<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645808.13	1	GAATTCCCCATGAGGCCCTGAGGTTACAAAGACTCAAAGAAGAAAAAACT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61171	GAATTCCCCATGAGGCCCTGAGGTTACAAAGACTCAAAGAAGAAAAAACT	61220

AL645808.13	51	CATGTAAATATTCAATTGTTTTAGAATGTGTTTCCTTTCCTTTATTTTAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61221	CATGTAAATATTCAATTGTTTTAGAATGTGTTTCCTTTCCTTTATTTTAT	61270

AL645808.13	101	TACGTTTTTATGTCTAGTTTTCACATTGTGTACTCCATCTATAAACTCAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61271	TACGTTTTTATGTCTAGTTTTCACATTGTGTACTCCATCTATAAACTCAT	61320

AL645808.13	151	AATTTAGGCTCTCCAGGAACCAGAAACCGGGCTTCACTACTCTCCCCTGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61321	AATTTAGGCTCTCCAGGAACCAGAAACCGGGCTTCACTACTCTCCCCTGT	61370

AL645808.13	201	GAGAACCGTCAGTGGTGAGCAAATGTGTAAGTGTGATGAAGCCTCTTTTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61371	GAGAACCGTCAGTGGTGAGCAAATGTGTAAGTGTGATGAAGCCTCTTTTC	61420

AL645808.13	251	CCAGGCTGGCCCTTTAAAGTTCCAATGGCTCGGTGTAAACTCCTCCAGTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61421	CCAGGCTGGCCCTTTAAAGTTCCAATGGCTCGGTGTAAACTCCTCCAGTT	61470

AL645808.13	301	TAGGGTGGGAAAAAACCTGCTGTGTGCTTGGGAGTTGGGTGGAGGACTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61471	TAGGGTGGGAAAAAACCTGCTGTGTGCTTGGGAGTTGGGTGGAGGACTGG	61520

AL645808.13	351	AGTCCAGAGCAGCATATTCCTTTTGTTATTTTTTCACTCCAGGCAGTATA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61521	AGTCCAGAGCAGCATATTCCTTTTGTTATTTTTTCACTCCAGGCAGTATA	61570

AL645808.13	401	ATCCTAGATACTTAACTCTCTGTCTCCATAAACGAACAGATTACTGATTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61571	ATCCTAGATACTTAACTCTCTGTCTCCATAAACGAACAGATTACTGATTC	61620

AL645808.13	451	TCATTCTACCAGCTTTTCATGGAAAAGAAGGGCAGTGTTTTGTTTTATTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61621	TCATTCTACCAGCTTTTCATGGAAAAGAAGGGCAGTGTTTTGTTTTATTT	61670

AL645808.13	501	TATTTTTTAAGTGCTTGTAGTTTCTTCCAAAGGAACAGCTTTGTGAGAAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61671	TATTTTTTAAGTGCTTGTAGTTTCTTCCAAAGGAACAGCTTTGTGAGAAC	61720

AL645808.13	551	CAACTTCTGCAAATTAGAAAAAAAATACTGTATATCAGTGACAAAGCACC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61721	CAACTTCTGCAAATTAGAAAAAAAATACTGTATATCAGTGACAAAGCACC	61770

AL645808.13	601	AGAGCTAAGGCCATTGGCGAAGGCTTGCCCCACCAGCAATCTGGACATGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61771	AGAGCTAAGGCCATTGGCGAAGGCTTGCCCCACCAGCAATCTGGACATGG	61820

AL645808.13	651	AAATCTGAGGACCCAGAGCTACACAGAGAGTTCAAGGCCAGTCTGGACAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61821	AAATCTGAGGACCCAGAGCTACACAGAGAGTTCAAGGCCAGTCTGGACAA	61870

AL645808.13	701	CATGAGGTCTATCTCAAAACAAAACCCAAAAAGCCAGCAAGGCCTCATTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61871	CATGAGGTCTATCTCAAAACAAAACCCAAAAAGCCAGCAAGGCCTCATTG	61920

AL645808.13	751	TGGTTGGGCATTTTCTTGCGTGGGATATATTTGCCCGATCAGTAAAAGAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61921	TGGTTGGGCATTTTCTTGCGTGGGATATATTTGCCCGATCAGTAAAAGAG	61970

AL645808.13	801	TTGCTCTTGAAAACAAGTGATGCTTCATTTTTGGTTAATTTTTAAAGATT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	61971	TTGCTCTTGAAAACAAGTGATGCTTCATTTTTGGTTAATTTTTAAAGATT	62020

AL645808.13	851	TATTATTTGTGTTTTATAGGCATAAGGATTTTGTTTACACGTATAACTAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62021	TATTATTTGTGTTTTATAGGCATAAGGATTTTGTTTACACGTATAACTAC	62070

AL645808.13	901	GTACCACATGTGTGCCTGTTACTCAGGGAAACCAGGAGTTACAAACAGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62071	GTACCACATGTGTGCCTGTTACTCAGGGAAACCAGGAGTTACAAACAGCT	62120

AL645808.13	951	GGGAGCCACCACATGGATGCTGGGGACTGAGCAAGCATCCTCTGCAAGAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62121	GGGAGCCACCACATGGATGCTGGGGACTGAGCAAGCATCCTCTGCAAGAG	62170

