<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645697.9	1	GAATTCAGCAGTGAAGTCATTTAGCCTACTGCCTCTGTGTTAGGTTATTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	96686	GAATTCAGCAGTGAAGTCATTTAGCCTACTGCCTCTGTGTTAGGTTATTC	96735

AL645697.9	51	ATTCTCAGTTCAATGTTTTTTATAAATACAGGCTCATTCAAATGATCTAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	96736	ATTCTCAGTTCAATGTTTTTTATAAATACAGGCTCATTCAAATGATCTAT	96785

AL645697.9	101	TTCATATATGACTTTTGACAGAACATGGTCTGTTGCTTTTGTGGTATCCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	96786	TTCATATATGACTTTTGACAGAACATGGTCTGTTGCTTTTGTGGTATCCC	96835

AL645697.9	151	ATACATTTTGATTAGTTTAGTTTAAAATATTGTAGAAATTGATCTCTCTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	96836	ATACATTTTGATTAGTTTAGTTTAAAATATTGTAGAAATTGATCTCTCTC	96885

AL645697.9	201	GATACTCCTCTGATCATGTTAATCAACGATCTTTTTAAAGTGTCCAGCTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	96886	GATACTCCTCTGATCATGTTAATCAACGATCTTTTTAAAGTGTCCAGCTA	96935

AL645697.9	251	TATTTCTTTTATTGATTTGTAGTTTTATTCCATTGTTGTCTGATAGCATA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	96936	TATTTCTTTTATTGATTTGTAGTTTTATTCCATTGTTGTCTGATAGCATA	96985

AL645697.9	301	GATCAGCTGATTTCTAGTCTCTTACATTTCTTAGGGTTCATCTAATGACC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	96986	GATCAGCTGATTTCTAGTCTCTTACATTTCTTAGGGTTCATCTAATGACC	97035

AL645697.9	351	TGGAATGTCATCTATCCTGGTGGAATGTCATGTGAGCTTGAAGAGAATCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97036	TGGAATGTCATCTATCCTGGTGGAATGTCATGTGAGCTTGAAGAGAATCT	97085

AL645697.9	401	ACTTTTCACTTTGTTGATGGAACTATTCTACAAATGTCACATATCATGCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97086	ACTTTTCACTTTGTTGATGGAACTATTCTACAAATGTCACATATCATGCA	97135

AL645697.9	451	TGTGTCAAACCTCTTTTAAGTCCTCTACTCTCTTGGATTTTTGTTGTTGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97136	TGTGTCAAACCTCTTTTAAGTCCTCTACTCTCTTGGATTTTTGTTGTTGC	97185

AL645697.9	501	TGTTCTCTCCCTTATTCTGTTTGCTTTGAAATACTAGAAGTTTCTTCTCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97186	TGTTCTCTCCCTTATTCTGTTTGCTTTGAAATACTAGAAGTTTCTTCTCA	97235

AL645697.9	551	CAAGCCTTCAGTTTCCACCTTTTTGGCAGTGTGTGGTGTCCTCGTGAGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97236	CAAGCCTTCAGTTTCCACCTTTTTGGCAGTGTGTGGTGTCCTCGTGAGCC	97285

AL645697.9	601	CACCTAGGGCATTTTTCACTTATTTTGCAATGTTCATTATTTGTGATATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97286	CACCTAGGGCATTTTTCACTTATTTTGCAATGTTCATTATTTGTGATATT	97335

AL645697.9	651	ACCTTTTGAGTCCCCACTTTTCTGCCTACTTACCCCCACCTCCTTCTTCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97336	ACCTTTTGAGTCCCCACTTTTCTGCCTACTTACCCCCACCTCCTTCTTCA	97385

AL645697.9	701	CAGAGCTTATTACATAATCATAGTAACAACTCTAAAGTCCAGATTTGATA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97386	CAGAGCTTATTACATAATCATAGTAACAACTCTAAAGTCCAGATTTGATA	97435

AL645697.9	751	GTTCTTTTACAGATTGAGTCTGTTTGCCTCTTCACATTGTGTTTACTGCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97436	GTTCTTTTACAGATTGAGTCTGTTTGCCTCTTCACATTGTGTTTACTGCC	97485

AL645697.9	801	TTTTAGCATGTCCCATAGTCAGAAGCCAGAGGGATGGATTTGGATTGAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97486	TTTTAGCATGTCCCATAGTCAGAAGCCAGAGGGATGGATTTGGATTGAGA	97535

AL645697.9	851	CATTGAGGCAAACAGGTGGGTTCCTGTGAGGTCCAGGACTTAGGCTGTGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97536	CATTGAGGCAAACAGGTGGGTTCCTGTGAGGTCCAGGACTTAGGCTGTGT	97585

AL645697.9	901	TTACTGCTGGATGCAGCCCTGACAGAGGTTACACTTTCCCACAGTGTCTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97586	TTACTGCTGGATGCAGCCCTGACAGAGGTTACACTTTCCCACAGTGTCTT	97635

AL645697.9	951	TGTGTTTGTTTTCCCCCTTTTAATTGATTTCCCTTTTTTCAACAGGCAGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97636	TGTGTTTGTTTTCCCCCTTTTAATTGATTTCCCTTTTTTCAACAGGCAGG	97685

