<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL691425.6	1	CGAGGGAAAAGTCTACTTTAGACTTTGAAACCAAGAAAGCTAGCACAGTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116245	CGAGGGAAAAGTCTACTTTAGACTTTGAAACCAAGAAAGCTAGCACAGTA	116294

AL691425.6	51	TTTAGAATGTTCTTTGTGCTGTGTTTTTTCAAATCTCAAACCATATATCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116295	TTTAGAATGTTCTTTGTGCTGTGTTTTTTCAAATCTCAAACCATATATCT	116344

AL691425.6	101	CCATTTACTAAAAAGGTGTTCGGAGTCCTACAGAGCCAACATGTAGAGTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116345	CCATTTACTAAAAAGGTGTTCGGAGTCCTACAGAGCCAACATGTAGAGTT	116394

AL691425.6	151	GTGTTTGAGAATGAACAAGACAACAACAGCTTGACTAAAACACAGAGGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116395	GTGTTTGAGAATGAACAAGACAACAACAGCTTGACTAAAACACAGAGGAA	116444

AL691425.6	201	ACGTAGTCTGGTAACCTCTGAACCTCAGCATGTAACATTAATTGTGTTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116445	ACGTAGTCTGGTAACCTCTGAACCTCAGCATGTAACATTAATTGTGTTTG	116494

AL691425.6	251	GGATTGGCATGGTGAACCGCACACACCTAGAGGCAGATATTGGTGGTCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116495	GGATTGGCATGGTGAACCGCACACACCTAGAGGCAGATATTGGTGGTCTG	116544

AL691425.6	301	ACAATGGAATCAGAACTGAAGAGGATCCATGGCAGTTTCACCCTTAAGGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116545	ACAATGGAATCAGAACTGAAGAGGATCCATGGCAGTTTCACCCTTAAGGA	116594

AL691425.6	351	AAAAATGAAAGGTATAACACTTTTCTAATACTTTAATGTTGCTTTGCTGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116595	AAAAATGAAAGGTATAACACTTTTCTAATACTTTAATGTTGCTTTGCTGA	116644

AL691425.6	401	AAGAAATGTGTTTCTAATATTTGAAAATTCAAGAAAAATGAAAGTTGTAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116645	AAGAAATGTGTTTCTAATATTTGAAAATTCAAGAAAAATGAAAGTTGTAC	116694

AL691425.6	451	AATATTTGCTTTTCCTCATTGCCACTATAGAAATTTATAATCTAGTATTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116695	AATATTTGCTTTTCCTCATTGCCACTATAGAAATTTATAATCTAGTATTC	116744

AL691425.6	501	ACTTTAGTACCTTTTTTAAAAATTAAGAACTTCACAAAAATTCTATTACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116745	ACTTTAGTACCTTTTTTAAAAATTAAGAACTTCACAAAAATTCTATTACT	116794

AL691425.6	551	GGATATAAAATTTCCCTAAAGTAATCAAAATGTGCCATTTATTTCTAAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116795	GGATATAAAATTTCCCTAAAGTAATCAAAATGTGCCATTTATTTCTAAAA	116844

AL691425.6	601	TGGTCACAGAAGGTGTGATAGTTCATGAAATCTAGGATAGCATCTGTTTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116845	TGGTCACAGAAGGTGTGATAGTTCATGAAATCTAGGATAGCATCTGTTTG	116894

AL691425.6	651	AATACGCTCCATAGATATGTATCACAAGGGAAATAATGCTGTCAGATGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116895	AATACGCTCCATAGATATGTATCACAAGGGAAATAATGCTGTCAGATGAA	116944

AL691425.6	701	ATTGCTTGTAAAATATACCCCAGTTTCAGAAATTCCAAAATAAAATTAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116945	ATTGCTTGTAAAATATACCCCAGTTTCAGAAATTCCAAAATAAAATTAAA	116994

AL691425.6	751	TGTTTAAGTCGGTGGATAAAGCAGTATGGAATTCACTTTCATATCAGTGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	116995	TGTTTAAGTCGGTGGATAAAGCAGTATGGAATTCACTTTCATATCAGTGT	117044

AL691425.6	801	TGTTTTCTTCATGGTTGTATTGTACAAGAAAAGGAACTTGTGAATTAACA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117045	TGTTTTCTTCATGGTTGTATTGTACAAGAAAAGGAACTTGTGAATTAACA	117094

AL691425.6	851	TTTGTTCTTGTTAACTTTATGATTATCCAACATACAAAGTCTAAATTTTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117095	TTTGTTCTTGTTAACTTTATGATTATCCAACATACAAAGTCTAAATTTTT	117144

AL691425.6	901	CATTAAATACTCTTCTTTAGCTGTTTTGTTTCATACCCTAAGTATGAAAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117145	CATTAAATACTCTTCTTTAGCTGTTTTGTTTCATACCCTAAGTATGAAAC	117194

AL691425.6	951	AGAAGTTAAGCACTGATTTTTACATGAAAATTTATGTGTGATTAAAGAAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117195	AGAAGTTAAGCACTGATTTTTACATGAAAATTTATGTGTGATTAAAGAAA	117244