AL645808.13	1001	CAGCAAGTGCTCTCAACCACTGAGTCATCTCTCCAGACCCAGACAAGTGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62171	CAGCAAGTGCTCTCAACCACTGAGTCATCTCTCCAGACCCAGACAAGTGA	62220

AL645808.13	1051	TGGTTTGGAATGAAATAACGAATAATGCAACCCAGAAAAAGAAAGAAATT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62221	TGGTTTGGAATGAAATAACGAATAATGCAACCCAGAAAAAGAAAGAAATT	62270

AL645808.13	1101	CTAAATGAACACAACAAGGAATGTGTGTGAATGCCACACTATGCTCTGCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62271	CTAAATGAACACAACAAGGAATGTGTGTGAATGCCACACTATGCTCTGCA	62320

AL645808.13	1151	ATCTCAGCCTCTCCCCACTGTGGACCTGGCAAGTGATGGCCCAGAGTGAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62321	ATCTCAGCCTCTCCCCACTGTGGACCTGGCAAGTGATGGCCCAGAGTGAA	62370

AL645808.13	1201	ATGGAGGGGGGCGAGTGTGGCTCCTCTACCATGGAAACGAGTGTCCACTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62371	ATGGAGGGGGGCGAGTGTGGCTCCTCTACCATGGAAACGAGTGTCCACTG	62420

AL645808.13	1251	CTTTAACGGGCATCTTGTTTTTGTAATGGTAGCAAAATGTACCTAATATA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62421	CTTTAACGGGCATCTTGTTTTTGTAATGGTAGCAAAATGTACCTAATATA	62470

AL645808.13	1301	AAATTGCCCACCCAGTTTTAGAGCCAGTCACCATCCAGATGAGCATTCTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62471	AAATTGCCCACCCAGTTTTAGAGCCAGTCACCATCCAGATGAGCATTCTT	62520

AL645808.13	1351	TTTTTTTCTTTTTTATTGGATATTTTCTTTATTTACATTTCAAATGTTAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62521	TTTTTTTCTTTTTTATTGGATATTTTCTTTATTTACATTTCAAATGTTAT	62570

AL645808.13	1401	CCCCTTTCCCAGTTCCCCCTACTCCTGGAAACCCCCTATCCCATCCTCCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62571	CCCCTTTCCCAGTTCCCCCTACTCCTGGAAACCCCCTATCCCATCCTCCC	62620

AL645808.13	1451	TCTCCCTGCTTCTCTGAGGATGCTCCTCCACCCACCCACCCACTCCCGCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62621	TCTCCCTGCTTCTCTGAGGATGCTCCTCCACCCACCCACCCACTCCCGCC	62670

AL645808.13	1501	TCCCCTGCCCTCGATTCCCCTATACTGGGACATCAATCAAGCCTTCATAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62671	TCCCCTGCCCTCGATTCCCCTATACTGGGACATCAATCAAGCCTTCATAG	62720

AL645808.13	1551	GACCAAGGACCTTTCTTCCCATTGATACATGCATGACAAGGCCATCCTCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62721	GACCAAGGACCTTTCTTCCCATTGATACATGCATGACAAGGCCATCCTCC	62770

AL645808.13	1601	GCTACATATGCAGCTGGAACCATGTCAGATAAACATTCCTACTGATGTGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62771	GCTACATATGCAGCTGGAACCATGTCAGATAAACATTCCTACTGATGTGC	62820

AL645808.13	1651	AACCACTGCTGCTATCTAGCTCCTGGAAACCTCACGTGTTCATCTAGCGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62821	AACCACTGCTGCTATCTAGCTCCTGGAAACCTCACGTGTTCATCTAGCGT	62870

AL645808.13	1701	TCTGCATTCTGTCCTTGTGGATCTGACCACTCTGAAGTGGGGTGACAGCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62871	TCTGCATTCTGTCCTTGTGGATCTGACCACTCTGAAGTGGGGTGACAGCA	62920

AL645808.13	1751	CTTGCCCCCTCATGACTGGTGTATTTTGTGTAGCACTAAGTCATCAACTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62921	CTTGCCCCCTCATGACTGGTGTATTTTGTGTAGCACTAAGTCATCAACTT	62970

AL645808.13	1801	CTTCGAGATAGCAAGCACCACAATTTCTTTCCTACTTGAGACTGAATCAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	62971	CTTCGAGATAGCAAGCACCACAATTTCTTTCCTACTTGAGACTGAATCAT	63020

AL645808.13	1851	ACCCCACTGATGCCCGTCCATTTACCTGTCAGTAGACACTGATCGCTCTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	63021	ACCCCACTGATGCCCGTCCATTTACCTGTCAGTAGACACTGATCGCTCTC	63070

AL645808.13	1901	CTGCTTAATCTAGTGTAAATAACACTGTGATGGGGATAAGTAGAGATGTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	63071	CTGCTTAATCTAGTGTAAATAACACTGTGATGGGGATAAGTAGAGATGTC	63120

AL645808.13	1951	TGTTCAAGACCCTACATCCAATTCTGTATCTGTTTAGTAGAACTGCCAGG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645799.5	63121	TGTTCAAGACCCTACATCCAATTCTGTATCTGTTTAGTAGAACTGCCAGG	63170

Overview

Query
AL645808.13 - 190673 bps
Hit
AL645799.5 - 63170 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link