCTCCAGTTCTTTTTACTGTCCTACAAAATACATAAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189524	CTTAGCATGATGATCTCCAGTTCTTTTTACTGTCCTACAAAATACATAAT	189573

AL645693.8	901	TTCATTCTTCTATACAGCTAAGTAAAACACCCAACACTGTATACAATACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189574	TTCATTCTTCTATACAGCTAAGTAAAACACCCAACACTGTATACAATACT	189623

AL645693.8	951	ACATGTAAAGTGACTATTAAGGCACCTCATGAAAGTTTCTGCAAAATTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189624	ACATGTAAAGTGACTATTAAGGCACCTCATGAAAGTTTCTGCAAAATTGA	189673

AL645693.8	1001	CCATAGAACTGGACACAAAACAAGTCTCACCTGATACAAAAAAGTGCAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189674	CCATAGAACTGGACACAAAACAAGTCTCACCTGATACAAAAAAGTGCAAT	189723

AL645693.8	1051	AACAACATGTACCCTGTCTGACCACTGTGGATTAAAGCTGACTATAAAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189724	AACAACATGTACCCTGTCTGACCACTGTGGATTAAAGCTGACTATAAAAA	189773

AL645693.8	1101	AACAACAGAAATAGCAGAAAGTTTATGAACTTAGTGAAACTAAACAGCTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189774	AACAACAGAAATAGCAGAAAGTTTATGAACTTAGTGAAACTAAACAGCTA	189823

AL645693.8	1151	TACACTAGTGAATGAAAATTGAGTCAAGACAGATTAGGAAAGAAATTAAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189824	TACACTAGTGAATGAAAATTGAGTCAAGACAGATTAGGAAAGAAATTAAG	189873

AL645693.8	1201	AACTTTTCAGAATTGAATGAAAATGAAAAGACTCAGACCCAAACTTTTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189874	AACTTTTCAGAATTGAATGAAAATGAAAAGACTCAGACCCAAACTTTTGG	189923

AL645693.8	1251	GACACACCAAAGGTTGTTCTAAGAGGCAAGTTCATAGCACCAAGTGTCTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189924	GACACACCAAAGGTTGTTCTAAGAGGCAAGTTCATAGCACCAAGTGTCTA	189973

AL645693.8	1301	AATTAAAAAATAATTGGGCAGTTCACCTACTAATAGCTTAATGTCAAACT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	189974	AATTAAAAAATAATTGGGCAGTTCACCTACTAATAGCTTAATGTCAAACT	190023

AL645693.8	1351	TGGAAGATCTTGAACAAAAAGAAGAAATCATACCCTTTTGGGAGTAGATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	190024	TGGAAGATCTTGAACAAAAAGAAGAAATCATACCCTTTTGGGAGTAGATG	190073

AL645693.8	1401	TCAAGAAATAAACTTTTGGTGGAAATAAGAGTGGTTCTTCAAGAAAATCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	190074	TCAAGAAATAAACTTTTGGTGGAAATAAGAGTGGTTCTTCAAGAAAATCA	190123

AL645693.8	1451	ATAAAATTGCCAAACCCTTAAACATGAAGAGTGGAGATTCAAATTAACAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	190124	ATAAAATTGCCAAACCCTTAAACATGAAGAGTGGAGATTCAAATTAACAA	190173

AL645693.8	1501	AATTAAAGAACAAAAGAGGGATATAATAGCCACCACAAAAACCGAGAGAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	190174	AATTAAAGAACAAAAGAGGGATATAATAGCCACCACAAAAACCGAGAGAA	190223

AL645693.8	1551	TCAAAAGGATGTATTTTGAGAACTTATATACCACCAACTTAGAAAATCTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	190224	TCAAAAGGATGTATTTTGAGAACTTATATACCACCAACTTAGAAAATCTA	190273

AL645693.8	1601	AAAGAAATCGAACATTTTCTTGACATATACCACGTACCTAAGTCAAATCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	190274	AAAGAAATCGAACATTTTCTTGACATATACCACGTACCTAAGTCAAATCA	190323

AL645693.8	1651	AGATCATATAAGCAATTTCAACAGAAATATAATCCCTAGGAACATATAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	190324	AGATCATATAAGCAATTTCAACAGAAATATAATCCCTAGGAACATATAAG	190373

AL645693.8	1701	TAGTAATTAAAATCTAACGGCCAAAAGATTCCAGGACCAGATGGTTTTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	190374	TAGTAATTAAAATCTAACGGCCAAAAGATTCCAGGACCAGATGGTTTTTA	190423

AL645693.8	1751	AAGCAGAATTTCGAAGTAGAATGAATGCCAATATTCCTCAAGTTATTCTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	190424	AAGCAGAATTTCGAAGTAGAATGAATGCCAATATTCCTCAAGTTATTCTA	190473

AL645693.8	1801	CAAAACTGGTACAGAAAGAATACTGCCCAATTCTTTTTATCAATCCAGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	190474	CAAAACTGGTACAGAAAGAATACTGCCCAATTCTTTTTATCAATCCAGAA	190523

AL645693.8	1851	TTAGCCTAATATCTAAACCATATATTGGTCATAAAAAGGAAGAAAATTAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	190524	TTAGCCTAATATCTAAACCATATATTGGTCATAAAAAGGAAGAAAATTAC	190573

AL645693.8	1901	AGAACAAAATTCCTAATAAAATAATCACAAACCAAATCCAAGAACACATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	190574	AGAACAAAATTCCTAATAAAATAATCACAAACCAAATCCAAGAACACATT	190623

AL645693.8	1951	AAAAAGATCATTCACTATGATCAAATTGGCTTCATCCCAGGGATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645808.13	190624	AAAAAGATCATTCACTATGATCAAATTGGCTTCATCCCAGGGATGAATTC	190673

Overview

Query
AL645693.8 - 13777 bps
Hit
AL645808.13 - 190673 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link