AL691425.6	1001	ATTATGTAAAGAAGTGAAAAACTATAAAATGCTGAGAAAAATACAAACAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117245	ATTATGTAAAGAAGTGAAAAACTATAAAATGCTGAGAAAAATACAAACAC	117294

AL691425.6	1051	ACGAATTCTCAAATACAAGGCAAAAGATGGCTATATTGAAGTAAATTTTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117295	ACGAATTCTCAAATACAAGGCAAAAGATGGCTATATTGAAGTAAATTTTT	117344

AL691425.6	1101	AACTTTAGTCGTTTTAAGACTACCAATTTTTTCTTCTGTTGTTTTAGTAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117345	AACTTTAGTCGTTTTAAGACTACCAATTTTTTCTTCTGTTGTTTTAGTAA	117394

AL691425.6	1151	ACATTAAGAATTACATTGGTGCTTTTGGTTAGAATCTGGAAAATGGGCAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117395	ACATTAAGAATTACATTGGTGCTTTTGGTTAGAATCTGGAAAATGGGCAT	117444

AL691425.6	1201	TCACTTCTAAATGAATAGATTTAACATTTGCAAAGTTTGATAGGTCTTAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117445	TCACTTCTAAATGAATAGATTTAACATTTGCAAAGTTTGATAGGTCTTAT	117494

AL691425.6	1251	CAATAGCCTCTAAGCTATATTTCTTCTTTATTGTAGCAATTCTAATTCTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117495	CAATAGCCTCTAAGCTATATTTCTTCTTTATTGTAGCAATTCTAATTCTA	117544

AL691425.6	1301	CAAACCTAGAAAGAACAGAAAATGACTGATGTTAAAGAGCTGGTGGTTAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117545	CAAACCTAGAAAGAACAGAAAATGACTGATGTTAAAGAGCTGGTGGTTAT	117594

AL691425.6	1351	TTTTATAGCCCCAAGACAGTTTAAGATTTACCCATTCCAAGTTGTATCAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117595	TTTTATAGCCCCAAGACAGTTTAAGATTTACCCATTCCAAGTTGTATCAT	117644

AL691425.6	1401	AGGATTTATTTGTATGAAAAAAATCTAAAAGAGAAAAGCAGGCAGAATGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117645	AGGATTTATTTGTATGAAAAAAATCTAAAAGAGAAAAGCAGGCAGAATGA	117694

AL691425.6	1451	CATATTTACTTTATTTAGATTTACAAGTAATAAATATATTAATTTCATAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117695	CATATTTACTTTATTTAGATTTACAAGTAATAAATATATTAATTTCATAA	117744

AL691425.6	1501	GAGGTATATGGACCAAGAGTAGTAGTTTATCTGGTTTCCTTTTTTTTCTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117745	GAGGTATATGGACCAAGAGTAGTAGTTTATCTGGTTTCCTTTTTTTTCTC	117794

AL691425.6	1551	TCAAAGCACATATGTGGTATAGACCATTTAATTCCAGTAAATTATTTAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117795	TCAAAGCACATATGTGGTATAGACCATTTAATTCCAGTAAATTATTTAAT	117844

AL691425.6	1601	GCATGAAGTCATGTTAAAGTGCATTTCTCCATATTTCTACTTTTTAGGTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117845	GCATGAAGTCATGTTAAAGTGCATTTCTCCATATTTCTACTTTTTAGGTA	117894

AL691425.6	1651	TACTCTGTATACATATATTTATGCAAAATAGTAAGCTGAGGAAATTTTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117895	TACTCTGTATACATATATTTATGCAAAATAGTAAGCTGAGGAAATTTTCT	117944

AL691425.6	1701	TAAGGTAGTCTGACAATAATTGAGCACATTTATTATAATTTATAGTTATC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117945	TAAGGTAGTCTGACAATAATTGAGCACATTTATTATAATTTATAGTTATC	117994

AL691425.6	1751	ATTTGTCATCAAATATATTGTAAATAAAGTAATTTTAATATCAGATACAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	117995	ATTTGTCATCAAATATATTGTAAATAAAGTAATTTTAATATCAGATACAA	118044

AL691425.6	1801	TTATTTTCAGAAGTCAGATTACATTTTTTTCATATTTAAGATGTTTTGCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	118045	TTATTTTCAGAAGTCAGATTACATTTTTTTCATATTTAAGATGTTTTGCA	118094

AL691425.6	1851	TCAAAAGATGACCGAGACCTGTGCTACTGCTCACATTGGTGGGGTTAATA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	118095	TCAAAAGATGACCGAGACCTGTGCTACTGCTCACATTGGTGGGGTTAATA	118144

AL691425.6	1901	TTGTACTACTTGAAGGGATCACACCAAATATACAGTAAGTGTGCTTATTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	118145	TTGTACTACTTGAAGGGATCACACCAAATATACAGTAAGTGTGCTTATTT	118194

AL691425.6	1951	TTACTGTTTTCTTTTATTCCTTGTTACAACTTATAAATAACTTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645759.11	118195	TTACTGTTTTCTTTTATTCCTTGTTACAACTTATAAATAACTTGGAATTC	118244

Overview

Query
AL691425.6 - 42679 bps
Hit
AL645759.11 - 118244 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link