AL645697.9	1001	AATAAGGCTGAAGTTGATGTTTGCCTTTCTTCAGGTCAGCTGGGCTGTGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97686	AATAAGGCTGAAGTTGATGTTTGCCTTTCTTCAGGTCAGCTGGGCTGTGG	97735

AL645697.9	1051	TAGATCTCTCCTTTAGGGACCGTTGTTGTTAAGGAGTTCTGGCTGAATAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97736	TAGATCTCTCCTTTAGGGACCGTTGTTGTTAAGGAGTTCTGGCTGAATAT	97785

AL645697.9	1101	GTAAAATTGATTACTTCTCCTCTTGCCACAAGCATGAGAAGTTTTTTTCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97786	GTAAAATTGATTACTTCTCCTCTTGCCACAAGCATGAGAAGTTTTTTTCC	97835

AL645697.9	1151	CACTGATCTTTACCTTGAGAAACTGGCAGGAAGTAAAGCAGGTGCAGTGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97836	CACTGATCTTTACCTTGAGAAACTGGCAGGAAGTAAAGCAGGTGCAGTGA	97885

AL645697.9	1201	AGGCCAACCTGGAGAGAGCTCTACTTCGTTAGTCCACAGCCACTGGCCTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97886	AGGCCAACCTGGAGAGAGCTCTACTTCGTTAGTCCACAGCCACTGGCCTT	97935

AL645697.9	1251	CCAAGGCTCCTGCTGCCTTCAGGAGCAGCTTCTGCCTTGGGTAAGATCTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97936	CCAAGGCTCCTGCTGCCTTCAGGAGCAGCTTCTGCCTTGGGTAAGATCTA	97985

AL645697.9	1301	ACTCTCTGGGTCATTTCTCCAGCTGGGGCAGTGGTTTGCTGTGCAACCTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	97986	ACTCTCTGGGTCATTTCTCCAGCTGGGGCAGTGGTTTGCTGTGCAACCTT	98035

AL645697.9	1351	GATTTTCTAGTGTTTCTTGGAAGCGCTGTGACTTTCAGTTGTTTCTCTTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	98036	GATTTTCTAGTGTTTCTTGGAAGCGCTGTGACTTTCAGTTGTTTCTCTTT	98085

AL645697.9	1401	CTTCTTTTGCTGAGGGGGAAAATGTTGCTTCCATGTATGTTGGACTGAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	98086	CTTCTTTTGCTGAGGGGGAAAATGTTGCTTCCATGTATGTTGGACTGAAG	98135

AL645697.9	1451	CCTGACCTGAGGCATACTTAGGACTTTTGGTATCATTTTGTCCTTATCGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	98136	CCTGACCTGAGGCATACTTAGGACTTTTGGTATCATTTTGTCCTTATCGT	98185

AL645697.9	1501	AATGCAACTTGGACAAATACATGCACATACAGAGCATGTTCTAATACACT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	98186	AATGCAACTTGGACAAATACATGCACATACAGAGCATGTTCTAATACACT	98235

AL645697.9	1551	GTGCTGATAAAGGAAGGCACCGGTTTGCTTCTAATCAACAGTAACACACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	98236	GTGCTGATAAAGGAAGGCACCGGTTTGCTTCTAATCAACAGTAACACACA	98285

AL645697.9	1601	AGACAAGGATGGAACAGAAAGCAGACAGTGTTTATACATTTTAACTTCAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	98286	AGACAAGGATGGAACAGAAAGCAGACAGTGTTTATACATTTTAACTTCAG	98335

AL645697.9	1651	TTTCAGTTAAAGATGAAGAACTAAAATGAGTTTTCTAGTTATTTTTCCAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	98336	TTTCAGTTAAAGATGAAGAACTAAAATGAGTTTTCTAGTTATTTTTCCAT	98385

AL645697.9	1701	ATGATTCTATCATAAATAATTTCTATAAAGAGGAATTTTCCTGTGTCAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	98386	ATGATTCTATCATAAATAATTTCTATAAAGAGGAATTTTCCTGTGTCAAA	98435

AL645697.9	1751	ATATTTTTCCAGGTATTTCTCTGATTCTGTAGAGCCTATCATTAACAATC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	98436	ATATTTTTCCAGGTATTTCTCTGATTCTGTAGAGCCTATCATTAACAATC	98485

AL645697.9	1801	CTAGACATGGGCTGGCTAGATGGCTGAGCAGGTGAAGGTGCTTGCTGCTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	98486	CTAGACATGGGCTGGCTAGATGGCTGAGCAGGTGAAGGTGCTTGCTGCTA	98535

AL645697.9	1851	ATGATGACATCTTGAGCTCTATCACTAGACCCTATGCAGTGGAAGGACAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	98536	ATGATGACATCTTGAGCTCTATCACTAGACCCTATGCAGTGGAAGGACAG	98585

AL645697.9	1901	AACTGACACCCACAGTTGTCCTCGACCTAGAGAGATACATGCACACCACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	98586	AACTGACACCCACAGTTGTCCTCGACCTAGAGAGATACATGCACACCACA	98635

AL645697.9	1951	AACAAGCCCCTGAGTCCTTTTATTTATACACAAATGGAACATAGCACAGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645783.13	98636	AACAAGCCCCTGAGTCCTTTTATTTATACACAAATGGAACATAGCACAGC	98685

Overview

Query
AL645697.9 - 74298 bps
Hit
AL645783.13 - 98685 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link